231 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_2432 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007947  Mfla_2432  adenosylcobinamide-phosphate synthase  100 
 
 
304 aa  606  9.999999999999999e-173  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0111605  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1044  CobD/CbiB family protein  40 
 
 
305 aa  228  1e-58  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.211721 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3023  CobD/CbiB family protein  42.86 
 
 
307 aa  219  3e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.473012  normal  0.958188 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1994  CobD/CbiB family protein  39.8 
 
 
303 aa  182  5.0000000000000004e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2660  CobD/CbiB family protein  37.74 
 
 
307 aa  180  2e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.95909  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1011  CobD/CbiB family protein  34.94 
 
 
312 aa  179  4e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.322198  normal  0.895923 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1279  cobalamin biosynthesis protein CbiB  34.38 
 
 
319 aa  175  9.999999999999999e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00447148  normal  0.925435 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0522  cobalamin biosynthesis protein CbiB  34.67 
 
 
319 aa  174  1.9999999999999998e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2972  CobD/CbiB family protein  34.94 
 
 
312 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.402163  normal  0.15784 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1666  CobD/CbiB family protein  34.29 
 
 
346 aa  171  2e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.805294  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0774  CobD/CbiB family protein  33.97 
 
 
312 aa  170  4e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.219768 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2912  CobD/CbiB family protein  34.62 
 
 
329 aa  169  6e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0396  CobD/CbiB family protein  34.62 
 
 
312 aa  169  6e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0206694  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2962  CobD/CbiB family protein  34.62 
 
 
329 aa  169  6e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0235  CobD/CbiB family protein  34.62 
 
 
312 aa  169  6e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2852  CobD/CbiB family protein  34.62 
 
 
312 aa  169  6e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2539  CobD/CbiB family protein  34.62 
 
 
312 aa  169  6e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.207097  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0912  CobD/CbiB family protein  34.62 
 
 
312 aa  169  6e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2578  CobD/CbiB family protein  32.82 
 
 
326 aa  168  1e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.884231 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0903  CobD/CbiB family protein  33.33 
 
 
331 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1033  CobD/CbiB family protein  34.98 
 
 
312 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0595  CobD/CbiB family protein  34.98 
 
 
312 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.142416  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1074  CobD/CbiB family protein  34.98 
 
 
312 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4188  CobD/CbiB family protein  34.6 
 
 
312 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.450468  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2229  CobD/CbiB family protein  34.6 
 
 
312 aa  162  9e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.29279  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0954  CobD/CbiB family protein  33.84 
 
 
312 aa  160  3e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.164316  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0950  CobD/CbiB family protein  33.84 
 
 
312 aa  160  3e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0938  CobD/CbiB family protein  34.5 
 
 
324 aa  158  8e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0164662 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3350  cobalamin biosynthesis protein CbiB  34.45 
 
 
328 aa  156  4e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.171722 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0880  CobD/CbiB family protein  34.19 
 
 
313 aa  154  1e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.910898 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0809  CobD/CbiB family protein  34.19 
 
 
313 aa  154  1e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.37142  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1109  putative cobalamin biosynthesis transmembrane protein  34.5 
 
 
329 aa  151  1e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.805383 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1478  cobalamin biosynthesis protein CbiB  31.46 
 
 
333 aa  150  2e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2698  cobalamin biosynthesis protein CbiB  34.65 
 
 
328 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5340  cobalamin biosynthesis protein CbiB  34.08 
 
 
336 aa  145  8.000000000000001e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1889  hypothetical protein  32.06 
 
 
334 aa  144  2e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00289969  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1695  hypothetical protein  31.5 
 
 
342 aa  143  4e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.93045  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1407  hypothetical protein  31.95 
 
 
328 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.909593  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0320  cobalamin biosynthesis protein CbiB  32.06 
 
 
338 aa  140  3e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.167497  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1466  hypothetical protein  31.5 
 
 
339 aa  136  4e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0686  putative cobalamin biosynthesis transmembrane protein  31.95 
 
 
329 aa  136  5e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.910501 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1644  cobalamin biosynthesis protein  34.08 
 
 
302 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.29794  normal  0.0167016 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1711  cobalamin biosynthesis protein CobD  33.33 
 
 
302 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33100  cobalamin biosynthesis protein  33.59 
 
 
302 aa  130  2.0000000000000002e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00042631  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3678  cobalamin biosynthesis protein  33.73 
 
 
302 aa  129  7.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.035544 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0140  cobalamin biosynthesis protein  31.25 
 
 
304 aa  129  7.000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1003  cobalamin biosynthesis protein  34.6 
 
 
311 aa  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2392  cobalamin biosynthesis protein  34.94 
 
 
331 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0151839 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3494  cobalamin biosynthesis protein  34.5 
 
 
311 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1274  cobalamin biosynthesis protein  34.9 
 
 
302 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.272014  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2200  cobalamin biosynthesis protein  33.08 
 
 
326 aa  126  4.0000000000000003e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0660969 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4044  cobalamin biosynthesis protein  34.51 
 
 
302 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1675  cobalamin biosynthesis protein  34.51 
 
 
307 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.653042  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3731  cobalamin biosynthesis protein  35.16 
 
 
321 aa  123  4e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1234  cobalamin biosynthesis protein  32.84 
 
 
302 aa  123  4e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.778235  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2205  cobalamin biosynthesis protein  31.62 
 
 
313 aa  120  3e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0351195  normal  0.625062 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2658  cobalamin biosynthesis protein  32.24 
 
 
326 aa  118  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.869405 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1753  cobalamin biosynthesis protein  33.58 
 
 
302 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2716  cobalamin biosynthesis protein  32.81 
 
 
310 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.530545 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2818  adenosylcobinamide-phosphate synthase  36.82 
 
 
311 aa  115  1.0000000000000001e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00349182  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4115  cobalamin biosynthesis protein  33.58 
 
 
312 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47730  cobalamin biosynthesis protein  33.96 
 
 
312 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.452767  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1837  cobalamin biosynthesis protein  33.98 
 
 
312 aa  114  3e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.41199  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2448  cobalamin biosynthesis protein  33.98 
 
 
312 aa  114  3e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2453  cobalamin biosynthesis protein  33.98 
 
 
312 aa  114  3e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.393352  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0846  cobalamin biosynthesis protein  35.14 
 
 
314 aa  109  6e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2496  cobalamin biosynthesis protein  32.67 
 
 
312 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.315833  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2364  cobalamin biosynthesis protein  33.33 
 
 
314 aa  108  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0271  cobalamin biosynthesis protein  29.25 
 
 
319 aa  107  2e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0842  cobalamin biosynthesis protein  32.35 
 
 
314 aa  103  5e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.98695  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3677  cobalamin biosynthesis protein CobD  31.23 
 
 
330 aa  102  6e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.544295 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1458  cobalamin biosynthesis protein CobD  32.61 
 
 
300 aa  101  1e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.862014  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2089  cobD; cobalamin biosynthetic protein  30.69 
 
 
301 aa  99.8  5e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.284243  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0102  cobalamin biosynthesis protein  34.58 
 
 
317 aa  99  1e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1630  cobalamin biosynthesis protein  33.73 
 
 
310 aa  97.4  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.187303  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0695  cobalamin biosynthesis protein  33.73 
 
 
310 aa  97.4  3e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.114905  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2318  cobalamin biosynthesis protein  33.73 
 
 
310 aa  97.4  3e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0401808  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2969  cobalamin biosynthesis protein  33.73 
 
 
310 aa  97.4  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1043  cobalamin biosynthesis protein  33.73 
 
 
314 aa  97.1  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.110651  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1198  cobalamin biosynthesis protein  33.73 
 
 
314 aa  97.1  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1037  cobalamin biosynthesis protein  33.73 
 
 
314 aa  97.1  4e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5779  cobalamin biosynthesis protein  31.92 
 
 
314 aa  96.3  5e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.642032 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2780  cobalamin biosynthesis protein  31.13 
 
 
326 aa  92  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0845124  normal  0.636847 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0663  cobalamin biosynthesis protein  29.68 
 
 
326 aa  88.6  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1721  adenosylcobinamide-phosphate synthase  26.72 
 
 
319 aa  84  0.000000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1131  cobalamin biosynthesis protein CobD  26.95 
 
 
351 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2209  cobalamin biosynthesis protein  26.71 
 
 
323 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2287  cobalamin biosynthesis protein  31.36 
 
 
313 aa  80.9  0.00000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.731902  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1113  cobalamin biosynthesis protein  22.87 
 
 
315 aa  80.1  0.00000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.386524  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1294  cobalamin biosynthesis protein  21.84 
 
 
315 aa  75.5  0.000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.392516  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1514  cobalamin biosynthesis protein  28.31 
 
 
325 aa  73.6  0.000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1305  cobalamin biosynthesis protein CobD  27.39 
 
 
321 aa  72.8  0.000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1424  adenosylcobinamide-phosphate synthase  25.23 
 
 
306 aa  72  0.00000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0419  cobalamin biosynthesis protein  27.68 
 
 
324 aa  71.2  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1857  cobalamin biosynthesis protein CobD  31.15 
 
 
308 aa  70.1  0.00000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0483  cobalamin biosynthesis protein  27.14 
 
 
314 aa  68.6  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1738  cobalamin biosynthesis protein CobD  26.49 
 
 
322 aa  67.4  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0463068 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0301  cobalamin biosynthesis protein CobD  25.29 
 
 
313 aa  67  0.0000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3555  cobalamin biosynthesis protein  30.77 
 
 
333 aa  65.9  0.0000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2090  adenosylcobinamide-phosphate synthase  27.16 
 
 
331 aa  65.9  0.0000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>