268 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_2762 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_2762  adenosylcobinamide-phosphate synthase  100 
 
 
318 aa  631  1e-180  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.861061  normal  0.0751378 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2148  cobalamin biosynthesis protein CobD  61.3 
 
 
327 aa  337  1.9999999999999998e-91  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.445636  normal  0.0604171 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3180  adenosylcobinamide-phosphate synthase  61.94 
 
 
325 aa  312  3.9999999999999997e-84  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2616  cobalamin biosynthesis protein CobD  61.06 
 
 
320 aa  310  2e-83  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2533  cobalamin biosynthesis protein CobD  62.72 
 
 
328 aa  293  2e-78  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2555  cobalamin biosynthesis protein CobD  56.43 
 
 
327 aa  282  7.000000000000001e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0881732  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1545  adenosylcobinamide-phosphate synthase  61.15 
 
 
342 aa  274  2.0000000000000002e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.215428  normal  0.112032 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2804  cobalamin biosynthesis protein CobD  56.46 
 
 
364 aa  262  6e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.584343  normal  0.747096 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0965  cobalamin biosynthesis protein CobD  56.79 
 
 
300 aa  259  4e-68  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0516  adenosylcobinamide-phosphate synthase  51.92 
 
 
300 aa  207  2e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.071273  normal  0.0684381 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1370  cobalamin biosynthesis protein CobD  36.88 
 
 
294 aa  178  1e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0645  cobalamin biosynthesis protein CobD  44.4 
 
 
311 aa  176  4e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0295  cobalamin biosynthesis protein CobD  37.37 
 
 
316 aa  174  9.999999999999999e-43  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1057  cobalamin biosynthesis protein CobD  44.01 
 
 
309 aa  174  1.9999999999999998e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1272  cobalamin biosynthesis protein CobD  44.98 
 
 
313 aa  172  1e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0706  cobalamin biosynthesis protein  31.75 
 
 
311 aa  168  1e-40  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.380522  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0007  cobalamin biosynthesis protein CobD  40.28 
 
 
314 aa  165  8e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0859  cobalamin biosynthesis protein CobD  33.89 
 
 
278 aa  163  4.0000000000000004e-39  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0252583  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0140  cobalamin biosynthesis protein  39.22 
 
 
304 aa  162  8.000000000000001e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2585  cobalamin biosynthesis protein  40.88 
 
 
303 aa  159  8e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.650377  hitchhiker  0.000040763 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0564  cobalamin biosynthesis protein CobD  42.86 
 
 
334 aa  158  1e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0008  cobalamin biosynthesis protein CobD  38.67 
 
 
306 aa  158  1e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2321  cobalamin biosynthesis protein CobD  35.48 
 
 
306 aa  157  2e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2348  cobalamin biosynthesis protein CobD  47.96 
 
 
305 aa  155  1e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.910265  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0633  cobalamin biosynthesis protein CobD  37.2 
 
 
323 aa  154  2e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0420011  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4469  cobalamin biosynthesis protein CobD  34.97 
 
 
317 aa  153  2.9999999999999998e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.277077  normal  0.0655318 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1704  cobalamin biosynthesis protein  33.33 
 
 
306 aa  153  4e-36  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.574312  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0238  cobalamin biosynthesis protein  33.45 
 
 
310 aa  153  4e-36  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0624  adenosylcobinamide-phosphate synthase  36.11 
 
 
308 aa  152  7e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.373431  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0654  cobalamin biosynthesis protein CobD  38.19 
 
 
308 aa  151  1e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0688  cobalamin biosynthesis protein CobD  38.19 
 
 
308 aa  151  1e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0758  cobalamin biosynthesis protein  32.25 
 
 
306 aa  150  2e-35  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5371  cobalamin biosynthesis protein CobD  35.79 
 
 
301 aa  150  3e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0198  cobalamin biosynthesis protein  32.61 
 
 
306 aa  150  3e-35  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.797231 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1583  cobalamin biosynthesis protein CobD  32.58 
 
 
323 aa  149  5e-35  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_592  adenosylcobinamide-phosphate synthase  38.19 
 
 
308 aa  149  5e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0061  adenosylcobinamide-phosphate synthase  33.23 
 
 
305 aa  149  8e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00552046  hitchhiker  0.00179506 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2090  adenosylcobinamide-phosphate synthase  31.89 
 
 
331 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0967  adenosylcobinamide-phosphate synthase  37 
 
 
307 aa  147  3e-34  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_956  cobalamin biosynthesis protein  36.65 
 
 
307 aa  146  4.0000000000000006e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3454  adenosylcobinamide-phosphate synthase  34.27 
 
 
328 aa  145  1e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.868099  normal  0.111955 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0370  cobalamin biosynthesis protein  38.67 
 
 
319 aa  143  3e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.527036  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0735  cobalamin biosynthesis protein CobD  43.81 
 
 
323 aa  143  4e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2209  cobalamin biosynthesis protein  34.42 
 
 
323 aa  143  4e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1138  cobalamin biosynthesis protein CobD  35.34 
 
 
307 aa  142  6e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.697499  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0388  cobalamin biosynthesis protein CobD  39.86 
 
 
337 aa  142  8e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2355  cobalamin biosynthesis protein CobD  38.25 
 
 
311 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0486  adenosylcobinamide-phosphate synthase  39.49 
 
 
318 aa  140  3e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1159  cobalamin biosynthesis protein CbiB  36.33 
 
 
336 aa  139  6e-32  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1099  adenosylcobinamide-phosphate synthase  35.79 
 
 
320 aa  139  8.999999999999999e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2495  cobalamin biosynthesis protein CobD  36.82 
 
 
328 aa  138  1e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.239005  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0790  cobalamin biosynthesis protein CobD  37.5 
 
 
323 aa  137  2e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0828155  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0430  adenosylcobinamide-phosphate synthase  38.6 
 
 
311 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2087  cobalamin biosynthesis protein CobD  38.6 
 
 
311 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0165  cobalamin biosynthesis protein  38.57 
 
 
303 aa  135  7.000000000000001e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.890938  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3677  cobalamin biosynthesis protein CobD  34.41 
 
 
330 aa  135  9e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.544295 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0419  cobalamin biosynthesis protein  35.09 
 
 
324 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3273  cobalamin biosynthesis protein CobD  38.89 
 
 
330 aa  134  3e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00284027 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_72  cobalamin biosynthesis protein CobD  32.5 
 
 
318 aa  134  3e-30  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0324  adenosylcobinamide-phosphate synthase  43.64 
 
 
316 aa  133  5e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3805  cobalamin biosynthesis protein CobD  31.23 
 
 
327 aa  133  5e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2229  cobalamin biosynthesis protein CobD  44.81 
 
 
310 aa  132  5e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0406571 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1286  cobalamin biosynthesis protein CobD  30.82 
 
 
320 aa  132  6e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.726575  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1514  cobalamin biosynthesis protein  35.21 
 
 
325 aa  132  6e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3731  cobalamin biosynthesis protein  39.11 
 
 
321 aa  132  6e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1711  cobalamin biosynthesis protein CobD  37.64 
 
 
302 aa  132  6.999999999999999e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1234  cobalamin biosynthesis protein  38.52 
 
 
302 aa  132  6.999999999999999e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.778235  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0246  cobalamin biosynthesis protein CobD  32.19 
 
 
318 aa  131  1.0000000000000001e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1644  cobalamin biosynthesis protein  38.17 
 
 
302 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.29794  normal  0.0167016 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0301  cobalamin biosynthesis protein CobD  33.57 
 
 
313 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1294  cobalamin biosynthesis protein  37.8 
 
 
331 aa  130  2.0000000000000002e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3857  cobalamin biosynthesis protein CobD  30.91 
 
 
327 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.932338  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1891  cobalamin biosynthesis protein  36.98 
 
 
327 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3678  cobalamin biosynthesis protein  36.9 
 
 
302 aa  130  3e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.035544 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2089  cobD; cobalamin biosynthetic protein  34.44 
 
 
301 aa  130  3e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.284243  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1274  cobalamin biosynthesis protein  38.16 
 
 
302 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.272014  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1441  cobalamin biosynthesis protein CobD  32.4 
 
 
329 aa  129  8.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47730  cobalamin biosynthesis protein  35.49 
 
 
312 aa  129  9.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.452767  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2716  cobalamin biosynthesis protein  38.31 
 
 
310 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.530545 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2178  cobalamin biosynthesis protein CobD  30.63 
 
 
316 aa  127  2.0000000000000002e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3382  adenosylcobinamide-phosphate synthase  44.39 
 
 
336 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0114495  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4115  cobalamin biosynthesis protein  35.15 
 
 
312 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3929  cobalamin biosynthesis protein  37.18 
 
 
332 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.512317  normal  0.0681298 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2658  cobalamin biosynthesis protein  37.17 
 
 
326 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.869405 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1931  cobalamin biosynthesis protein CobD  31.79 
 
 
313 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1113  cobalamin biosynthesis protein  28.07 
 
 
315 aa  126  4.0000000000000003e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.386524  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1675  cobalamin biosynthesis protein  38.16 
 
 
307 aa  126  5e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.653042  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1256  cobalamin biosynthesis protein  37.4 
 
 
331 aa  126  6e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.252791  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0271  cobalamin biosynthesis protein  36.55 
 
 
319 aa  126  6e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1458  cobalamin biosynthesis protein CobD  43.43 
 
 
300 aa  125  7e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.862014  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3127  cobalamin biosynthesis protein  31.99 
 
 
320 aa  125  8.000000000000001e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4044  cobalamin biosynthesis protein  37.46 
 
 
302 aa  125  9e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2621  cobalamin biosynthesis protein  36.52 
 
 
323 aa  125  9e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.246707  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0483  cobalamin biosynthesis protein  37.14 
 
 
314 aa  124  1e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2200  cobalamin biosynthesis protein  35.42 
 
 
326 aa  125  1e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0660969 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33100  cobalamin biosynthesis protein  38.83 
 
 
302 aa  124  2e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00042631  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2392  cobalamin biosynthesis protein  36.49 
 
 
331 aa  124  2e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0151839 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1305  cobalamin biosynthesis protein CobD  33.09 
 
 
321 aa  124  2e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1743  cobalamin biosynthesis protein  35.61 
 
 
317 aa  124  2e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.22977  normal  0.192923 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6127  cobalamin biosynthesis protein CobD  36.36 
 
 
314 aa  124  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00302618  hitchhiker  0.00095084 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>