227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9515_14771 on replicon NC_008817
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9515



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008817  P9515_14771  putative cobalamin biosynthetic protein  100 
 
 
337 aa  662    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15021  putative cobalamin biosynthetic protein  72.54 
 
 
337 aa  504  1e-141  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15151  putative cobalamin biosynthetic protein  72.09 
 
 
339 aa  491  9.999999999999999e-139  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.216618  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1413  adenosylcobinamide-phosphate synthase  71.83 
 
 
339 aa  485  1e-136  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1551  cobalamin biosynthesis protein CbiB  35.17 
 
 
326 aa  228  9e-59  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.529167  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0882  adenosylcobinamide-phosphate synthase  39.94 
 
 
315 aa  213  2.9999999999999995e-54  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.736703  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13641  putative cobalamin biosynthetic protein  36.09 
 
 
329 aa  197  3e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  decreased coverage  0.00725389  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17371  putative cobalamin biosynthetic protein  38.06 
 
 
314 aa  194  2e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0838  adenosylcobinamide-phosphate synthase  35.91 
 
 
348 aa  191  1e-47  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00314316 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1441  cobalamin biosynthesis protein CobD  34.76 
 
 
329 aa  181  1e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20061  putative cobalamin biosynthetic protein  33.89 
 
 
302 aa  176  6e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.785313 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3857  cobalamin biosynthesis protein CobD  35.15 
 
 
327 aa  167  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.932338  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3805  cobalamin biosynthesis protein CobD  35.15 
 
 
327 aa  166  4e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1861  cobalamin biosynthesis protein  32.46 
 
 
330 aa  155  1e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.130243 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3127  cobalamin biosynthesis protein  32.82 
 
 
320 aa  154  2.9999999999999998e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2178  cobalamin biosynthesis protein CobD  30.36 
 
 
316 aa  144  2e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0042  cobalamin biosynthesis protein CobD  29.55 
 
 
328 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1119  cobalamin biosynthesis protein  29.03 
 
 
317 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2704  cobalamin biosynthesis protein CobD  31.76 
 
 
315 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4469  cobalamin biosynthesis protein CobD  32.67 
 
 
317 aa  139  6e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.277077  normal  0.0655318 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0418  cobalamin biosynthesis protein CobD  30.07 
 
 
332 aa  139  7e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.984045  normal  0.740708 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1441  cobalamin biosynthesis protein  31.35 
 
 
325 aa  139  7e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.282346  normal  0.506208 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1468  cobalamin biosynthesis protein CobD  29.09 
 
 
318 aa  139  7.999999999999999e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5371  cobalamin biosynthesis protein CobD  30.09 
 
 
301 aa  137  2e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1233  cobalamin biosynthesis protein CobD  30.41 
 
 
321 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0870  cobalamin biosynthesis protein CobD  31.41 
 
 
323 aa  132  6e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1294  cobalamin biosynthesis protein  35.02 
 
 
315 aa  130  3e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.392516  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1099  adenosylcobinamide-phosphate synthase  26.46 
 
 
320 aa  130  4.0000000000000003e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1738  cobalamin biosynthesis protein CobD  28.48 
 
 
322 aa  129  5.0000000000000004e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0463068 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0633  cobalamin biosynthesis protein CobD  27.06 
 
 
323 aa  129  8.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0420011  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1113  cobalamin biosynthesis protein  33.75 
 
 
315 aa  129  1.0000000000000001e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.386524  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3092  cobalamin biosynthesis protein CobD  34.15 
 
 
336 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.423715  hitchhiker  0.00432553 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1721  adenosylcobinamide-phosphate synthase  28.78 
 
 
319 aa  129  1.0000000000000001e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2990  cobalamin biosynthesis protein CobD  28.98 
 
 
320 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.168567  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3604  cobalamin biosynthesis protein CobD  26.69 
 
 
319 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2156  cobalamin biosynthesis protein  26.81 
 
 
319 aa  126  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1159  cobalamin biosynthesis protein CbiB  28.4 
 
 
336 aa  125  7e-28  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0757  cobalamin biosynthesis protein  27.97 
 
 
321 aa  125  9e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.463156  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2203  cobalamin biosynthesis protein  27.58 
 
 
319 aa  125  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2369  cobalamin biosynthesis protein  27.16 
 
 
319 aa  124  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2210  cobalamin biosynthesis protein  27.16 
 
 
319 aa  124  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.265457  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2256  cobalamin biosynthesis protein  27.73 
 
 
319 aa  124  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.853927  normal  0.381632 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0301  cobalamin biosynthesis protein CobD  29.75 
 
 
313 aa  124  3e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0486  adenosylcobinamide-phosphate synthase  28.48 
 
 
318 aa  123  4e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0555  cobalamin biosynthesis protein CobD  28.91 
 
 
311 aa  123  4e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0483  cobalamin biosynthesis protein  28.21 
 
 
314 aa  123  5e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1266  cobalamin biosynthesis protein  28.53 
 
 
319 aa  123  5e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1286  cobalamin biosynthesis protein CobD  28.14 
 
 
320 aa  123  5e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.726575  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0790  cobalamin biosynthesis protein CobD  29.63 
 
 
323 aa  122  9e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0828155  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2209  cobalamin biosynthesis protein  29.45 
 
 
323 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1931  cobalamin biosynthesis protein CobD  28.3 
 
 
313 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1847  cobalamin biosynthesis protein CobD  25.62 
 
 
319 aa  120  1.9999999999999998e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3744  cobalamin biosynthesis protein CobD  28.22 
 
 
323 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00858099  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1068  cobalamin biosynthesis protein  27.55 
 
 
321 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.882793  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1019  cobalamin biosynthesis protein CobD  29.09 
 
 
308 aa  120  3e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3538  cobalamin biosynthesis protein CobD  26.43 
 
 
319 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21170  cobalamin biosynthesis protein CobD  30.1 
 
 
323 aa  119  6e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1305  cobalamin biosynthesis protein CobD  29.06 
 
 
321 aa  119  7e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1514  cobalamin biosynthesis protein  28.35 
 
 
325 aa  119  9e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1005  cobalamin biosynthesis protein CobD  26.4 
 
 
320 aa  116  5e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7401  adenosylcobinamide-phosphate synthase  26.62 
 
 
369 aa  115  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0833  cobalamin biosynthesis protein CbiB  27.18 
 
 
374 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0399526 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3553  cobalamin biosynthesis protein CobD  28.12 
 
 
315 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0341108  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1267  cobalamin biosynthesis protein  29.31 
 
 
324 aa  114  3e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0940  cobalamin biosynthesis protein CobD  30.25 
 
 
324 aa  113  5e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.185008 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2886  cobalamin biosynthesis protein CobD  25.16 
 
 
323 aa  112  7.000000000000001e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3678  cobalamin biosynthesis protein  24.92 
 
 
302 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.035544 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0370  cobalamin biosynthesis protein  28.25 
 
 
319 aa  111  1.0000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.527036  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2389  cobalamin biosynthesis protein CobD  28.57 
 
 
357 aa  110  3e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2576  cobalamin biosynthesis protein CobD  25 
 
 
317 aa  108  9.000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0419  cobalamin biosynthesis protein  25 
 
 
324 aa  108  1e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1138  cobalamin biosynthesis protein  25.08 
 
 
320 aa  108  1e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.200777 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1529  adenosylcobinamide-phosphate synthase  25.56 
 
 
317 aa  108  1e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.292471  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3273  cobalamin biosynthesis protein CobD  28.7 
 
 
330 aa  108  2e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00284027 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0735  cobalamin biosynthesis protein CobD  26.28 
 
 
323 aa  108  2e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1583  cobalamin biosynthesis protein CobD  30.3 
 
 
323 aa  108  2e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2585  cobalamin biosynthesis protein  25.94 
 
 
303 aa  107  3e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.650377  hitchhiker  0.000040763 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1711  cobalamin biosynthesis protein CobD  24.3 
 
 
302 aa  107  4e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2355  cobalamin biosynthesis protein CobD  30.28 
 
 
311 aa  107  4e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1110  cobalamin biosynthesis protein CobD  29.15 
 
 
339 aa  105  8e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1891  cobalamin biosynthesis protein  29.14 
 
 
327 aa  105  1e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2621  cobalamin biosynthesis protein  27.91 
 
 
323 aa  104  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.246707  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2087  cobalamin biosynthesis protein CobD  30.64 
 
 
311 aa  104  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0430  adenosylcobinamide-phosphate synthase  30.64 
 
 
311 aa  103  3e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1675  cobalamin biosynthesis protein  25.37 
 
 
307 aa  103  4e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.653042  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2363  cobalamin biosynthesis protein  30.57 
 
 
326 aa  103  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.764656  normal  0.0402118 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1644  cobalamin biosynthesis protein  24.76 
 
 
302 aa  103  5e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.29794  normal  0.0167016 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4044  cobalamin biosynthesis protein  29.7 
 
 
302 aa  102  7e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3102  cobalamin biosynthesis protein CobD  22.73 
 
 
330 aa  102  8e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0194792  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0388  cobalamin biosynthesis protein CobD  31.72 
 
 
337 aa  102  9e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1743  cobalamin biosynthesis protein  29.67 
 
 
317 aa  101  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.22977  normal  0.192923 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0271  cobalamin biosynthesis protein  31.77 
 
 
319 aa  102  1e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2715  cobalamin biosynthesis protein CobD  26.4 
 
 
310 aa  101  2e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0846  cobalamin biosynthesis protein  29.7 
 
 
314 aa  101  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2205  cobalamin biosynthesis protein  28.44 
 
 
313 aa  101  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0351195  normal  0.625062 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2121  cobalamin biosynthesis protein  30.57 
 
 
326 aa  101  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.373169  hitchhiker  0.00319539 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12265  cobalamin biosynthesis protein  23.91 
 
 
313 aa  100  3e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2090  adenosylcobinamide-phosphate synthase  29.1 
 
 
331 aa  100  3e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1256  cobalamin biosynthesis protein  29.1 
 
 
331 aa  100  3e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.252791  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1837  cobalamin biosynthesis protein  29.86 
 
 
312 aa  100  5e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.41199  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>