227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9301_15021 on replicon NC_009091
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9301



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009091  P9301_15021  putative cobalamin biosynthetic protein  100 
 
 
337 aa  664    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15151  putative cobalamin biosynthetic protein  88.34 
 
 
339 aa  573  1.0000000000000001e-162  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.216618  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1413  adenosylcobinamide-phosphate synthase  87.31 
 
 
339 aa  554  1e-157  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14771  putative cobalamin biosynthetic protein  72.54 
 
 
337 aa  504  1e-141  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1551  cobalamin biosynthesis protein CbiB  34.67 
 
 
326 aa  223  4.9999999999999996e-57  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.529167  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0882  adenosylcobinamide-phosphate synthase  37.99 
 
 
315 aa  211  2e-53  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.736703  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0838  adenosylcobinamide-phosphate synthase  36.02 
 
 
348 aa  204  3e-51  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00314316 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17371  putative cobalamin biosynthetic protein  40.51 
 
 
314 aa  201  1.9999999999999998e-50  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13641  putative cobalamin biosynthetic protein  35.45 
 
 
329 aa  192  9e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  decreased coverage  0.00725389  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20061  putative cobalamin biosynthetic protein  38.05 
 
 
302 aa  177  2e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.785313 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1441  cobalamin biosynthesis protein CobD  32.93 
 
 
329 aa  173  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3857  cobalamin biosynthesis protein CobD  35.52 
 
 
327 aa  169  5e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.932338  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3805  cobalamin biosynthesis protein CobD  35.52 
 
 
327 aa  169  8e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3127  cobalamin biosynthesis protein  32.83 
 
 
320 aa  163  4.0000000000000004e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1861  cobalamin biosynthesis protein  31.96 
 
 
330 aa  156  5.0000000000000005e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.130243 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1468  cobalamin biosynthesis protein CobD  31.8 
 
 
318 aa  150  3e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0418  cobalamin biosynthesis protein CobD  29.41 
 
 
332 aa  139  7e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.984045  normal  0.740708 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1738  cobalamin biosynthesis protein CobD  28.97 
 
 
322 aa  139  8.999999999999999e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0463068 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2156  cobalamin biosynthesis protein  31.88 
 
 
319 aa  137  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2369  cobalamin biosynthesis protein  31.88 
 
 
319 aa  137  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1233  cobalamin biosynthesis protein CobD  30.99 
 
 
321 aa  136  4e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2210  cobalamin biosynthesis protein  31.88 
 
 
319 aa  137  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.265457  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2203  cobalamin biosynthesis protein  31.88 
 
 
319 aa  136  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2178  cobalamin biosynthesis protein CobD  29.17 
 
 
316 aa  136  5e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2256  cobalamin biosynthesis protein  31.88 
 
 
319 aa  136  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.853927  normal  0.381632 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1721  adenosylcobinamide-phosphate synthase  30.65 
 
 
319 aa  136  5e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1441  cobalamin biosynthesis protein  30.57 
 
 
325 aa  135  7.000000000000001e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.282346  normal  0.506208 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2209  cobalamin biosynthesis protein  30.53 
 
 
323 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0483  cobalamin biosynthesis protein  27.73 
 
 
314 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0870  cobalamin biosynthesis protein CobD  31.5 
 
 
323 aa  133  5e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0042  cobalamin biosynthesis protein CobD  29.14 
 
 
328 aa  132  6e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2704  cobalamin biosynthesis protein CobD  29.51 
 
 
315 aa  131  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2990  cobalamin biosynthesis protein CobD  29.55 
 
 
320 aa  129  6e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.168567  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3744  cobalamin biosynthesis protein CobD  29.85 
 
 
323 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00858099  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1266  cobalamin biosynthesis protein  30.62 
 
 
319 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0486  adenosylcobinamide-phosphate synthase  29.15 
 
 
318 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1099  adenosylcobinamide-phosphate synthase  26.92 
 
 
320 aa  127  2.0000000000000002e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1005  cobalamin biosynthesis protein CobD  28.34 
 
 
320 aa  127  3e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1514  cobalamin biosynthesis protein  29.7 
 
 
325 aa  127  3e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5371  cobalamin biosynthesis protein CobD  29 
 
 
301 aa  126  5e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0633  cobalamin biosynthesis protein CobD  27.54 
 
 
323 aa  126  6e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0420011  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3092  cobalamin biosynthesis protein CobD  32.39 
 
 
336 aa  124  2e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.423715  hitchhiker  0.00432553 
 
 
-
 
NC_002950  PG1159  cobalamin biosynthesis protein CbiB  29.25 
 
 
336 aa  124  3e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3604  cobalamin biosynthesis protein CobD  27.93 
 
 
319 aa  122  6e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1119  cobalamin biosynthesis protein  25.97 
 
 
317 aa  123  6e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0301  cobalamin biosynthesis protein CobD  29.72 
 
 
313 aa  122  7e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0757  cobalamin biosynthesis protein  26.73 
 
 
321 aa  122  9e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.463156  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1931  cobalamin biosynthesis protein CobD  28.97 
 
 
313 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1286  cobalamin biosynthesis protein CobD  28.08 
 
 
320 aa  121  1.9999999999999998e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.726575  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2585  cobalamin biosynthesis protein  27.65 
 
 
303 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.650377  hitchhiker  0.000040763 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1294  cobalamin biosynthesis protein  33.68 
 
 
315 aa  120  3e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.392516  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1267  cobalamin biosynthesis protein  30.66 
 
 
324 aa  120  4.9999999999999996e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1019  cobalamin biosynthesis protein CobD  29.75 
 
 
308 aa  119  6e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1068  cobalamin biosynthesis protein  27.54 
 
 
321 aa  119  6e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.882793  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1113  cobalamin biosynthesis protein  32.42 
 
 
315 aa  119  6e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.386524  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3538  cobalamin biosynthesis protein CobD  28.86 
 
 
319 aa  117  3e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1583  cobalamin biosynthesis protein CobD  32.77 
 
 
323 aa  116  6e-25  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2886  cobalamin biosynthesis protein CobD  25.88 
 
 
323 aa  116  6.9999999999999995e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0370  cobalamin biosynthesis protein  29.75 
 
 
319 aa  115  7.999999999999999e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.527036  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3553  cobalamin biosynthesis protein CobD  28.43 
 
 
315 aa  115  8.999999999999998e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0341108  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2389  cobalamin biosynthesis protein CobD  29.61 
 
 
357 aa  115  1.0000000000000001e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0419  cobalamin biosynthesis protein  25.94 
 
 
324 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0833  cobalamin biosynthesis protein CbiB  26.16 
 
 
374 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0399526 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1847  cobalamin biosynthesis protein CobD  26.75 
 
 
319 aa  114  3e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4469  cobalamin biosynthesis protein CobD  27.47 
 
 
317 aa  113  4.0000000000000004e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.277077  normal  0.0655318 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0790  cobalamin biosynthesis protein CobD  28.86 
 
 
323 aa  113  6e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0828155  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1138  cobalamin biosynthesis protein  27 
 
 
320 aa  112  7.000000000000001e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.200777 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1529  adenosylcobinamide-phosphate synthase  27.22 
 
 
317 aa  112  9e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.292471  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7401  adenosylcobinamide-phosphate synthase  26.42 
 
 
369 aa  111  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1891  cobalamin biosynthesis protein  30.12 
 
 
327 aa  110  3e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0735  cobalamin biosynthesis protein CobD  27.49 
 
 
323 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0940  cobalamin biosynthesis protein CobD  31.15 
 
 
324 aa  109  7.000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.185008 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21170  cobalamin biosynthesis protein CobD  27.61 
 
 
323 aa  109  8.000000000000001e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3273  cobalamin biosynthesis protein CobD  30.13 
 
 
330 aa  108  1e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00284027 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3678  cobalamin biosynthesis protein  24.04 
 
 
302 aa  108  1e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.035544 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2576  cobalamin biosynthesis protein CobD  26.69 
 
 
317 aa  108  2e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2355  cobalamin biosynthesis protein CobD  32.13 
 
 
311 aa  107  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2087  cobalamin biosynthesis protein CobD  35.47 
 
 
311 aa  107  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1305  cobalamin biosynthesis protein CobD  30.65 
 
 
321 aa  107  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2090  adenosylcobinamide-phosphate synthase  28.29 
 
 
331 aa  107  3e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1675  cobalamin biosynthesis protein  25.36 
 
 
307 aa  107  4e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.653042  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0555  cobalamin biosynthesis protein CobD  23.79 
 
 
311 aa  106  5e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1644  cobalamin biosynthesis protein  25.7 
 
 
302 aa  105  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.29794  normal  0.0167016 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4044  cobalamin biosynthesis protein  30.14 
 
 
302 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1711  cobalamin biosynthesis protein CobD  24.02 
 
 
302 aa  104  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0430  adenosylcobinamide-phosphate synthase  34.88 
 
 
311 aa  104  2e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3454  adenosylcobinamide-phosphate synthase  30.03 
 
 
328 aa  103  4e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.868099  normal  0.111955 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0324  adenosylcobinamide-phosphate synthase  25.58 
 
 
316 aa  103  5e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1274  cobalamin biosynthesis protein  24.35 
 
 
302 aa  103  5e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.272014  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1837  cobalamin biosynthesis protein  30.13 
 
 
312 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.41199  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0706  cobalamin biosynthesis protein  32.13 
 
 
311 aa  102  1e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.380522  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2448  cobalamin biosynthesis protein  30.13 
 
 
312 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2453  cobalamin biosynthesis protein  30.13 
 
 
312 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.393352  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2205  cobalamin biosynthesis protein  27.78 
 
 
313 aa  101  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0351195  normal  0.625062 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0758  cobalamin biosynthesis protein  32.84 
 
 
306 aa  101  2e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1234  cobalamin biosynthesis protein  25.15 
 
 
302 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.778235  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2715  cobalamin biosynthesis protein CobD  25.24 
 
 
310 aa  100  3e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1753  cobalamin biosynthesis protein  27.88 
 
 
302 aa  100  4e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3677  cobalamin biosynthesis protein CobD  23.64 
 
 
330 aa  100  5e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.544295 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1287  cobalamin biosynthesis protein CobD  23.84 
 
 
325 aa  100  5e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0123328  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>