65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_0994 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_0994  signaling modulator of AmpD, AmpE  100 
 
 		 297 aa  577  1e-164  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0873  signaling modulator of AmpD, AmpE  99.33 
 
 		 297 aa  575  1.0000000000000001e-163  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.62468  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02953  transmembrane protein  64.03 
 
 		 296 aa  325  6e-88  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3699  signaling modulator of AmpD, AmpE  59.86 
 
 		 295 aa  273  2.0000000000000002e-72  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.32125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0638  signaling modulator of AmpD, AmpE  27.97 
 
 		 296 aa  83.6  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3350  cobalamin biosynthesis protein CbiB  28.57 
 
 		 328 aa  68.2  0.0000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.171722 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5340  cobalamin biosynthesis protein CbiB  26.32 
 
 		 336 aa  66.2  0.0000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0522  cobalamin biosynthesis protein CbiB  26.83 
 
 		 319 aa  63.5  0.000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1463  hypothetical protein  23.61 
 
 		 250 aa  62.8  0.000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0320  cobalamin biosynthesis protein CbiB  27.8 
 
 		 338 aa  62.4  0.000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.167497  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1520  hypothetical protein  23.04 
 
 		 250 aa  62.4  0.000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12130  Inner membrane protein  32.88 
 
 		 280 aa  60.5  0.00000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.567702  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2698  cobalamin biosynthesis protein CbiB  25.75 
 
 		 328 aa  60.1  0.00000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1044  CobD/CbiB family protein  26.62 
 
 		 305 aa  60.1  0.00000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.211721 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1011  CobD/CbiB family protein  29.33 
 
 		 312 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.322198  normal  0.895923 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0788  AmpE  30.21 
 
 		 277 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.689986  normal  0.152356 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1279  cobalamin biosynthesis protein CbiB  27.23 
 
 		 319 aa  57.8  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00447148  normal  0.925435 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2972  CobD/CbiB family protein  28.72 
 
 		 312 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.402163  normal  0.15784 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1407  hypothetical protein  26.89 
 
 		 328 aa  55.8  0.0000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.909593  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0686  putative cobalamin biosynthesis transmembrane protein  30 
 
 		 329 aa  54.3  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.910501 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0781  signaling modulator of AmpD, AmpE  34.51 
 
 		 277 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2432  adenosylcobinamide-phosphate synthase  28.76 
 
 		 304 aa  54.3  0.000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0111605  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1478  cobalamin biosynthesis protein CbiB  25.96 
 
 		 333 aa  53.9  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1889  hypothetical protein  27.44 
 
 		 334 aa  53.5  0.000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00289969  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0809  CobD/CbiB family protein  25.96 
 
 		 313 aa  53.1  0.000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.37142  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0880  CobD/CbiB family protein  25.96 
 
 		 313 aa  53.1  0.000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.910898 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0903  CobD/CbiB family protein  28.49 
 
 		 331 aa  53.1  0.000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1458  cobalamin biosynthesis protein CobD  30.58 
 
 		 300 aa  52.8  0.000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.862014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0877  signaling modulator of AmpD, AmpE  37.11 
 
 		 281 aa  52.8  0.000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0027178  normal  0.0245194 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2578  CobD/CbiB family protein  24.25 
 
 		 326 aa  51.6  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.884231 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1466  hypothetical protein  27.45 
 
 		 339 aa  51.6  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58660  hypothetical protein  34.25 
 
 		 278 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1695  hypothetical protein  25.56 
 
 		 342 aa  49.7  0.00006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.93045  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1666  CobD/CbiB family protein  27.41 
 
 		 346 aa  49.3  0.00007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.805294  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2229  CobD/CbiB family protein  28.76 
 
 		 312 aa  48.5  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.29279  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0938  CobD/CbiB family protein  28.4 
 
 		 324 aa  48.5  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0164662 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1074  CobD/CbiB family protein  28.76 
 
 		 312 aa  48.1  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0595  CobD/CbiB family protein  28.76 
 
 		 312 aa  48.1  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.142416  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1109  putative cobalamin biosynthesis transmembrane protein  27.31 
 
 		 329 aa  48.1  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.805383 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1033  CobD/CbiB family protein  28.76 
 
 		 312 aa  48.1  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2660  CobD/CbiB family protein  28.41 
 
 		 307 aa  47.4  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.95909  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2852  CobD/CbiB family protein  29.7 
 
 		 312 aa  47  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0396  CobD/CbiB family protein  29.7 
 
 		 312 aa  47  0.0004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0206694  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2539  CobD/CbiB family protein  29.7 
 
 		 312 aa  47  0.0004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.207097  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0912  CobD/CbiB family protein  29.7 
 
 		 312 aa  47  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0235  CobD/CbiB family protein  29.7 
 
 		 312 aa  47  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4188  CobD/CbiB family protein  30.95 
 
 		 312 aa  47  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.450468  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1697  signaling modulator of AmpD, AmpE  27.18 
 
 		 337 aa  46.6  0.0005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2962  CobD/CbiB family protein  29.7 
 
 		 329 aa  46.6  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2912  CobD/CbiB family protein  29.7 
 
 		 329 aa  46.6  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2818  adenosylcobinamide-phosphate synthase  29.76 
 
 		 311 aa  46.6  0.0005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00349182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0271  cobalamin biosynthesis protein  26.96 
 
 		 319 aa  46.2  0.0007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0954  CobD/CbiB family protein  30.36 
 
 		 312 aa  45.8  0.0008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.164316  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0950  CobD/CbiB family protein  30.36 
 
 		 312 aa  45.8  0.0008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3757  regulatory protein AmpE  25.64 
 
 		 284 aa  45.8  0.0009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.118765  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0568  hypothetical protein  32.29 
 
 		 258 aa  45.1  0.001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000159703  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0813  signaling modulator of AmpD, AmpE  33.33 
 
 		 276 aa  45.1  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.17689 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1615  beta-lactamase induction protein  32.29 
 
 		 258 aa  45.1  0.002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0562539  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0790  signaling modulator of AmpD, AmpE  33.33 
 
 		 276 aa  44.3  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4404  signaling modulator of AmpD, AmpE  29.03 
 
 		 276 aa  44.3  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.154037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0774  CobD/CbiB family protein  28.14 
 
 		 312 aa  43.1  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.219768 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1994  CobD/CbiB family protein  28.24 
 
 		 303 aa  42.7  0.007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2205  cobalamin biosynthesis protein  27.73 
 
 		 313 aa  42.7  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0351195  normal  0.625062 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3571  regulatory protein AmpE  24.66 
 
 		 284 aa  42.7  0.007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0824  signaling modulator of AmpD, AmpE  28.57 
 
 		 276 aa  42.4  0.009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>