242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_2363 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_2363  cobalamin biosynthesis protein  100 
 
 		 326 aa  644    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.764656  normal  0.0402118 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2121  cobalamin biosynthesis protein  91.1 
 
 		 326 aa  554  1e-157  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.373169  hitchhiker  0.00319539 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1743  cobalamin biosynthesis protein  62.94 
 
 		 317 aa  375  1e-103  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.22977  normal  0.192923 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2621  cobalamin biosynthesis protein  60.76 
 
 		 323 aa  343  2e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.246707  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1294  cobalamin biosynthesis protein  52.24 
 
 		 331 aa  285  8e-76  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0633  cobalamin biosynthesis protein CobD  50 
 
 		 323 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0420011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1256  cobalamin biosynthesis protein  52.24 
 
 		 331 aa  282  5.000000000000001e-75  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.252791  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1891  cobalamin biosynthesis protein  51.49 
 
 		 327 aa  279  4e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3744  cobalamin biosynthesis protein CobD  49.84 
 
 		 323 aa  266  4e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00858099  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0790  cobalamin biosynthesis protein CobD  48.45 
 
 		 323 aa  263  3e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0828155  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0735  cobalamin biosynthesis protein CobD  50.3 
 
 		 323 aa  256  5e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0370  cobalamin biosynthesis protein  50 
 
 		 319 aa  244  1.9999999999999999e-63  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.527036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3137  adenosylcobinamide-phosphate synthase  48.84 
 
 		 323 aa  241  1e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2585  cobalamin biosynthesis protein  45.93 
 
 		 303 aa  236  3e-61  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.650377  hitchhiker  0.000040763 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3382  adenosylcobinamide-phosphate synthase  49.47 
 
 		 336 aa  236  6e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0114495  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0388  cobalamin biosynthesis protein CobD  44.03 
 
 		 337 aa  233  4.0000000000000004e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5191  cobalamin biosynthesis protein CobD  49.52 
 
 		 333 aa  232  5e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.683033 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4724  cobalamin biosynthesis protein CobD  49.52 
 
 		 333 aa  231  1e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0822126  normal  0.571798 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3273  cobalamin biosynthesis protein CobD  48.31 
 
 		 330 aa  229  5e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00284027 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0324  adenosylcobinamide-phosphate synthase  45.78 
 
 		 316 aa  223  2e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0165  cobalamin biosynthesis protein  46.69 
 
 		 303 aa  224  2e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.890938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3779  cobalamin biosynthesis protein CobD  48.97 
 
 		 323 aa  221  9.999999999999999e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.975904  normal  0.744686 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5724  cobalamin biosynthesis protein CobD  50 
 
 		 330 aa  219  5e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.571029 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1854  cobalamin biosynthesis protein CobD  50.87 
 
 		 329 aa  218  1e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5263  cobalamin biosynthesis protein CobD  46.77 
 
 		 333 aa  215  9e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.758113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2087  cobalamin biosynthesis protein CobD  46.33 
 
 		 311 aa  208  9e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1475  cobalamin biosynthesis protein CobD  50.53 
 
 		 331 aa  207  2e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.311979  hitchhiker  0.000015122 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0430  adenosylcobinamide-phosphate synthase  46 
 
 		 311 aa  206  6e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5371  cobalamin biosynthesis protein CobD  39.24 
 
 		 301 aa  205  9e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3631  cobalamin biosynthesis protein CobD  44.3 
 
 		 310 aa  202  6e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0416966  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4469  cobalamin biosynthesis protein CobD  41.86 
 
 		 317 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.277077  normal  0.0655318 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1351  cobalamin biosynthesis protein CobD  46.67 
 
 		 328 aa  198  1.0000000000000001e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2355  cobalamin biosynthesis protein CobD  47.14 
 
 		 311 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4869  cobalamin biosynthesis protein CobD  52.43 
 
 		 323 aa  192  4e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.30299 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2209  cobalamin biosynthesis protein  40 
 
 		 323 aa  191  1e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1286  cobalamin biosynthesis protein CobD  39.09 
 
 		 320 aa  190  2.9999999999999997e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.726575  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0419  cobalamin biosynthesis protein  42.96 
 
 		 324 aa  185  9e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0486  adenosylcobinamide-phosphate synthase  43.77 
 
 		 318 aa  183  3e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1287  cobalamin biosynthesis protein CobD  42.46 
 
 		 325 aa  182  9.000000000000001e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0123328  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3604  cobalamin biosynthesis protein CobD  39.21 
 
 		 319 aa  181  1e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2741  cobalamin biosynthesis protein CobD  42.9 
 
 		 304 aa  178  9e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0957714 
 
 
-
 
NC_002950  PG1159  cobalamin biosynthesis protein CbiB  37.19 
 
 		 336 aa  178  1e-43  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3538  cobalamin biosynthesis protein CobD  38.96 
 
 		 319 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1267  cobalamin biosynthesis protein  40.14 
 
 		 324 aa  173  3.9999999999999995e-42  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1721  adenosylcobinamide-phosphate synthase  35.31 
 
 		 319 aa  172  7.999999999999999e-42  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2990  cobalamin biosynthesis protein CobD  39.12 
 
 		 320 aa  171  1e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.168567  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0870  cobalamin biosynthesis protein CobD  37.79 
 
 		 323 aa  171  2e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2389  cobalamin biosynthesis protein CobD  34.71 
 
 		 357 aa  170  3e-41  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0042  cobalamin biosynthesis protein CobD  39.76 
 
 		 328 aa  170  3e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7401  adenosylcobinamide-phosphate synthase  40 
 
 		 369 aa  169  4e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1294  cobalamin biosynthesis protein  34.22 
 
 		 315 aa  168  1e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.392516  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2704  cobalamin biosynthesis protein CobD  35.45 
 
 		 315 aa  167  2e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1099  adenosylcobinamide-phosphate synthase  36.53 
 
 		 320 aa  166  4e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1113  cobalamin biosynthesis protein  33.78 
 
 		 315 aa  166  4e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.386524  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1019  cobalamin biosynthesis protein CobD  32.6 
 
 		 308 aa  166  4e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1305  cobalamin biosynthesis protein CobD  36.3 
 
 		 321 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1468  cobalamin biosynthesis protein CobD  40.73 
 
 		 318 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2256  cobalamin biosynthesis protein  36.83 
 
 		 319 aa  164  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.853927  normal  0.381632 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1110  cobalamin biosynthesis protein CobD  33.13 
 
 		 339 aa  163  4.0000000000000004e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1266  cobalamin biosynthesis protein  39.25 
 
 		 319 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2369  cobalamin biosynthesis protein  37.5 
 
 		 319 aa  162  5.0000000000000005e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2210  cobalamin biosynthesis protein  37.5 
 
 		 319 aa  162  5.0000000000000005e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.265457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3677  cobalamin biosynthesis protein CobD  35.78 
 
 		 330 aa  162  6e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.544295 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2156  cobalamin biosynthesis protein  37.5 
 
 		 319 aa  162  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1119  cobalamin biosynthesis protein  40.85 
 
 		 317 aa  161  1e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2576  cobalamin biosynthesis protein CobD  39.02 
 
 		 317 aa  160  2e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1068  cobalamin biosynthesis protein  39.29 
 
 		 321 aa  161  2e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.882793  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2203  cobalamin biosynthesis protein  37.19 
 
 		 319 aa  161  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1738  cobalamin biosynthesis protein CobD  39.49 
 
 		 322 aa  160  2e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0463068 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3555  cobalamin biosynthesis protein  39.51 
 
 		 333 aa  160  2e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0757  cobalamin biosynthesis protein  40 
 
 		 321 aa  159  4e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.463156  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0301  cobalamin biosynthesis protein CobD  32.29 
 
 		 313 aa  159  8e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3929  cobalamin biosynthesis protein  41.46 
 
 		 332 aa  159  9e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.512317  normal  0.0681298 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2224  cobalamin biosynthesis protein  40.71 
 
 		 322 aa  157  2e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0483  cobalamin biosynthesis protein  37.96 
 
 		 314 aa  157  3e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1931  cobalamin biosynthesis protein CobD  33.23 
 
 		 313 aa  157  3e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21170  cobalamin biosynthesis protein CobD  38.19 
 
 		 323 aa  156  4e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3553  cobalamin biosynthesis protein CobD  40.37 
 
 		 315 aa  155  6e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0341108  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0561  cobalamin biosynthesis protein CobD  40.07 
 
 		 318 aa  155  7e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0872  cobalamin biosynthesis protein CobD  41.04 
 
 		 315 aa  154  2e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1138  cobalamin biosynthesis protein  37.93 
 
 		 320 aa  154  2e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.200777 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1847  cobalamin biosynthesis protein CobD  38.29 
 
 		 319 aa  152  5.9999999999999996e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1675  cobalamin biosynthesis protein  38.41 
 
 		 307 aa  152  7e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.653042  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3443  cobalamin biosynthesis protein CobD  37.89 
 
 		 295 aa  152  7e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.10368  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1514  cobalamin biosynthesis protein  35.78 
 
 		 325 aa  152  1e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4044  cobalamin biosynthesis protein  38.06 
 
 		 302 aa  152  1e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1234  cobalamin biosynthesis protein  38.06 
 
 		 302 aa  151  2e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.778235  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6127  cobalamin biosynthesis protein CobD  44 
 
 		 314 aa  150  3e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00302618  hitchhiker  0.00095084 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1274  cobalamin biosynthesis protein  37.72 
 
 		 302 aa  150  4e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.272014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0174  cobalamin biosynthesis protein CobD  40.07 
 
 		 316 aa  149  5e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1583  cobalamin biosynthesis protein CobD  33.22 
 
 		 323 aa  146  4.0000000000000006e-34  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3127  cobalamin biosynthesis protein  32.64 
 
 		 320 aa  146  4.0000000000000006e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0271  cobalamin biosynthesis protein  35.62 
 
 		 319 aa  146  4.0000000000000006e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1233  cobalamin biosynthesis protein CobD  37.67 
 
 		 321 aa  146  5e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2200  cobalamin biosynthesis protein  36.42 
 
 		 326 aa  146  5e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0660969 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12265  cobalamin biosynthesis protein  35.83 
 
 		 313 aa  145  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0940  cobalamin biosynthesis protein CobD  30.64 
 
 		 324 aa  145  9e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.185008 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1441  cobalamin biosynthesis protein CobD  35.37 
 
 		 329 aa  145  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2885  adenosylcobinamide-phosphate synthase  43.56 
 
 		 291 aa  144  3e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3092  cobalamin biosynthesis protein CobD  36.62 
 
 		 336 aa  143  4e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.423715  hitchhiker  0.00432553 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>