297 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMASAVP1_A2318 on replicon NC_008785
Organism: Burkholderia mallei SAVP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006348  BMA0695  cobalamin biosynthesis protein  100 
 
 
310 aa  581  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.114905  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2969  cobalamin biosynthesis protein  100 
 
 
310 aa  581  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1630  cobalamin biosynthesis protein  100 
 
 
310 aa  581  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.187303  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2318  cobalamin biosynthesis protein  100 
 
 
310 aa  581  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0401808  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1043  cobalamin biosynthesis protein  96.5 
 
 
314 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.110651  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1198  cobalamin biosynthesis protein  96.5 
 
 
314 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1037  cobalamin biosynthesis protein  96.5 
 
 
314 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0842  cobalamin biosynthesis protein  92.99 
 
 
314 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.98695  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5779  cobalamin biosynthesis protein  79.55 
 
 
314 aa  425  1e-118  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.642032 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2453  cobalamin biosynthesis protein  79.94 
 
 
312 aa  417  1e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.393352  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1837  cobalamin biosynthesis protein  79.94 
 
 
312 aa  417  1e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.41199  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2448  cobalamin biosynthesis protein  79.94 
 
 
312 aa  417  1e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1003  cobalamin biosynthesis protein  72.58 
 
 
311 aa  412  1e-114  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3494  cobalamin biosynthesis protein  73.23 
 
 
311 aa  408  1e-113  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2205  cobalamin biosynthesis protein  71.2 
 
 
313 aa  401  1e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0351195  normal  0.625062 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2496  cobalamin biosynthesis protein  81.35 
 
 
312 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.315833  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2364  cobalamin biosynthesis protein  81.47 
 
 
314 aa  393  1e-108  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0846  cobalamin biosynthesis protein  80.19 
 
 
314 aa  384  1e-106  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2658  cobalamin biosynthesis protein  59.26 
 
 
326 aa  315  5e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.869405 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0140  cobalamin biosynthesis protein  58.11 
 
 
304 aa  309  4e-83  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2392  cobalamin biosynthesis protein  60.82 
 
 
331 aa  304  1.0000000000000001e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0151839 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2780  cobalamin biosynthesis protein  62.21 
 
 
326 aa  304  1.0000000000000001e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0845124  normal  0.636847 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2200  cobalamin biosynthesis protein  58.59 
 
 
326 aa  303  2.0000000000000002e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0660969 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4044  cobalamin biosynthesis protein  54.67 
 
 
302 aa  298  9e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1675  cobalamin biosynthesis protein  54.67 
 
 
307 aa  298  1e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.653042  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1274  cobalamin biosynthesis protein  54.33 
 
 
302 aa  296  2e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.272014  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3678  cobalamin biosynthesis protein  53.51 
 
 
302 aa  296  3e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.035544 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1234  cobalamin biosynthesis protein  55.22 
 
 
302 aa  296  4e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.778235  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0663  cobalamin biosynthesis protein  61.22 
 
 
326 aa  294  1e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1644  cobalamin biosynthesis protein  55.48 
 
 
302 aa  294  1e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.29794  normal  0.0167016 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1711  cobalamin biosynthesis protein CobD  52.51 
 
 
302 aa  289  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33100  cobalamin biosynthesis protein  59.35 
 
 
302 aa  288  8e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00042631  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2716  cobalamin biosynthesis protein  61.28 
 
 
310 aa  276  3e-73  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.530545 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3731  cobalamin biosynthesis protein  57.84 
 
 
321 aa  276  4e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1753  cobalamin biosynthesis protein  53.36 
 
 
302 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0102  cobalamin biosynthesis protein  54.28 
 
 
317 aa  273  4.0000000000000004e-72  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4115  cobalamin biosynthesis protein  53.82 
 
 
312 aa  271  1e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47730  cobalamin biosynthesis protein  53.98 
 
 
312 aa  270  2e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.452767  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0271  cobalamin biosynthesis protein  51.93 
 
 
319 aa  265  8.999999999999999e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2818  adenosylcobinamide-phosphate synthase  55.87 
 
 
311 aa  260  2e-68  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00349182  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1458  cobalamin biosynthesis protein CobD  50.84 
 
 
300 aa  258  9e-68  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.862014  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2287  cobalamin biosynthesis protein  51.33 
 
 
313 aa  248  7e-65  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.731902  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3677  cobalamin biosynthesis protein CobD  46.73 
 
 
330 aa  245  6.999999999999999e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.544295 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2089  cobD; cobalamin biosynthetic protein  46.04 
 
 
301 aa  222  6e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.284243  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1857  cobalamin biosynthesis protein CobD  49.3 
 
 
308 aa  213  3.9999999999999995e-54  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1424  adenosylcobinamide-phosphate synthase  44.01 
 
 
306 aa  210  2e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1131  cobalamin biosynthesis protein CobD  40.19 
 
 
351 aa  210  3e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1143  putative cobalamin biosynthesis protein D  36.16 
 
 
344 aa  186  6e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3555  cobalamin biosynthesis protein  47.58 
 
 
333 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3929  cobalamin biosynthesis protein  46.1 
 
 
332 aa  181  2e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.512317  normal  0.0681298 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2224  cobalamin biosynthesis protein  42.14 
 
 
322 aa  172  9e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0174  cobalamin biosynthesis protein CobD  43.49 
 
 
316 aa  170  3e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1287  cobalamin biosynthesis protein CobD  43.97 
 
 
325 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0123328  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3102  cobalamin biosynthesis protein CobD  42.07 
 
 
330 aa  162  5.0000000000000005e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0194792  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17720  adenosylcobinamide-phosphate synthase  41.44 
 
 
332 aa  161  1e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.213248  normal  0.925164 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4864  cobalamin biosynthesis protein  42.24 
 
 
332 aa  160  2e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0377956  normal  0.399913 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3411  cobalamin biosynthesis protein  43.73 
 
 
344 aa  160  3e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.530159 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3360  cobalamin biosynthesis protein  43.73 
 
 
344 aa  160  3e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.406666  normal  0.480267 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3349  cobalamin biosynthesis protein  43.73 
 
 
344 aa  160  3e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3443  cobalamin biosynthesis protein CobD  41.52 
 
 
295 aa  160  3e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.10368  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12265  cobalamin biosynthesis protein  42.96 
 
 
313 aa  159  6e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0301  cobalamin biosynthesis protein CobD  32.79 
 
 
313 aa  158  1e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0872  cobalamin biosynthesis protein CobD  40.93 
 
 
315 aa  157  3e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1743  cobalamin biosynthesis protein  37.36 
 
 
317 aa  157  3e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.22977  normal  0.192923 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2886  cobalamin biosynthesis protein  44.44 
 
 
340 aa  157  3e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0800022  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3604  cobalamin biosynthesis protein CobD  37.54 
 
 
319 aa  156  5.0000000000000005e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2715  cobalamin biosynthesis protein CobD  40.49 
 
 
310 aa  155  8e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0633  cobalamin biosynthesis protein CobD  38.68 
 
 
323 aa  155  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0420011  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0419  cobalamin biosynthesis protein  37.63 
 
 
324 aa  154  2e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2585  cobalamin biosynthesis protein  38.71 
 
 
303 aa  154  2e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.650377  hitchhiker  0.000040763 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0165  cobalamin biosynthesis protein  41.16 
 
 
303 aa  153  2.9999999999999998e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.890938  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3624  cobalamin biosynthesis protein  40.2 
 
 
317 aa  153  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.69655  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0561  cobalamin biosynthesis protein CobD  43.54 
 
 
318 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3538  cobalamin biosynthesis protein CobD  37.66 
 
 
319 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0324  adenosylcobinamide-phosphate synthase  39.39 
 
 
316 aa  152  8.999999999999999e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0483  cobalamin biosynthesis protein  38.91 
 
 
314 aa  151  2e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1267  cobalamin biosynthesis protein  38.46 
 
 
324 aa  150  2e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0735  cobalamin biosynthesis protein CobD  41.23 
 
 
323 aa  151  2e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1113  cobalamin biosynthesis protein  29.13 
 
 
315 aa  150  2e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.386524  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2209  cobalamin biosynthesis protein  33.44 
 
 
323 aa  150  3e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1931  cobalamin biosynthesis protein CobD  32.34 
 
 
313 aa  149  4e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5371  cobalamin biosynthesis protein CobD  34 
 
 
301 aa  149  5e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7401  adenosylcobinamide-phosphate synthase  38.43 
 
 
369 aa  149  6e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1294  cobalamin biosynthesis protein  29.41 
 
 
315 aa  148  1.0000000000000001e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.392516  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6127  cobalamin biosynthesis protein CobD  38.03 
 
 
314 aa  147  3e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00302618  hitchhiker  0.00095084 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1119  cobalamin biosynthesis protein  38.1 
 
 
317 aa  146  5e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2990  cobalamin biosynthesis protein CobD  39.86 
 
 
320 aa  145  1e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.168567  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0486  adenosylcobinamide-phosphate synthase  37.99 
 
 
318 aa  145  1e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2704  cobalamin biosynthesis protein CobD  35.62 
 
 
315 aa  144  2e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2576  cobalamin biosynthesis protein CobD  41.28 
 
 
317 aa  144  2e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0370  cobalamin biosynthesis protein  40.67 
 
 
319 aa  144  2e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.527036  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1738  cobalamin biosynthesis protein CobD  37.97 
 
 
322 aa  144  2e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0463068 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0790  cobalamin biosynthesis protein CobD  37.67 
 
 
323 aa  143  4e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0828155  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2087  cobalamin biosynthesis protein CobD  40.29 
 
 
311 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0555  cobalamin biosynthesis protein CobD  33.87 
 
 
311 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2885  adenosylcobinamide-phosphate synthase  37.87 
 
 
291 aa  139  4.999999999999999e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2604  cobalamin biosynthesis protein  39.57 
 
 
366 aa  139  7.999999999999999e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0562249  normal  0.0827399 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2355  cobalamin biosynthesis protein CobD  40.78 
 
 
311 aa  138  1e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1044  CobD/CbiB family protein  35.29 
 
 
305 aa  137  2e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.211721 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0430  adenosylcobinamide-phosphate synthase  39.93 
 
 
311 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>