274 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_0870 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_0870  cobalamin biosynthesis protein CobD  100 
 
 		 323 aa  639    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0042  cobalamin biosynthesis protein CobD  60.26 
 
 		 328 aa  335  5.999999999999999e-91  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2990  cobalamin biosynthesis protein CobD  62.02 
 
 		 320 aa  328  8e-89  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.168567  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0486  adenosylcobinamide-phosphate synthase  60.96 
 
 		 318 aa  328  1.0000000000000001e-88  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3604  cobalamin biosynthesis protein CobD  55.73 
 
 		 319 aa  301  1e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3538  cobalamin biosynthesis protein CobD  57.82 
 
 		 319 aa  293  3e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3553  cobalamin biosynthesis protein CobD  50 
 
 		 315 aa  275  8e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0341108  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0301  cobalamin biosynthesis protein CobD  48.15 
 
 		 313 aa  275  9e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1931  cobalamin biosynthesis protein CobD  47.47 
 
 		 313 aa  270  2.9999999999999997e-71  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0483  cobalamin biosynthesis protein  49.15 
 
 		 314 aa  262  6.999999999999999e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2210  cobalamin biosynthesis protein  47.94 
 
 		 319 aa  254  1.0000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.265457  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2369  cobalamin biosynthesis protein  47.94 
 
 		 319 aa  254  1.0000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2256  cobalamin biosynthesis protein  47.94 
 
 		 319 aa  253  3e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.853927  normal  0.381632 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2156  cobalamin biosynthesis protein  47.94 
 
 		 319 aa  253  3e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1113  cobalamin biosynthesis protein  46.59 
 
 		 315 aa  252  5.000000000000001e-66  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.386524  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2203  cobalamin biosynthesis protein  47.62 
 
 		 319 aa  252  6e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1294  cobalamin biosynthesis protein  46.24 
 
 		 315 aa  249  5e-65  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.392516  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21170  cobalamin biosynthesis protein CobD  44.05 
 
 		 323 aa  248  1e-64  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1110  cobalamin biosynthesis protein CobD  43.1 
 
 		 339 aa  246  4e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2209  cobalamin biosynthesis protein  45.55 
 
 		 323 aa  245  6e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1738  cobalamin biosynthesis protein CobD  47.3 
 
 		 322 aa  244  1.9999999999999999e-63  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0463068 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1286  cobalamin biosynthesis protein CobD  43.62 
 
 		 320 aa  242  6e-63  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.726575  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3092  cobalamin biosynthesis protein CobD  46.67 
 
 		 336 aa  239  2.9999999999999997e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.423715  hitchhiker  0.00432553 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2704  cobalamin biosynthesis protein CobD  44.41 
 
 		 315 aa  231  1e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1119  cobalamin biosynthesis protein  42.39 
 
 		 317 aa  231  2e-59  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0419  cobalamin biosynthesis protein  48.78 
 
 		 324 aa  229  3e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2389  cobalamin biosynthesis protein CobD  43.52 
 
 		 357 aa  229  5e-59  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1138  cobalamin biosynthesis protein  43.3 
 
 		 320 aa  228  7e-59  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.200777 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1266  cobalamin biosynthesis protein  43.29 
 
 		 319 aa  228  1e-58  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1267  cobalamin biosynthesis protein  44.48 
 
 		 324 aa  225  6e-58  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1019  cobalamin biosynthesis protein CobD  40.32 
 
 		 308 aa  223  4.9999999999999996e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0757  cobalamin biosynthesis protein  40.65 
 
 		 321 aa  220  3e-56  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.463156  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1305  cobalamin biosynthesis protein CobD  40.2 
 
 		 321 aa  217  2.9999999999999998e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4469  cobalamin biosynthesis protein CobD  41.69 
 
 		 317 aa  217  2.9999999999999998e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.277077  normal  0.0655318 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1068  cobalamin biosynthesis protein  41.14 
 
 		 321 aa  214  9.999999999999999e-55  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.882793  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1514  cobalamin biosynthesis protein  41.1 
 
 		 325 aa  213  2.9999999999999995e-54  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1099  adenosylcobinamide-phosphate synthase  42.81 
 
 		 320 aa  212  4.9999999999999996e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1721  adenosylcobinamide-phosphate synthase  42.12 
 
 		 319 aa  211  2e-53  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1847  cobalamin biosynthesis protein CobD  43 
 
 		 319 aa  204  1e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0633  cobalamin biosynthesis protein CobD  40.85 
 
 		 323 aa  203  3e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0420011  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1287  cobalamin biosynthesis protein CobD  43.75 
 
 		 325 aa  202  5e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0123328  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1468  cobalamin biosynthesis protein CobD  41.11 
 
 		 318 aa  202  6e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3127  cobalamin biosynthesis protein  39.46 
 
 		 320 aa  201  1.9999999999999998e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3150  adenosylcobinamide-phosphate synthase  35.83 
 
 		 351 aa  200  3e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000125584  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0790  cobalamin biosynthesis protein CobD  41.1 
 
 		 323 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0828155  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6127  cobalamin biosynthesis protein CobD  41.33 
 
 		 314 aa  194  2e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00302618  hitchhiker  0.00095084 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3555  cobalamin biosynthesis protein  42.8 
 
 		 333 aa  192  5e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3929  cobalamin biosynthesis protein  41.14 
 
 		 332 aa  191  2e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.512317  normal  0.0681298 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1441  cobalamin biosynthesis protein CobD  38.33 
 
 		 329 aa  190  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1233  cobalamin biosynthesis protein CobD  40.26 
 
 		 321 aa  190  2.9999999999999997e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3744  cobalamin biosynthesis protein CobD  42.6 
 
 		 323 aa  189  4e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00858099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3779  cobalamin biosynthesis protein CobD  39.8 
 
 		 323 aa  187  2e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.975904  normal  0.744686 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3857  cobalamin biosynthesis protein CobD  37.58 
 
 		 327 aa  186  3e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.932338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3805  cobalamin biosynthesis protein CobD  37.58 
 
 		 327 aa  186  4e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0418  cobalamin biosynthesis protein CobD  39.93 
 
 		 332 aa  186  4e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.984045  normal  0.740708 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1005  cobalamin biosynthesis protein CobD  39.94 
 
 		 320 aa  186  4e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3443  cobalamin biosynthesis protein CobD  42.33 
 
 		 295 aa  186  5e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.10368  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2576  cobalamin biosynthesis protein CobD  41.91 
 
 		 317 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7401  adenosylcobinamide-phosphate synthase  40.45 
 
 		 369 aa  183  3e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2178  cobalamin biosynthesis protein CobD  38.19 
 
 		 316 aa  183  3e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5371  cobalamin biosynthesis protein CobD  37.67 
 
 		 301 aa  182  6e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1441  cobalamin biosynthesis protein  39.94 
 
 		 325 aa  180  2.9999999999999997e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.282346  normal  0.506208 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2355  cobalamin biosynthesis protein CobD  44.27 
 
 		 311 aa  179  4e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0324  adenosylcobinamide-phosphate synthase  41.22 
 
 		 316 aa  179  7e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2090  adenosylcobinamide-phosphate synthase  38.32 
 
 		 331 aa  178  1e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0735  cobalamin biosynthesis protein CobD  40.71 
 
 		 323 aa  177  2e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1743  cobalamin biosynthesis protein  42.75 
 
 		 317 aa  177  2e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.22977  normal  0.192923 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2886  cobalamin biosynthesis protein  40.81 
 
 		 340 aa  177  2e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0800022  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0174  cobalamin biosynthesis protein CobD  42.96 
 
 		 316 aa  177  2e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0555  cobalamin biosynthesis protein CobD  36.13 
 
 		 311 aa  177  3e-43  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12265  cobalamin biosynthesis protein  39.05 
 
 		 313 aa  175  9e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0833  cobalamin biosynthesis protein CbiB  41.7 
 
 		 374 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0399526 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1861  cobalamin biosynthesis protein  35.31 
 
 		 330 aa  174  1.9999999999999998e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.130243 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2224  cobalamin biosynthesis protein  41.28 
 
 		 322 aa  173  3.9999999999999995e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0430  adenosylcobinamide-phosphate synthase  43.22 
 
 		 311 aa  173  3.9999999999999995e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2087  cobalamin biosynthesis protein CobD  42.86 
 
 		 311 aa  172  5e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17720  adenosylcobinamide-phosphate synthase  40.29 
 
 		 332 aa  172  7.999999999999999e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.213248  normal  0.925164 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3624  cobalamin biosynthesis protein  37.83 
 
 		 317 aa  172  7.999999999999999e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.69655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3360  cobalamin biosynthesis protein  39.55 
 
 		 344 aa  170  3e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.406666  normal  0.480267 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0561  cobalamin biosynthesis protein CobD  42.41 
 
 		 318 aa  170  3e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3349  cobalamin biosynthesis protein  39.55 
 
 		 344 aa  170  3e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3411  cobalamin biosynthesis protein  39.55 
 
 		 344 aa  170  3e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.530159 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0940  cobalamin biosynthesis protein CobD  36.56 
 
 		 324 aa  170  4e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.185008 
 
 
-
 
NC_002950  PG1159  cobalamin biosynthesis protein CbiB  35.03 
 
 		 336 aa  167  2e-40  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0008  cobalamin biosynthesis protein CobD  36.83 
 
 		 306 aa  167  2e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3273  cobalamin biosynthesis protein CobD  40.83 
 
 		 330 aa  167  2e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00284027 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0388  cobalamin biosynthesis protein CobD  40.53 
 
 		 337 aa  167  2e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2363  cobalamin biosynthesis protein  36.6 
 
 		 326 aa  166  4e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.764656  normal  0.0402118 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2121  cobalamin biosynthesis protein  38.71 
 
 		 326 aa  166  4e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.373169  hitchhiker  0.00319539 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1583  cobalamin biosynthesis protein CobD  34.42 
 
 		 323 aa  165  6.9999999999999995e-40  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2885  adenosylcobinamide-phosphate synthase  42.21 
 
 		 291 aa  165  1.0000000000000001e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2621  cobalamin biosynthesis protein  38.25 
 
 		 323 aa  163  4.0000000000000004e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.246707  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4864  cobalamin biosynthesis protein  40 
 
 		 332 aa  162  5.0000000000000005e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0377956  normal  0.399913 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2886  cobalamin biosynthesis protein CobD  41.58 
 
 		 323 aa  162  8.000000000000001e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0370  cobalamin biosynthesis protein  39.1 
 
 		 319 aa  162  9e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.527036  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2741  cobalamin biosynthesis protein CobD  39.86 
 
 		 304 aa  161  1e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0957714 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3382  adenosylcobinamide-phosphate synthase  39.93 
 
 		 336 aa  161  1e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0114495  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13641  putative cobalamin biosynthetic protein  38.54 
 
 		 329 aa  161  1e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  decreased coverage  0.00725389  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3102  cobalamin biosynthesis protein CobD  40.53 
 
 		 330 aa  160  2e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0194792  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0872  cobalamin biosynthesis protein CobD  39.23 
 
 		 315 aa  160  3e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>