262 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_1545 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_1545  adenosylcobinamide-phosphate synthase  100 
 
 		 342 aa  641    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.215428  normal  0.112032 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3180  adenosylcobinamide-phosphate synthase  69.26 
 
 		 325 aa  352  7e-96  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2533  cobalamin biosynthesis protein CobD  70.77 
 
 		 328 aa  343  2e-93  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2616  cobalamin biosynthesis protein CobD  60.53 
 
 		 320 aa  294  2e-78  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2148  cobalamin biosynthesis protein CobD  57.01 
 
 		 327 aa  292  5e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.445636  normal  0.0604171 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2762  adenosylcobinamide-phosphate synthase  59.73 
 
 		 318 aa  288  1e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.861061  normal  0.0751378 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2555  cobalamin biosynthesis protein CobD  62.91 
 
 		 327 aa  287  2e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0881732  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2804  cobalamin biosynthesis protein CobD  57.14 
 
 		 364 aa  280  3e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.584343  normal  0.747096 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0965  cobalamin biosynthesis protein CobD  55.04 
 
 		 300 aa  252  7e-66  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0516  adenosylcobinamide-phosphate synthase  54.96 
 
 		 300 aa  209  7e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.071273  normal  0.0684381 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1272  cobalamin biosynthesis protein CobD  48.72 
 
 		 313 aa  162  6e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1057  cobalamin biosynthesis protein CobD  45.74 
 
 		 309 aa  160  3e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2321  cobalamin biosynthesis protein CobD  36.07 
 
 		 306 aa  158  1e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0706  cobalamin biosynthesis protein  28.01 
 
 		 311 aa  157  2e-37  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.380522  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1370  cobalamin biosynthesis protein CobD  33.72 
 
 		 294 aa  156  6e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0061  adenosylcobinamide-phosphate synthase  35.95 
 
 		 305 aa  154  2e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00552046  hitchhiker  0.00179506 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0645  cobalamin biosynthesis protein CobD  45.62 
 
 		 311 aa  154  2e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0008  cobalamin biosynthesis protein CobD  39.29 
 
 		 306 aa  154  2e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0238  cobalamin biosynthesis protein  31.72 
 
 		 310 aa  154  2e-36  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1704  cobalamin biosynthesis protein  29.59 
 
 		 306 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.574312  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0758  cobalamin biosynthesis protein  29.21 
 
 		 306 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2090  adenosylcobinamide-phosphate synthase  30.75 
 
 		 331 aa  153  4e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0007  cobalamin biosynthesis protein CobD  40 
 
 		 314 aa  151  1e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0198  cobalamin biosynthesis protein  29.78 
 
 		 306 aa  150  4e-35  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.797231 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0859  cobalamin biosynthesis protein CobD  33.11 
 
 		 278 aa  150  4e-35  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0252583  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2348  cobalamin biosynthesis protein CobD  48.23 
 
 		 305 aa  148  1.0000000000000001e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.910265  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0624  adenosylcobinamide-phosphate synthase  33.92 
 
 		 308 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.373431  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0654  cobalamin biosynthesis protein CobD  34.27 
 
 		 308 aa  147  3e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0688  cobalamin biosynthesis protein CobD  34.27 
 
 		 308 aa  147  3e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0295  cobalamin biosynthesis protein CobD  34.68 
 
 		 316 aa  147  3e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_592  adenosylcobinamide-phosphate synthase  34.62 
 
 		 308 aa  147  4.0000000000000006e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1159  cobalamin biosynthesis protein CbiB  34.71 
 
 		 336 aa  145  1e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0633  cobalamin biosynthesis protein CobD  37.65 
 
 		 323 aa  144  3e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0420011  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2585  cobalamin biosynthesis protein  37.72 
 
 		 303 aa  143  3e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.650377  hitchhiker  0.000040763 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5371  cobalamin biosynthesis protein CobD  35.85 
 
 		 301 aa  142  8e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1138  cobalamin biosynthesis protein CobD  33.83 
 
 		 307 aa  140  3e-32  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.697499  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0967  adenosylcobinamide-phosphate synthase  36.65 
 
 		 307 aa  140  3e-32  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0564  cobalamin biosynthesis protein CobD  45.82 
 
 		 334 aa  140  3e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1583  cobalamin biosynthesis protein CobD  31.47 
 
 		 323 aa  139  4.999999999999999e-32  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0388  cobalamin biosynthesis protein CobD  40.65 
 
 		 337 aa  139  6e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_956  cobalamin biosynthesis protein  35.03 
 
 		 307 aa  138  1e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4469  cobalamin biosynthesis protein CobD  35.46 
 
 		 317 aa  137  2e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.277077  normal  0.0655318 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0790  cobalamin biosynthesis protein CobD  40.29 
 
 		 323 aa  135  7.000000000000001e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0828155  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0165  cobalamin biosynthesis protein  50.55 
 
 		 303 aa  135  9e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.890938  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0324  adenosylcobinamide-phosphate synthase  42.22 
 
 		 316 aa  134  1.9999999999999998e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0735  cobalamin biosynthesis protein CobD  44.04 
 
 		 323 aa  133  6e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3454  adenosylcobinamide-phosphate synthase  33.33 
 
 		 328 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.868099  normal  0.111955 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21170  cobalamin biosynthesis protein CobD  34.55 
 
 		 323 aa  131  2.0000000000000002e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2495  cobalamin biosynthesis protein CobD  39.22 
 
 		 328 aa  129  5.0000000000000004e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.239005  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1294  cobalamin biosynthesis protein  37.02 
 
 		 331 aa  129  8.000000000000001e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1099  adenosylcobinamide-phosphate synthase  35.05 
 
 		 320 aa  129  8.000000000000001e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3677  cobalamin biosynthesis protein CobD  37.83 
 
 		 330 aa  128  2.0000000000000002e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.544295 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3382  adenosylcobinamide-phosphate synthase  39.53 
 
 		 336 aa  127  3e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0114495  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3273  cobalamin biosynthesis protein CobD  38.03 
 
 		 330 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00284027 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3137  adenosylcobinamide-phosphate synthase  39.62 
 
 		 323 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2229  cobalamin biosynthesis protein CobD  39.81 
 
 		 310 aa  126  5e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0406571 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0430  adenosylcobinamide-phosphate synthase  42.74 
 
 		 311 aa  125  9e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2087  cobalamin biosynthesis protein CobD  41.53 
 
 		 311 aa  125  9e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2392  cobalamin biosynthesis protein  40.07 
 
 		 331 aa  125  1e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0151839 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1256  cobalamin biosynthesis protein  37.02 
 
 		 331 aa  125  1e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.252791  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_72  cobalamin biosynthesis protein CobD  33.81 
 
 		 318 aa  125  1e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1891  cobalamin biosynthesis protein  37.11 
 
 		 327 aa  124  2e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0246  cobalamin biosynthesis protein CobD  33.09 
 
 		 318 aa  124  3e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1738  cobalamin biosynthesis protein CobD  35.74 
 
 		 322 aa  124  3e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0463068 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2355  cobalamin biosynthesis protein CobD  40.96 
 
 		 311 aa  123  4e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3494  cobalamin biosynthesis protein  37.74 
 
 		 311 aa  123  4e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0987  cobalamin biosynthesis protein CbiB  37.7 
 
 		 340 aa  122  9.999999999999999e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6127  cobalamin biosynthesis protein CobD  44.29 
 
 		 314 aa  120  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00302618  hitchhiker  0.00095084 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3744  cobalamin biosynthesis protein CobD  39.13 
 
 		 323 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00858099  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1644  cobalamin biosynthesis protein  44.55 
 
 		 302 aa  120  3e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.29794  normal  0.0167016 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1475  cobalamin biosynthesis protein CobD  48.07 
 
 		 331 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.311979  hitchhiker  0.000015122 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1424  adenosylcobinamide-phosphate synthase  41.54 
 
 		 306 aa  120  3.9999999999999996e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1003  cobalamin biosynthesis protein  39.34 
 
 		 311 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1113  cobalamin biosynthesis protein  27.31 
 
 		 315 aa  119  7.999999999999999e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.386524  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0232  cobalamin biosynthesis protein CobD  35.99 
 
 		 334 aa  119  9.999999999999999e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.700118  normal  0.268973 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3631  cobalamin biosynthesis protein CobD  43.65 
 
 		 310 aa  118  9.999999999999999e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0416966  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1234  cobalamin biosynthesis protein  45.88 
 
 		 302 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.778235  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2121  cobalamin biosynthesis protein  36.57 
 
 		 326 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.373169  hitchhiker  0.00319539 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0370  cobalamin biosynthesis protein  40.07 
 
 		 319 aa  117  1.9999999999999998e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.527036  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1274  cobalamin biosynthesis protein  45.36 
 
 		 302 aa  117  3e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.272014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2621  cobalamin biosynthesis protein  36.1 
 
 		 323 aa  117  3e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.246707  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0419  cobalamin biosynthesis protein  37.11 
 
 		 324 aa  117  3e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1294  cobalamin biosynthesis protein  27.69 
 
 		 315 aa  117  3e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.392516  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0140  cobalamin biosynthesis protein  41.15 
 
 		 304 aa  116  3.9999999999999997e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5724  cobalamin biosynthesis protein CobD  47 
 
 		 330 aa  116  6e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.571029 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0483  cobalamin biosynthesis protein  37.82 
 
 		 314 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1743  cobalamin biosynthesis protein  35.53 
 
 		 317 aa  116  6.9999999999999995e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.22977  normal  0.192923 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3929  cobalamin biosynthesis protein  39.34 
 
 		 332 aa  115  8.999999999999998e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.512317  normal  0.0681298 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33100  cobalamin biosynthesis protein  40.43 
 
 		 302 aa  114  2.0000000000000002e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00042631  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1675  cobalamin biosynthesis protein  44.33 
 
 		 307 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.653042  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1711  cobalamin biosynthesis protein CobD  42.23 
 
 		 302 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2716  cobalamin biosynthesis protein  40.67 
 
 		 310 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.530545 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1351  cobalamin biosynthesis protein CobD  39.29 
 
 		 328 aa  114  2.0000000000000002e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2205  cobalamin biosynthesis protein  39.77 
 
 		 313 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0351195  normal  0.625062 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1857  cobalamin biosynthesis protein CobD  37.62 
 
 		 308 aa  114  2.0000000000000002e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4044  cobalamin biosynthesis protein  44.33 
 
 		 302 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1458  cobalamin biosynthesis protein CobD  43.16 
 
 		 300 aa  114  3e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.862014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7401  adenosylcobinamide-phosphate synthase  46.11 
 
 		 369 aa  114  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0846  cobalamin biosynthesis protein  44.77 
 
 		 314 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3555  cobalamin biosynthesis protein  38.75 
 
 		 333 aa  112  7.000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>