274 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_3127 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_3127  cobalamin biosynthesis protein  100 
 
 		 320 aa  642    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2178  cobalamin biosynthesis protein CobD  73.16 
 
 		 316 aa  449  1e-125  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1861  cobalamin biosynthesis protein  62.61 
 
 		 330 aa  406  1.0000000000000001e-112  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.130243 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1441  cobalamin biosynthesis protein CobD  65.06 
 
 		 329 aa  404  1e-111  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3805  cobalamin biosynthesis protein CobD  62.03 
 
 		 327 aa  386  1e-106  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3857  cobalamin biosynthesis protein CobD  62.03 
 
 		 327 aa  386  1e-106  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.932338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0418  cobalamin biosynthesis protein CobD  63.61 
 
 		 332 aa  353  2.9999999999999997e-96  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.984045  normal  0.740708 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1441  cobalamin biosynthesis protein  56.96 
 
 		 325 aa  342  4e-93  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.282346  normal  0.506208 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0301  cobalamin biosynthesis protein CobD  40.45 
 
 		 313 aa  232  8.000000000000001e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1931  cobalamin biosynthesis protein CobD  40.07 
 
 		 313 aa  229  5e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2209  cobalamin biosynthesis protein  42.43 
 
 		 323 aa  225  1e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0419  cobalamin biosynthesis protein  43.37 
 
 		 324 aa  224  2e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1113  cobalamin biosynthesis protein  37.66 
 
 		 315 aa  212  7.999999999999999e-54  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.386524  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0483  cobalamin biosynthesis protein  41.32 
 
 		 314 aa  210  2e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1294  cobalamin biosynthesis protein  37.34 
 
 		 315 aa  208  8e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.392516  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2704  cobalamin biosynthesis protein CobD  39.45 
 
 		 315 aa  207  3e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3553  cobalamin biosynthesis protein CobD  43.75 
 
 		 315 aa  207  3e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0341108  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0757  cobalamin biosynthesis protein  39.56 
 
 		 321 aa  206  6e-52  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.463156  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1305  cobalamin biosynthesis protein CobD  39.46 
 
 		 321 aa  203  4e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1233  cobalamin biosynthesis protein CobD  38.46 
 
 		 321 aa  202  7e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2990  cobalamin biosynthesis protein CobD  41.75 
 
 		 320 aa  202  8e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.168567  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1468  cobalamin biosynthesis protein CobD  42.86 
 
 		 318 aa  202  9e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2203  cobalamin biosynthesis protein  38.54 
 
 		 319 aa  201  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2369  cobalamin biosynthesis protein  38.22 
 
 		 319 aa  201  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0042  cobalamin biosynthesis protein CobD  43.14 
 
 		 328 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2210  cobalamin biosynthesis protein  38.22 
 
 		 319 aa  201  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.265457  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2156  cobalamin biosynthesis protein  39.03 
 
 		 319 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1119  cobalamin biosynthesis protein  38.34 
 
 		 317 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2256  cobalamin biosynthesis protein  37.9 
 
 		 319 aa  199  3.9999999999999996e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.853927  normal  0.381632 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3092  cobalamin biosynthesis protein CobD  41.61 
 
 		 336 aa  199  5e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.423715  hitchhiker  0.00432553 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0486  adenosylcobinamide-phosphate synthase  41.75 
 
 		 318 aa  199  5e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1138  cobalamin biosynthesis protein  36.83 
 
 		 320 aa  199  6e-50  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.200777 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1514  cobalamin biosynthesis protein  37.14 
 
 		 325 aa  193  4e-48  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0870  cobalamin biosynthesis protein CobD  39.37 
 
 		 323 aa  192  6e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1099  adenosylcobinamide-phosphate synthase  38.96 
 
 		 320 aa  192  8e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13641  putative cobalamin biosynthetic protein  38.05 
 
 		 329 aa  192  9e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  decreased coverage  0.00725389  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1551  cobalamin biosynthesis protein CbiB  39.56 
 
 		 326 aa  191  1e-47  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.529167  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1738  cobalamin biosynthesis protein CobD  38.82 
 
 		 322 aa  191  2e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0463068 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3604  cobalamin biosynthesis protein CobD  41.14 
 
 		 319 aa  189  4e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1019  cobalamin biosynthesis protein CobD  33.97 
 
 		 308 aa  189  7e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0882  adenosylcobinamide-phosphate synthase  35.43 
 
 		 315 aa  187  1e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.736703  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1266  cobalamin biosynthesis protein  38.63 
 
 		 319 aa  187  2e-46  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1068  cobalamin biosynthesis protein  36.79 
 
 		 321 aa  186  4e-46  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.882793  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1286  cobalamin biosynthesis protein CobD  36.7 
 
 		 320 aa  184  2.0000000000000003e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.726575  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1267  cobalamin biosynthesis protein  37.67 
 
 		 324 aa  184  2.0000000000000003e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3538  cobalamin biosynthesis protein CobD  41.53 
 
 		 319 aa  183  3e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1721  adenosylcobinamide-phosphate synthase  34.46 
 
 		 319 aa  180  2.9999999999999997e-44  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20061  putative cobalamin biosynthetic protein  41.83 
 
 		 302 aa  180  4e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.785313 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1847  cobalamin biosynthesis protein CobD  38.46 
 
 		 319 aa  178  1e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21170  cobalamin biosynthesis protein CobD  36.66 
 
 		 323 aa  177  2e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1110  cobalamin biosynthesis protein CobD  33.44 
 
 		 339 aa  177  2e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17371  putative cobalamin biosynthetic protein  36.09 
 
 		 314 aa  175  8e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0838  adenosylcobinamide-phosphate synthase  40.38 
 
 		 348 aa  174  1.9999999999999998e-42  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00314316 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0940  cobalamin biosynthesis protein CobD  33.64 
 
 		 324 aa  168  1e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.185008 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2090  adenosylcobinamide-phosphate synthase  36.62 
 
 		 331 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15021  putative cobalamin biosynthetic protein  32.83 
 
 		 337 aa  163  3e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4469  cobalamin biosynthesis protein CobD  33.55 
 
 		 317 aa  159  6e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.277077  normal  0.0655318 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2389  cobalamin biosynthesis protein CobD  31.45 
 
 		 357 aa  156  4e-37  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15151  putative cobalamin biosynthetic protein  32.4 
 
 		 339 aa  156  4e-37  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.216618  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14771  putative cobalamin biosynthetic protein  32.82 
 
 		 337 aa  154  2e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6127  cobalamin biosynthesis protein CobD  37.24 
 
 		 314 aa  154  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00302618  hitchhiker  0.00095084 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0624  adenosylcobinamide-phosphate synthase  31.75 
 
 		 308 aa  153  4e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.373431  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0654  cobalamin biosynthesis protein CobD  31.55 
 
 		 308 aa  152  5.9999999999999996e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0688  cobalamin biosynthesis protein CobD  31.55 
 
 		 308 aa  152  5.9999999999999996e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1413  adenosylcobinamide-phosphate synthase  31.85 
 
 		 339 aa  151  1e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_592  adenosylcobinamide-phosphate synthase  30.91 
 
 		 308 aa  150  2e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1583  cobalamin biosynthesis protein CobD  29.87 
 
 		 323 aa  149  7e-35  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5371  cobalamin biosynthesis protein CobD  32.43 
 
 		 301 aa  149  9e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0790  cobalamin biosynthesis protein CobD  36.36 
 
 		 323 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0828155  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3929  cobalamin biosynthesis protein  34.19 
 
 		 332 aa  148  1.0000000000000001e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.512317  normal  0.0681298 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2715  cobalamin biosynthesis protein CobD  33.75 
 
 		 310 aa  147  2.0000000000000003e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0633  cobalamin biosynthesis protein CobD  32.06 
 
 		 323 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0420011  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3744  cobalamin biosynthesis protein CobD  33.98 
 
 		 323 aa  147  3e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00858099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7401  adenosylcobinamide-phosphate synthase  33.44 
 
 		 369 aa  147  3e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3555  cobalamin biosynthesis protein  33.55 
 
 		 333 aa  146  4.0000000000000006e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3150  adenosylcobinamide-phosphate synthase  26.73 
 
 		 351 aa  145  9e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000125584  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1287  cobalamin biosynthesis protein CobD  35.07 
 
 		 325 aa  145  1e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0123328  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3677  cobalamin biosynthesis protein CobD  32.7 
 
 		 330 aa  143  4e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.544295 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2087  cobalamin biosynthesis protein CobD  31.05 
 
 		 311 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0295  cobalamin biosynthesis protein CobD  31.15 
 
 		 316 aa  141  9.999999999999999e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0430  adenosylcobinamide-phosphate synthase  31.05 
 
 		 311 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3454  adenosylcobinamide-phosphate synthase  33.94 
 
 		 328 aa  140  3e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.868099  normal  0.111955 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2886  cobalamin biosynthesis protein  32 
 
 		 340 aa  139  4.999999999999999e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0800022  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1159  cobalamin biosynthesis protein CbiB  31.92 
 
 		 336 aa  139  7e-32  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3624  cobalamin biosynthesis protein  31.31 
 
 		 317 aa  139  7e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.69655  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0324  adenosylcobinamide-phosphate synthase  32.15 
 
 		 316 aa  139  7.999999999999999e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47730  cobalamin biosynthesis protein  35.37 
 
 		 312 aa  139  8.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.452767  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2576  cobalamin biosynthesis protein CobD  33.22 
 
 		 317 aa  138  1e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0140  cobalamin biosynthesis protein  33.55 
 
 		 304 aa  138  1e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3443  cobalamin biosynthesis protein CobD  32.79 
 
 		 295 aa  138  1e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.10368  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0555  cobalamin biosynthesis protein CobD  31.86 
 
 		 311 aa  138  1e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4115  cobalamin biosynthesis protein  35.05 
 
 		 312 aa  137  2e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0370  cobalamin biosynthesis protein  32.57 
 
 		 319 aa  138  2e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.527036  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2885  adenosylcobinamide-phosphate synthase  38.18 
 
 		 291 aa  136  5e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2886  cobalamin biosynthesis protein CobD  36.15 
 
 		 323 aa  136  6.0000000000000005e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2355  cobalamin biosynthesis protein CobD  32.75 
 
 		 311 aa  135  8e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1743  cobalamin biosynthesis protein  33.68 
 
 		 317 aa  135  9e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.22977  normal  0.192923 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1005  cobalamin biosynthesis protein CobD  35.33 
 
 		 320 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0561  cobalamin biosynthesis protein CobD  38.65 
 
 		 318 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0872  cobalamin biosynthesis protein CobD  37.38 
 
 		 315 aa  133  3e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>