250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_1057 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_1057  cobalamin biosynthesis protein CobD  100 
 
 		 309 aa  614  1e-175  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0564  cobalamin biosynthesis protein CobD  61.09 
 
 		 334 aa  310  2.9999999999999997e-83  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0645  cobalamin biosynthesis protein CobD  60.23 
 
 		 311 aa  300  2e-80  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1272  cobalamin biosynthesis protein CobD  58.91 
 
 		 313 aa  280  3e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0624  adenosylcobinamide-phosphate synthase  40.86 
 
 		 308 aa  196  3e-49  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.373431  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0654  cobalamin biosynthesis protein CobD  38.28 
 
 		 308 aa  192  5e-48  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0688  cobalamin biosynthesis protein CobD  38.28 
 
 		 308 aa  192  5e-48  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_592  adenosylcobinamide-phosphate synthase  37.93 
 
 		 308 aa  190  2.9999999999999997e-47  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2348  cobalamin biosynthesis protein CobD  51.12 
 
 		 305 aa  180  2.9999999999999997e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.910265  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1370  cobalamin biosynthesis protein CobD  37.37 
 
 		 294 aa  176  4e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2148  cobalamin biosynthesis protein CobD  42.02 
 
 		 327 aa  172  5e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.445636  normal  0.0604171 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0706  cobalamin biosynthesis protein  32.6 
 
 		 311 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.380522  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0965  cobalamin biosynthesis protein CobD  45.38 
 
 		 300 aa  162  6e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0859  cobalamin biosynthesis protein CobD  34.8 
 
 		 278 aa  162  6e-39  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0252583  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1704  cobalamin biosynthesis protein  32.11 
 
 		 306 aa  159  8e-38  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.574312  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2762  adenosylcobinamide-phosphate synthase  43.6 
 
 		 318 aa  157  2e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.861061  normal  0.0751378 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1583  cobalamin biosynthesis protein CobD  35.06 
 
 		 323 aa  157  3e-37  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0758  cobalamin biosynthesis protein  32.31 
 
 		 306 aa  155  6e-37  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_956  cobalamin biosynthesis protein  36.07 
 
 		 307 aa  155  6e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0238  cobalamin biosynthesis protein  33.33 
 
 		 310 aa  155  8e-37  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3929  cobalamin biosynthesis protein  42.21 
 
 		 332 aa  154  1e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.512317  normal  0.0681298 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1711  cobalamin biosynthesis protein CobD  46.31 
 
 		 302 aa  154  2e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3631  cobalamin biosynthesis protein CobD  41.79 
 
 		 310 aa  154  2e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0416966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0198  cobalamin biosynthesis protein  31.99 
 
 		 306 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.797231 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3180  adenosylcobinamide-phosphate synthase  43.42 
 
 		 325 aa  153  4e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2533  cobalamin biosynthesis protein CobD  45.22 
 
 		 328 aa  152  5e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0967  adenosylcobinamide-phosphate synthase  36.56 
 
 		 307 aa  151  1e-35  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2090  adenosylcobinamide-phosphate synthase  30.7 
 
 		 331 aa  149  4e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0301  cobalamin biosynthesis protein CobD  33.33 
 
 		 313 aa  148  9e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1545  adenosylcobinamide-phosphate synthase  47.1 
 
 		 342 aa  148  1.0000000000000001e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.215428  normal  0.112032 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_72  cobalamin biosynthesis protein CobD  36.03 
 
 		 318 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1138  cobalamin biosynthesis protein CobD  34.86 
 
 		 307 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.697499  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3678  cobalamin biosynthesis protein  44.67 
 
 		 302 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.035544 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0430  adenosylcobinamide-phosphate synthase  40.48 
 
 		 311 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7401  adenosylcobinamide-phosphate synthase  39.93 
 
 		 369 aa  146  4.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5371  cobalamin biosynthesis protein CobD  48.41 
 
 		 301 aa  146  4.0000000000000006e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0246  cobalamin biosynthesis protein CobD  35.69 
 
 		 318 aa  146  5e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3555  cobalamin biosynthesis protein  39.48 
 
 		 333 aa  145  7.0000000000000006e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1931  cobalamin biosynthesis protein CobD  33.33 
 
 		 313 aa  144  1e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1644  cobalamin biosynthesis protein  40.77 
 
 		 302 aa  144  2e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.29794  normal  0.0167016 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2616  cobalamin biosynthesis protein CobD  42.07 
 
 		 320 aa  144  3e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1234  cobalamin biosynthesis protein  51.14 
 
 		 302 aa  142  6e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.778235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2087  cobalamin biosynthesis protein CobD  39.46 
 
 		 311 aa  142  7e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1159  cobalamin biosynthesis protein CbiB  40 
 
 		 336 aa  142  8e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2256  cobalamin biosynthesis protein  35.56 
 
 		 319 aa  142  8e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.853927  normal  0.381632 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1675  cobalamin biosynthesis protein  44.05 
 
 		 307 aa  142  9e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.653042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2355  cobalamin biosynthesis protein CobD  39.2 
 
 		 311 aa  142  9e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4115  cobalamin biosynthesis protein  44.19 
 
 		 312 aa  142  9e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0486  adenosylcobinamide-phosphate synthase  42.26 
 
 		 318 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0324  adenosylcobinamide-phosphate synthase  51.52 
 
 		 316 aa  142  9.999999999999999e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47730  cobalamin biosynthesis protein  44.19 
 
 		 312 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.452767  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1458  cobalamin biosynthesis protein CobD  42.97 
 
 		 300 aa  141  9.999999999999999e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.862014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2156  cobalamin biosynthesis protein  35.21 
 
 		 319 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2369  cobalamin biosynthesis protein  35.21 
 
 		 319 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2210  cobalamin biosynthesis protein  35.21 
 
 		 319 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.265457  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1274  cobalamin biosynthesis protein  43.75 
 
 		 302 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.272014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1099  adenosylcobinamide-phosphate synthase  42.05 
 
 		 320 aa  140  3e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4044  cobalamin biosynthesis protein  43.61 
 
 		 302 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0295  cobalamin biosynthesis protein CobD  33.56 
 
 		 316 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2555  cobalamin biosynthesis protein CobD  41.16 
 
 		 327 aa  139  6e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0881732  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2203  cobalamin biosynthesis protein  34.86 
 
 		 319 aa  139  6e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4469  cobalamin biosynthesis protein CobD  39.6 
 
 		 317 aa  138  1e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.277077  normal  0.0655318 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2392  cobalamin biosynthesis protein  38.6 
 
 		 331 aa  137  2e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0151839 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3382  adenosylcobinamide-phosphate synthase  43.09 
 
 		 336 aa  137  2e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0114495  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3744  cobalamin biosynthesis protein CobD  46.11 
 
 		 323 aa  137  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00858099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2585  cobalamin biosynthesis protein  47.37 
 
 		 303 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.650377  hitchhiker  0.000040763 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2804  cobalamin biosynthesis protein CobD  41.78 
 
 		 364 aa  136  5e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.584343  normal  0.747096 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0165  cobalamin biosynthesis protein  42.69 
 
 		 303 aa  135  7.000000000000001e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.890938  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0516  adenosylcobinamide-phosphate synthase  47.22 
 
 		 300 aa  135  8e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.071273  normal  0.0684381 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0419  cobalamin biosynthesis protein  42.78 
 
 		 324 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2321  cobalamin biosynthesis protein CobD  33.78 
 
 		 306 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3677  cobalamin biosynthesis protein CobD  39.22 
 
 		 330 aa  134  1.9999999999999998e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.544295 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1287  cobalamin biosynthesis protein CobD  38.18 
 
 		 325 aa  133  3.9999999999999996e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0123328  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3454  adenosylcobinamide-phosphate synthase  33.7 
 
 		 328 aa  132  6.999999999999999e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.868099  normal  0.111955 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1753  cobalamin biosynthesis protein  39.02 
 
 		 302 aa  132  7.999999999999999e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0271  cobalamin biosynthesis protein  40.54 
 
 		 319 aa  132  9e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2990  cobalamin biosynthesis protein CobD  39.05 
 
 		 320 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.168567  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0790  cobalamin biosynthesis protein CobD  39.33 
 
 		 323 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0828155  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2716  cobalamin biosynthesis protein  38.61 
 
 		 310 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.530545 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2200  cobalamin biosynthesis protein  38.14 
 
 		 326 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0660969 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0008  cobalamin biosynthesis protein CobD  42 
 
 		 306 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1256  cobalamin biosynthesis protein  39.74 
 
 		 331 aa  130  2.0000000000000002e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.252791  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33100  cobalamin biosynthesis protein  42.07 
 
 		 302 aa  130  3e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00042631  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0007  cobalamin biosynthesis protein CobD  34.75 
 
 		 314 aa  130  3e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3137  adenosylcobinamide-phosphate synthase  39.15 
 
 		 323 aa  130  3e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0735  cobalamin biosynthesis protein CobD  44.06 
 
 		 323 aa  130  3e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0633  cobalamin biosynthesis protein CobD  44.78 
 
 		 323 aa  130  3e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0420011  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0370  cobalamin biosynthesis protein  44.53 
 
 		 319 aa  130  4.0000000000000003e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.527036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1743  cobalamin biosynthesis protein  38.68 
 
 		 317 aa  129  5.0000000000000004e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.22977  normal  0.192923 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2621  cobalamin biosynthesis protein  40.83 
 
 		 323 aa  128  1.0000000000000001e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.246707  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0174  cobalamin biosynthesis protein CobD  39.39 
 
 		 316 aa  128  1.0000000000000001e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1294  cobalamin biosynthesis protein  39.3 
 
 		 331 aa  128  2.0000000000000002e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1305  cobalamin biosynthesis protein CobD  37.31 
 
 		 321 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1738  cobalamin biosynthesis protein CobD  37.76 
 
 		 322 aa  127  2.0000000000000002e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0463068 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1286  cobalamin biosynthesis protein CobD  32.87 
 
 		 320 aa  127  2.0000000000000002e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.726575  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2287  cobalamin biosynthesis protein  39.83 
 
 		 313 aa  127  3e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.731902  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1468  cobalamin biosynthesis protein CobD  40.27 
 
 		 318 aa  127  3e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17720  adenosylcobinamide-phosphate synthase  36.79 
 
 		 332 aa  127  3e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.213248  normal  0.925164 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1003  cobalamin biosynthesis protein  38.19 
 
 		 311 aa  127  3e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0940  cobalamin biosynthesis protein CobD  30.47 
 
 		 324 aa  125  6e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.185008 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>