118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnec_1279 on replicon NC_010531
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010531  Pnec_1279  cobalamin biosynthesis protein CbiB  100 
 
 		 319 aa  644    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00447148  normal  0.925435 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0522  cobalamin biosynthesis protein CbiB  92.48 
 
 		 319 aa  609  1e-173  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2578  CobD/CbiB family protein  44.44 
 
 		 326 aa  263  3e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.884231 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1011  CobD/CbiB family protein  45.2 
 
 		 312 aa  258  7e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.322198  normal  0.895923 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2972  CobD/CbiB family protein  44.72 
 
 		 312 aa  253  3e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.402163  normal  0.15784 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0903  CobD/CbiB family protein  43.96 
 
 		 331 aa  245  9e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0396  CobD/CbiB family protein  46.44 
 
 		 312 aa  242  6e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0206694  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2539  CobD/CbiB family protein  46.44 
 
 		 312 aa  242  6e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.207097  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0912  CobD/CbiB family protein  46.44 
 
 		 312 aa  242  6e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2852  CobD/CbiB family protein  46.44 
 
 		 312 aa  242  6e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0235  CobD/CbiB family protein  46.44 
 
 		 312 aa  242  6e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2962  CobD/CbiB family protein  46.44 
 
 		 329 aa  242  7e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2912  CobD/CbiB family protein  46.44 
 
 		 329 aa  242  7e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1666  CobD/CbiB family protein  46.44 
 
 		 346 aa  241  1e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.805294  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0950  CobD/CbiB family protein  45.43 
 
 		 312 aa  239  4e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0954  CobD/CbiB family protein  45.43 
 
 		 312 aa  239  4e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.164316  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0880  CobD/CbiB family protein  44.48 
 
 		 313 aa  238  6.999999999999999e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.910898 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0809  CobD/CbiB family protein  44.48 
 
 		 313 aa  238  6.999999999999999e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.37142  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4188  CobD/CbiB family protein  44.68 
 
 		 312 aa  238  8e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.450468  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0938  CobD/CbiB family protein  46.01 
 
 		 324 aa  237  2e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0164662 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0595  CobD/CbiB family protein  43.77 
 
 		 312 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.142416  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1074  CobD/CbiB family protein  43.77 
 
 		 312 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1033  CobD/CbiB family protein  43.77 
 
 		 312 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0774  CobD/CbiB family protein  43.65 
 
 		 312 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.219768 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2229  CobD/CbiB family protein  43.47 
 
 		 312 aa  233  5e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.29279  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3350  cobalamin biosynthesis protein CbiB  38.15 
 
 		 328 aa  199  7e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.171722 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5340  cobalamin biosynthesis protein CbiB  38.04 
 
 		 336 aa  196  3e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2698  cobalamin biosynthesis protein CbiB  38.26 
 
 		 328 aa  190  2.9999999999999997e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1695  hypothetical protein  36.01 
 
 		 342 aa  185  1.0000000000000001e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.93045  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1889  hypothetical protein  37.54 
 
 		 334 aa  185  1.0000000000000001e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00289969  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1044  CobD/CbiB family protein  35.51 
 
 		 305 aa  183  4.0000000000000006e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.211721 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1478  cobalamin biosynthesis protein CbiB  33.94 
 
 		 333 aa  183  4.0000000000000006e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1109  putative cobalamin biosynthesis transmembrane protein  36.56 
 
 		 329 aa  181  1e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.805383 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0320  cobalamin biosynthesis protein CbiB  34.88 
 
 		 338 aa  178  1e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.167497  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3023  CobD/CbiB family protein  36.57 
 
 		 307 aa  173  2.9999999999999996e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.473012  normal  0.958188 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1994  CobD/CbiB family protein  37.46 
 
 		 303 aa  172  5e-42  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1466  hypothetical protein  35.03 
 
 		 339 aa  172  6.999999999999999e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0686  putative cobalamin biosynthesis transmembrane protein  34.86 
 
 		 329 aa  168  1e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.910501 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1407  hypothetical protein  32.63 
 
 		 328 aa  166  5e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.909593  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2660  CobD/CbiB family protein  33.44 
 
 		 307 aa  154  2e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.95909  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2432  adenosylcobinamide-phosphate synthase  33.44 
 
 		 304 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0111605  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1644  cobalamin biosynthesis protein  31.91 
 
 		 302 aa  93.6  4e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.29794  normal  0.0167016 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3678  cobalamin biosynthesis protein  30.04 
 
 		 302 aa  90.9  3e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.035544 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1711  cobalamin biosynthesis protein CobD  30.04 
 
 		 302 aa  89.7  5e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3731  cobalamin biosynthesis protein  32.77 
 
 		 321 aa  87.4  3e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1458  cobalamin biosynthesis protein CobD  31.67 
 
 		 300 aa  86.7  4e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.862014  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33100  cobalamin biosynthesis protein  30.77 
 
 		 302 aa  86.3  7e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00042631  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2818  adenosylcobinamide-phosphate synthase  30.32 
 
 		 311 aa  85.5  0.000000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00349182  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2089  cobD; cobalamin biosynthetic protein  28.43 
 
 		 301 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.284243  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1675  cobalamin biosynthesis protein  30.85 
 
 		 307 aa  83.2  0.000000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.653042  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2392  cobalamin biosynthesis protein  29.33 
 
 		 331 aa  83.2  0.000000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0151839 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1274  cobalamin biosynthesis protein  31.34 
 
 		 302 aa  83.2  0.000000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.272014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1234  cobalamin biosynthesis protein  30.85 
 
 		 302 aa  83.6  0.000000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.778235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4044  cobalamin biosynthesis protein  31.15 
 
 		 302 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5779  cobalamin biosynthesis protein  31.55 
 
 		 314 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.642032 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2658  cobalamin biosynthesis protein  29.18 
 
 		 326 aa  80.5  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.869405 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0140  cobalamin biosynthesis protein  28.8 
 
 		 304 aa  80.1  0.00000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2496  cobalamin biosynthesis protein  30.95 
 
 		 312 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.315833  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2364  cobalamin biosynthesis protein  30.95 
 
 		 314 aa  79.7  0.00000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2205  cobalamin biosynthesis protein  26.97 
 
 		 313 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0351195  normal  0.625062 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2716  cobalamin biosynthesis protein  30.94 
 
 		 310 aa  78.2  0.0000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.530545 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0102  cobalamin biosynthesis protein  27.13 
 
 		 317 aa  78.2  0.0000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0846  cobalamin biosynthesis protein  30.36 
 
 		 314 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0271  cobalamin biosynthesis protein  27.45 
 
 		 319 aa  77.4  0.0000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47730  cobalamin biosynthesis protein  28.52 
 
 		 312 aa  76.6  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.452767  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2200  cobalamin biosynthesis protein  29.02 
 
 		 326 aa  76.6  0.0000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0660969 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1837  cobalamin biosynthesis protein  28.41 
 
 		 312 aa  76.6  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.41199  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2448  cobalamin biosynthesis protein  28.41 
 
 		 312 aa  76.6  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4115  cobalamin biosynthesis protein  28.52 
 
 		 312 aa  76.3  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2453  cobalamin biosynthesis protein  28.41 
 
 		 312 aa  76.6  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.393352  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3494  cobalamin biosynthesis protein  28.16 
 
 		 311 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1003  cobalamin biosynthesis protein  27.67 
 
 		 311 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1753  cobalamin biosynthesis protein  31.32 
 
 		 302 aa  72.4  0.000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3677  cobalamin biosynthesis protein CobD  25 
 
 		 330 aa  70.9  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.544295 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0842  cobalamin biosynthesis protein  29.76 
 
 		 314 aa  68.9  0.00000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.98695  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0695  cobalamin biosynthesis protein  32.06 
 
 		 310 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.114905  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2318  cobalamin biosynthesis protein  32.06 
 
 		 310 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0401808  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2969  cobalamin biosynthesis protein  32.06 
 
 		 310 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1630  cobalamin biosynthesis protein  32.06 
 
 		 310 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.187303  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1198  cobalamin biosynthesis protein  32.06 
 
 		 314 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1037  cobalamin biosynthesis protein  32.06 
 
 		 314 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1043  cobalamin biosynthesis protein  32.06 
 
 		 314 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.110651  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0638  signaling modulator of AmpD, AmpE  25.98 
 
 		 296 aa  67.4  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2287  cobalamin biosynthesis protein  26.88 
 
 		 313 aa  64.3  0.000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.731902  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2780  cobalamin biosynthesis protein  26.47 
 
 		 326 aa  62.8  0.000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0845124  normal  0.636847 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3858  regulatory protein AmpE  25.73 
 
 		 283 aa  59.3  0.00000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000015429 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0663  cobalamin biosynthesis protein  27.98 
 
 		 326 aa  57.8  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3348  regulatory protein AmpE  22.7 
 
 		 270 aa  58.2  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0422  regulatory protein AmpE  23.5 
 
 		 283 aa  57.4  0.0000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3419  regulatory protein AmpE  24.26 
 
 		 283 aa  57.4  0.0000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.535716  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1424  adenosylcobinamide-phosphate synthase  26.49 
 
 		 306 aa  56.6  0.0000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0781  signaling modulator of AmpD, AmpE  31.62 
 
 		 277 aa  52  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0517  cobalamin biosynthesis protein CbiB  25 
 
 		 298 aa  51.2  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0373  regulatory protein AmpE  24 
 
 		 286 aa  51.6  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.490103  hitchhiker  0.0000919241 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1463  hypothetical protein  23.05 
 
 		 250 aa  50.8  0.00003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1520  hypothetical protein  23.42 
 
 		 250 aa  50.8  0.00003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12130  Inner membrane protein  34.19 
 
 		 280 aa  50.8  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.567702  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0426  regulatory protein AmpE  25.17 
 
 		 283 aa  49.7  0.00006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3150  adenosylcobinamide-phosphate synthase  24.18 
 
 		 351 aa  48.1  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000125584  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1823  cobalamin biosynthesis protein CbiB  21.05 
 
 		 325 aa  47.8  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  1.8692500000000003e-18  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>