86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_3699 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_3699  signaling modulator of AmpD, AmpE  100 
 
 		 295 aa  555  1e-157  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.32125  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02953  transmembrane protein  64.53 
 
 		 296 aa  303  2.0000000000000002e-81  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0873  signaling modulator of AmpD, AmpE  60.07 
 
 		 297 aa  281  1e-74  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.62468  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0994  signaling modulator of AmpD, AmpE  60.07 
 
 		 297 aa  280  2e-74  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0638  signaling modulator of AmpD, AmpE  34.94 
 
 		 296 aa  112  8.000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1011  CobD/CbiB family protein  30.4 
 
 		 312 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.322198  normal  0.895923 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2972  CobD/CbiB family protein  31.35 
 
 		 312 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.402163  normal  0.15784 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5340  cobalamin biosynthesis protein CbiB  30.21 
 
 		 336 aa  74.7  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0522  cobalamin biosynthesis protein CbiB  27.24 
 
 		 319 aa  74.3  0.000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3350  cobalamin biosynthesis protein CbiB  31.37 
 
 		 328 aa  73.9  0.000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.171722 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1044  CobD/CbiB family protein  28.39 
 
 		 305 aa  72.8  0.000000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.211721 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0396  CobD/CbiB family protein  31.88 
 
 		 312 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0206694  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2912  CobD/CbiB family protein  31.88 
 
 		 329 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2852  CobD/CbiB family protein  31.88 
 
 		 312 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0235  CobD/CbiB family protein  31.88 
 
 		 312 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2539  CobD/CbiB family protein  31.88 
 
 		 312 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.207097  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2962  CobD/CbiB family protein  31.88 
 
 		 329 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0912  CobD/CbiB family protein  31.88 
 
 		 312 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0774  CobD/CbiB family protein  30.77 
 
 		 312 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.219768 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1666  CobD/CbiB family protein  30.66 
 
 		 346 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.805294  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1279  cobalamin biosynthesis protein CbiB  26.21 
 
 		 319 aa  70.1  0.00000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00447148  normal  0.925435 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1520  hypothetical protein  24.75 
 
 		 250 aa  70.1  0.00000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1463  hypothetical protein  25.74 
 
 		 250 aa  69.7  0.00000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1074  CobD/CbiB family protein  33.08 
 
 		 312 aa  68.9  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0595  CobD/CbiB family protein  33.08 
 
 		 312 aa  68.9  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.142416  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1033  CobD/CbiB family protein  33.08 
 
 		 312 aa  68.9  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2578  CobD/CbiB family protein  27.84 
 
 		 326 aa  68.6  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.884231 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2698  cobalamin biosynthesis protein CbiB  29.04 
 
 		 328 aa  68.6  0.0000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2229  CobD/CbiB family protein  32.74 
 
 		 312 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.29279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4188  CobD/CbiB family protein  32.38 
 
 		 312 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.450468  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1697  signaling modulator of AmpD, AmpE  29.41 
 
 		 337 aa  65.9  0.0000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0954  CobD/CbiB family protein  32.03 
 
 		 312 aa  65.9  0.0000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.164316  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0950  CobD/CbiB family protein  32.03 
 
 		 312 aa  65.9  0.0000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1478  cobalamin biosynthesis protein CbiB  27.73 
 
 		 333 aa  65.5  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1407  hypothetical protein  28.1 
 
 		 328 aa  63.9  0.000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.909593  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3858  regulatory protein AmpE  32.46 
 
 		 283 aa  63.5  0.000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000015429 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1889  hypothetical protein  29.39 
 
 		 334 aa  63.2  0.000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00289969  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1109  putative cobalamin biosynthesis transmembrane protein  31.3 
 
 		 329 aa  63.2  0.000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.805383 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0320  cobalamin biosynthesis protein CbiB  30.87 
 
 		 338 aa  63.2  0.000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.167497  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0631  regulatory protein AmpE  31.96 
 
 		 284 aa  62.4  0.000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0809  CobD/CbiB family protein  27.73 
 
 		 313 aa  61.6  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.37142  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0880  CobD/CbiB family protein  27.73 
 
 		 313 aa  61.6  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.910898 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0568  hypothetical protein  25.98 
 
 		 258 aa  60.8  0.00000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000159703  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1615  beta-lactamase induction protein  25.98 
 
 		 258 aa  60.8  0.00000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0562539  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1695  hypothetical protein  28.53 
 
 		 342 aa  60.1  0.00000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.93045  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0788  AmpE  33.57 
 
 		 277 aa  60.1  0.00000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.689986  normal  0.152356 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0686  putative cobalamin biosynthesis transmembrane protein  27.56 
 
 		 329 aa  59.7  0.00000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.910501 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3571  regulatory protein AmpE  29.85 
 
 		 284 aa  59.7  0.00000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3757  regulatory protein AmpE  28.23 
 
 		 284 aa  59.7  0.00000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.118765  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0938  CobD/CbiB family protein  29.44 
 
 		 324 aa  58.2  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0164662 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1466  hypothetical protein  28.05 
 
 		 339 aa  56.6  0.0000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2660  CobD/CbiB family protein  32.89 
 
 		 307 aa  56.2  0.0000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.95909  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12130  Inner membrane protein  29.41 
 
 		 280 aa  55.1  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.567702  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3494  cobalamin biosynthesis protein  30.1 
 
 		 311 aa  54.3  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2432  adenosylcobinamide-phosphate synthase  28.77 
 
 		 304 aa  54.7  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0111605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4056  regulatory protein AmpE  31.55 
 
 		 283 aa  53.9  0.000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000497634  normal  0.464654 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3936  regulatory protein AmpE  30.36 
 
 		 283 aa  53.1  0.000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.501947  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3419  regulatory protein AmpE  28.04 
 
 		 283 aa  53.5  0.000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.535716  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2818  adenosylcobinamide-phosphate synthase  30.58 
 
 		 311 aa  52.8  0.000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00349182  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0781  signaling modulator of AmpD, AmpE  35.43 
 
 		 277 aa  52.4  0.000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3779  regulatory protein AmpE  26.05 
 
 		 283 aa  52.4  0.000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1003  cobalamin biosynthesis protein  30.17 
 
 		 311 aa  51.6  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3023  CobD/CbiB family protein  30.53 
 
 		 307 aa  50.8  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.473012  normal  0.958188 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3915  regulatory protein AmpE  30.95 
 
 		 283 aa  51.2  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.370917  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0877  signaling modulator of AmpD, AmpE  30.57 
 
 		 281 aa  51.6  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0027178  normal  0.0245194 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0317  regulatory protein AmpE  24.9 
 
 		 284 aa  50.8  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.810004 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3495  regulatory protein AmpE  26.16 
 
 		 284 aa  50.1  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1038  regulatory protein AmpE  26.16 
 
 		 284 aa  50.1  0.00004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.363864 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3367  regulatory protein AmpE  26.16 
 
 		 284 aa  50.1  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.470719  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0417  regulatory protein AmpE  26.29 
 
 		 282 aa  50.1  0.00005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0429  regulatory protein AmpE  26.84 
 
 		 283 aa  49.7  0.00006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000942425 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0422  regulatory protein AmpE  27.96 
 
 		 283 aa  49.3  0.00007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0426  regulatory protein AmpE  27.71 
 
 		 283 aa  48.5  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1994  CobD/CbiB family protein  33.52 
 
 		 303 aa  48.5  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2716  cobalamin biosynthesis protein  31.37 
 
 		 310 aa  47.4  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.530545 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0903  CobD/CbiB family protein  25.1 
 
 		 331 aa  47.4  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3601  regulatory protein AmpE  27.31 
 
 		 283 aa  46.6  0.0004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.088498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3433  regulatory protein AmpE  27.89 
 
 		 283 aa  47  0.0004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.483045  normal  0.595075 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0780  regulatory protein AmpE  27 
 
 		 284 aa  46.6  0.0005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.29134 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1458  cobalamin biosynthesis protein CobD  30.82 
 
 		 300 aa  46.2  0.0007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.862014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0424  regulatory protein AmpE  28.22 
 
 		 283 aa  45.8  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0508582  normal  0.052266 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0373  regulatory protein AmpE  24.53 
 
 		 286 aa  45.4  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.490103  hitchhiker  0.0000919241 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33100  cobalamin biosynthesis protein  31.22 
 
 		 302 aa  44.3  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00042631  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0140  cobalamin biosynthesis protein  28.57 
 
 		 304 aa  43.5  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0790  signaling modulator of AmpD, AmpE  35.17 
 
 		 276 aa  43.1  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58660  hypothetical protein  37.06 
 
 		 278 aa  42.7  0.008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>