261 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_0388 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_0388  cobalamin biosynthesis protein CobD  100 
 
 		 337 aa  667    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3273  cobalamin biosynthesis protein CobD  56.52 
 
 		 330 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00284027 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3137  adenosylcobinamide-phosphate synthase  54.05 
 
 		 323 aa  306  3e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4724  cobalamin biosynthesis protein CobD  56.77 
 
 		 333 aa  279  4e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0822126  normal  0.571798 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5191  cobalamin biosynthesis protein CobD  55.88 
 
 		 333 aa  278  7e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.683033 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0633  cobalamin biosynthesis protein CobD  48.48 
 
 		 323 aa  269  5e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0420011  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1351  cobalamin biosynthesis protein CobD  51.5 
 
 		 328 aa  265  7e-70  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3744  cobalamin biosynthesis protein CobD  51.92 
 
 		 323 aa  258  8e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00858099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3779  cobalamin biosynthesis protein CobD  51.86 
 
 		 323 aa  255  8e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.975904  normal  0.744686 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0790  cobalamin biosynthesis protein CobD  47 
 
 		 323 aa  255  9e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0828155  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1854  cobalamin biosynthesis protein CobD  53.72 
 
 		 329 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5263  cobalamin biosynthesis protein CobD  55.87 
 
 		 333 aa  251  1e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.758113  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5724  cobalamin biosynthesis protein CobD  56.04 
 
 		 330 aa  249  5e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.571029 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3382  adenosylcobinamide-phosphate synthase  49.84 
 
 		 336 aa  247  2e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0114495  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0324  adenosylcobinamide-phosphate synthase  47.1 
 
 		 316 aa  248  2e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2355  cobalamin biosynthesis protein CobD  50 
 
 		 311 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0735  cobalamin biosynthesis protein CobD  47.3 
 
 		 323 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2087  cobalamin biosynthesis protein CobD  50 
 
 		 311 aa  242  7.999999999999999e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1475  cobalamin biosynthesis protein CobD  54.9 
 
 		 331 aa  241  1e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.311979  hitchhiker  0.000015122 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0430  adenosylcobinamide-phosphate synthase  49.67 
 
 		 311 aa  239  5e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2621  cobalamin biosynthesis protein  45.95 
 
 		 323 aa  228  8e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.246707  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3631  cobalamin biosynthesis protein CobD  46.62 
 
 		 310 aa  228  2e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0416966  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4869  cobalamin biosynthesis protein CobD  54.24 
 
 		 323 aa  226  4e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.30299 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1891  cobalamin biosynthesis protein  50.37 
 
 		 327 aa  225  9e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2121  cobalamin biosynthesis protein  43.89 
 
 		 326 aa  222  9e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.373169  hitchhiker  0.00319539 
 
 
-
 
NC_004310  BR1294  cobalamin biosynthesis protein  47.96 
 
 		 331 aa  219  3.9999999999999997e-56  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1743  cobalamin biosynthesis protein  44.68 
 
 		 317 aa  219  6e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.22977  normal  0.192923 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2363  cobalamin biosynthesis protein  43.53 
 
 		 326 aa  217  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.764656  normal  0.0402118 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1256  cobalamin biosynthesis protein  47.62 
 
 		 331 aa  214  1.9999999999999998e-54  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.252791  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0370  cobalamin biosynthesis protein  48.56 
 
 		 319 aa  198  9e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.527036  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2585  cobalamin biosynthesis protein  46.15 
 
 		 303 aa  196  3e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.650377  hitchhiker  0.000040763 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2741  cobalamin biosynthesis protein CobD  45.77 
 
 		 304 aa  195  1e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0957714 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0419  cobalamin biosynthesis protein  40.57 
 
 		 324 aa  186  4e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1738  cobalamin biosynthesis protein CobD  39.72 
 
 		 322 aa  185  9e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0463068 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0165  cobalamin biosynthesis protein  46.49 
 
 		 303 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.890938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5371  cobalamin biosynthesis protein CobD  38.74 
 
 		 301 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2209  cobalamin biosynthesis protein  36.43 
 
 		 323 aa  180  2.9999999999999997e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1113  cobalamin biosynthesis protein  33.77 
 
 		 315 aa  177  2e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.386524  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0870  cobalamin biosynthesis protein CobD  41.09 
 
 		 323 aa  175  9.999999999999999e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1294  cobalamin biosynthesis protein  33.12 
 
 		 315 aa  173  2.9999999999999996e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.392516  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2990  cobalamin biosynthesis protein CobD  41.39 
 
 		 320 aa  173  3.9999999999999995e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.168567  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2704  cobalamin biosynthesis protein CobD  37.99 
 
 		 315 aa  173  3.9999999999999995e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3604  cobalamin biosynthesis protein CobD  40.55 
 
 		 319 aa  172  5.999999999999999e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3538  cobalamin biosynthesis protein CobD  39.86 
 
 		 319 aa  169  5e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0042  cobalamin biosynthesis protein CobD  42.86 
 
 		 328 aa  168  9e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1099  adenosylcobinamide-phosphate synthase  43.67 
 
 		 320 aa  168  1e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1305  cobalamin biosynthesis protein CobD  35.53 
 
 		 321 aa  168  1e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4469  cobalamin biosynthesis protein CobD  35.07 
 
 		 317 aa  167  2e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.277077  normal  0.0655318 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1110  cobalamin biosynthesis protein CobD  35.05 
 
 		 339 aa  167  2e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2369  cobalamin biosynthesis protein  37.79 
 
 		 319 aa  166  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2389  cobalamin biosynthesis protein CobD  37.62 
 
 		 357 aa  166  4e-40  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2210  cobalamin biosynthesis protein  37.79 
 
 		 319 aa  166  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.265457  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2203  cobalamin biosynthesis protein  37.79 
 
 		 319 aa  166  5.9999999999999996e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2256  cobalamin biosynthesis protein  37.46 
 
 		 319 aa  165  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.853927  normal  0.381632 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2156  cobalamin biosynthesis protein  37.46 
 
 		 319 aa  163  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1721  adenosylcobinamide-phosphate synthase  32.9 
 
 		 319 aa  163  4.0000000000000004e-39  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1159  cobalamin biosynthesis protein CbiB  36.27 
 
 		 336 aa  162  1e-38  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21170  cobalamin biosynthesis protein CobD  38.35 
 
 		 323 aa  161  2e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0174  cobalamin biosynthesis protein CobD  41.67 
 
 		 316 aa  159  7e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1286  cobalamin biosynthesis protein CobD  33.87 
 
 		 320 aa  158  1e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.726575  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0483  cobalamin biosynthesis protein  37.86 
 
 		 314 aa  157  2e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3553  cobalamin biosynthesis protein CobD  39.67 
 
 		 315 aa  157  4e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0341108  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0486  adenosylcobinamide-phosphate synthase  42.04 
 
 		 318 aa  155  8e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2604  cobalamin biosynthesis protein  44.12 
 
 		 366 aa  154  1e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0562249  normal  0.0827399 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1267  cobalamin biosynthesis protein  39.93 
 
 		 324 aa  155  1e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3555  cobalamin biosynthesis protein  38.25 
 
 		 333 aa  154  2.9999999999999998e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3092  cobalamin biosynthesis protein CobD  36.79 
 
 		 336 aa  153  4e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.423715  hitchhiker  0.00432553 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0301  cobalamin biosynthesis protein CobD  33.33 
 
 		 313 aa  152  5.9999999999999996e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4864  cobalamin biosynthesis protein  37.85 
 
 		 332 aa  152  7e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0377956  normal  0.399913 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1287  cobalamin biosynthesis protein CobD  36.91 
 
 		 325 aa  152  8e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0123328  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3360  cobalamin biosynthesis protein  40 
 
 		 344 aa  151  1e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.406666  normal  0.480267 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3349  cobalamin biosynthesis protein  40 
 
 		 344 aa  151  1e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3411  cobalamin biosynthesis protein  40 
 
 		 344 aa  151  1e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.530159 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1583  cobalamin biosynthesis protein CobD  30.28 
 
 		 323 aa  150  2e-35  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7401  adenosylcobinamide-phosphate synthase  36.09 
 
 		 369 aa  151  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1931  cobalamin biosynthesis protein CobD  34 
 
 		 313 aa  150  3e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3929  cobalamin biosynthesis protein  37.76 
 
 		 332 aa  150  3e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.512317  normal  0.0681298 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3624  cobalamin biosynthesis protein  37.59 
 
 		 317 aa  149  6e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.69655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1233  cobalamin biosynthesis protein CobD  36.62 
 
 		 321 aa  149  7e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3443  cobalamin biosynthesis protein CobD  36.75 
 
 		 295 aa  149  7e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.10368  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1514  cobalamin biosynthesis protein  36.5 
 
 		 325 aa  148  1.0000000000000001e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2658  cobalamin biosynthesis protein  38.43 
 
 		 326 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.869405 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1274  cobalamin biosynthesis protein  36.36 
 
 		 302 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.272014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1266  cobalamin biosynthesis protein  35.83 
 
 		 319 aa  147  3e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2885  adenosylcobinamide-phosphate synthase  44.33 
 
 		 291 aa  146  4.0000000000000006e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0940  cobalamin biosynthesis protein CobD  34.83 
 
 		 324 aa  146  6e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.185008 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1468  cobalamin biosynthesis protein CobD  34.77 
 
 		 318 aa  146  6e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2090  adenosylcobinamide-phosphate synthase  31.01 
 
 		 331 aa  145  9e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17720  adenosylcobinamide-phosphate synthase  43.1 
 
 		 332 aa  145  1e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.213248  normal  0.925164 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1644  cobalamin biosynthesis protein  36.36 
 
 		 302 aa  145  1e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.29794  normal  0.0167016 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1019  cobalamin biosynthesis protein CobD  30.52 
 
 		 308 aa  145  1e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1441  cobalamin biosynthesis protein CobD  33.44 
 
 		 329 aa  144  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3805  cobalamin biosynthesis protein CobD  33.93 
 
 		 327 aa  144  2e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1675  cobalamin biosynthesis protein  35.69 
 
 		 307 aa  144  3e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.653042  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3857  cobalamin biosynthesis protein CobD  33.93 
 
 		 327 aa  144  3e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.932338  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1119  cobalamin biosynthesis protein  39.21 
 
 		 317 aa  144  3e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6127  cobalamin biosynthesis protein CobD  40.91 
 
 		 314 aa  144  3e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00302618  hitchhiker  0.00095084 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1234  cobalamin biosynthesis protein  36.18 
 
 		 302 aa  143  4e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.778235  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33100  cobalamin biosynthesis protein  38.87 
 
 		 302 aa  143  5e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00042631  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4044  cobalamin biosynthesis protein  34.47 
 
 		 302 aa  142  7e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>