114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene COXBURSA331_A0568 on replicon NC_010117
Organism: Coxiella burnetii RSA 331



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010117  COXBURSA331_A0568  hypothetical protein  100 
 
 
258 aa  515  1.0000000000000001e-145  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000159703  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1615  beta-lactamase induction protein  99.61 
 
 
258 aa  512  1e-144  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0562539  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1520  hypothetical protein  27.04 
 
 
250 aa  97.1  3e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1463  hypothetical protein  26.77 
 
 
250 aa  92  7e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0638  signaling modulator of AmpD, AmpE  26.32 
 
 
296 aa  76.6  0.0000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2200  cobalamin biosynthesis protein  30.3 
 
 
326 aa  65.9  0.0000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0660969 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3348  regulatory protein AmpE  25.18 
 
 
270 aa  63.9  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2658  cobalamin biosynthesis protein  29.55 
 
 
326 aa  63.2  0.000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.869405 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1274  cobalamin biosynthesis protein  28.92 
 
 
302 aa  62  0.000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.272014  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1675  cobalamin biosynthesis protein  28.31 
 
 
307 aa  59.3  0.00000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.653042  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2578  CobD/CbiB family protein  24.1 
 
 
326 aa  58.2  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.884231 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4044  cobalamin biosynthesis protein  27.71 
 
 
302 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2392  cobalamin biosynthesis protein  27.27 
 
 
331 aa  57.4  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0151839 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3678  cobalamin biosynthesis protein  27.44 
 
 
302 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.035544 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1644  cobalamin biosynthesis protein  26.83 
 
 
302 aa  57  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.29794  normal  0.0167016 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1407  hypothetical protein  23.19 
 
 
328 aa  57  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.909593  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2698  cobalamin biosynthesis protein CbiB  24.88 
 
 
328 aa  57  0.0000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1234  cobalamin biosynthesis protein  26.83 
 
 
302 aa  57  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.778235  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3350  cobalamin biosynthesis protein CbiB  25.48 
 
 
328 aa  56.2  0.0000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.171722 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1011  CobD/CbiB family protein  26.5 
 
 
312 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.322198  normal  0.895923 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2972  CobD/CbiB family protein  26.5 
 
 
312 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.402163  normal  0.15784 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1711  cobalamin biosynthesis protein CobD  27.44 
 
 
302 aa  55.8  0.0000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0595  CobD/CbiB family protein  31.69 
 
 
312 aa  55.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.142416  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1074  CobD/CbiB family protein  31.69 
 
 
312 aa  55.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0522  cobalamin biosynthesis protein CbiB  24.26 
 
 
319 aa  54.7  0.000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2229  CobD/CbiB family protein  31.69 
 
 
312 aa  55.1  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.29279  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1033  CobD/CbiB family protein  31.69 
 
 
312 aa  55.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0938  CobD/CbiB family protein  26.4 
 
 
324 aa  54.3  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0164662 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1458  cobalamin biosynthesis protein CobD  26.9 
 
 
300 aa  54.7  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.862014  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0880  CobD/CbiB family protein  25.27 
 
 
313 aa  54.3  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.910898 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0809  CobD/CbiB family protein  25.27 
 
 
313 aa  54.3  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.37142  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4188  CobD/CbiB family protein  30.28 
 
 
312 aa  53.1  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.450468  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1994  CobD/CbiB family protein  28.03 
 
 
303 aa  52.8  0.000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0950  CobD/CbiB family protein  30.28 
 
 
312 aa  52.8  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0954  CobD/CbiB family protein  30.28 
 
 
312 aa  52.8  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.164316  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0396  CobD/CbiB family protein  29.45 
 
 
312 aa  52.4  0.000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0206694  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0903  CobD/CbiB family protein  35.11 
 
 
331 aa  52.8  0.000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2539  CobD/CbiB family protein  29.45 
 
 
312 aa  52.4  0.000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.207097  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0912  CobD/CbiB family protein  29.45 
 
 
312 aa  52.4  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2852  CobD/CbiB family protein  29.45 
 
 
312 aa  52.4  0.000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0235  CobD/CbiB family protein  29.45 
 
 
312 aa  52.4  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0774  CobD/CbiB family protein  28.48 
 
 
312 aa  52.4  0.000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.219768 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2962  CobD/CbiB family protein  29.45 
 
 
329 aa  52.4  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2912  CobD/CbiB family protein  29.45 
 
 
329 aa  52.4  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4056  regulatory protein AmpE  32.31 
 
 
283 aa  52  0.000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000497634  normal  0.464654 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47730  cobalamin biosynthesis protein  31.01 
 
 
312 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.452767  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4115  cobalamin biosynthesis protein  31.01 
 
 
312 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3858  regulatory protein AmpE  32.31 
 
 
283 aa  52  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000015429 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3023  CobD/CbiB family protein  30.19 
 
 
307 aa  50.8  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.473012  normal  0.958188 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1666  CobD/CbiB family protein  27.5 
 
 
346 aa  50.8  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.805294  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3936  regulatory protein AmpE  32.31 
 
 
283 aa  51.2  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.501947  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1279  cobalamin biosynthesis protein CbiB  24.26 
 
 
319 aa  50.8  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00447148  normal  0.925435 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3433  regulatory protein AmpE  29.5 
 
 
283 aa  50.1  0.00004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.483045  normal  0.595075 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1753  cobalamin biosynthesis protein  28.8 
 
 
302 aa  50.1  0.00004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3915  regulatory protein AmpE  31.54 
 
 
283 aa  49.7  0.00005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.370917  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0117  regulatory protein AmpE  27.86 
 
 
284 aa  49.7  0.00005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0149146  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0790  signaling modulator of AmpD, AmpE  30.26 
 
 
276 aa  48.9  0.00009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00110  predicted inner membrane protein  27.86 
 
 
284 aa  48.5  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0643086  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3491  signaling modulator of AmpD, AmpE  27.86 
 
 
284 aa  48.5  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2287  cobalamin biosynthesis protein  32.38 
 
 
313 aa  48.1  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.731902  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00109  hypothetical protein  27.86 
 
 
284 aa  48.5  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.147668  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0877  signaling modulator of AmpD, AmpE  26.21 
 
 
281 aa  48.5  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0027178  normal  0.0245194 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2432  adenosylcobinamide-phosphate synthase  30.83 
 
 
304 aa  48.5  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0111605  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3731  cobalamin biosynthesis protein  23.76 
 
 
321 aa  48.5  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12130  Inner membrane protein  31.33 
 
 
280 aa  48.5  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.567702  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0813  signaling modulator of AmpD, AmpE  30.26 
 
 
276 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.17689 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0115  regulatory protein AmpE  27.86 
 
 
284 aa  48.5  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000121424  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0113  regulatory protein AmpE  27.86 
 
 
284 aa  48.5  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000149419  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3548  regulatory protein AmpE  27.86 
 
 
284 aa  48.5  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0782358  hitchhiker  0.00499322 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0140  cobalamin biosynthesis protein  25.68 
 
 
304 aa  47.8  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0102  cobalamin biosynthesis protein  24.14 
 
 
317 aa  47.8  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2818  adenosylcobinamide-phosphate synthase  25 
 
 
311 aa  47.8  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00349182  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0320  cobalamin biosynthesis protein CbiB  26.75 
 
 
338 aa  47.4  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.167497  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33100  cobalamin biosynthesis protein  23.71 
 
 
302 aa  47.8  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00042631  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0824  signaling modulator of AmpD, AmpE  29.61 
 
 
276 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0114  regulatory protein AmpE  27.86 
 
 
284 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.363052 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0317  regulatory protein AmpE  33.6 
 
 
284 aa  47.8  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.810004 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4404  signaling modulator of AmpD, AmpE  27.59 
 
 
276 aa  47  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.154037  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0788  AmpE  25.32 
 
 
277 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.689986  normal  0.152356 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0104  regulatory protein AmpE  27.86 
 
 
284 aa  46.6  0.0004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.325186  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3419  regulatory protein AmpE  30.23 
 
 
283 aa  46.2  0.0005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.535716  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2716  cobalamin biosynthesis protein  31.71 
 
 
310 aa  46.2  0.0006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.530545 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5340  cobalamin biosynthesis protein CbiB  24.84 
 
 
336 aa  46.2  0.0006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2660  CobD/CbiB family protein  23.46 
 
 
307 aa  45.8  0.0007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.95909  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0424  regulatory protein AmpE  24.86 
 
 
283 aa  45.8  0.0007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0508582  normal  0.052266 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0781  signaling modulator of AmpD, AmpE  30.95 
 
 
277 aa  45.8  0.0008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3367  regulatory protein AmpE  22.99 
 
 
284 aa  45.4  0.0008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.470719  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1038  regulatory protein AmpE  22.99 
 
 
284 aa  45.4  0.0008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.363864 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3495  regulatory protein AmpE  22.99 
 
 
284 aa  45.4  0.0008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3699  signaling modulator of AmpD, AmpE  25.98 
 
 
295 aa  45.4  0.0008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.32125  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3601  regulatory protein AmpE  28.46 
 
 
283 aa  45.4  0.0009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.088498  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0426  regulatory protein AmpE  28.46 
 
 
283 aa  45.1  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0417  regulatory protein AmpE  27.1 
 
 
282 aa  45.1  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1857  cobalamin biosynthesis protein CobD  31.25 
 
 
308 aa  44.3  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0160  regulatory protein AmpE  27.74 
 
 
284 aa  44.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0161  regulatory protein AmpE  27.74 
 
 
284 aa  44.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.667372  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0164  regulatory protein AmpE  27.74 
 
 
284 aa  44.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.320883  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0167  regulatory protein AmpE  27.74 
 
 
284 aa  44.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.762774  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0159  regulatory protein AmpE  27.74 
 
 
284 aa  44.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1478  cobalamin biosynthesis protein CbiB  26.09 
 
 
333 aa  43.5  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>