276 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2885 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_2885  adenosylcobinamide-phosphate synthase  100 
 
 		 291 aa  553  1e-156  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0174  cobalamin biosynthesis protein CobD  60.58 
 
 		 316 aa  268  5.9999999999999995e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7401  adenosylcobinamide-phosphate synthase  54.21 
 
 		 369 aa  261  1e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1287  cobalamin biosynthesis protein CobD  57.61 
 
 		 325 aa  257  2e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0123328  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17720  adenosylcobinamide-phosphate synthase  54.48 
 
 		 332 aa  255  7e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.213248  normal  0.925164 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3555  cobalamin biosynthesis protein  54.51 
 
 		 333 aa  251  9.000000000000001e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3929  cobalamin biosynthesis protein  54.51 
 
 		 332 aa  250  2e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.512317  normal  0.0681298 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0561  cobalamin biosynthesis protein CobD  57.41 
 
 		 318 aa  245  6e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6127  cobalamin biosynthesis protein CobD  58.06 
 
 		 314 aa  242  7e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00302618  hitchhiker  0.00095084 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2224  cobalamin biosynthesis protein  52.25 
 
 		 322 aa  239  4e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2715  cobalamin biosynthesis protein CobD  53.02 
 
 		 310 aa  234  2.0000000000000002e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2576  cobalamin biosynthesis protein CobD  56.93 
 
 		 317 aa  233  3e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0872  cobalamin biosynthesis protein CobD  54.01 
 
 		 315 aa  228  7e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2886  cobalamin biosynthesis protein  50.18 
 
 		 340 aa  228  1e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0800022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3349  cobalamin biosynthesis protein  50.73 
 
 		 344 aa  225  5.0000000000000005e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3360  cobalamin biosynthesis protein  50.73 
 
 		 344 aa  225  5.0000000000000005e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.406666  normal  0.480267 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3411  cobalamin biosynthesis protein  50.73 
 
 		 344 aa  225  5.0000000000000005e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.530159 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3102  cobalamin biosynthesis protein CobD  54.58 
 
 		 330 aa  223  3e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0194792  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4864  cobalamin biosynthesis protein  52.43 
 
 		 332 aa  221  1.9999999999999999e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0377956  normal  0.399913 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2604  cobalamin biosynthesis protein  52.42 
 
 		 366 aa  218  1e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0562249  normal  0.0827399 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3624  cobalamin biosynthesis protein  48.29 
 
 		 317 aa  217  1e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.69655  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3443  cobalamin biosynthesis protein CobD  55.93 
 
 		 295 aa  213  2.9999999999999995e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.10368  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12265  cobalamin biosynthesis protein  44.41 
 
 		 313 aa  209  3e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3553  cobalamin biosynthesis protein CobD  42.23 
 
 		 315 aa  189  4e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0341108  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0430  adenosylcobinamide-phosphate synthase  47.35 
 
 		 311 aa  185  7e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2087  cobalamin biosynthesis protein CobD  53.8 
 
 		 311 aa  182  8.000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0538  cobalamin biosynthesis protein CobD  44.77 
 
 		 299 aa  179  4e-44  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.404725  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2716  cobalamin biosynthesis protein  43.75 
 
 		 310 aa  178  9e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.530545 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2355  cobalamin biosynthesis protein CobD  48.79 
 
 		 311 aa  176  4e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2089  cobD; cobalamin biosynthetic protein  41.26 
 
 		 301 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.284243  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2209  cobalamin biosynthesis protein  39.85 
 
 		 323 aa  173  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0042  cobalamin biosynthesis protein CobD  41.89 
 
 		 328 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0870  cobalamin biosynthesis protein CobD  39.93 
 
 		 323 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2990  cobalamin biosynthesis protein CobD  43.49 
 
 		 320 aa  172  6.999999999999999e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.168567  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0483  cobalamin biosynthesis protein  42.25 
 
 		 314 aa  170  2e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3538  cobalamin biosynthesis protein CobD  43.61 
 
 		 319 aa  167  2e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0790  cobalamin biosynthesis protein CobD  38.16 
 
 		 323 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0828155  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3731  cobalamin biosynthesis protein  43.27 
 
 		 321 aa  166  4e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1514  cobalamin biosynthesis protein  41.18 
 
 		 325 aa  166  5e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1294  cobalamin biosynthesis protein  35.4 
 
 		 315 aa  166  5.9999999999999996e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.392516  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3137  adenosylcobinamide-phosphate synthase  44.22 
 
 		 323 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1113  cobalamin biosynthesis protein  35.04 
 
 		 315 aa  164  1.0000000000000001e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.386524  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1138  cobalamin biosynthesis protein  41.27 
 
 		 320 aa  163  3e-39  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.200777 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33100  cobalamin biosynthesis protein  43.87 
 
 		 302 aa  162  5.0000000000000005e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00042631  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0486  adenosylcobinamide-phosphate synthase  45.73 
 
 		 318 aa  162  6e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3604  cobalamin biosynthesis protein CobD  42.86 
 
 		 319 aa  162  8.000000000000001e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0419  cobalamin biosynthesis protein  47.42 
 
 		 324 aa  162  9e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0140  cobalamin biosynthesis protein  40.52 
 
 		 304 aa  161  1e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2200  cobalamin biosynthesis protein  39.36 
 
 		 326 aa  161  1e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0660969 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4115  cobalamin biosynthesis protein  41.88 
 
 		 312 aa  161  1e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47730  cobalamin biosynthesis protein  42.24 
 
 		 312 aa  161  1e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.452767  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1458  cobalamin biosynthesis protein CobD  45.35 
 
 		 300 aa  161  1e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.862014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1234  cobalamin biosynthesis protein  40 
 
 		 302 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.778235  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1711  cobalamin biosynthesis protein CobD  41.18 
 
 		 302 aa  160  2e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3805  cobalamin biosynthesis protein CobD  35.09 
 
 		 327 aa  160  3e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3678  cobalamin biosynthesis protein  40.78 
 
 		 302 aa  160  3e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.035544 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0735  cobalamin biosynthesis protein CobD  45.7 
 
 		 323 aa  160  3e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0324  adenosylcobinamide-phosphate synthase  40.07 
 
 		 316 aa  160  3e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21170  cobalamin biosynthesis protein CobD  43.13 
 
 		 323 aa  160  3e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3857  cobalamin biosynthesis protein CobD  35.09 
 
 		 327 aa  160  3e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.932338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1644  cobalamin biosynthesis protein  41.18 
 
 		 302 aa  159  5e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.29794  normal  0.0167016 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1753  cobalamin biosynthesis protein  41.49 
 
 		 302 aa  159  6e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1675  cobalamin biosynthesis protein  40 
 
 		 307 aa  158  8e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.653042  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1274  cobalamin biosynthesis protein  40 
 
 		 302 aa  158  9e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.272014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0633  cobalamin biosynthesis protein CobD  39.72 
 
 		 323 aa  158  1e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0420011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4044  cobalamin biosynthesis protein  40 
 
 		 302 aa  158  1e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2704  cobalamin biosynthesis protein CobD  44.44 
 
 		 315 aa  157  2e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2658  cobalamin biosynthesis protein  38.21 
 
 		 326 aa  157  2e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.869405 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3494  cobalamin biosynthesis protein  39.56 
 
 		 311 aa  157  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3631  cobalamin biosynthesis protein CobD  47.72 
 
 		 310 aa  157  2e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0416966  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2392  cobalamin biosynthesis protein  40.57 
 
 		 331 aa  155  7e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0151839 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1743  cobalamin biosynthesis protein  39.7 
 
 		 317 aa  155  1e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.22977  normal  0.192923 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3382  adenosylcobinamide-phosphate synthase  41.57 
 
 		 336 aa  155  1e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0114495  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2205  cobalamin biosynthesis protein  37.89 
 
 		 313 aa  155  1e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0351195  normal  0.625062 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3779  cobalamin biosynthesis protein CobD  46.19 
 
 		 323 aa  154  1e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.975904  normal  0.744686 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3273  cobalamin biosynthesis protein CobD  46.8 
 
 		 330 aa  154  2e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00284027 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0757  cobalamin biosynthesis protein  39.5 
 
 		 321 aa  154  2e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.463156  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5724  cobalamin biosynthesis protein CobD  48.5 
 
 		 330 aa  154  2e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.571029 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0301  cobalamin biosynthesis protein CobD  32.86 
 
 		 313 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1468  cobalamin biosynthesis protein CobD  40.79 
 
 		 318 aa  153  2.9999999999999998e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3744  cobalamin biosynthesis protein CobD  47.57 
 
 		 323 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00858099  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1266  cobalamin biosynthesis protein  40.6 
 
 		 319 aa  152  5e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1099  adenosylcobinamide-phosphate synthase  49.75 
 
 		 320 aa  152  5.9999999999999996e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1738  cobalamin biosynthesis protein CobD  38.52 
 
 		 322 aa  152  5.9999999999999996e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0463068 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06900  cobalamin biosynthesis protein cobD/CbiB  42.81 
 
 		 326 aa  152  8.999999999999999e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.056091 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4724  cobalamin biosynthesis protein CobD  43.42 
 
 		 333 aa  151  1e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0822126  normal  0.571798 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3092  cobalamin biosynthesis protein CobD  37.81 
 
 		 336 aa  151  1e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.423715  hitchhiker  0.00432553 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1267  cobalamin biosynthesis protein  39.29 
 
 		 324 aa  150  2e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5191  cobalamin biosynthesis protein CobD  43.48 
 
 		 333 aa  150  2e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.683033 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5263  cobalamin biosynthesis protein CobD  52.75 
 
 		 333 aa  150  2e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.758113  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1441  cobalamin biosynthesis protein  36.62 
 
 		 325 aa  150  2e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.282346  normal  0.506208 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0102  cobalamin biosynthesis protein  41 
 
 		 317 aa  151  2e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1861  cobalamin biosynthesis protein  33.69 
 
 		 330 aa  151  2e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.130243 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1931  cobalamin biosynthesis protein CobD  32.86 
 
 		 313 aa  150  3e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3127  cobalamin biosynthesis protein  34.97 
 
 		 320 aa  150  3e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2156  cobalamin biosynthesis protein  36.97 
 
 		 319 aa  149  4e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2287  cobalamin biosynthesis protein  41.03 
 
 		 313 aa  149  5e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.731902  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1305  cobalamin biosynthesis protein CobD  37.98 
 
 		 321 aa  149  5e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2210  cobalamin biosynthesis protein  36.97 
 
 		 319 aa  149  5e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.265457  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1119  cobalamin biosynthesis protein  39.02 
 
 		 317 aa  149  5e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>