279 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3443 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_3443  cobalamin biosynthesis protein CobD  100 
 
 		 295 aa  555  1e-157  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.10368  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7401  adenosylcobinamide-phosphate synthase  61.75 
 
 		 369 aa  317  2e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1287  cobalamin biosynthesis protein CobD  62.07 
 
 		 325 aa  306  2.0000000000000002e-82  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0123328  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2224  cobalamin biosynthesis protein  64.19 
 
 		 322 aa  303  2.0000000000000002e-81  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3555  cobalamin biosynthesis protein  57.58 
 
 		 333 aa  291  1e-77  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3929  cobalamin biosynthesis protein  57.24 
 
 		 332 aa  282  6.000000000000001e-75  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.512317  normal  0.0681298 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2576  cobalamin biosynthesis protein CobD  62.72 
 
 		 317 aa  273  2.0000000000000002e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0561  cobalamin biosynthesis protein CobD  58.97 
 
 		 318 aa  269  5e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2886  cobalamin biosynthesis protein  53.77 
 
 		 340 aa  267  2e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0800022  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0174  cobalamin biosynthesis protein CobD  60.63 
 
 		 316 aa  266  4e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3624  cobalamin biosynthesis protein  54.13 
 
 		 317 aa  265  5.999999999999999e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.69655  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17720  adenosylcobinamide-phosphate synthase  56.19 
 
 		 332 aa  264  1e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.213248  normal  0.925164 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0872  cobalamin biosynthesis protein CobD  54.17 
 
 		 315 aa  253  3e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3360  cobalamin biosynthesis protein  53.21 
 
 		 344 aa  248  1e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.406666  normal  0.480267 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3349  cobalamin biosynthesis protein  53.21 
 
 		 344 aa  248  1e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3411  cobalamin biosynthesis protein  53.21 
 
 		 344 aa  248  1e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.530159 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3102  cobalamin biosynthesis protein CobD  55.52 
 
 		 330 aa  246  4.9999999999999997e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0194792  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12265  cobalamin biosynthesis protein  50.5 
 
 		 313 aa  245  6e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2604  cobalamin biosynthesis protein  52.3 
 
 		 366 aa  242  5e-63  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0562249  normal  0.0827399 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2715  cobalamin biosynthesis protein CobD  54.67 
 
 		 310 aa  241  1e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4864  cobalamin biosynthesis protein  54.48 
 
 		 332 aa  241  1e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0377956  normal  0.399913 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6127  cobalamin biosynthesis protein CobD  56.16 
 
 		 314 aa  238  1e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00302618  hitchhiker  0.00095084 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2885  adenosylcobinamide-phosphate synthase  54.81 
 
 		 291 aa  223  3e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0633  cobalamin biosynthesis protein CobD  43.41 
 
 		 323 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0420011  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3604  cobalamin biosynthesis protein CobD  46.18 
 
 		 319 aa  194  1e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0538  cobalamin biosynthesis protein CobD  46.71 
 
 		 299 aa  190  2e-47  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.404725  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1113  cobalamin biosynthesis protein  32.35 
 
 		 315 aa  189  5.999999999999999e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.386524  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3538  cobalamin biosynthesis protein CobD  44.85 
 
 		 319 aa  188  1e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0042  cobalamin biosynthesis protein CobD  46.02 
 
 		 328 aa  188  1e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0486  adenosylcobinamide-phosphate synthase  45.96 
 
 		 318 aa  188  1e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1294  cobalamin biosynthesis protein  32.35 
 
 		 315 aa  187  2e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.392516  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0870  cobalamin biosynthesis protein CobD  42.09 
 
 		 323 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0555  cobalamin biosynthesis protein CobD  40 
 
 		 311 aa  181  2e-44  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2990  cobalamin biosynthesis protein CobD  46.81 
 
 		 320 aa  179  4e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.168567  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0301  cobalamin biosynthesis protein CobD  33.55 
 
 		 313 aa  178  8e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1286  cobalamin biosynthesis protein CobD  34.97 
 
 		 320 aa  178  8e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.726575  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0140  cobalamin biosynthesis protein  41.61 
 
 		 304 aa  178  1e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1458  cobalamin biosynthesis protein CobD  44.41 
 
 		 300 aa  176  4e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.862014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06900  cobalamin biosynthesis protein cobD/CbiB  44.48 
 
 		 326 aa  175  6e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.056091 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21170  cobalamin biosynthesis protein CobD  38.66 
 
 		 323 aa  173  3.9999999999999995e-42  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1019  cobalamin biosynthesis protein CobD  31.88 
 
 		 308 aa  172  5e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1931  cobalamin biosynthesis protein CobD  32.9 
 
 		 313 aa  171  2e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3731  cobalamin biosynthesis protein  44.86 
 
 		 321 aa  171  2e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0419  cobalamin biosynthesis protein  44.62 
 
 		 324 aa  170  3e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1305  cobalamin biosynthesis protein CobD  37.37 
 
 		 321 aa  168  1e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2716  cobalamin biosynthesis protein  43.17 
 
 		 310 aa  166  5e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.530545 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1738  cobalamin biosynthesis protein CobD  42.73 
 
 		 322 aa  166  5e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0463068 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3494  cobalamin biosynthesis protein  40.75 
 
 		 311 aa  165  9e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1468  cobalamin biosynthesis protein CobD  41.72 
 
 		 318 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2087  cobalamin biosynthesis protein CobD  46.51 
 
 		 311 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2209  cobalamin biosynthesis protein  38.04 
 
 		 323 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1675  cobalamin biosynthesis protein  40.07 
 
 		 307 aa  163  3e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.653042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4044  cobalamin biosynthesis protein  40.07 
 
 		 302 aa  163  3e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1847  cobalamin biosynthesis protein CobD  41.46 
 
 		 319 aa  163  4.0000000000000004e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1099  adenosylcobinamide-phosphate synthase  40.42 
 
 		 320 aa  162  5.0000000000000005e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3553  cobalamin biosynthesis protein CobD  41.97 
 
 		 315 aa  162  8.000000000000001e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0341108  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0430  adenosylcobinamide-phosphate synthase  46.51 
 
 		 311 aa  162  8.000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2355  cobalamin biosynthesis protein CobD  45.62 
 
 		 311 aa  161  1e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3273  cobalamin biosynthesis protein CobD  41.94 
 
 		 330 aa  160  2e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00284027 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3779  cobalamin biosynthesis protein CobD  50.26 
 
 		 323 aa  160  2e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.975904  normal  0.744686 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0790  cobalamin biosynthesis protein CobD  39.66 
 
 		 323 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0828155  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3744  cobalamin biosynthesis protein CobD  38.13 
 
 		 323 aa  160  3e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00858099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1743  cobalamin biosynthesis protein  40 
 
 		 317 aa  159  4e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.22977  normal  0.192923 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2256  cobalamin biosynthesis protein  37.74 
 
 		 319 aa  159  5e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.853927  normal  0.381632 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1274  cobalamin biosynthesis protein  40 
 
 		 302 aa  159  6e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.272014  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2392  cobalamin biosynthesis protein  42.46 
 
 		 331 aa  159  6e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0151839 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1514  cobalamin biosynthesis protein  36.91 
 
 		 325 aa  159  6e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5371  cobalamin biosynthesis protein CobD  37.41 
 
 		 301 aa  159  6e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33100  cobalamin biosynthesis protein  43.49 
 
 		 302 aa  159  7e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00042631  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1003  cobalamin biosynthesis protein  39.04 
 
 		 311 aa  158  9e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2210  cobalamin biosynthesis protein  37.42 
 
 		 319 aa  158  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.265457  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3678  cobalamin biosynthesis protein  38.31 
 
 		 302 aa  157  1e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.035544 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47730  cobalamin biosynthesis protein  40.13 
 
 		 312 aa  158  1e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.452767  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2369  cobalamin biosynthesis protein  37.42 
 
 		 319 aa  158  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1233  cobalamin biosynthesis protein CobD  39.27 
 
 		 321 aa  157  2e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1753  cobalamin biosynthesis protein  40.28 
 
 		 302 aa  157  2e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2203  cobalamin biosynthesis protein  37.1 
 
 		 319 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4115  cobalamin biosynthesis protein  39.8 
 
 		 312 aa  157  3e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2704  cobalamin biosynthesis protein CobD  44.14 
 
 		 315 aa  155  5.0000000000000005e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0940  cobalamin biosynthesis protein CobD  32.39 
 
 		 324 aa  155  6e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.185008 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2156  cobalamin biosynthesis protein  37.1 
 
 		 319 aa  155  6e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0735  cobalamin biosynthesis protein CobD  46.48 
 
 		 323 aa  155  7e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0324  adenosylcobinamide-phosphate synthase  39.86 
 
 		 316 aa  155  8e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2089  cobD; cobalamin biosynthetic protein  36.2 
 
 		 301 aa  155  8e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.284243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4469  cobalamin biosynthesis protein CobD  33.01 
 
 		 317 aa  155  1e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.277077  normal  0.0655318 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2658  cobalamin biosynthesis protein  40.48 
 
 		 326 aa  155  1e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.869405 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1644  cobalamin biosynthesis protein  38.75 
 
 		 302 aa  154  2e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.29794  normal  0.0167016 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1234  cobalamin biosynthesis protein  38.72 
 
 		 302 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.778235  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2205  cobalamin biosynthesis protein  40.43 
 
 		 313 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0351195  normal  0.625062 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1711  cobalamin biosynthesis protein CobD  38.31 
 
 		 302 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0483  cobalamin biosynthesis protein  40.58 
 
 		 314 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2200  cobalamin biosynthesis protein  39.19 
 
 		 326 aa  152  7e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0660969 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3137  adenosylcobinamide-phosphate synthase  42.25 
 
 		 323 aa  151  1e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1721  adenosylcobinamide-phosphate synthase  33.57 
 
 		 319 aa  150  2e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1110  cobalamin biosynthesis protein CobD  32.89 
 
 		 339 aa  150  2e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1068  cobalamin biosynthesis protein  36.73 
 
 		 321 aa  150  3e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.882793  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1891  cobalamin biosynthesis protein  37.87 
 
 		 327 aa  149  4e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5263  cobalamin biosynthesis protein CobD  48.5 
 
 		 333 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.758113  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3382  adenosylcobinamide-phosphate synthase  39.29 
 
 		 336 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0114495  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5724  cobalamin biosynthesis protein CobD  48.74 
 
 		 330 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.571029 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>