68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene XfasM23_0873 on replicon NC_010577
Organism: Xylella fastidiosa M23



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010577  XfasM23_0873  signaling modulator of AmpD, AmpE  100 
 
 		 297 aa  579  1e-164  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.62468  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0994  signaling modulator of AmpD, AmpE  99.33 
 
 		 297 aa  575  1.0000000000000001e-163  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02953  transmembrane protein  64.39 
 
 		 296 aa  327  2.0000000000000001e-88  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3699  signaling modulator of AmpD, AmpE  59.86 
 
 		 295 aa  275  7e-73  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.32125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0638  signaling modulator of AmpD, AmpE  29.96 
 
 		 296 aa  85.1  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3350  cobalamin biosynthesis protein CbiB  28.91 
 
 		 328 aa  69.7  0.00000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.171722 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5340  cobalamin biosynthesis protein CbiB  26.01 
 
 		 336 aa  66.6  0.0000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0522  cobalamin biosynthesis protein CbiB  27.24 
 
 		 319 aa  64.3  0.000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0320  cobalamin biosynthesis protein CbiB  28.22 
 
 		 338 aa  63.9  0.000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.167497  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1463  hypothetical protein  23.15 
 
 		 250 aa  62  0.00000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1520  hypothetical protein  22.58 
 
 		 250 aa  62  0.00000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2698  cobalamin biosynthesis protein CbiB  26.42 
 
 		 328 aa  61.2  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12130  Inner membrane protein  32.88 
 
 		 280 aa  60.5  0.00000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.567702  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0788  AmpE  30.21 
 
 		 277 aa  59.3  0.00000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.689986  normal  0.152356 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1279  cobalamin biosynthesis protein CbiB  27.7 
 
 		 319 aa  58.9  0.00000009  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00447148  normal  0.925435 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1011  CobD/CbiB family protein  28.98 
 
 		 312 aa  59.3  0.00000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.322198  normal  0.895923 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2972  CobD/CbiB family protein  28.72 
 
 		 312 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.402163  normal  0.15784 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1044  CobD/CbiB family protein  26.3 
 
 		 305 aa  58.2  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.211721 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1407  hypothetical protein  27.36 
 
 		 328 aa  57.4  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.909593  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1889  hypothetical protein  27.91 
 
 		 334 aa  55.1  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00289969  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2432  adenosylcobinamide-phosphate synthase  28.76 
 
 		 304 aa  55.1  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0111605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0686  putative cobalamin biosynthesis transmembrane protein  30 
 
 		 329 aa  54.7  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.910501 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0903  CobD/CbiB family protein  29.07 
 
 		 331 aa  54.3  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0809  CobD/CbiB family protein  25.43 
 
 		 313 aa  53.9  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.37142  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1478  cobalamin biosynthesis protein CbiB  26.86 
 
 		 333 aa  53.9  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0880  CobD/CbiB family protein  25.43 
 
 		 313 aa  53.9  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.910898 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0781  signaling modulator of AmpD, AmpE  34.51 
 
 		 277 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1466  hypothetical protein  27.84 
 
 		 339 aa  52.8  0.000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0877  signaling modulator of AmpD, AmpE  37.11 
 
 		 281 aa  52.8  0.000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0027178  normal  0.0245194 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2578  CobD/CbiB family protein  23.51 
 
 		 326 aa  52.4  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.884231 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1458  cobalamin biosynthesis protein CobD  30.14 
 
 		 300 aa  51.2  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.862014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1695  hypothetical protein  25.97 
 
 		 342 aa  50.4  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.93045  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0938  CobD/CbiB family protein  25.65 
 
 		 324 aa  49.7  0.00005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0164662 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1109  putative cobalamin biosynthesis transmembrane protein  27.73 
 
 		 329 aa  49.3  0.00007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.805383 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1666  CobD/CbiB family protein  27.04 
 
 		 346 aa  49.3  0.00008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.805294  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2229  CobD/CbiB family protein  28.76 
 
 		 312 aa  49.3  0.00008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.29279  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58660  hypothetical protein  33.56 
 
 		 278 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1074  CobD/CbiB family protein  28.76 
 
 		 312 aa  48.5  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2660  CobD/CbiB family protein  28.98 
 
 		 307 aa  48.5  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.95909  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1033  CobD/CbiB family protein  28.76 
 
 		 312 aa  48.5  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0595  CobD/CbiB family protein  28.76 
 
 		 312 aa  48.5  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.142416  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2852  CobD/CbiB family protein  29.7 
 
 		 312 aa  47.4  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4188  CobD/CbiB family protein  27.9 
 
 		 312 aa  47.4  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.450468  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2539  CobD/CbiB family protein  29.7 
 
 		 312 aa  47.4  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.207097  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0396  CobD/CbiB family protein  29.7 
 
 		 312 aa  47.4  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0206694  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3757  regulatory protein AmpE  26.26 
 
 		 284 aa  47.4  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.118765  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1697  signaling modulator of AmpD, AmpE  27.59 
 
 		 337 aa  47.4  0.0003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0912  CobD/CbiB family protein  29.7 
 
 		 312 aa  47.4  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0235  CobD/CbiB family protein  29.7 
 
 		 312 aa  47.4  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2818  adenosylcobinamide-phosphate synthase  28.97 
 
 		 311 aa  47  0.0004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00349182  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2962  CobD/CbiB family protein  29.7 
 
 		 329 aa  46.6  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2912  CobD/CbiB family protein  29.7 
 
 		 329 aa  46.6  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0950  CobD/CbiB family protein  27.47 
 
 		 312 aa  46.2  0.0006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0954  CobD/CbiB family protein  27.47 
 
 		 312 aa  46.2  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.164316  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0271  cobalamin biosynthesis protein  27.17 
 
 		 319 aa  45.8  0.0008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0568  hypothetical protein  32.29 
 
 		 258 aa  45.1  0.001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000159703  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1615  beta-lactamase induction protein  32.29 
 
 		 258 aa  45.1  0.001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0562539  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0774  CobD/CbiB family protein  28.14 
 
 		 312 aa  43.5  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.219768 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1994  CobD/CbiB family protein  29.63 
 
 		 303 aa  43.9  0.004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4404  signaling modulator of AmpD, AmpE  28.9 
 
 		 276 aa  43.5  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.154037  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3571  regulatory protein AmpE  25.11 
 
 		 284 aa  43.9  0.004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0813  signaling modulator of AmpD, AmpE  32.67 
 
 		 276 aa  43.1  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.17689 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2205  cobalamin biosynthesis protein  27.73 
 
 		 313 aa  43.1  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0351195  normal  0.625062 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0631  regulatory protein AmpE  27.78 
 
 		 284 aa  42.7  0.006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3023  CobD/CbiB family protein  27.92 
 
 		 307 aa  42.4  0.009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.473012  normal  0.958188 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1711  cobalamin biosynthesis protein CobD  27.92 
 
 		 302 aa  42.4  0.009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0790  signaling modulator of AmpD, AmpE  32.67 
 
 		 276 aa  42.4  0.009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2089  cobD; cobalamin biosynthetic protein  28.37 
 
 		 301 aa  42.4  0.01  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.284243  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>