270 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_2090 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007955  Mbur_2090  adenosylcobinamide-phosphate synthase  100 
 
 
331 aa  666    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3454  adenosylcobinamide-phosphate synthase  54.86 
 
 
328 aa  343  2.9999999999999997e-93  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.868099  normal  0.111955 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0295  cobalamin biosynthesis protein CobD  43.46 
 
 
316 aa  226  6e-58  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0238  cobalamin biosynthesis protein  39.51 
 
 
310 aa  183  3e-45  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1305  cobalamin biosynthesis protein CobD  35.53 
 
 
321 aa  183  4.0000000000000006e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21170  cobalamin biosynthesis protein CobD  34.86 
 
 
323 aa  182  5.0000000000000004e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1583  cobalamin biosynthesis protein CobD  36.59 
 
 
323 aa  182  8.000000000000001e-45  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1738  cobalamin biosynthesis protein CobD  34.74 
 
 
322 aa  181  2e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0463068 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_592  adenosylcobinamide-phosphate synthase  33.54 
 
 
308 aa  178  1e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0654  cobalamin biosynthesis protein CobD  33.96 
 
 
308 aa  176  5e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0688  cobalamin biosynthesis protein CobD  33.96 
 
 
308 aa  176  5e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0624  adenosylcobinamide-phosphate synthase  34.91 
 
 
308 aa  175  9.999999999999999e-43  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.373431  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1113  cobalamin biosynthesis protein  39.66 
 
 
315 aa  172  5.999999999999999e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.386524  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1019  cobalamin biosynthesis protein CobD  35.94 
 
 
308 aa  171  2e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1266  cobalamin biosynthesis protein  37.87 
 
 
319 aa  171  2e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0870  cobalamin biosynthesis protein CobD  37.79 
 
 
323 aa  171  2e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2203  cobalamin biosynthesis protein  35.71 
 
 
319 aa  169  8e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1931  cobalamin biosynthesis protein CobD  35.42 
 
 
313 aa  168  1e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0483  cobalamin biosynthesis protein  33.85 
 
 
314 aa  167  2e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2369  cobalamin biosynthesis protein  35.4 
 
 
319 aa  167  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2210  cobalamin biosynthesis protein  35.4 
 
 
319 aa  167  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.265457  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0301  cobalamin biosynthesis protein CobD  35.51 
 
 
313 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2156  cobalamin biosynthesis protein  35.83 
 
 
319 aa  166  5e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2256  cobalamin biosynthesis protein  35.4 
 
 
319 aa  166  5.9999999999999996e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.853927  normal  0.381632 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2209  cobalamin biosynthesis protein  36.39 
 
 
323 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3127  cobalamin biosynthesis protein  36.62 
 
 
320 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1704  cobalamin biosynthesis protein  37.95 
 
 
306 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.574312  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0007  cobalamin biosynthesis protein CobD  34.64 
 
 
314 aa  164  2.0000000000000002e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1294  cobalamin biosynthesis protein  37.29 
 
 
315 aa  164  2.0000000000000002e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.392516  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0706  cobalamin biosynthesis protein  33.23 
 
 
311 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.380522  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1721  adenosylcobinamide-phosphate synthase  33.57 
 
 
319 aa  162  6e-39  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1286  cobalamin biosynthesis protein CobD  32.92 
 
 
320 aa  162  7e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.726575  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1847  cobalamin biosynthesis protein CobD  37.23 
 
 
319 aa  162  9e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_956  cobalamin biosynthesis protein  32.7 
 
 
307 aa  161  1e-38  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1514  cobalamin biosynthesis protein  35.99 
 
 
325 aa  162  1e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0008  cobalamin biosynthesis protein CobD  39.48 
 
 
306 aa  162  1e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0419  cobalamin biosynthesis protein  34.28 
 
 
324 aa  159  8e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2148  cobalamin biosynthesis protein CobD  32.13 
 
 
327 aa  158  1e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.445636  normal  0.0604171 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3092  cobalamin biosynthesis protein CobD  37.69 
 
 
336 aa  157  2e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.423715  hitchhiker  0.00432553 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0758  cobalamin biosynthesis protein  34.38 
 
 
306 aa  157  2e-37  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0486  adenosylcobinamide-phosphate synthase  37.28 
 
 
318 aa  157  2e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0633  cobalamin biosynthesis protein CobD  29.76 
 
 
323 aa  157  3e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0420011  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1267  cobalamin biosynthesis protein  34.89 
 
 
324 aa  157  3e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1099  adenosylcobinamide-phosphate synthase  33.75 
 
 
320 aa  156  4e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3180  adenosylcobinamide-phosphate synthase  31.19 
 
 
325 aa  156  4e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4469  cobalamin biosynthesis protein CobD  32.83 
 
 
317 aa  156  6e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.277077  normal  0.0655318 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0969  cobalamin biosynthesis protein CobD  35.03 
 
 
305 aa  155  7e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.380612  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0198  cobalamin biosynthesis protein  37.5 
 
 
306 aa  155  7e-37  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.797231 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1068  cobalamin biosynthesis protein  32.32 
 
 
321 aa  155  9e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.882793  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3604  cobalamin biosynthesis protein CobD  34.56 
 
 
319 aa  155  9e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2704  cobalamin biosynthesis protein CobD  34.56 
 
 
315 aa  154  1e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1861  cobalamin biosynthesis protein  29.94 
 
 
330 aa  155  1e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.130243 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2389  cobalamin biosynthesis protein CobD  32.84 
 
 
357 aa  154  2e-36  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1441  cobalamin biosynthesis protein CobD  35.84 
 
 
329 aa  154  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3744  cobalamin biosynthesis protein CobD  34.26 
 
 
323 aa  154  2e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00858099  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3553  cobalamin biosynthesis protein CobD  34.52 
 
 
315 aa  154  2e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0341108  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0757  cobalamin biosynthesis protein  31.8 
 
 
321 aa  153  2.9999999999999998e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.463156  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2495  cobalamin biosynthesis protein CobD  33.69 
 
 
328 aa  153  4e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.239005  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3538  cobalamin biosynthesis protein CobD  36.27 
 
 
319 aa  153  4e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1110  cobalamin biosynthesis protein CobD  36.09 
 
 
339 aa  153  5e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3857  cobalamin biosynthesis protein CobD  36.3 
 
 
327 aa  152  1e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.932338  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2533  cobalamin biosynthesis protein CobD  32.34 
 
 
328 aa  151  1e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2990  cobalamin biosynthesis protein CobD  37.28 
 
 
320 aa  151  2e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.168567  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3805  cobalamin biosynthesis protein CobD  36.14 
 
 
327 aa  151  2e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1370  cobalamin biosynthesis protein CobD  35.4 
 
 
294 aa  150  2e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1119  cobalamin biosynthesis protein  35.19 
 
 
317 aa  151  2e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1441  cobalamin biosynthesis protein  33.94 
 
 
325 aa  150  3e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.282346  normal  0.506208 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0042  cobalamin biosynthesis protein CobD  36.18 
 
 
328 aa  149  6e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0246  cobalamin biosynthesis protein CobD  33.33 
 
 
318 aa  149  7e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2804  cobalamin biosynthesis protein CobD  32.56 
 
 
364 aa  148  1.0000000000000001e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.584343  normal  0.747096 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2616  cobalamin biosynthesis protein CobD  31.53 
 
 
320 aa  147  3e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2178  cobalamin biosynthesis protein CobD  35.46 
 
 
316 aa  147  3e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_72  cobalamin biosynthesis protein CobD  33.88 
 
 
318 aa  146  4.0000000000000006e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0967  adenosylcobinamide-phosphate synthase  32.03 
 
 
307 aa  145  7.0000000000000006e-34  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2321  cobalamin biosynthesis protein CobD  35.23 
 
 
306 aa  145  8.000000000000001e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1138  cobalamin biosynthesis protein CobD  32.06 
 
 
307 aa  145  1e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.697499  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1057  cobalamin biosynthesis protein CobD  30.49 
 
 
309 aa  144  2e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1005  cobalamin biosynthesis protein CobD  30.86 
 
 
320 aa  144  2e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1138  cobalamin biosynthesis protein  33.09 
 
 
320 aa  143  3e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.200777 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0987  cobalamin biosynthesis protein CbiB  30.67 
 
 
340 aa  143  5e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1529  adenosylcobinamide-phosphate synthase  31.17 
 
 
317 aa  142  8e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.292471  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5371  cobalamin biosynthesis protein CobD  31.92 
 
 
301 aa  142  9e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2555  cobalamin biosynthesis protein CobD  33.33 
 
 
327 aa  142  9.999999999999999e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0881732  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0388  cobalamin biosynthesis protein CobD  30.28 
 
 
337 aa  140  3e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0324  adenosylcobinamide-phosphate synthase  31.58 
 
 
316 aa  140  3.9999999999999997e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1743  cobalamin biosynthesis protein  35.16 
 
 
317 aa  140  3.9999999999999997e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.22977  normal  0.192923 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1545  adenosylcobinamide-phosphate synthase  29.94 
 
 
342 aa  139  6e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.215428  normal  0.112032 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0735  cobalamin biosynthesis protein CobD  31.45 
 
 
323 aa  139  7e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0833  cobalamin biosynthesis protein CbiB  32.61 
 
 
374 aa  137  2e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0399526 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1468  cobalamin biosynthesis protein CobD  34.22 
 
 
318 aa  137  2e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0232  cobalamin biosynthesis protein CobD  30.34 
 
 
334 aa  137  3.0000000000000003e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.700118  normal  0.268973 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0859  cobalamin biosynthesis protein CobD  35.16 
 
 
278 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0252583  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0430  adenosylcobinamide-phosphate synthase  35.69 
 
 
311 aa  137  4e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0061  adenosylcobinamide-phosphate synthase  32.84 
 
 
305 aa  137  4e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00552046  hitchhiker  0.00179506 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1675  cobalamin biosynthesis protein  32.71 
 
 
307 aa  136  5e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.653042  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0965  cobalamin biosynthesis protein CobD  33.79 
 
 
300 aa  136  5e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2229  cobalamin biosynthesis protein CobD  34.07 
 
 
310 aa  136  5e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0406571 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0645  cobalamin biosynthesis protein CobD  32.28 
 
 
311 aa  136  6.0000000000000005e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2762  adenosylcobinamide-phosphate synthase  31.53 
 
 
318 aa  136  6.0000000000000005e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.861061  normal  0.0751378 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2355  cobalamin biosynthesis protein CobD  34.38 
 
 
311 aa  136  6.0000000000000005e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>