299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_1857 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_1857  cobalamin biosynthesis protein CobD  100 
 
 		 308 aa  593  1e-169  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3731  cobalamin biosynthesis protein  57.79 
 
 		 321 aa  265  7e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33100  cobalamin biosynthesis protein  56.63 
 
 		 302 aa  259  3e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00042631  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0271  cobalamin biosynthesis protein  52.3 
 
 		 319 aa  254  1.0000000000000001e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3678  cobalamin biosynthesis protein  52.3 
 
 		 302 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.035544 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1644  cobalamin biosynthesis protein  52.52 
 
 		 302 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.29794  normal  0.0167016 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1003  cobalamin biosynthesis protein  51.06 
 
 		 311 aa  251  1e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4044  cobalamin biosynthesis protein  52.63 
 
 		 302 aa  250  2e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1458  cobalamin biosynthesis protein CobD  51.69 
 
 		 300 aa  249  4e-65  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.862014  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1675  cobalamin biosynthesis protein  52.28 
 
 		 307 aa  248  7e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.653042  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1711  cobalamin biosynthesis protein CobD  51.59 
 
 		 302 aa  248  9e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1274  cobalamin biosynthesis protein  51.23 
 
 		 302 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.272014  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2392  cobalamin biosynthesis protein  50.52 
 
 		 331 aa  242  6e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0151839 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1234  cobalamin biosynthesis protein  50.88 
 
 		 302 aa  242  7e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.778235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2716  cobalamin biosynthesis protein  52.19 
 
 		 310 aa  241  7.999999999999999e-63  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.530545 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2205  cobalamin biosynthesis protein  48.97 
 
 		 313 aa  241  7.999999999999999e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0351195  normal  0.625062 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3494  cobalamin biosynthesis protein  48.77 
 
 		 311 aa  241  1e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0102  cobalamin biosynthesis protein  50.17 
 
 		 317 aa  240  2e-62  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1424  adenosylcobinamide-phosphate synthase  50 
 
 		 306 aa  239  4e-62  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0140  cobalamin biosynthesis protein  46.84 
 
 		 304 aa  233  3e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2658  cobalamin biosynthesis protein  51.41 
 
 		 326 aa  233  3e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.869405 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2200  cobalamin biosynthesis protein  48.45 
 
 		 326 aa  229  5e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0660969 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1753  cobalamin biosynthesis protein  51.94 
 
 		 302 aa  227  2e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47730  cobalamin biosynthesis protein  51.06 
 
 		 312 aa  224  1e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.452767  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2287  cobalamin biosynthesis protein  49.83 
 
 		 313 aa  224  2e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.731902  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0663  cobalamin biosynthesis protein  50.68 
 
 		 326 aa  224  2e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4115  cobalamin biosynthesis protein  50.71 
 
 		 312 aa  224  2e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2818  adenosylcobinamide-phosphate synthase  52.67 
 
 		 311 aa  223  2e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00349182  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2089  cobD; cobalamin biosynthetic protein  47.7 
 
 		 301 aa  219  5e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.284243  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1837  cobalamin biosynthesis protein  46.69 
 
 		 312 aa  216  4e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.41199  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2448  cobalamin biosynthesis protein  46.69 
 
 		 312 aa  216  4e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2453  cobalamin biosynthesis protein  46.69 
 
 		 312 aa  216  4e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.393352  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2496  cobalamin biosynthesis protein  49.82 
 
 		 312 aa  215  7e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.315833  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2364  cobalamin biosynthesis protein  47.67 
 
 		 314 aa  212  5.999999999999999e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0846  cobalamin biosynthesis protein  48.79 
 
 		 314 aa  212  5.999999999999999e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1131  cobalamin biosynthesis protein CobD  41.31 
 
 		 351 aa  212  5.999999999999999e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3677  cobalamin biosynthesis protein CobD  41.67 
 
 		 330 aa  208  9e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.544295 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5779  cobalamin biosynthesis protein  48.57 
 
 		 314 aa  206  3e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.642032 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0842  cobalamin biosynthesis protein  45.52 
 
 		 314 aa  206  4e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.98695  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2780  cobalamin biosynthesis protein  48.81 
 
 		 326 aa  206  5e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0845124  normal  0.636847 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2318  cobalamin biosynthesis protein  47.04 
 
 		 310 aa  205  7e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0401808  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2969  cobalamin biosynthesis protein  47.04 
 
 		 310 aa  205  7e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0695  cobalamin biosynthesis protein  47.04 
 
 		 310 aa  205  7e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.114905  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1630  cobalamin biosynthesis protein  47.04 
 
 		 310 aa  205  7e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.187303  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1037  cobalamin biosynthesis protein  48.08 
 
 		 314 aa  202  4e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1198  cobalamin biosynthesis protein  48.08 
 
 		 314 aa  202  4e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1043  cobalamin biosynthesis protein  48.08 
 
 		 314 aa  202  4e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.110651  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1143  putative cobalamin biosynthesis protein D  37.26 
 
 		 344 aa  196  4.0000000000000005e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7401  adenosylcobinamide-phosphate synthase  41.07 
 
 		 369 aa  164  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1119  cobalamin biosynthesis protein  39.12 
 
 		 317 aa  162  1e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3555  cobalamin biosynthesis protein  40.5 
 
 		 333 aa  157  2e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3102  cobalamin biosynthesis protein CobD  39.25 
 
 		 330 aa  157  3e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0194792  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3929  cobalamin biosynthesis protein  40.57 
 
 		 332 aa  156  4e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.512317  normal  0.0681298 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2576  cobalamin biosynthesis protein CobD  41.18 
 
 		 317 aa  154  1e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0430  adenosylcobinamide-phosphate synthase  40.94 
 
 		 311 aa  154  1e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2087  cobalamin biosynthesis protein CobD  40 
 
 		 311 aa  154  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2355  cobalamin biosynthesis protein CobD  39.36 
 
 		 311 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0757  cobalamin biosynthesis protein  37.86 
 
 		 321 aa  153  2.9999999999999998e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.463156  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4864  cobalamin biosynthesis protein  40.64 
 
 		 332 aa  152  8e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0377956  normal  0.399913 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1287  cobalamin biosynthesis protein CobD  40.34 
 
 		 325 aa  152  1e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0123328  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6127  cobalamin biosynthesis protein CobD  37.32 
 
 		 314 aa  151  1e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00302618  hitchhiker  0.00095084 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0872  cobalamin biosynthesis protein CobD  39.08 
 
 		 315 aa  151  1e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1267  cobalamin biosynthesis protein  36.36 
 
 		 324 aa  150  2e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0174  cobalamin biosynthesis protein CobD  42.81 
 
 		 316 aa  149  6e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2704  cobalamin biosynthesis protein CobD  42.5 
 
 		 315 aa  148  9e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2715  cobalamin biosynthesis protein CobD  38.68 
 
 		 310 aa  148  1.0000000000000001e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2209  cobalamin biosynthesis protein  31.31 
 
 		 323 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0633  cobalamin biosynthesis protein CobD  35.65 
 
 		 323 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0420011  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3443  cobalamin biosynthesis protein CobD  38.16 
 
 		 295 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.10368  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12265  cobalamin biosynthesis protein  37.98 
 
 		 313 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1441  cobalamin biosynthesis protein CobD  31.58 
 
 		 329 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1514  cobalamin biosynthesis protein  37.2 
 
 		 325 aa  147  3e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3857  cobalamin biosynthesis protein CobD  33.01 
 
 		 327 aa  144  1e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.932338  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0555  cobalamin biosynthesis protein CobD  36.04 
 
 		 311 aa  145  1e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0324  adenosylcobinamide-phosphate synthase  38.57 
 
 		 316 aa  145  1e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2585  cobalamin biosynthesis protein  40.3 
 
 		 303 aa  145  1e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.650377  hitchhiker  0.000040763 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0165  cobalamin biosynthesis protein  39.29 
 
 		 303 aa  144  1e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.890938  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3273  cobalamin biosynthesis protein CobD  34.73 
 
 		 330 aa  144  2e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00284027 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3411  cobalamin biosynthesis protein  38.89 
 
 		 344 aa  142  5e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.530159 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3805  cobalamin biosynthesis protein CobD  32.68 
 
 		 327 aa  142  5e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3360  cobalamin biosynthesis protein  38.89 
 
 		 344 aa  142  5e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.406666  normal  0.480267 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0301  cobalamin biosynthesis protein CobD  32.12 
 
 		 313 aa  142  5e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3349  cobalamin biosynthesis protein  38.89 
 
 		 344 aa  142  5e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1068  cobalamin biosynthesis protein  35.86 
 
 		 321 aa  142  6e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.882793  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0940  cobalamin biosynthesis protein CobD  30.77 
 
 		 324 aa  140  1.9999999999999998e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.185008 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1138  cobalamin biosynthesis protein  36.25 
 
 		 320 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.200777 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3744  cobalamin biosynthesis protein CobD  39.86 
 
 		 323 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00858099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0042  cobalamin biosynthesis protein CobD  37.68 
 
 		 328 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17720  adenosylcobinamide-phosphate synthase  37.54 
 
 		 332 aa  140  3e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.213248  normal  0.925164 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2886  cobalamin biosynthesis protein  38.01 
 
 		 340 aa  140  3e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0800022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1113  cobalamin biosynthesis protein  32.49 
 
 		 315 aa  140  3e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.386524  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1441  cobalamin biosynthesis protein  35.23 
 
 		 325 aa  140  3.9999999999999997e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.282346  normal  0.506208 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0790  cobalamin biosynthesis protein CobD  35.02 
 
 		 323 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0828155  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2621  cobalamin biosynthesis protein  35.62 
 
 		 323 aa  138  8.999999999999999e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.246707  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0419  cobalamin biosynthesis protein  35.49 
 
 		 324 aa  138  1e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0483  cobalamin biosynthesis protein  37.98 
 
 		 314 aa  137  2e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3538  cobalamin biosynthesis protein CobD  36.9 
 
 		 319 aa  137  2e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1931  cobalamin biosynthesis protein CobD  32.12 
 
 		 313 aa  137  2e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3604  cobalamin biosynthesis protein CobD  36.82 
 
 		 319 aa  137  2e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1044  CobD/CbiB family protein  36 
 
 		 305 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.211721 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>