233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_2321 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_2321  cobalamin biosynthesis protein CobD  100 
 
 
306 aa  621  1e-177  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2229  cobalamin biosynthesis protein CobD  59.72 
 
 
310 aa  323  3e-87  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0406571 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0061  adenosylcobinamide-phosphate synthase  53.11 
 
 
305 aa  317  2e-85  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00552046  hitchhiker  0.00179506 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0007  cobalamin biosynthesis protein CobD  54.61 
 
 
314 aa  314  9.999999999999999e-85  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0008  cobalamin biosynthesis protein CobD  56.55 
 
 
306 aa  313  1.9999999999999998e-84  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1583  cobalamin biosynthesis protein CobD  37.42 
 
 
323 aa  181  1e-44  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0238  cobalamin biosynthesis protein  37.16 
 
 
310 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_592  adenosylcobinamide-phosphate synthase  37.73 
 
 
308 aa  166  5e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0654  cobalamin biosynthesis protein CobD  38.1 
 
 
308 aa  165  1.0000000000000001e-39  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0688  cobalamin biosynthesis protein CobD  38.1 
 
 
308 aa  165  1.0000000000000001e-39  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0624  adenosylcobinamide-phosphate synthase  37.36 
 
 
308 aa  162  5.0000000000000005e-39  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.373431  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0706  cobalamin biosynthesis protein  34.28 
 
 
311 aa  157  3e-37  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.380522  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0758  cobalamin biosynthesis protein  34.75 
 
 
306 aa  154  2e-36  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1704  cobalamin biosynthesis protein  34.23 
 
 
306 aa  152  7e-36  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.574312  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2616  cobalamin biosynthesis protein CobD  35.95 
 
 
320 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0633  cobalamin biosynthesis protein CobD  36.26 
 
 
323 aa  145  6e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0420011  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2090  adenosylcobinamide-phosphate synthase  35.23 
 
 
331 aa  145  7.0000000000000006e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0198  cobalamin biosynthesis protein  34.32 
 
 
306 aa  144  2e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.797231 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1545  adenosylcobinamide-phosphate synthase  35.02 
 
 
342 aa  144  2e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.215428  normal  0.112032 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2804  cobalamin biosynthesis protein CobD  37.74 
 
 
364 aa  143  4e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.584343  normal  0.747096 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2555  cobalamin biosynthesis protein CobD  39.13 
 
 
327 aa  141  9.999999999999999e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0881732  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2704  cobalamin biosynthesis protein CobD  37.69 
 
 
315 aa  140  3.9999999999999997e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2148  cobalamin biosynthesis protein CobD  33.33 
 
 
327 aa  138  1e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.445636  normal  0.0604171 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0301  cobalamin biosynthesis protein CobD  34.21 
 
 
313 aa  137  2e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2762  adenosylcobinamide-phosphate synthase  36.12 
 
 
318 aa  137  3.0000000000000003e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.861061  normal  0.0751378 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0859  cobalamin biosynthesis protein CobD  35.18 
 
 
278 aa  136  4e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0252583  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2089  cobD; cobalamin biosynthetic protein  35.02 
 
 
301 aa  135  6.0000000000000005e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.284243  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0790  cobalamin biosynthesis protein CobD  31.61 
 
 
323 aa  135  7.000000000000001e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0828155  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1099  adenosylcobinamide-phosphate synthase  35.48 
 
 
320 aa  134  1.9999999999999998e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3180  adenosylcobinamide-phosphate synthase  37.12 
 
 
325 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1057  cobalamin biosynthesis protein CobD  34.4 
 
 
309 aa  132  5e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0295  cobalamin biosynthesis protein CobD  34.41 
 
 
316 aa  132  5e-30  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1931  cobalamin biosynthesis protein CobD  33.01 
 
 
313 aa  132  6.999999999999999e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0870  cobalamin biosynthesis protein CobD  33.55 
 
 
323 aa  132  9e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1721  adenosylcobinamide-phosphate synthase  31.16 
 
 
319 aa  131  1.0000000000000001e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4044  cobalamin biosynthesis protein  33.45 
 
 
302 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1458  cobalamin biosynthesis protein CobD  35.64 
 
 
300 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.862014  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0042  cobalamin biosynthesis protein CobD  35.39 
 
 
328 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0516  adenosylcobinamide-phosphate synthase  37.94 
 
 
300 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.071273  normal  0.0684381 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0735  cobalamin biosynthesis protein CobD  34.36 
 
 
323 aa  130  3e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2533  cobalamin biosynthesis protein CobD  36.21 
 
 
328 aa  130  3e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1113  cobalamin biosynthesis protein  31.87 
 
 
315 aa  130  3e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.386524  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1370  cobalamin biosynthesis protein CobD  30.94 
 
 
294 aa  130  4.0000000000000003e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1019  cobalamin biosynthesis protein CobD  33.46 
 
 
308 aa  129  6e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2990  cobalamin biosynthesis protein CobD  36.22 
 
 
320 aa  129  7.000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.168567  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1675  cobalamin biosynthesis protein  33.45 
 
 
307 aa  129  8.000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.653042  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1305  cobalamin biosynthesis protein CobD  36.05 
 
 
321 aa  129  8.000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1138  cobalamin biosynthesis protein CobD  32.41 
 
 
307 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.697499  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0324  adenosylcobinamide-phosphate synthase  35.21 
 
 
316 aa  128  1.0000000000000001e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3677  cobalamin biosynthesis protein CobD  34.3 
 
 
330 aa  127  2.0000000000000002e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.544295 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0486  adenosylcobinamide-phosphate synthase  32.8 
 
 
318 aa  127  3e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1294  cobalamin biosynthesis protein  32.67 
 
 
315 aa  126  4.0000000000000003e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.392516  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1514  cobalamin biosynthesis protein  32.63 
 
 
325 aa  126  5e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0757  cobalamin biosynthesis protein  34.92 
 
 
321 aa  126  5e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.463156  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2585  cobalamin biosynthesis protein  32.95 
 
 
303 aa  125  9e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.650377  hitchhiker  0.000040763 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1891  cobalamin biosynthesis protein  35.32 
 
 
327 aa  125  1e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1274  cobalamin biosynthesis protein  32.43 
 
 
302 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.272014  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0483  cobalamin biosynthesis protein  32.37 
 
 
314 aa  124  2e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3744  cobalamin biosynthesis protein CobD  33.46 
 
 
323 aa  124  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00858099  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3553  cobalamin biosynthesis protein CobD  37.7 
 
 
315 aa  124  2e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0341108  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0965  cobalamin biosynthesis protein CobD  44.38 
 
 
300 aa  123  3e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1267  cobalamin biosynthesis protein  33.33 
 
 
324 aa  123  3e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0645  cobalamin biosynthesis protein CobD  36.82 
 
 
311 aa  123  4e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2087  cobalamin biosynthesis protein CobD  37.9 
 
 
311 aa  123  4e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0967  adenosylcobinamide-phosphate synthase  31.8 
 
 
307 aa  122  5e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_956  cobalamin biosynthesis protein  31.13 
 
 
307 aa  122  7e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2209  cobalamin biosynthesis protein  29 
 
 
323 aa  122  9e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2389  cobalamin biosynthesis protein CobD  33.95 
 
 
357 aa  122  9.999999999999999e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21170  cobalamin biosynthesis protein CobD  29.57 
 
 
323 aa  122  9.999999999999999e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0419  cobalamin biosynthesis protein  31.65 
 
 
324 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0969  cobalamin biosynthesis protein CobD  30.67 
 
 
305 aa  120  3e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.380612  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0246  cobalamin biosynthesis protein CobD  30.19 
 
 
318 aa  120  3e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0430  adenosylcobinamide-phosphate synthase  40.35 
 
 
311 aa  120  3e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1234  cobalamin biosynthesis protein  32.81 
 
 
302 aa  120  3e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.778235  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1644  cobalamin biosynthesis protein  33.56 
 
 
302 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.29794  normal  0.0167016 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0102  cobalamin biosynthesis protein  30.94 
 
 
317 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_72  cobalamin biosynthesis protein CobD  32.27 
 
 
318 aa  120  3.9999999999999996e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1711  cobalamin biosynthesis protein CobD  35.29 
 
 
302 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1266  cobalamin biosynthesis protein  35 
 
 
319 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3454  adenosylcobinamide-phosphate synthase  29.75 
 
 
328 aa  119  6e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.868099  normal  0.111955 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1738  cobalamin biosynthesis protein CobD  31.21 
 
 
322 aa  119  6e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0463068 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5371  cobalamin biosynthesis protein CobD  31.72 
 
 
301 aa  119  6e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1294  cobalamin biosynthesis protein  34.8 
 
 
331 aa  118  9.999999999999999e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2355  cobalamin biosynthesis protein CobD  40.35 
 
 
311 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1119  cobalamin biosynthesis protein  33.2 
 
 
317 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4469  cobalamin biosynthesis protein CobD  33.08 
 
 
317 aa  117  3e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.277077  normal  0.0655318 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2716  cobalamin biosynthesis protein  34.87 
 
 
310 aa  117  3e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.530545 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3538  cobalamin biosynthesis protein CobD  33.33 
 
 
319 aa  117  3e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1256  cobalamin biosynthesis protein  34.92 
 
 
331 aa  116  5e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.252791  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0388  cobalamin biosynthesis protein CobD  31.78 
 
 
337 aa  116  5e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3604  cobalamin biosynthesis protein CobD  31.72 
 
 
319 aa  116  5e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3678  cobalamin biosynthesis protein  33.59 
 
 
302 aa  116  6e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.035544 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33100  cobalamin biosynthesis protein  32.13 
 
 
302 aa  115  6.9999999999999995e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00042631  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3382  adenosylcobinamide-phosphate synthase  36.93 
 
 
336 aa  115  7.999999999999999e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0114495  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0140  cobalamin biosynthesis protein  33.7 
 
 
304 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1743  cobalamin biosynthesis protein  31.95 
 
 
317 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.22977  normal  0.192923 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1272  cobalamin biosynthesis protein CobD  35.62 
 
 
313 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2495  cobalamin biosynthesis protein CobD  32.97 
 
 
328 aa  114  2.0000000000000002e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.239005  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2621  cobalamin biosynthesis protein  30.94 
 
 
323 aa  114  2.0000000000000002e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.246707  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1468  cobalamin biosynthesis protein CobD  30.98 
 
 
318 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>