274 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1721 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_1721  adenosylcobinamide-phosphate synthase  100 
 
 		 319 aa  660    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2210  cobalamin biosynthesis protein  44.84 
 
 		 319 aa  260  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.265457  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2369  cobalamin biosynthesis protein  44.84 
 
 		 319 aa  260  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2203  cobalamin biosynthesis protein  44.52 
 
 		 319 aa  259  4e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2256  cobalamin biosynthesis protein  45.16 
 
 		 319 aa  259  5.0000000000000005e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.853927  normal  0.381632 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2156  cobalamin biosynthesis protein  44.52 
 
 		 319 aa  257  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0301  cobalamin biosynthesis protein CobD  42.77 
 
 		 313 aa  254  1.0000000000000001e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1286  cobalamin biosynthesis protein CobD  40.13 
 
 		 320 aa  252  8.000000000000001e-66  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.726575  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1931  cobalamin biosynthesis protein CobD  41.48 
 
 		 313 aa  249  5e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1113  cobalamin biosynthesis protein  42.12 
 
 		 315 aa  247  1e-64  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.386524  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1110  cobalamin biosynthesis protein CobD  43.13 
 
 		 339 aa  247  2e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1294  cobalamin biosynthesis protein  41.72 
 
 		 315 aa  245  8e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.392516  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0042  cobalamin biosynthesis protein CobD  43.51 
 
 		 328 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1019  cobalamin biosynthesis protein CobD  42.02 
 
 		 308 aa  237  2e-61  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2389  cobalamin biosynthesis protein CobD  41.12 
 
 		 357 aa  228  1e-58  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1099  adenosylcobinamide-phosphate synthase  41.04 
 
 		 320 aa  223  2e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0483  cobalamin biosynthesis protein  39.38 
 
 		 314 aa  223  3e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3604  cobalamin biosynthesis protein CobD  42.03 
 
 		 319 aa  223  3e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21170  cobalamin biosynthesis protein CobD  39 
 
 		 323 aa  223  4.9999999999999996e-57  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0486  adenosylcobinamide-phosphate synthase  44.96 
 
 		 318 aa  219  6e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3538  cobalamin biosynthesis protein CobD  41.9 
 
 		 319 aa  218  8.999999999999998e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1738  cobalamin biosynthesis protein CobD  38.14 
 
 		 322 aa  216  2.9999999999999998e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0463068 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1514  cobalamin biosynthesis protein  38.16 
 
 		 325 aa  212  7e-54  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2209  cobalamin biosynthesis protein  39.37 
 
 		 323 aa  212  9e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0419  cobalamin biosynthesis protein  38.03 
 
 		 324 aa  211  1e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1305  cobalamin biosynthesis protein CobD  38.46 
 
 		 321 aa  209  4e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0870  cobalamin biosynthesis protein CobD  42.05 
 
 		 323 aa  208  9e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3553  cobalamin biosynthesis protein CobD  41.2 
 
 		 315 aa  206  6e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0341108  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2990  cobalamin biosynthesis protein CobD  43.28 
 
 		 320 aa  205  7e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.168567  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1468  cobalamin biosynthesis protein CobD  36.74 
 
 		 318 aa  204  1e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1267  cobalamin biosynthesis protein  36.86 
 
 		 324 aa  203  4e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5371  cobalamin biosynthesis protein CobD  36.69 
 
 		 301 aa  203  4e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4469  cobalamin biosynthesis protein CobD  35.71 
 
 		 317 aa  202  6e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.277077  normal  0.0655318 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2704  cobalamin biosynthesis protein CobD  39.6 
 
 		 315 aa  200  1.9999999999999998e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1233  cobalamin biosynthesis protein CobD  36.89 
 
 		 321 aa  200  3e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1847  cobalamin biosynthesis protein CobD  37.17 
 
 		 319 aa  199  5e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0633  cobalamin biosynthesis protein CobD  35.28 
 
 		 323 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0420011  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1119  cobalamin biosynthesis protein  38.05 
 
 		 317 aa  196  5.000000000000001e-49  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3092  cobalamin biosynthesis protein CobD  40.26 
 
 		 336 aa  195  7e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.423715  hitchhiker  0.00432553 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0940  cobalamin biosynthesis protein CobD  36.06 
 
 		 324 aa  194  2e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.185008 
 
 
-
 
NC_002950  PG1159  cobalamin biosynthesis protein CbiB  37.14 
 
 		 336 aa  192  4e-48  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0757  cobalamin biosynthesis protein  35.08 
 
 		 321 aa  192  4e-48  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.463156  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1068  cobalamin biosynthesis protein  34.82 
 
 		 321 aa  187  3e-46  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.882793  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1441  cobalamin biosynthesis protein CobD  36.97 
 
 		 329 aa  185  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3744  cobalamin biosynthesis protein CobD  36.31 
 
 		 323 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00858099  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3127  cobalamin biosynthesis protein  34.15 
 
 		 320 aa  182  7e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1861  cobalamin biosynthesis protein  34.44 
 
 		 330 aa  182  7e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.130243 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3857  cobalamin biosynthesis protein CobD  34.3 
 
 		 327 aa  179  4e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.932338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3805  cobalamin biosynthesis protein CobD  34.3 
 
 		 327 aa  179  4e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0790  cobalamin biosynthesis protein CobD  34.75 
 
 		 323 aa  177  1e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0828155  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1138  cobalamin biosynthesis protein  33.66 
 
 		 320 aa  178  1e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.200777 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3150  adenosylcobinamide-phosphate synthase  32.93 
 
 		 351 aa  177  2e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000125584  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1266  cobalamin biosynthesis protein  35.65 
 
 		 319 aa  177  3e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3273  cobalamin biosynthesis protein CobD  37.45 
 
 		 330 aa  176  4e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00284027 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2363  cobalamin biosynthesis protein  35.16 
 
 		 326 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.764656  normal  0.0402118 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2121  cobalamin biosynthesis protein  36.12 
 
 		 326 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.373169  hitchhiker  0.00319539 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2178  cobalamin biosynthesis protein CobD  37.37 
 
 		 316 aa  175  9.999999999999999e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2087  cobalamin biosynthesis protein CobD  38.08 
 
 		 311 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1441  cobalamin biosynthesis protein  34.84 
 
 		 325 aa  174  1.9999999999999998e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.282346  normal  0.506208 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3929  cobalamin biosynthesis protein  33.55 
 
 		 332 aa  172  9e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.512317  normal  0.0681298 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3678  cobalamin biosynthesis protein  33.22 
 
 		 302 aa  171  2e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.035544 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2090  adenosylcobinamide-phosphate synthase  34.29 
 
 		 331 aa  171  2e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0430  adenosylcobinamide-phosphate synthase  37.01 
 
 		 311 aa  168  9e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0324  adenosylcobinamide-phosphate synthase  36.93 
 
 		 316 aa  168  9e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2355  cobalamin biosynthesis protein CobD  36.65 
 
 		 311 aa  168  1e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1711  cobalamin biosynthesis protein CobD  33.55 
 
 		 302 aa  167  2e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3555  cobalamin biosynthesis protein  34.18 
 
 		 333 aa  167  2e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0735  cobalamin biosynthesis protein CobD  36.15 
 
 		 323 aa  166  4e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1675  cobalamin biosynthesis protein  32.89 
 
 		 307 aa  165  8e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.653042  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1274  cobalamin biosynthesis protein  33.22 
 
 		 302 aa  165  8e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.272014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1644  cobalamin biosynthesis protein  34.84 
 
 		 302 aa  165  9e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.29794  normal  0.0167016 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1529  adenosylcobinamide-phosphate synthase  33.92 
 
 		 317 aa  165  9e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.292471  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1583  cobalamin biosynthesis protein CobD  32.3 
 
 		 323 aa  164  1.0000000000000001e-39  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1234  cobalamin biosynthesis protein  33.55 
 
 		 302 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.778235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4044  cobalamin biosynthesis protein  32.89 
 
 		 302 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3382  adenosylcobinamide-phosphate synthase  38.35 
 
 		 336 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0114495  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7401  adenosylcobinamide-phosphate synthase  34.55 
 
 		 369 aa  163  4.0000000000000004e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0388  cobalamin biosynthesis protein CobD  32.9 
 
 		 337 aa  162  9e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3137  adenosylcobinamide-phosphate synthase  34.47 
 
 		 323 aa  160  2e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3631  cobalamin biosynthesis protein CobD  33.57 
 
 		 310 aa  159  4e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0416966  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1287  cobalamin biosynthesis protein CobD  33.45 
 
 		 325 aa  159  5e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0123328  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1743  cobalamin biosynthesis protein  35.36 
 
 		 317 aa  159  7e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.22977  normal  0.192923 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47730  cobalamin biosynthesis protein  35.23 
 
 		 312 aa  159  7e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.452767  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0833  cobalamin biosynthesis protein CbiB  32.01 
 
 		 374 aa  158  1e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0399526 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4115  cobalamin biosynthesis protein  35.23 
 
 		 312 aa  157  2e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33100  cobalamin biosynthesis protein  34.24 
 
 		 302 aa  157  3e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00042631  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12265  cobalamin biosynthesis protein  33.11 
 
 		 313 aa  156  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1891  cobalamin biosynthesis protein  36.1 
 
 		 327 aa  155  1e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3779  cobalamin biosynthesis protein CobD  35.41 
 
 		 323 aa  154  2e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.975904  normal  0.744686 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3443  cobalamin biosynthesis protein CobD  32.03 
 
 		 295 aa  154  2e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.10368  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2621  cobalamin biosynthesis protein  35.13 
 
 		 323 aa  153  4e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.246707  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1294  cobalamin biosynthesis protein  36.56 
 
 		 331 aa  153  5e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_592  adenosylcobinamide-phosphate synthase  33.93 
 
 		 308 aa  152  8.999999999999999e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2585  cobalamin biosynthesis protein  36.84 
 
 		 303 aa  152  8.999999999999999e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.650377  hitchhiker  0.000040763 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17720  adenosylcobinamide-phosphate synthase  33.33 
 
 		 332 aa  151  1e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.213248  normal  0.925164 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1458  cobalamin biosynthesis protein CobD  34.17 
 
 		 300 aa  151  1e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.862014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1256  cobalamin biosynthesis protein  36.56 
 
 		 331 aa  152  1e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.252791  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0654  cobalamin biosynthesis protein CobD  33.93 
 
 		 308 aa  151  2e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0688  cobalamin biosynthesis protein CobD  33.93 
 
 		 308 aa  151  2e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0418  cobalamin biosynthesis protein CobD  32.39 
 
 		 332 aa  150  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.984045  normal  0.740708 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>