262 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_1891 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009667  Oant_1891  cobalamin biosynthesis protein  100 
 
 
327 aa  649    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1294  cobalamin biosynthesis protein  81.65 
 
 
331 aa  499  1e-140  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1256  cobalamin biosynthesis protein  81.65 
 
 
331 aa  496  1e-139  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.252791  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2121  cobalamin biosynthesis protein  51.16 
 
 
326 aa  287  2e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.373169  hitchhiker  0.00319539 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2621  cobalamin biosynthesis protein  54.79 
 
 
323 aa  285  7e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.246707  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2363  cobalamin biosynthesis protein  51.49 
 
 
326 aa  285  9e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.764656  normal  0.0402118 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1743  cobalamin biosynthesis protein  50.99 
 
 
317 aa  283  2.0000000000000002e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.22977  normal  0.192923 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0633  cobalamin biosynthesis protein CobD  48.57 
 
 
323 aa  277  2e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0420011  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0790  cobalamin biosynthesis protein CobD  47.73 
 
 
323 aa  263  4e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0828155  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3744  cobalamin biosynthesis protein CobD  50 
 
 
323 aa  256  5e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00858099  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0370  cobalamin biosynthesis protein  50 
 
 
319 aa  253  4.0000000000000004e-66  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.527036  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3137  adenosylcobinamide-phosphate synthase  47.85 
 
 
323 aa  246  4.9999999999999997e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0735  cobalamin biosynthesis protein CobD  47.25 
 
 
323 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3273  cobalamin biosynthesis protein CobD  47 
 
 
330 aa  238  1e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00284027 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3382  adenosylcobinamide-phosphate synthase  50.34 
 
 
336 aa  237  2e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0114495  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0388  cobalamin biosynthesis protein CobD  47.08 
 
 
337 aa  235  6e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2585  cobalamin biosynthesis protein  44.97 
 
 
303 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.650377  hitchhiker  0.000040763 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0430  adenosylcobinamide-phosphate synthase  48.31 
 
 
311 aa  226  3e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2087  cobalamin biosynthesis protein CobD  47.97 
 
 
311 aa  226  3e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2355  cobalamin biosynthesis protein CobD  46.62 
 
 
311 aa  226  5.0000000000000005e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4724  cobalamin biosynthesis protein CobD  49.2 
 
 
333 aa  222  8e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0822126  normal  0.571798 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5191  cobalamin biosynthesis protein CobD  49.2 
 
 
333 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.683033 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0165  cobalamin biosynthesis protein  45.36 
 
 
303 aa  219  6e-56  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.890938  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0324  adenosylcobinamide-phosphate synthase  43.73 
 
 
316 aa  214  1.9999999999999998e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3631  cobalamin biosynthesis protein CobD  45.83 
 
 
310 aa  209  6e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0416966  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5263  cobalamin biosynthesis protein CobD  54.95 
 
 
333 aa  207  2e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.758113  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3779  cobalamin biosynthesis protein CobD  44.04 
 
 
323 aa  206  5e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.975904  normal  0.744686 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5724  cobalamin biosynthesis protein CobD  56.13 
 
 
330 aa  202  6e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.571029 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5371  cobalamin biosynthesis protein CobD  38.65 
 
 
301 aa  200  1.9999999999999998e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1854  cobalamin biosynthesis protein CobD  56.87 
 
 
329 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1294  cobalamin biosynthesis protein  39.19 
 
 
315 aa  195  8.000000000000001e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.392516  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1113  cobalamin biosynthesis protein  39.19 
 
 
315 aa  195  9e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.386524  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1159  cobalamin biosynthesis protein CbiB  40.13 
 
 
336 aa  191  1e-47  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1475  cobalamin biosynthesis protein CobD  47.97 
 
 
331 aa  191  2e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.311979  hitchhiker  0.000015122 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0419  cobalamin biosynthesis protein  41.48 
 
 
324 aa  189  4e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2156  cobalamin biosynthesis protein  37.3 
 
 
319 aa  189  5e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2369  cobalamin biosynthesis protein  37.3 
 
 
319 aa  189  5e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2210  cobalamin biosynthesis protein  37.3 
 
 
319 aa  189  5e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.265457  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2741  cobalamin biosynthesis protein CobD  47.04 
 
 
304 aa  189  7e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0957714 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2203  cobalamin biosynthesis protein  37.3 
 
 
319 aa  189  8e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2256  cobalamin biosynthesis protein  36.79 
 
 
319 aa  187  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.853927  normal  0.381632 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1305  cobalamin biosynthesis protein CobD  41.54 
 
 
321 aa  185  7e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3604  cobalamin biosynthesis protein CobD  42.31 
 
 
319 aa  185  8e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3538  cobalamin biosynthesis protein CobD  42.6 
 
 
319 aa  182  7e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1019  cobalamin biosynthesis protein CobD  33.96 
 
 
308 aa  182  7e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4469  cobalamin biosynthesis protein CobD  36.34 
 
 
317 aa  181  1e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.277077  normal  0.0655318 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1266  cobalamin biosynthesis protein  37.97 
 
 
319 aa  179  4e-44  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1099  adenosylcobinamide-phosphate synthase  36.45 
 
 
320 aa  179  4.999999999999999e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4869  cobalamin biosynthesis protein CobD  57.35 
 
 
323 aa  179  7e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.30299 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2209  cobalamin biosynthesis protein  40.15 
 
 
323 aa  179  7e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1738  cobalamin biosynthesis protein CobD  39.81 
 
 
322 aa  179  8e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0463068 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1514  cobalamin biosynthesis protein  38.56 
 
 
325 aa  179  8e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1286  cobalamin biosynthesis protein CobD  35.99 
 
 
320 aa  178  1e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.726575  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1119  cobalamin biosynthesis protein  40.77 
 
 
317 aa  178  1e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1267  cobalamin biosynthesis protein  39.02 
 
 
324 aa  177  2e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1233  cobalamin biosynthesis protein CobD  37.86 
 
 
321 aa  177  2e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2389  cobalamin biosynthesis protein CobD  36.72 
 
 
357 aa  176  5e-43  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1068  cobalamin biosynthesis protein  39.38 
 
 
321 aa  175  8e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.882793  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21170  cobalamin biosynthesis protein CobD  38.46 
 
 
323 aa  175  9.999999999999999e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1721  adenosylcobinamide-phosphate synthase  36.24 
 
 
319 aa  172  5.999999999999999e-42  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0486  adenosylcobinamide-phosphate synthase  42.55 
 
 
318 aa  172  6.999999999999999e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1351  cobalamin biosynthesis protein CobD  41.88 
 
 
328 aa  170  3e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1847  cobalamin biosynthesis protein CobD  38.96 
 
 
319 aa  170  3e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0757  cobalamin biosynthesis protein  39.19 
 
 
321 aa  169  5e-41  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.463156  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2704  cobalamin biosynthesis protein CobD  36.86 
 
 
315 aa  168  1e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7401  adenosylcobinamide-phosphate synthase  41.11 
 
 
369 aa  168  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1583  cobalamin biosynthesis protein CobD  33.75 
 
 
323 aa  167  2e-40  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3443  cobalamin biosynthesis protein CobD  37.75 
 
 
295 aa  167  2e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.10368  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0042  cobalamin biosynthesis protein CobD  37.89 
 
 
328 aa  166  6.9999999999999995e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1287  cobalamin biosynthesis protein CobD  38.28 
 
 
325 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0123328  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2990  cobalamin biosynthesis protein CobD  38.34 
 
 
320 aa  163  4.0000000000000004e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.168567  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1110  cobalamin biosynthesis protein CobD  36.25 
 
 
339 aa  163  4.0000000000000004e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1468  cobalamin biosynthesis protein CobD  36.83 
 
 
318 aa  162  7e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1644  cobalamin biosynthesis protein  39.93 
 
 
302 aa  161  1e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.29794  normal  0.0167016 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1682  cobalamin biosynthesis protein CobD  35.53 
 
 
330 aa  161  1e-38  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1931  cobalamin biosynthesis protein CobD  36.1 
 
 
313 aa  162  1e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0301  cobalamin biosynthesis protein CobD  35.46 
 
 
313 aa  161  2e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0940  cobalamin biosynthesis protein CobD  34.75 
 
 
324 aa  159  4e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.185008 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1138  cobalamin biosynthesis protein  37.27 
 
 
320 aa  159  6e-38  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.200777 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0483  cobalamin biosynthesis protein  35.95 
 
 
314 aa  159  9e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1234  cobalamin biosynthesis protein  37.75 
 
 
302 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.778235  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1274  cobalamin biosynthesis protein  37.97 
 
 
302 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.272014  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3349  cobalamin biosynthesis protein  40.45 
 
 
344 aa  157  3e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3360  cobalamin biosynthesis protein  40.45 
 
 
344 aa  157  3e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.406666  normal  0.480267 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3411  cobalamin biosynthesis protein  40.45 
 
 
344 aa  157  3e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.530159 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1675  cobalamin biosynthesis protein  37.97 
 
 
307 aa  155  8e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.653042  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3678  cobalamin biosynthesis protein  38.61 
 
 
302 aa  155  1e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.035544 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0870  cobalamin biosynthesis protein CobD  40.23 
 
 
323 aa  154  2e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3092  cobalamin biosynthesis protein CobD  37.28 
 
 
336 aa  152  7e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.423715  hitchhiker  0.00432553 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4044  cobalamin biosynthesis protein  36.95 
 
 
302 aa  151  1e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0271  cobalamin biosynthesis protein  35.43 
 
 
319 aa  151  1e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1711  cobalamin biosynthesis protein CobD  37.16 
 
 
302 aa  151  2e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2604  cobalamin biosynthesis protein  35.47 
 
 
366 aa  150  2e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0562249  normal  0.0827399 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3553  cobalamin biosynthesis protein CobD  36.54 
 
 
315 aa  150  2e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0341108  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33100  cobalamin biosynthesis protein  38.2 
 
 
302 aa  150  3e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00042631  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3624  cobalamin biosynthesis protein  45.21 
 
 
317 aa  150  4e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.69655  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2576  cobalamin biosynthesis protein CobD  40.27 
 
 
317 aa  149  5e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1753  cobalamin biosynthesis protein  36.54 
 
 
302 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1458  cobalamin biosynthesis protein CobD  35.62 
 
 
300 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.862014  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3555  cobalamin biosynthesis protein  37.72 
 
 
333 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>