230 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_0987 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013922  Nmag_0987  cobalamin biosynthesis protein CbiB  100 
 
 		 340 aa  642    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2833  cobalamin biosynthesis protein CobD  67 
 
 		 378 aa  319  3e-86  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2495  cobalamin biosynthesis protein CobD  52.68 
 
 		 328 aa  248  1e-64  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.239005  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0232  cobalamin biosynthesis protein CobD  48.56 
 
 		 334 aa  212  5.999999999999999e-54  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.700118  normal  0.268973 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2090  adenosylcobinamide-phosphate synthase  35.85 
 
 		 331 aa  169  5e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0144  cobalamin biosynthesis protein CobD  51.08 
 
 		 313 aa  165  1.0000000000000001e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.942138 
 
 
-
 
NC_002936  DET0654  cobalamin biosynthesis protein CobD  34.39 
 
 		 308 aa  135  7.000000000000001e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0688  cobalamin biosynthesis protein CobD  34.39 
 
 		 308 aa  135  7.000000000000001e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_592  adenosylcobinamide-phosphate synthase  34.08 
 
 		 308 aa  135  8e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1441  cobalamin biosynthesis protein CobD  33.57 
 
 		 329 aa  133  5e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0483  cobalamin biosynthesis protein  36.02 
 
 		 314 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2087  cobalamin biosynthesis protein CobD  38.96 
 
 		 311 aa  130  5.0000000000000004e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0419  cobalamin biosynthesis protein  39.06 
 
 		 324 aa  129  8.000000000000001e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3454  adenosylcobinamide-phosphate synthase  33.75 
 
 		 328 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.868099  normal  0.111955 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2209  cobalamin biosynthesis protein  32.27 
 
 		 323 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1294  cobalamin biosynthesis protein  28.33 
 
 		 315 aa  128  1.0000000000000001e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.392516  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3180  adenosylcobinamide-phosphate synthase  38.23 
 
 		 325 aa  129  1.0000000000000001e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0624  adenosylcobinamide-phosphate synthase  32.05 
 
 		 308 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.373431  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0486  adenosylcobinamide-phosphate synthase  40.29 
 
 		 318 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1583  cobalamin biosynthesis protein CobD  29.61 
 
 		 323 aa  128  2.0000000000000002e-28  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0007  cobalamin biosynthesis protein CobD  33.89 
 
 		 314 aa  128  2.0000000000000002e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21170  cobalamin biosynthesis protein CobD  32.48 
 
 		 323 aa  127  3e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0633  cobalamin biosynthesis protein CobD  38.07 
 
 		 323 aa  127  3e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0420011  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1113  cobalamin biosynthesis protein  27.99 
 
 		 315 aa  125  7e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.386524  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3127  cobalamin biosynthesis protein  32.49 
 
 		 320 aa  125  1e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0430  adenosylcobinamide-phosphate synthase  38.83 
 
 		 311 aa  125  1e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0295  cobalamin biosynthesis protein CobD  32.78 
 
 		 316 aa  125  1e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1545  adenosylcobinamide-phosphate synthase  38.85 
 
 		 342 aa  125  1e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.215428  normal  0.112032 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2533  cobalamin biosynthesis protein CobD  36.13 
 
 		 328 aa  124  2e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1704  cobalamin biosynthesis protein  28.37 
 
 		 306 aa  123  4e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.574312  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2990  cobalamin biosynthesis protein CobD  36.9 
 
 		 320 aa  123  6e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.168567  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2256  cobalamin biosynthesis protein  33 
 
 		 319 aa  122  8e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.853927  normal  0.381632 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2148  cobalamin biosynthesis protein CobD  34.8 
 
 		 327 aa  122  9e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.445636  normal  0.0604171 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1305  cobalamin biosynthesis protein CobD  32.7 
 
 		 321 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2616  cobalamin biosynthesis protein CobD  36.51 
 
 		 320 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2156  cobalamin biosynthesis protein  32.67 
 
 		 319 aa  121  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2203  cobalamin biosynthesis protein  32.67 
 
 		 319 aa  121  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2210  cobalamin biosynthesis protein  32.67 
 
 		 319 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.265457  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2369  cobalamin biosynthesis protein  32.67 
 
 		 319 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2355  cobalamin biosynthesis protein CobD  40.78 
 
 		 311 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0238  cobalamin biosynthesis protein  27.3 
 
 		 310 aa  120  3e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3857  cobalamin biosynthesis protein CobD  30.82 
 
 		 327 aa  120  3e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.932338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0758  cobalamin biosynthesis protein  28.37 
 
 		 306 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2716  cobalamin biosynthesis protein  39.3 
 
 		 310 aa  118  9.999999999999999e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.530545 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3805  cobalamin biosynthesis protein CobD  30.25 
 
 		 327 aa  118  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0042  cobalamin biosynthesis protein CobD  35.76 
 
 		 328 aa  117  3e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0061  adenosylcobinamide-phosphate synthase  30.42 
 
 		 305 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00552046  hitchhiker  0.00179506 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1514  cobalamin biosynthesis protein  35.8 
 
 		 325 aa  116  5e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3273  cobalamin biosynthesis protein CobD  37 
 
 		 330 aa  116  6.9999999999999995e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00284027 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_956  cobalamin biosynthesis protein  30.79 
 
 		 307 aa  115  8.999999999999998e-25  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0301  cobalamin biosynthesis protein CobD  29.58 
 
 		 313 aa  115  8.999999999999998e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0706  cobalamin biosynthesis protein  26.95 
 
 		 311 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.380522  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0965  cobalamin biosynthesis protein CobD  35.08 
 
 		 300 aa  115  2.0000000000000002e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1267  cobalamin biosynthesis protein  34.48 
 
 		 324 aa  114  2.0000000000000002e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3604  cobalamin biosynthesis protein CobD  38.18 
 
 		 319 aa  114  3e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1441  cobalamin biosynthesis protein  36.88 
 
 		 325 aa  114  3e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.282346  normal  0.506208 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3538  cobalamin biosynthesis protein CobD  38.81 
 
 		 319 aa  113  4.0000000000000004e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0790  cobalamin biosynthesis protein CobD  36.79 
 
 		 323 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0828155  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1266  cobalamin biosynthesis protein  32.61 
 
 		 319 aa  113  5e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5371  cobalamin biosynthesis protein CobD  33.46 
 
 		 301 aa  112  7.000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1738  cobalamin biosynthesis protein CobD  36.12 
 
 		 322 aa  112  8.000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0463068 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0198  cobalamin biosynthesis protein  28.37 
 
 		 306 aa  112  9e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.797231 
 
 
-
 
NC_002950  PG1159  cobalamin biosynthesis protein CbiB  30.1 
 
 		 336 aa  112  1.0000000000000001e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2178  cobalamin biosynthesis protein CobD  32.23 
 
 		 316 aa  111  2.0000000000000002e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0757  cobalamin biosynthesis protein  31.79 
 
 		 321 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.463156  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0418  cobalamin biosynthesis protein CobD  34.81 
 
 		 332 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.984045  normal  0.740708 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0555  cobalamin biosynthesis protein CobD  32.7 
 
 		 311 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1458  cobalamin biosynthesis protein CobD  39.62 
 
 		 300 aa  110  3e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.862014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1931  cobalamin biosynthesis protein CobD  27.97 
 
 		 313 aa  110  3e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4469  cobalamin biosynthesis protein CobD  30.38 
 
 		 317 aa  110  3e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.277077  normal  0.0655318 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0008  cobalamin biosynthesis protein CobD  36.21 
 
 		 306 aa  110  3e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0324  adenosylcobinamide-phosphate synthase  39.22 
 
 		 316 aa  110  5e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1551  cobalamin biosynthesis protein CbiB  36.59 
 
 		 326 aa  109  6e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.529167  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2585  cobalamin biosynthesis protein  35.27 
 
 		 303 aa  109  7.000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.650377  hitchhiker  0.000040763 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1119  cobalamin biosynthesis protein  34.32 
 
 		 317 aa  109  7.000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0940  cobalamin biosynthesis protein CobD  28.23 
 
 		 324 aa  109  9.000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.185008 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2762  adenosylcobinamide-phosphate synthase  35.6 
 
 		 318 aa  108  1e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.861061  normal  0.0751378 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2555  cobalamin biosynthesis protein CobD  37.89 
 
 		 327 aa  108  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0881732  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0870  cobalamin biosynthesis protein CobD  33.99 
 
 		 323 aa  108  2e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0516  adenosylcobinamide-phosphate synthase  38.78 
 
 		 300 aa  107  2e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.071273  normal  0.0684381 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1861  cobalamin biosynthesis protein  30.1 
 
 		 330 aa  107  3e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.130243 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1351  cobalamin biosynthesis protein CobD  37.69 
 
 		 328 aa  106  7e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3092  cobalamin biosynthesis protein CobD  34.43 
 
 		 336 aa  103  3e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.423715  hitchhiker  0.00432553 
 
 
-
 
NC_002936  DET1138  cobalamin biosynthesis protein CobD  30.06 
 
 		 307 aa  103  4e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.697499  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1711  cobalamin biosynthesis protein CobD  34.16 
 
 		 302 aa  103  4e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1099  adenosylcobinamide-phosphate synthase  33.01 
 
 		 320 aa  103  4e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0388  cobalamin biosynthesis protein CobD  35.59 
 
 		 337 aa  103  4e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1068  cobalamin biosynthesis protein  33.95 
 
 		 321 aa  103  4e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.882793  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2804  cobalamin biosynthesis protein CobD  35.02 
 
 		 364 aa  102  6e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.584343  normal  0.747096 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0165  cobalamin biosynthesis protein  32.99 
 
 		 303 aa  103  6e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.890938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2704  cobalamin biosynthesis protein CobD  30.92 
 
 		 315 aa  102  7e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0370  cobalamin biosynthesis protein  36.82 
 
 		 319 aa  102  8e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.527036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3137  adenosylcobinamide-phosphate synthase  37.96 
 
 		 323 aa  102  8e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0735  cobalamin biosynthesis protein CobD  38.29 
 
 		 323 aa  101  2e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1370  cobalamin biosynthesis protein CobD  29.23 
 
 		 294 aa  101  2e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0538  cobalamin biosynthesis protein CobD  35.34 
 
 		 299 aa  101  2e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.404725  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3553  cobalamin biosynthesis protein CobD  36.36 
 
 		 315 aa  101  2e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0341108  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2389  cobalamin biosynthesis protein CobD  32.64 
 
 		 357 aa  100  3e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3744  cobalamin biosynthesis protein CobD  39.01 
 
 		 323 aa  100  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00858099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0967  adenosylcobinamide-phosphate synthase  33.22 
 
 		 307 aa  100  3e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>