98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp1463 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006368  lpp1463  hypothetical protein  100 
 
 		 250 aa  501  1e-141  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1520  hypothetical protein  98.4 
 
 		 250 aa  495  1e-139  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0638  signaling modulator of AmpD, AmpE  26.1 
 
 		 296 aa  104  1e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0568  hypothetical protein  26.77 
 
 		 258 aa  89.7  4e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000159703  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1615  beta-lactamase induction protein  26.77 
 
 		 258 aa  87.8  2e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0562539  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0788  AmpE  27.67 
 
 		 277 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.689986  normal  0.152356 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0781  signaling modulator of AmpD, AmpE  27.49 
 
 		 277 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3348  regulatory protein AmpE  26.18 
 
 		 270 aa  65.5  0.0000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12130  Inner membrane protein  35.85 
 
 		 280 aa  65.1  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.567702  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0950  CobD/CbiB family protein  24.7 
 
 		 312 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0954  CobD/CbiB family protein  24.7 
 
 		 312 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.164316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4188  CobD/CbiB family protein  26.4 
 
 		 312 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.450468  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2539  CobD/CbiB family protein  24.1 
 
 		 312 aa  62.4  0.000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.207097  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0912  CobD/CbiB family protein  24.1 
 
 		 312 aa  62.4  0.000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2852  CobD/CbiB family protein  24.1 
 
 		 312 aa  62.4  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0235  CobD/CbiB family protein  24.1 
 
 		 312 aa  62.4  0.000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0396  CobD/CbiB family protein  24.1 
 
 		 312 aa  62.4  0.000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0206694  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2962  CobD/CbiB family protein  24.1 
 
 		 329 aa  62.4  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2229  CobD/CbiB family protein  24.3 
 
 		 312 aa  62.4  0.000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.29279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2912  CobD/CbiB family protein  24.1 
 
 		 329 aa  62.4  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0595  CobD/CbiB family protein  24.21 
 
 		 312 aa  62  0.000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.142416  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1033  CobD/CbiB family protein  24.21 
 
 		 312 aa  62  0.000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1074  CobD/CbiB family protein  24.21 
 
 		 312 aa  62  0.000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0813  signaling modulator of AmpD, AmpE  30.28 
 
 		 276 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.17689 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0774  CobD/CbiB family protein  25.63 
 
 		 312 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.219768 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2818  adenosylcobinamide-phosphate synthase  26.22 
 
 		 311 aa  60.5  0.00000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00349182  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1666  CobD/CbiB family protein  23.29 
 
 		 346 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.805294  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0824  signaling modulator of AmpD, AmpE  31.78 
 
 		 276 aa  59.7  0.00000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0790  signaling modulator of AmpD, AmpE  29.03 
 
 		 276 aa  59.3  0.00000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1011  CobD/CbiB family protein  24.2 
 
 		 312 aa  58.9  0.00000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.322198  normal  0.895923 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2660  CobD/CbiB family protein  28.28 
 
 		 307 aa  58.5  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.95909  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1458  cobalamin biosynthesis protein CobD  24.74 
 
 		 300 aa  57.4  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.862014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3699  signaling modulator of AmpD, AmpE  27.23 
 
 		 295 aa  56.6  0.0000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.32125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0522  cobalamin biosynthesis protein CbiB  23.42 
 
 		 319 aa  56.6  0.0000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2972  CobD/CbiB family protein  29.13 
 
 		 312 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.402163  normal  0.15784 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1044  CobD/CbiB family protein  26.32 
 
 		 305 aa  55.8  0.0000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.211721 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58660  hypothetical protein  30.56 
 
 		 278 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4404  signaling modulator of AmpD, AmpE  27.89 
 
 		 276 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.154037  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2432  adenosylcobinamide-phosphate synthase  30.19 
 
 		 304 aa  53.9  0.000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0111605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0994  signaling modulator of AmpD, AmpE  23.15 
 
 		 297 aa  53.1  0.000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0873  signaling modulator of AmpD, AmpE  22.69 
 
 		 297 aa  52.8  0.000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.62468  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0317  regulatory protein AmpE  23.53 
 
 		 284 aa  50.8  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.810004 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1279  cobalamin biosynthesis protein CbiB  23.05 
 
 		 319 aa  50.8  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00447148  normal  0.925435 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2578  CobD/CbiB family protein  27.64 
 
 		 326 aa  49.7  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.884231 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0373  regulatory protein AmpE  21.33 
 
 		 286 aa  49.7  0.00005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.490103  hitchhiker  0.0000919241 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1994  CobD/CbiB family protein  26.17 
 
 		 303 aa  49.3  0.00006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3494  cobalamin biosynthesis protein  25.81 
 
 		 311 aa  49.3  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0903  CobD/CbiB family protein  28.44 
 
 		 331 aa  49.3  0.00006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2453  cobalamin biosynthesis protein  24.71 
 
 		 312 aa  48.5  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.393352  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0686  putative cobalamin biosynthesis transmembrane protein  25.89 
 
 		 329 aa  48.5  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.910501 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1837  cobalamin biosynthesis protein  24.71 
 
 		 312 aa  48.5  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.41199  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1003  cobalamin biosynthesis protein  24 
 
 		 311 aa  48.1  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2448  cobalamin biosynthesis protein  24.71 
 
 		 312 aa  48.5  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3779  regulatory protein AmpE  23.86 
 
 		 283 aa  47.4  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0846  cobalamin biosynthesis protein  24.24 
 
 		 314 aa  47  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2698  cobalamin biosynthesis protein CbiB  25.44 
 
 		 328 aa  46.6  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3023  CobD/CbiB family protein  25.78 
 
 		 307 aa  46.6  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.473012  normal  0.958188 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3350  cobalamin biosynthesis protein CbiB  27.18 
 
 		 328 aa  46.6  0.0004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.171722 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3858  regulatory protein AmpE  25.38 
 
 		 283 aa  45.8  0.0006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000015429 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3915  regulatory protein AmpE  25.38 
 
 		 283 aa  45.8  0.0006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.370917  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3936  regulatory protein AmpE  25.38 
 
 		 283 aa  45.8  0.0007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.501947  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4056  regulatory protein AmpE  25.38 
 
 		 283 aa  45.8  0.0007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000497634  normal  0.464654 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5340  cobalamin biosynthesis protein CbiB  21.08 
 
 		 336 aa  45.8  0.0007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1857  cobalamin biosynthesis protein CobD  33.33 
 
 		 308 aa  45.8  0.0007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0818  ampE protein  28.44 
 
 		 278 aa  45.4  0.0009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.927721  normal  0.187912 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1697  signaling modulator of AmpD, AmpE  26.4 
 
 		 337 aa  44.7  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0951  ampE protein  28.5 
 
 		 278 aa  44.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2716  cobalamin biosynthesis protein  25.93 
 
 		 310 aa  44.3  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.530545 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0102  cobalamin biosynthesis protein  28.28 
 
 		 317 aa  44.7  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0877  signaling modulator of AmpD, AmpE  20 
 
 		 281 aa  44.3  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0027178  normal  0.0245194 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02953  transmembrane protein  23.24 
 
 		 296 aa  43.9  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4742  cobD/cbiB family protein  24.65 
 
 		 321 aa  43.5  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2496  cobalamin biosynthesis protein  23.2 
 
 		 312 aa  43.5  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.315833  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03227  regulatory protein AmpE  28.72 
 
 		 289 aa  43.9  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0544057  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2658  cobalamin biosynthesis protein  22.79 
 
 		 326 aa  43.5  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.869405 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2364  cobalamin biosynthesis protein  23.2 
 
 		 314 aa  43.5  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0140  cobalamin biosynthesis protein  21.05 
 
 		 304 aa  43.5  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1753  cobalamin biosynthesis protein  27.27 
 
 		 302 aa  43.5  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3731  cobalamin biosynthesis protein  23.58 
 
 		 321 aa  43.1  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5779  cobalamin biosynthesis protein  22.4 
 
 		 314 aa  43.1  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.642032 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2089  cobD; cobalamin biosynthetic protein  24.22 
 
 		 301 aa  42.7  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.284243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0417  regulatory protein AmpE  21.8 
 
 		 282 aa  42.7  0.005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1478  cobalamin biosynthesis protein CbiB  24.62 
 
 		 333 aa  42.7  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1889  hypothetical protein  25.19 
 
 		 334 aa  42.4  0.007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00289969  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4469  cobalamin biosynthesis protein CobD  31.78 
 
 		 317 aa  42  0.008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.277077  normal  0.0655318 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1711  cobalamin biosynthesis protein CobD  26.42 
 
 		 302 aa  42  0.009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0271  cobalamin biosynthesis protein  25 
 
 		 319 aa  42  0.009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0842  cobalamin biosynthesis protein  27.27 
 
 		 314 aa  42  0.009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.98695  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0809  CobD/CbiB family protein  23.35 
 
 		 313 aa  42  0.01  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.37142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1037  cobalamin biosynthesis protein  27.27 
 
 		 314 aa  42  0.01  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2969  cobalamin biosynthesis protein  27.27 
 
 		 310 aa  42  0.01  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1630  cobalamin biosynthesis protein  27.27 
 
 		 310 aa  42  0.01  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.187303  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0695  cobalamin biosynthesis protein  27.27 
 
 		 310 aa  42  0.01  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.114905  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1043  cobalamin biosynthesis protein  27.27 
 
 		 314 aa  42  0.01  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.110651  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2318  cobalamin biosynthesis protein  27.27 
 
 		 310 aa  42  0.01  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0401808  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0880  CobD/CbiB family protein  23.35 
 
 		 313 aa  42  0.01  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.910898 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2200  cobalamin biosynthesis protein  24.79 
 
 		 326 aa  42  0.01  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0660969 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1198  cobalamin biosynthesis protein  27.27 
 
 		 314 aa  42  0.01  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>