261 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_592 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013552  DhcVS_592  adenosylcobinamide-phosphate synthase  100 
 
 		 308 aa  620  1e-176  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0654  cobalamin biosynthesis protein CobD  98.38 
 
 		 308 aa  613  9.999999999999999e-175  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0688  cobalamin biosynthesis protein CobD  98.38 
 
 		 308 aa  613  9.999999999999999e-175  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0624  adenosylcobinamide-phosphate synthase  89.94 
 
 		 308 aa  570  1e-161  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.373431  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_956  cobalamin biosynthesis protein  40.2 
 
 		 307 aa  236  5.0000000000000005e-61  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0246  cobalamin biosynthesis protein CobD  42.02 
 
 		 318 aa  229  4e-59  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0967  adenosylcobinamide-phosphate synthase  40.2 
 
 		 307 aa  223  4e-57  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_72  cobalamin biosynthesis protein CobD  41.04 
 
 		 318 aa  223  4e-57  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1138  cobalamin biosynthesis protein CobD  39.54 
 
 		 307 aa  222  6e-57  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.697499  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1583  cobalamin biosynthesis protein CobD  37.54 
 
 		 323 aa  207  2e-52  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1057  cobalamin biosynthesis protein CobD  37.91 
 
 		 309 aa  184  2.0000000000000003e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0301  cobalamin biosynthesis protein CobD  35.46 
 
 		 313 aa  182  9.000000000000001e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0645  cobalamin biosynthesis protein CobD  43.08 
 
 		 311 aa  181  9.000000000000001e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2090  adenosylcobinamide-phosphate synthase  33.54 
 
 		 331 aa  178  1e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1113  cobalamin biosynthesis protein  33.22 
 
 		 315 aa  177  2e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.386524  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0564  cobalamin biosynthesis protein CobD  40.74 
 
 		 334 aa  175  7e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1294  cobalamin biosynthesis protein  32.89 
 
 		 315 aa  174  1.9999999999999998e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.392516  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1931  cobalamin biosynthesis protein CobD  34.19 
 
 		 313 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1286  cobalamin biosynthesis protein CobD  36.1 
 
 		 320 aa  173  3.9999999999999995e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.726575  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1704  cobalamin biosynthesis protein  34.33 
 
 		 306 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.574312  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1099  adenosylcobinamide-phosphate synthase  37.58 
 
 		 320 aa  172  5e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3454  adenosylcobinamide-phosphate synthase  38.38 
 
 		 328 aa  171  1e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.868099  normal  0.111955 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1305  cobalamin biosynthesis protein CobD  35.18 
 
 		 321 aa  170  3e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0706  cobalamin biosynthesis protein  31.7 
 
 		 311 aa  169  6e-41  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.380522  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1370  cobalamin biosynthesis protein CobD  37.05 
 
 		 294 aa  169  6e-41  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1019  cobalamin biosynthesis protein CobD  33.11 
 
 		 308 aa  168  1e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0758  cobalamin biosynthesis protein  32.09 
 
 		 306 aa  167  2e-40  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2321  cobalamin biosynthesis protein CobD  37.73 
 
 		 306 aa  166  5e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0198  cobalamin biosynthesis protein  31.1 
 
 		 306 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.797231 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0042  cobalamin biosynthesis protein CobD  35.12 
 
 		 328 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0486  adenosylcobinamide-phosphate synthase  35.48 
 
 		 318 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2210  cobalamin biosynthesis protein  33.66 
 
 		 319 aa  163  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.265457  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2369  cobalamin biosynthesis protein  33.66 
 
 		 319 aa  163  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2256  cobalamin biosynthesis protein  33.66 
 
 		 319 aa  162  6e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.853927  normal  0.381632 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0238  cobalamin biosynthesis protein  35.06 
 
 		 310 aa  162  8.000000000000001e-39  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2990  cobalamin biosynthesis protein CobD  37.8 
 
 		 320 aa  162  1e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.168567  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2203  cobalamin biosynthesis protein  33.33 
 
 		 319 aa  161  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3604  cobalamin biosynthesis protein CobD  36.94 
 
 		 319 aa  161  2e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2156  cobalamin biosynthesis protein  33.33 
 
 		 319 aa  160  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0008  cobalamin biosynthesis protein CobD  38.15 
 
 		 306 aa  159  5e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0007  cobalamin biosynthesis protein CobD  37.18 
 
 		 314 aa  159  8e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3538  cobalamin biosynthesis protein CobD  36.57 
 
 		 319 aa  158  1e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1468  cobalamin biosynthesis protein CobD  39.02 
 
 		 318 aa  157  2e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0859  cobalamin biosynthesis protein CobD  35.64 
 
 		 278 aa  156  4e-37  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0252583  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0649  adenosylcobinamide-phosphate synthase  42.75 
 
 		 301 aa  155  7e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0129272  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5371  cobalamin biosynthesis protein CobD  38.52 
 
 		 301 aa  155  9e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21170  cobalamin biosynthesis protein CobD  33.99 
 
 		 323 aa  154  2e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2585  cobalamin biosynthesis protein  36.13 
 
 		 303 aa  154  2e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.650377  hitchhiker  0.000040763 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2229  cobalamin biosynthesis protein CobD  34.69 
 
 		 310 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0406571 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1110  cobalamin biosynthesis protein CobD  31.51 
 
 		 339 aa  152  5e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0969  cobalamin biosynthesis protein CobD  33.44 
 
 		 305 aa  152  1e-35  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.380612  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0965  cobalamin biosynthesis protein CobD  33.65 
 
 		 300 aa  151  1e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0324  adenosylcobinamide-phosphate synthase  38.04 
 
 		 316 aa  152  1e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3127  cobalamin biosynthesis protein  30.91 
 
 		 320 aa  150  2e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0295  cobalamin biosynthesis protein CobD  34.23 
 
 		 316 aa  151  2e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1738  cobalamin biosynthesis protein CobD  37.29 
 
 		 322 aa  150  3e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0463068 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1272  cobalamin biosynthesis protein CobD  38.24 
 
 		 313 aa  149  5e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7401  adenosylcobinamide-phosphate synthase  35.99 
 
 		 369 aa  148  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2209  cobalamin biosynthesis protein  33.44 
 
 		 323 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1233  cobalamin biosynthesis protein CobD  34.65 
 
 		 321 aa  147  3e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2178  cobalamin biosynthesis protein CobD  30.65 
 
 		 316 aa  147  3e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2148  cobalamin biosynthesis protein CobD  33.44 
 
 		 327 aa  146  4.0000000000000006e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.445636  normal  0.0604171 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1847  cobalamin biosynthesis protein CobD  32.17 
 
 		 319 aa  145  6e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1721  adenosylcobinamide-phosphate synthase  33.93 
 
 		 319 aa  145  1e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1743  cobalamin biosynthesis protein  34.47 
 
 		 317 aa  144  3e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.22977  normal  0.192923 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0870  cobalamin biosynthesis protein CobD  32.67 
 
 		 323 aa  143  3e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2704  cobalamin biosynthesis protein CobD  35.69 
 
 		 315 aa  143  4e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2389  cobalamin biosynthesis protein CobD  32.49 
 
 		 357 aa  143  5e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0483  cobalamin biosynthesis protein  36.94 
 
 		 314 aa  143  5e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12265  cobalamin biosynthesis protein  34.56 
 
 		 313 aa  142  6e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0940  cobalamin biosynthesis protein CobD  31.29 
 
 		 324 aa  140  1.9999999999999998e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.185008 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3555  cobalamin biosynthesis protein  35.56 
 
 		 333 aa  139  3.9999999999999997e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1458  cobalamin biosynthesis protein CobD  34.91 
 
 		 300 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.862014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6127  cobalamin biosynthesis protein CobD  36.15 
 
 		 314 aa  139  4.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00302618  hitchhiker  0.00095084 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0061  adenosylcobinamide-phosphate synthase  33.71 
 
 		 305 aa  139  7e-32  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00552046  hitchhiker  0.00179506 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3092  cobalamin biosynthesis protein CobD  33.89 
 
 		 336 aa  139  7e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.423715  hitchhiker  0.00432553 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2715  cobalamin biosynthesis protein CobD  35.89 
 
 		 310 aa  138  1e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0419  cobalamin biosynthesis protein  35.46 
 
 		 324 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2355  cobalamin biosynthesis protein CobD  32.47 
 
 		 311 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1441  cobalamin biosynthesis protein  32.92 
 
 		 325 aa  136  4e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.282346  normal  0.506208 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4864  cobalamin biosynthesis protein  37.8 
 
 		 332 aa  135  8e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0377956  normal  0.399913 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0757  cobalamin biosynthesis protein  31.61 
 
 		 321 aa  135  9e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.463156  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0232  cobalamin biosynthesis protein CobD  33.63 
 
 		 334 aa  135  9e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.700118  normal  0.268973 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0418  cobalamin biosynthesis protein CobD  33.33 
 
 		 332 aa  135  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.984045  normal  0.740708 
 
 
-
 
NC_002950  PG1159  cobalamin biosynthesis protein CbiB  32.26 
 
 		 336 aa  134  1.9999999999999998e-30  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1287  cobalamin biosynthesis protein CobD  36.23 
 
 		 325 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0123328  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4044  cobalamin biosynthesis protein  33.98 
 
 		 302 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3744  cobalamin biosynthesis protein CobD  30.82 
 
 		 323 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00858099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0516  adenosylcobinamide-phosphate synthase  35.02 
 
 		 300 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.071273  normal  0.0684381 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1861  cobalamin biosynthesis protein  30.91 
 
 		 330 aa  134  1.9999999999999998e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.130243 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3929  cobalamin biosynthesis protein  33.8 
 
 		 332 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.512317  normal  0.0681298 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1545  adenosylcobinamide-phosphate synthase  34.67 
 
 		 342 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.215428  normal  0.112032 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2495  cobalamin biosynthesis protein CobD  35.4 
 
 		 328 aa  133  3e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.239005  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2716  cobalamin biosynthesis protein  36.46 
 
 		 310 aa  133  3e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.530545 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3677  cobalamin biosynthesis protein CobD  32.48 
 
 		 330 aa  134  3e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.544295 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0561  cobalamin biosynthesis protein CobD  36.93 
 
 		 318 aa  134  3e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2886  cobalamin biosynthesis protein  36.78 
 
 		 340 aa  133  3e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0800022  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2762  adenosylcobinamide-phosphate synthase  36.71 
 
 		 318 aa  132  5e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.861061  normal  0.0751378 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3180  adenosylcobinamide-phosphate synthase  35.15 
 
 		 325 aa  132  5e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1138  cobalamin biosynthesis protein  31.45 
 
 		 320 aa  132  6e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.200777 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>