159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_0638 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_0638  signaling modulator of AmpD, AmpE  100 
 
 		 296 aa  587  1e-166  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1520  hypothetical protein  26.44 
 
 		 250 aa  110  3e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1463  hypothetical protein  26.1 
 
 		 250 aa  109  5e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02953  transmembrane protein  39.73 
 
 		 296 aa  87.4  3e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0568  hypothetical protein  25.33 
 
 		 258 aa  86.3  6e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000159703  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1615  beta-lactamase induction protein  25.33 
 
 		 258 aa  85.1  0.000000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0562539  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3699  signaling modulator of AmpD, AmpE  38.56 
 
 		 295 aa  83.2  0.000000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.32125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4188  CobD/CbiB family protein  25.68 
 
 		 312 aa  82.8  0.000000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.450468  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0954  CobD/CbiB family protein  25.29 
 
 		 312 aa  82.4  0.000000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.164316  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0950  CobD/CbiB family protein  25.29 
 
 		 312 aa  82.4  0.000000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1033  CobD/CbiB family protein  26.07 
 
 		 312 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1044  CobD/CbiB family protein  27.53 
 
 		 305 aa  80.9  0.00000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.211721 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0595  CobD/CbiB family protein  26.07 
 
 		 312 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.142416  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1074  CobD/CbiB family protein  26.07 
 
 		 312 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0522  cobalamin biosynthesis protein CbiB  28.53 
 
 		 319 aa  81.3  0.00000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2229  CobD/CbiB family protein  25.68 
 
 		 312 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.29279  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3348  regulatory protein AmpE  24.5 
 
 		 270 aa  79.3  0.00000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1711  cobalamin biosynthesis protein CobD  28.07 
 
 		 302 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0140  cobalamin biosynthesis protein  28.09 
 
 		 304 aa  77.4  0.0000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0396  CobD/CbiB family protein  25.29 
 
 		 312 aa  76.3  0.0000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0206694  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2539  CobD/CbiB family protein  25.29 
 
 		 312 aa  76.3  0.0000000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.207097  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0912  CobD/CbiB family protein  25.29 
 
 		 312 aa  76.3  0.0000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2852  CobD/CbiB family protein  25.29 
 
 		 312 aa  76.3  0.0000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0235  CobD/CbiB family protein  25.29 
 
 		 312 aa  76.3  0.0000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12130  Inner membrane protein  37.01 
 
 		 280 aa  75.9  0.0000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.567702  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2962  CobD/CbiB family protein  25.29 
 
 		 329 aa  75.5  0.0000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3494  cobalamin biosynthesis protein  30.5 
 
 		 311 aa  75.5  0.0000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2578  CobD/CbiB family protein  24.55 
 
 		 326 aa  75.5  0.0000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.884231 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2912  CobD/CbiB family protein  25.29 
 
 		 329 aa  75.5  0.0000000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33100  cobalamin biosynthesis protein  27.64 
 
 		 302 aa  74.7  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00042631  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1003  cobalamin biosynthesis protein  27.04 
 
 		 311 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1279  cobalamin biosynthesis protein CbiB  26.81 
 
 		 319 aa  73.9  0.000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00447148  normal  0.925435 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3858  regulatory protein AmpE  27.68 
 
 		 283 aa  73.6  0.000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000015429 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1666  CobD/CbiB family protein  24.9 
 
 		 346 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.805294  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1644  cobalamin biosynthesis protein  25.45 
 
 		 302 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.29794  normal  0.0167016 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2089  cobD; cobalamin biosynthetic protein  24.8 
 
 		 301 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.284243  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0877  signaling modulator of AmpD, AmpE  26.42 
 
 		 281 aa  70.9  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0027178  normal  0.0245194 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3678  cobalamin biosynthesis protein  25.09 
 
 		 302 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.035544 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1695  hypothetical protein  28.11 
 
 		 342 aa  69.7  0.00000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.93045  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0873  signaling modulator of AmpD, AmpE  29.96 
 
 		 297 aa  69.3  0.00000000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.62468  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1011  CobD/CbiB family protein  24.32 
 
 		 312 aa  69.3  0.00000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.322198  normal  0.895923 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3350  cobalamin biosynthesis protein CbiB  33.33 
 
 		 328 aa  69.3  0.00000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.171722 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0788  AmpE  31.65 
 
 		 277 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.689986  normal  0.152356 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1407  hypothetical protein  28.15 
 
 		 328 aa  68.9  0.0000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.909593  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5340  cobalamin biosynthesis protein CbiB  30.86 
 
 		 336 aa  68.2  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0373  regulatory protein AmpE  24.01 
 
 		 286 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.490103  hitchhiker  0.0000919241 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0994  signaling modulator of AmpD, AmpE  29.52 
 
 		 297 aa  68.2  0.0000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2205  cobalamin biosynthesis protein  28.65 
 
 		 313 aa  67  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0351195  normal  0.625062 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0417  regulatory protein AmpE  25.93 
 
 		 282 aa  66.6  0.0000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0903  CobD/CbiB family protein  26.18 
 
 		 331 aa  67  0.0000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1234  cobalamin biosynthesis protein  25.57 
 
 		 302 aa  66.6  0.0000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.778235  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0774  CobD/CbiB family protein  24.12 
 
 		 312 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.219768 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1274  cobalamin biosynthesis protein  26.94 
 
 		 302 aa  66.2  0.0000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.272014  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1675  cobalamin biosynthesis protein  25.97 
 
 		 307 aa  65.9  0.0000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.653042  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2972  CobD/CbiB family protein  25.71 
 
 		 312 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.402163  normal  0.15784 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2698  cobalamin biosynthesis protein CbiB  27.05 
 
 		 328 aa  65.5  0.000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1994  CobD/CbiB family protein  31.28 
 
 		 303 aa  65.1  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1466  hypothetical protein  27.34 
 
 		 339 aa  65.1  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1697  signaling modulator of AmpD, AmpE  27.04 
 
 		 337 aa  65.1  0.000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0422  regulatory protein AmpE  26.48 
 
 		 283 aa  64.7  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2716  cobalamin biosynthesis protein  28.44 
 
 		 310 aa  64.3  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.530545 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2453  cobalamin biosynthesis protein  29.61 
 
 		 312 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.393352  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1837  cobalamin biosynthesis protein  29.61 
 
 		 312 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.41199  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2448  cobalamin biosynthesis protein  29.61 
 
 		 312 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0320  cobalamin biosynthesis protein CbiB  30.48 
 
 		 338 aa  65.1  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.167497  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3915  regulatory protein AmpE  28.12 
 
 		 283 aa  64.3  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.370917  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4056  regulatory protein AmpE  26.91 
 
 		 283 aa  64.3  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000497634  normal  0.464654 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1478  cobalamin biosynthesis protein CbiB  26.91 
 
 		 333 aa  64.3  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0102  cobalamin biosynthesis protein  27.53 
 
 		 317 aa  64.3  0.000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3779  regulatory protein AmpE  26.36 
 
 		 283 aa  64.3  0.000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3936  regulatory protein AmpE  26.91 
 
 		 283 aa  64.3  0.000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.501947  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5779  cobalamin biosynthesis protein  28.3 
 
 		 314 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.642032 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3419  regulatory protein AmpE  26.7 
 
 		 283 aa  63.5  0.000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.535716  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2658  cobalamin biosynthesis protein  28.36 
 
 		 326 aa  63.2  0.000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.869405 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1109  putative cobalamin biosynthesis transmembrane protein  30.69 
 
 		 329 aa  63.2  0.000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.805383 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0424  regulatory protein AmpE  26.48 
 
 		 283 aa  62.4  0.000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0508582  normal  0.052266 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0426  regulatory protein AmpE  27.27 
 
 		 283 aa  61.6  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4044  cobalamin biosynthesis protein  25.58 
 
 		 302 aa  62  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2818  adenosylcobinamide-phosphate synthase  32.18 
 
 		 311 aa  60.8  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00349182  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0686  putative cobalamin biosynthesis transmembrane protein  25.75 
 
 		 329 aa  61.2  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.910501 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2200  cobalamin biosynthesis protein  28.22 
 
 		 326 aa  61.6  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0660969 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0655  regulatory protein AmpE  26.05 
 
 		 284 aa  61.2  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0317  regulatory protein AmpE  24.75 
 
 		 284 aa  61.2  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.810004 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1889  hypothetical protein  27.73 
 
 		 334 aa  60.5  0.00000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00289969  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2364  cobalamin biosynthesis protein  30 
 
 		 314 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3601  regulatory protein AmpE  27.89 
 
 		 283 aa  60.5  0.00000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.088498  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2496  cobalamin biosynthesis protein  30 
 
 		 312 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.315833  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0846  cobalamin biosynthesis protein  30 
 
 		 314 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0164  regulatory protein AmpE  26.81 
 
 		 284 aa  60.1  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.320883  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2392  cobalamin biosynthesis protein  26.94 
 
 		 331 aa  59.7  0.00000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0151839 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0159  regulatory protein AmpE  26.81 
 
 		 284 aa  60.1  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0160  regulatory protein AmpE  26.81 
 
 		 284 aa  60.1  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1458  cobalamin biosynthesis protein CobD  28.57 
 
 		 300 aa  59.3  0.00000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.862014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3385  regulatory protein AmpE  26.07 
 
 		 327 aa  59.3  0.00000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0781  signaling modulator of AmpD, AmpE  31.91 
 
 		 277 aa  59.3  0.00000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2660  CobD/CbiB family protein  25.1 
 
 		 307 aa  58.5  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.95909  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3757  regulatory protein AmpE  27.87 
 
 		 284 aa  58.5  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.118765  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0161  regulatory protein AmpE  26.81 
 
 		 284 aa  58.9  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.667372  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0790  signaling modulator of AmpD, AmpE  29.3 
 
 		 276 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0167  regulatory protein AmpE  26.38 
 
 		 284 aa  58.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.762774  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>