244 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_4724 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_5191  cobalamin biosynthesis protein CobD  99.1 
 
 		 333 aa  634    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.683033 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4724  cobalamin biosynthesis protein CobD  100 
 
 		 333 aa  641    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0822126  normal  0.571798 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5263  cobalamin biosynthesis protein CobD  89.79 
 
 		 333 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.758113  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5724  cobalamin biosynthesis protein CobD  77.04 
 
 		 330 aa  382  1e-105  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.571029 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1854  cobalamin biosynthesis protein CobD  74.68 
 
 		 329 aa  360  3e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1475  cobalamin biosynthesis protein CobD  73.03 
 
 		 331 aa  324  2e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.311979  hitchhiker  0.000015122 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4869  cobalamin biosynthesis protein CobD  75.09 
 
 		 323 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.30299 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3137  adenosylcobinamide-phosphate synthase  58.19 
 
 		 323 aa  303  2.0000000000000002e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3779  cobalamin biosynthesis protein CobD  59 
 
 		 323 aa  303  3.0000000000000004e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.975904  normal  0.744686 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0388  cobalamin biosynthesis protein CobD  57.76 
 
 		 337 aa  298  1e-79  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3273  cobalamin biosynthesis protein CobD  55.06 
 
 		 330 aa  290  2e-77  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00284027 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0790  cobalamin biosynthesis protein CobD  52.46 
 
 		 323 aa  278  1e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0828155  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0633  cobalamin biosynthesis protein CobD  51.23 
 
 		 323 aa  278  1e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0420011  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3744  cobalamin biosynthesis protein CobD  53.55 
 
 		 323 aa  276  4e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00858099  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1351  cobalamin biosynthesis protein CobD  54.55 
 
 		 328 aa  270  2e-71  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2087  cobalamin biosynthesis protein CobD  53.02 
 
 		 311 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0430  adenosylcobinamide-phosphate synthase  52.68 
 
 		 311 aa  261  1e-68  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0735  cobalamin biosynthesis protein CobD  51.13 
 
 		 323 aa  258  8e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1743  cobalamin biosynthesis protein  51.79 
 
 		 317 aa  258  9e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.22977  normal  0.192923 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3631  cobalamin biosynthesis protein CobD  51.97 
 
 		 310 aa  257  2e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0416966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2355  cobalamin biosynthesis protein CobD  52.35 
 
 		 311 aa  253  3e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3382  adenosylcobinamide-phosphate synthase  51.9 
 
 		 336 aa  249  6e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0114495  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0324  adenosylcobinamide-phosphate synthase  48.83 
 
 		 316 aa  246  4e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2121  cobalamin biosynthesis protein  49.52 
 
 		 326 aa  239  4e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.373169  hitchhiker  0.00319539 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2363  cobalamin biosynthesis protein  49.2 
 
 		 326 aa  235  6e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.764656  normal  0.0402118 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2621  cobalamin biosynthesis protein  49.83 
 
 		 323 aa  231  1e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.246707  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0370  cobalamin biosynthesis protein  49.84 
 
 		 319 aa  218  1e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.527036  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2585  cobalamin biosynthesis protein  45.48 
 
 		 303 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.650377  hitchhiker  0.000040763 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0165  cobalamin biosynthesis protein  53.28 
 
 		 303 aa  211  1e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.890938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1891  cobalamin biosynthesis protein  48.89 
 
 		 327 aa  209  4e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1294  cobalamin biosynthesis protein  48.55 
 
 		 331 aa  207  3e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1256  cobalamin biosynthesis protein  48.23 
 
 		 331 aa  206  4e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.252791  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1113  cobalamin biosynthesis protein  35.17 
 
 		 315 aa  192  7e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.386524  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2741  cobalamin biosynthesis protein CobD  45.86 
 
 		 304 aa  190  2e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0957714 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1294  cobalamin biosynthesis protein  34.48 
 
 		 315 aa  189  4e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.392516  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2210  cobalamin biosynthesis protein  38.8 
 
 		 319 aa  186  5e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.265457  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2369  cobalamin biosynthesis protein  38.8 
 
 		 319 aa  186  5e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2203  cobalamin biosynthesis protein  40.2 
 
 		 319 aa  185  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3604  cobalamin biosynthesis protein CobD  43.55 
 
 		 319 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2256  cobalamin biosynthesis protein  38.49 
 
 		 319 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.853927  normal  0.381632 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2156  cobalamin biosynthesis protein  38.49 
 
 		 319 aa  183  4.0000000000000006e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21170  cobalamin biosynthesis protein CobD  41.94 
 
 		 323 aa  182  5.0000000000000004e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0870  cobalamin biosynthesis protein CobD  44.23 
 
 		 323 aa  179  5.999999999999999e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3538  cobalamin biosynthesis protein CobD  42.81 
 
 		 319 aa  179  8e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1267  cobalamin biosynthesis protein  41.95 
 
 		 324 aa  178  1e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2990  cobalamin biosynthesis protein CobD  44.24 
 
 		 320 aa  177  2e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.168567  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1110  cobalamin biosynthesis protein CobD  34.58 
 
 		 339 aa  176  7e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2209  cobalamin biosynthesis protein  36.42 
 
 		 323 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3553  cobalamin biosynthesis protein CobD  43.84 
 
 		 315 aa  173  3.9999999999999995e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0341108  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1738  cobalamin biosynthesis protein CobD  41.13 
 
 		 322 aa  172  7.999999999999999e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0463068 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0419  cobalamin biosynthesis protein  41.25 
 
 		 324 aa  172  1e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0486  adenosylcobinamide-phosphate synthase  42.65 
 
 		 318 aa  171  2e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5371  cobalamin biosynthesis protein CobD  37.88 
 
 		 301 aa  171  2e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1305  cobalamin biosynthesis protein CobD  37.24 
 
 		 321 aa  170  3e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2704  cobalamin biosynthesis protein CobD  39.65 
 
 		 315 aa  167  2.9999999999999998e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1468  cobalamin biosynthesis protein CobD  41.52 
 
 		 318 aa  166  5e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1099  adenosylcobinamide-phosphate synthase  41.13 
 
 		 320 aa  165  1.0000000000000001e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0042  cobalamin biosynthesis protein CobD  40.92 
 
 		 328 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1721  adenosylcobinamide-phosphate synthase  36.14 
 
 		 319 aa  163  4.0000000000000004e-39  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3443  cobalamin biosynthesis protein CobD  42.19 
 
 		 295 aa  162  6e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.10368  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1514  cobalamin biosynthesis protein  36.45 
 
 		 325 aa  162  6e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2886  cobalamin biosynthesis protein  41.67 
 
 		 340 aa  162  9e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0800022  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0301  cobalamin biosynthesis protein CobD  36.33 
 
 		 313 aa  161  1e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2389  cobalamin biosynthesis protein CobD  33.82 
 
 		 357 aa  160  2e-38  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3555  cobalamin biosynthesis protein  42.46 
 
 		 333 aa  161  2e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4469  cobalamin biosynthesis protein CobD  34.36 
 
 		 317 aa  160  4e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.277077  normal  0.0655318 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1286  cobalamin biosynthesis protein CobD  35.4 
 
 		 320 aa  159  6e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.726575  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0757  cobalamin biosynthesis protein  38.66 
 
 		 321 aa  159  6e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.463156  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2885  adenosylcobinamide-phosphate synthase  52.43 
 
 		 291 aa  157  2e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1019  cobalamin biosynthesis protein CobD  33.11 
 
 		 308 aa  157  3e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3929  cobalamin biosynthesis protein  40.64 
 
 		 332 aa  155  6e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.512317  normal  0.0681298 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0483  cobalamin biosynthesis protein  41.38 
 
 		 314 aa  155  1e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1583  cobalamin biosynthesis protein CobD  32.59 
 
 		 323 aa  154  1e-36  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1119  cobalamin biosynthesis protein  37.93 
 
 		 317 aa  154  1e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1931  cobalamin biosynthesis protein CobD  35.67 
 
 		 313 aa  155  1e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3360  cobalamin biosynthesis protein  41.5 
 
 		 344 aa  154  2e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.406666  normal  0.480267 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7401  adenosylcobinamide-phosphate synthase  39.02 
 
 		 369 aa  154  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3349  cobalamin biosynthesis protein  41.5 
 
 		 344 aa  154  2e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0940  cobalamin biosynthesis protein CobD  34.9 
 
 		 324 aa  154  2e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.185008 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3411  cobalamin biosynthesis protein  41.5 
 
 		 344 aa  154  2e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.530159 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3624  cobalamin biosynthesis protein  46.81 
 
 		 317 aa  154  2e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.69655  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1266  cobalamin biosynthesis protein  42.16 
 
 		 319 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2604  cobalamin biosynthesis protein  52.27 
 
 		 366 aa  153  4e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0562249  normal  0.0827399 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12265  cobalamin biosynthesis protein  40.26 
 
 		 313 aa  151  1e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1138  cobalamin biosynthesis protein  42.91 
 
 		 320 aa  150  2e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.200777 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0174  cobalamin biosynthesis protein CobD  42.86 
 
 		 316 aa  151  2e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17720  adenosylcobinamide-phosphate synthase  42.33 
 
 		 332 aa  150  3e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.213248  normal  0.925164 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2576  cobalamin biosynthesis protein CobD  39.87 
 
 		 317 aa  149  7e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1847  cobalamin biosynthesis protein CobD  38.18 
 
 		 319 aa  147  3e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1287  cobalamin biosynthesis protein CobD  40.52 
 
 		 325 aa  147  3e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0123328  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0561  cobalamin biosynthesis protein CobD  39.14 
 
 		 318 aa  146  4.0000000000000006e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_592  adenosylcobinamide-phosphate synthase  32.71 
 
 		 308 aa  146  5e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0654  cobalamin biosynthesis protein CobD  33.33 
 
 		 308 aa  145  8.000000000000001e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0688  cobalamin biosynthesis protein CobD  33.33 
 
 		 308 aa  145  8.000000000000001e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0872  cobalamin biosynthesis protein CobD  47.57 
 
 		 315 aa  145  1e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1159  cobalamin biosynthesis protein CbiB  34.48 
 
 		 336 aa  144  2e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3102  cobalamin biosynthesis protein CobD  40.58 
 
 		 330 aa  144  2e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0194792  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2818  adenosylcobinamide-phosphate synthase  39.81 
 
 		 311 aa  144  2e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00349182  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0555  cobalamin biosynthesis protein CobD  33.76 
 
 		 311 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1233  cobalamin biosynthesis protein CobD  36.81 
 
 		 321 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>