270 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6127 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_6127  cobalamin biosynthesis protein CobD  100 
 
 		 314 aa  592  1e-168  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00302618  hitchhiker  0.00095084 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1287  cobalamin biosynthesis protein CobD  64.97 
 
 		 325 aa  331  1e-89  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0123328  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7401  adenosylcobinamide-phosphate synthase  59.38 
 
 		 369 aa  317  2e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3929  cobalamin biosynthesis protein  58.78 
 
 		 332 aa  304  1.0000000000000001e-81  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.512317  normal  0.0681298 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4864  cobalamin biosynthesis protein  62.06 
 
 		 332 aa  303  3.0000000000000004e-81  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0377956  normal  0.399913 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3555  cobalamin biosynthesis protein  56.01 
 
 		 333 aa  300  3e-80  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0174  cobalamin biosynthesis protein CobD  58.97 
 
 		 316 aa  295  1e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2576  cobalamin biosynthesis protein CobD  60.34 
 
 		 317 aa  293  3e-78  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0872  cobalamin biosynthesis protein CobD  59.31 
 
 		 315 aa  292  5e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2715  cobalamin biosynthesis protein CobD  60.27 
 
 		 310 aa  291  1e-77  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0561  cobalamin biosynthesis protein CobD  61.54 
 
 		 318 aa  289  5.0000000000000004e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3360  cobalamin biosynthesis protein  58.06 
 
 		 344 aa  284  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.406666  normal  0.480267 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3349  cobalamin biosynthesis protein  58.06 
 
 		 344 aa  284  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3411  cobalamin biosynthesis protein  58.06 
 
 		 344 aa  284  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.530159 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17720  adenosylcobinamide-phosphate synthase  56.81 
 
 		 332 aa  280  3e-74  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.213248  normal  0.925164 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2886  cobalamin biosynthesis protein  56.51 
 
 		 340 aa  279  5e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0800022  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2224  cobalamin biosynthesis protein  56.25 
 
 		 322 aa  276  4e-73  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2604  cobalamin biosynthesis protein  57.14 
 
 		 366 aa  276  4e-73  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0562249  normal  0.0827399 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12265  cobalamin biosynthesis protein  52.3 
 
 		 313 aa  272  4.0000000000000004e-72  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3624  cobalamin biosynthesis protein  52.96 
 
 		 317 aa  265  7e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.69655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2885  adenosylcobinamide-phosphate synthase  59.06 
 
 		 291 aa  262  4e-69  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3443  cobalamin biosynthesis protein CobD  57.53 
 
 		 295 aa  257  2e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.10368  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3102  cobalamin biosynthesis protein CobD  53.26 
 
 		 330 aa  231  9e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0194792  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06900  cobalamin biosynthesis protein cobD/CbiB  47.54 
 
 		 326 aa  206  4e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.056091 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0301  cobalamin biosynthesis protein CobD  39.27 
 
 		 313 aa  204  1e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2209  cobalamin biosynthesis protein  40.72 
 
 		 323 aa  202  5e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1113  cobalamin biosynthesis protein  33.22 
 
 		 315 aa  202  6e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.386524  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0870  cobalamin biosynthesis protein CobD  41.54 
 
 		 323 aa  201  9.999999999999999e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2990  cobalamin biosynthesis protein CobD  47.25 
 
 		 320 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.168567  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0042  cobalamin biosynthesis protein CobD  43.96 
 
 		 328 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21170  cobalamin biosynthesis protein CobD  41.3 
 
 		 323 aa  199  6e-50  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1294  cobalamin biosynthesis protein  32.89 
 
 		 315 aa  199  7e-50  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.392516  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1931  cobalamin biosynthesis protein CobD  39.13 
 
 		 313 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0538  cobalamin biosynthesis protein CobD  47.46 
 
 		 299 aa  196  3e-49  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.404725  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0633  cobalamin biosynthesis protein CobD  40.74 
 
 		 323 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0420011  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0419  cobalamin biosynthesis protein  51.42 
 
 		 324 aa  192  6e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3538  cobalamin biosynthesis protein CobD  43.12 
 
 		 319 aa  190  2e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0430  adenosylcobinamide-phosphate synthase  43.34 
 
 		 311 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3604  cobalamin biosynthesis protein CobD  43.49 
 
 		 319 aa  189  5e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0486  adenosylcobinamide-phosphate synthase  42.35 
 
 		 318 aa  187  1e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1441  cobalamin biosynthesis protein CobD  37.38 
 
 		 329 aa  187  1e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2087  cobalamin biosynthesis protein CobD  42.32 
 
 		 311 aa  187  2e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2392  cobalamin biosynthesis protein  44.71 
 
 		 331 aa  186  6e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0151839 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2355  cobalamin biosynthesis protein CobD  42.01 
 
 		 311 aa  186  6e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0483  cobalamin biosynthesis protein  41.44 
 
 		 314 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1286  cobalamin biosynthesis protein CobD  36.27 
 
 		 320 aa  184  2.0000000000000003e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.726575  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3553  cobalamin biosynthesis protein CobD  41.89 
 
 		 315 aa  183  3e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0341108  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2716  cobalamin biosynthesis protein  44 
 
 		 310 aa  183  3e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.530545 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0790  cobalamin biosynthesis protein CobD  39.67 
 
 		 323 aa  183  3e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0828155  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2658  cobalamin biosynthesis protein  41.96 
 
 		 326 aa  180  2e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.869405 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1234  cobalamin biosynthesis protein  42.91 
 
 		 302 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.778235  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1458  cobalamin biosynthesis protein CobD  44.53 
 
 		 300 aa  178  1e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.862014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2704  cobalamin biosynthesis protein CobD  38.43 
 
 		 315 aa  177  2e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2200  cobalamin biosynthesis protein  40.62 
 
 		 326 aa  177  2e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0660969 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47730  cobalamin biosynthesis protein  42.36 
 
 		 312 aa  177  2e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.452767  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1675  cobalamin biosynthesis protein  42.14 
 
 		 307 aa  177  3e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.653042  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3678  cobalamin biosynthesis protein  41.45 
 
 		 302 aa  177  3e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.035544 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0735  cobalamin biosynthesis protein CobD  47.77 
 
 		 323 aa  176  3e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1274  cobalamin biosynthesis protein  42.16 
 
 		 302 aa  177  3e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.272014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3127  cobalamin biosynthesis protein  39.02 
 
 		 320 aa  176  4e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1753  cobalamin biosynthesis protein  42.5 
 
 		 302 aa  176  5e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1861  cobalamin biosynthesis protein  33.44 
 
 		 330 aa  176  5e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.130243 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4115  cobalamin biosynthesis protein  42.01 
 
 		 312 aa  175  7e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4044  cobalamin biosynthesis protein  41.79 
 
 		 302 aa  175  8e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1468  cobalamin biosynthesis protein CobD  43.38 
 
 		 318 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1644  cobalamin biosynthesis protein  41.57 
 
 		 302 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.29794  normal  0.0167016 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1514  cobalamin biosynthesis protein  38.25 
 
 		 325 aa  173  2.9999999999999996e-42  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1711  cobalamin biosynthesis protein CobD  40.73 
 
 		 302 aa  172  5e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1738  cobalamin biosynthesis protein CobD  39.62 
 
 		 322 aa  172  5e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0463068 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0940  cobalamin biosynthesis protein CobD  34.1 
 
 		 324 aa  172  5.999999999999999e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.185008 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3731  cobalamin biosynthesis protein  40.69 
 
 		 321 aa  172  1e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1119  cobalamin biosynthesis protein  37.8 
 
 		 317 aa  171  1e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1099  adenosylcobinamide-phosphate synthase  47.85 
 
 		 320 aa  170  2e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3744  cobalamin biosynthesis protein CobD  46.38 
 
 		 323 aa  171  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00858099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2089  cobD; cobalamin biosynthetic protein  37.72 
 
 		 301 aa  171  2e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.284243  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1068  cobalamin biosynthesis protein  38.34 
 
 		 321 aa  171  2e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.882793  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2256  cobalamin biosynthesis protein  38.02 
 
 		 319 aa  170  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.853927  normal  0.381632 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3857  cobalamin biosynthesis protein CobD  34 
 
 		 327 aa  170  3e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.932338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3494  cobalamin biosynthesis protein  38.98 
 
 		 311 aa  170  3e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3805  cobalamin biosynthesis protein CobD  34 
 
 		 327 aa  169  4e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1583  cobalamin biosynthesis protein CobD  34.17 
 
 		 323 aa  169  5e-41  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2210  cobalamin biosynthesis protein  38.83 
 
 		 319 aa  169  5e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.265457  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2369  cobalamin biosynthesis protein  38.83 
 
 		 319 aa  169  5e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2205  cobalamin biosynthesis protein  38.98 
 
 		 313 aa  169  7e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0351195  normal  0.625062 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2156  cobalamin biosynthesis protein  38.51 
 
 		 319 aa  168  9e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2203  cobalamin biosynthesis protein  38.83 
 
 		 319 aa  168  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2178  cobalamin biosynthesis protein CobD  36.73 
 
 		 316 aa  165  1.0000000000000001e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2287  cobalamin biosynthesis protein  42.38 
 
 		 313 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.731902  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3677  cobalamin biosynthesis protein CobD  36.64 
 
 		 330 aa  164  2.0000000000000002e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.544295 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33100  cobalamin biosynthesis protein  39.78 
 
 		 302 aa  163  3e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00042631  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0418  cobalamin biosynthesis protein CobD  36.88 
 
 		 332 aa  162  5.0000000000000005e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.984045  normal  0.740708 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3092  cobalamin biosynthesis protein CobD  36.52 
 
 		 336 aa  162  5.0000000000000005e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.423715  hitchhiker  0.00432553 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1003  cobalamin biosynthesis protein  38.64 
 
 		 311 aa  162  6e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4469  cobalamin biosynthesis protein CobD  33.01 
 
 		 317 aa  162  6e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.277077  normal  0.0655318 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1138  cobalamin biosynthesis protein  39.13 
 
 		 320 aa  162  8.000000000000001e-39  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.200777 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3382  adenosylcobinamide-phosphate synthase  46.27 
 
 		 336 aa  162  8.000000000000001e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0114495  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0846  cobalamin biosynthesis protein  41.33 
 
 		 314 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0757  cobalamin biosynthesis protein  41.09 
 
 		 321 aa  161  1e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.463156  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1266  cobalamin biosynthesis protein  38.06 
 
 		 319 aa  160  2e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3150  adenosylcobinamide-phosphate synthase  35.71 
 
 		 351 aa  160  2e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000125584  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>