238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_5263 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_5263  cobalamin biosynthesis protein CobD  100 
 
 		 333 aa  635    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.758113  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4724  cobalamin biosynthesis protein CobD  89.79 
 
 		 333 aa  518  1e-146  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0822126  normal  0.571798 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5191  cobalamin biosynthesis protein CobD  89.79 
 
 		 333 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.683033 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5724  cobalamin biosynthesis protein CobD  75.16 
 
 		 330 aa  366  1e-100  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.571029 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1854  cobalamin biosynthesis protein CobD  71.57 
 
 		 329 aa  347  2e-94  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1475  cobalamin biosynthesis protein CobD  71.71 
 
 		 331 aa  318  7e-86  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.311979  hitchhiker  0.000015122 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3137  adenosylcobinamide-phosphate synthase  58.11 
 
 		 323 aa  300  2e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4869  cobalamin biosynthesis protein CobD  73.7 
 
 		 323 aa  299  5e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.30299 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3779  cobalamin biosynthesis protein CobD  56.81 
 
 		 323 aa  294  2e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.975904  normal  0.744686 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3273  cobalamin biosynthesis protein CobD  57.91 
 
 		 330 aa  292  5e-78  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00284027 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0388  cobalamin biosynthesis protein CobD  55.49 
 
 		 337 aa  284  2.0000000000000002e-75  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0633  cobalamin biosynthesis protein CobD  51.85 
 
 		 323 aa  277  2e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0420011  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3744  cobalamin biosynthesis protein CobD  53.4 
 
 		 323 aa  268  1e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00858099  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0790  cobalamin biosynthesis protein CobD  51.34 
 
 		 323 aa  266  4e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0828155  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2087  cobalamin biosynthesis protein CobD  52.35 
 
 		 311 aa  261  8.999999999999999e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1351  cobalamin biosynthesis protein CobD  53.99 
 
 		 328 aa  261  1e-68  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0430  adenosylcobinamide-phosphate synthase  52.01 
 
 		 311 aa  257  2e-67  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1743  cobalamin biosynthesis protein  51.8 
 
 		 317 aa  257  2e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.22977  normal  0.192923 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3382  adenosylcobinamide-phosphate synthase  53.66 
 
 		 336 aa  252  8.000000000000001e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0114495  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0324  adenosylcobinamide-phosphate synthase  51.31 
 
 		 316 aa  252  8.000000000000001e-66  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2355  cobalamin biosynthesis protein CobD  50.67 
 
 		 311 aa  251  1e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0735  cobalamin biosynthesis protein CobD  51.85 
 
 		 323 aa  250  2e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3631  cobalamin biosynthesis protein CobD  50.99 
 
 		 310 aa  248  8e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0416966  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2121  cobalamin biosynthesis protein  48.88 
 
 		 326 aa  239  2.9999999999999997e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.373169  hitchhiker  0.00319539 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2363  cobalamin biosynthesis protein  47.92 
 
 		 326 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.764656  normal  0.0402118 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2621  cobalamin biosynthesis protein  52.01 
 
 		 323 aa  232  7.000000000000001e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.246707  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0370  cobalamin biosynthesis protein  48.54 
 
 		 319 aa  217  2e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.527036  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2585  cobalamin biosynthesis protein  44.78 
 
 		 303 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.650377  hitchhiker  0.000040763 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1891  cobalamin biosynthesis protein  52.63 
 
 		 327 aa  211  1e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0165  cobalamin biosynthesis protein  49.33 
 
 		 303 aa  211  1e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.890938  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1294  cobalamin biosynthesis protein  47.91 
 
 		 331 aa  202  4e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1256  cobalamin biosynthesis protein  47.91 
 
 		 331 aa  203  4e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.252791  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2741  cobalamin biosynthesis protein CobD  46.98 
 
 		 304 aa  199  6e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0957714 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1113  cobalamin biosynthesis protein  33.33 
 
 		 315 aa  187  3e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.386524  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1294  cobalamin biosynthesis protein  32.65 
 
 		 315 aa  184  2.0000000000000003e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.392516  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2990  cobalamin biosynthesis protein CobD  45.38 
 
 		 320 aa  182  9.000000000000001e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.168567  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3538  cobalamin biosynthesis protein CobD  44.91 
 
 		 319 aa  180  2.9999999999999997e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3604  cobalamin biosynthesis protein CobD  43.21 
 
 		 319 aa  178  1e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1267  cobalamin biosynthesis protein  39.93 
 
 		 324 aa  176  4e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1468  cobalamin biosynthesis protein CobD  43.46 
 
 		 318 aa  175  9e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21170  cobalamin biosynthesis protein CobD  38.46 
 
 		 323 aa  175  9.999999999999999e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0870  cobalamin biosynthesis protein CobD  43.46 
 
 		 323 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2210  cobalamin biosynthesis protein  37.99 
 
 		 319 aa  173  3.9999999999999995e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.265457  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1738  cobalamin biosynthesis protein CobD  39.59 
 
 		 322 aa  173  3.9999999999999995e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0463068 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2369  cobalamin biosynthesis protein  37.99 
 
 		 319 aa  173  3.9999999999999995e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2256  cobalamin biosynthesis protein  37.99 
 
 		 319 aa  172  9e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.853927  normal  0.381632 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2203  cobalamin biosynthesis protein  37.66 
 
 		 319 aa  172  9e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0486  adenosylcobinamide-phosphate synthase  44.17 
 
 		 318 aa  171  2e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2156  cobalamin biosynthesis protein  37.66 
 
 		 319 aa  170  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1305  cobalamin biosynthesis protein CobD  38.44 
 
 		 321 aa  167  2e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0419  cobalamin biosynthesis protein  39.93 
 
 		 324 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5371  cobalamin biosynthesis protein CobD  36.84 
 
 		 301 aa  166  5e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1110  cobalamin biosynthesis protein CobD  32.88 
 
 		 339 aa  166  5e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2704  cobalamin biosynthesis protein CobD  39.79 
 
 		 315 aa  166  5e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0301  cobalamin biosynthesis protein CobD  35.43 
 
 		 313 aa  166  5.9999999999999996e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1019  cobalamin biosynthesis protein CobD  32.81 
 
 		 308 aa  164  1.0000000000000001e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2209  cobalamin biosynthesis protein  36.23 
 
 		 323 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3443  cobalamin biosynthesis protein CobD  42.52 
 
 		 295 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.10368  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0483  cobalamin biosynthesis protein  42.53 
 
 		 314 aa  161  1e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1514  cobalamin biosynthesis protein  37.46 
 
 		 325 aa  160  2e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3553  cobalamin biosynthesis protein CobD  42.03 
 
 		 315 aa  161  2e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0341108  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0042  cobalamin biosynthesis protein CobD  41.04 
 
 		 328 aa  160  2e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1099  adenosylcobinamide-phosphate synthase  40.64 
 
 		 320 aa  160  4e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2886  cobalamin biosynthesis protein  43.32 
 
 		 340 aa  160  4e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0800022  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1583  cobalamin biosynthesis protein CobD  32.7 
 
 		 323 aa  159  6e-38  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1931  cobalamin biosynthesis protein CobD  35.1 
 
 		 313 aa  158  1e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3555  cobalamin biosynthesis protein  42.41 
 
 		 333 aa  158  1e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1721  adenosylcobinamide-phosphate synthase  34.39 
 
 		 319 aa  158  1e-37  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7401  adenosylcobinamide-phosphate synthase  39.87 
 
 		 369 aa  158  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4469  cobalamin biosynthesis protein CobD  35.02 
 
 		 317 aa  155  7e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.277077  normal  0.0655318 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0757  cobalamin biosynthesis protein  37.06 
 
 		 321 aa  154  1e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.463156  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0174  cobalamin biosynthesis protein CobD  42.6 
 
 		 316 aa  154  2e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2885  adenosylcobinamide-phosphate synthase  52.97 
 
 		 291 aa  153  5e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1286  cobalamin biosynthesis protein CobD  33.45 
 
 		 320 aa  152  5.9999999999999996e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.726575  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1266  cobalamin biosynthesis protein  39.93 
 
 		 319 aa  151  1e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3624  cobalamin biosynthesis protein  46.84 
 
 		 317 aa  151  1e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.69655  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2389  cobalamin biosynthesis protein CobD  33.24 
 
 		 357 aa  150  2e-35  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2576  cobalamin biosynthesis protein CobD  42.16 
 
 		 317 aa  151  2e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3929  cobalamin biosynthesis protein  41.54 
 
 		 332 aa  150  2e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.512317  normal  0.0681298 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0940  cobalamin biosynthesis protein CobD  34.1 
 
 		 324 aa  150  4e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.185008 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12265  cobalamin biosynthesis protein  38.16 
 
 		 313 aa  149  6e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1138  cobalamin biosynthesis protein  41.42 
 
 		 320 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.200777 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2604  cobalamin biosynthesis protein  50 
 
 		 366 aa  147  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0562249  normal  0.0827399 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3349  cobalamin biosynthesis protein  42.75 
 
 		 344 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17720  adenosylcobinamide-phosphate synthase  40.6 
 
 		 332 aa  147  2.0000000000000003e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.213248  normal  0.925164 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3411  cobalamin biosynthesis protein  42.75 
 
 		 344 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.530159 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3360  cobalamin biosynthesis protein  42.75 
 
 		 344 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.406666  normal  0.480267 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0561  cobalamin biosynthesis protein CobD  49.46 
 
 		 318 aa  147  3e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1287  cobalamin biosynthesis protein CobD  41 
 
 		 325 aa  146  4.0000000000000006e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0123328  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1159  cobalamin biosynthesis protein CbiB  34.82 
 
 		 336 aa  146  6e-34  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1119  cobalamin biosynthesis protein  36.22 
 
 		 317 aa  145  7.0000000000000006e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_592  adenosylcobinamide-phosphate synthase  32.7 
 
 		 308 aa  145  9e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2716  cobalamin biosynthesis protein  40.73 
 
 		 310 aa  144  2e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.530545 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3102  cobalamin biosynthesis protein CobD  40.43 
 
 		 330 aa  144  2e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0194792  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0654  cobalamin biosynthesis protein CobD  33.02 
 
 		 308 aa  142  8e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0688  cobalamin biosynthesis protein CobD  33.02 
 
 		 308 aa  142  8e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1233  cobalamin biosynthesis protein CobD  35.28 
 
 		 321 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0872  cobalamin biosynthesis protein CobD  40.53 
 
 		 315 aa  140  1.9999999999999998e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1005  cobalamin biosynthesis protein CobD  38.95 
 
 		 320 aa  140  3e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2224  cobalamin biosynthesis protein  48.28 
 
 		 322 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>