299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_0102 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007947  Mfla_0102  cobalamin biosynthesis protein  100 
 
 
317 aa  625  1e-178  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0140  cobalamin biosynthesis protein  60.67 
 
 
304 aa  322  7e-87  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2205  cobalamin biosynthesis protein  57.09 
 
 
313 aa  305  7e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0351195  normal  0.625062 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1675  cobalamin biosynthesis protein  55.97 
 
 
307 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.653042  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1274  cobalamin biosynthesis protein  55.97 
 
 
302 aa  302  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.272014  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4044  cobalamin biosynthesis protein  55.63 
 
 
302 aa  301  7.000000000000001e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1234  cobalamin biosynthesis protein  55.63 
 
 
302 aa  301  8.000000000000001e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.778235  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2392  cobalamin biosynthesis protein  56.64 
 
 
331 aa  300  2e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0151839 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1458  cobalamin biosynthesis protein CobD  55.93 
 
 
300 aa  300  2e-80  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.862014  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2200  cobalamin biosynthesis protein  57.45 
 
 
326 aa  299  5e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0660969 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3678  cobalamin biosynthesis protein  55.75 
 
 
302 aa  297  2e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.035544 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1003  cobalamin biosynthesis protein  56.74 
 
 
311 aa  295  5e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3494  cobalamin biosynthesis protein  57.45 
 
 
311 aa  294  1e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1711  cobalamin biosynthesis protein CobD  54.7 
 
 
302 aa  291  7e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2658  cobalamin biosynthesis protein  54.96 
 
 
326 aa  290  2e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.869405 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2716  cobalamin biosynthesis protein  57.72 
 
 
310 aa  287  1e-76  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.530545 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0271  cobalamin biosynthesis protein  55.99 
 
 
319 aa  287  2e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1837  cobalamin biosynthesis protein  57.76 
 
 
312 aa  285  5e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.41199  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2448  cobalamin biosynthesis protein  57.76 
 
 
312 aa  285  5e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2453  cobalamin biosynthesis protein  57.76 
 
 
312 aa  285  5e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.393352  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33100  cobalamin biosynthesis protein  57.34 
 
 
302 aa  285  5.999999999999999e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00042631  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1644  cobalamin biosynthesis protein  53.38 
 
 
302 aa  285  8e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.29794  normal  0.0167016 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1753  cobalamin biosynthesis protein  54.11 
 
 
302 aa  281  1e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3731  cobalamin biosynthesis protein  57.05 
 
 
321 aa  280  2e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2780  cobalamin biosynthesis protein  54.17 
 
 
326 aa  278  1e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0845124  normal  0.636847 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0663  cobalamin biosynthesis protein  57.53 
 
 
326 aa  275  5e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3677  cobalamin biosynthesis protein CobD  50.83 
 
 
330 aa  275  5e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.544295 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2496  cobalamin biosynthesis protein  54.79 
 
 
312 aa  275  5e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.315833  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5779  cobalamin biosynthesis protein  57.19 
 
 
314 aa  275  6e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.642032 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2364  cobalamin biosynthesis protein  55.29 
 
 
314 aa  273  3e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47730  cobalamin biosynthesis protein  53.63 
 
 
312 aa  270  2e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.452767  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4115  cobalamin biosynthesis protein  53.29 
 
 
312 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2818  adenosylcobinamide-phosphate synthase  55.63 
 
 
311 aa  268  7e-71  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00349182  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0846  cobalamin biosynthesis protein  56.03 
 
 
314 aa  262  4.999999999999999e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2089  cobD; cobalamin biosynthetic protein  50.68 
 
 
301 aa  261  8e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.284243  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1424  adenosylcobinamide-phosphate synthase  53.66 
 
 
306 aa  258  1e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2287  cobalamin biosynthesis protein  53.29 
 
 
313 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.731902  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1043  cobalamin biosynthesis protein  53.42 
 
 
314 aa  249  5e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.110651  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1037  cobalamin biosynthesis protein  53.42 
 
 
314 aa  249  5e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1198  cobalamin biosynthesis protein  53.42 
 
 
314 aa  249  5e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0842  cobalamin biosynthesis protein  52.98 
 
 
314 aa  248  1e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.98695  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2318  cobalamin biosynthesis protein  53.42 
 
 
310 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0401808  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0695  cobalamin biosynthesis protein  53.42 
 
 
310 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.114905  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2969  cobalamin biosynthesis protein  53.42 
 
 
310 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1630  cobalamin biosynthesis protein  53.42 
 
 
310 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.187303  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1131  cobalamin biosynthesis protein CobD  44.3 
 
 
351 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1857  cobalamin biosynthesis protein CobD  51.57 
 
 
308 aa  225  8e-58  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1143  putative cobalamin biosynthesis protein D  40.91 
 
 
344 aa  209  3e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3555  cobalamin biosynthesis protein  41.5 
 
 
333 aa  188  1e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3929  cobalamin biosynthesis protein  41.69 
 
 
332 aa  183  4.0000000000000006e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.512317  normal  0.0681298 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17720  adenosylcobinamide-phosphate synthase  41.06 
 
 
332 aa  176  7e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.213248  normal  0.925164 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0174  cobalamin biosynthesis protein CobD  42.51 
 
 
316 aa  167  2e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0757  cobalamin biosynthesis protein  37.86 
 
 
321 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.463156  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1119  cobalamin biosynthesis protein  41.7 
 
 
317 aa  162  5.0000000000000005e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7401  adenosylcobinamide-phosphate synthase  36.84 
 
 
369 aa  162  1e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1704  cobalamin biosynthesis protein  31.39 
 
 
306 aa  161  1e-38  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.574312  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2355  cobalamin biosynthesis protein CobD  40.99 
 
 
311 aa  161  1e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2585  cobalamin biosynthesis protein  39.8 
 
 
303 aa  160  3e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.650377  hitchhiker  0.000040763 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0633  cobalamin biosynthesis protein CobD  37.62 
 
 
323 aa  159  4e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0420011  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2209  cobalamin biosynthesis protein  35.76 
 
 
323 aa  159  6e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1138  cobalamin biosynthesis protein  40.22 
 
 
320 aa  158  9e-38  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.200777 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0430  adenosylcobinamide-phosphate synthase  42.05 
 
 
311 aa  158  1e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0483  cobalamin biosynthesis protein  41.09 
 
 
314 aa  158  1e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1113  cobalamin biosynthesis protein  33.33 
 
 
315 aa  157  2e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.386524  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2087  cobalamin biosynthesis protein CobD  43.94 
 
 
311 aa  157  2e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1267  cobalamin biosynthesis protein  38.41 
 
 
324 aa  157  3e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0790  cobalamin biosynthesis protein CobD  38.52 
 
 
323 aa  157  3e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0828155  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2885  adenosylcobinamide-phosphate synthase  40.36 
 
 
291 aa  157  3e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0486  adenosylcobinamide-phosphate synthase  40.88 
 
 
318 aa  156  4e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0419  cobalamin biosynthesis protein  39.1 
 
 
324 aa  156  4e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1294  cobalamin biosynthesis protein  33.33 
 
 
315 aa  156  4e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.392516  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3411  cobalamin biosynthesis protein  41.79 
 
 
344 aa  156  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.530159 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3360  cobalamin biosynthesis protein  41.79 
 
 
344 aa  156  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.406666  normal  0.480267 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2224  cobalamin biosynthesis protein  36.88 
 
 
322 aa  156  5.0000000000000005e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3349  cobalamin biosynthesis protein  41.79 
 
 
344 aa  156  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2604  cobalamin biosynthesis protein  39.49 
 
 
366 aa  155  6e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0562249  normal  0.0827399 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12265  cobalamin biosynthesis protein  39.64 
 
 
313 aa  155  7e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2576  cobalamin biosynthesis protein CobD  40.42 
 
 
317 aa  155  9e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2741  cobalamin biosynthesis protein CobD  41.16 
 
 
304 aa  154  2e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0957714 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0324  adenosylcobinamide-phosphate synthase  41.92 
 
 
316 aa  153  2.9999999999999998e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4469  cobalamin biosynthesis protein CobD  32.56 
 
 
317 aa  153  2.9999999999999998e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.277077  normal  0.0655318 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0555  cobalamin biosynthesis protein CobD  35.42 
 
 
311 aa  153  4e-36  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1266  cobalamin biosynthesis protein  40.64 
 
 
319 aa  153  4e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4864  cobalamin biosynthesis protein  38.11 
 
 
332 aa  152  5e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0377956  normal  0.399913 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0758  cobalamin biosynthesis protein  29.77 
 
 
306 aa  152  5e-36  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3538  cobalamin biosynthesis protein CobD  38.43 
 
 
319 aa  152  8e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3553  cobalamin biosynthesis protein CobD  41.06 
 
 
315 aa  152  1e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0341108  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1044  CobD/CbiB family protein  37.75 
 
 
305 aa  151  1e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.211721 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3604  cobalamin biosynthesis protein CobD  38.31 
 
 
319 aa  152  1e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0735  cobalamin biosynthesis protein CobD  39.09 
 
 
323 aa  152  1e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1514  cobalamin biosynthesis protein  38.91 
 
 
325 aa  150  2e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1721  adenosylcobinamide-phosphate synthase  31.25 
 
 
319 aa  150  2e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1287  cobalamin biosynthesis protein CobD  39.51 
 
 
325 aa  150  2e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0123328  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0238  cobalamin biosynthesis protein  30.75 
 
 
310 aa  150  2e-35  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3631  cobalamin biosynthesis protein CobD  39.77 
 
 
310 aa  150  2e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0416966  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0538  cobalamin biosynthesis protein CobD  39.86 
 
 
299 aa  150  4e-35  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.404725  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2990  cobalamin biosynthesis protein CobD  42.26 
 
 
320 aa  149  5e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.168567  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0301  cobalamin biosynthesis protein CobD  33.33 
 
 
313 aa  149  5e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2715  cobalamin biosynthesis protein CobD  36.45 
 
 
310 aa  149  7e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1743  cobalamin biosynthesis protein  36.82 
 
 
317 aa  148  1.0000000000000001e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.22977  normal  0.192923 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>