152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_1889 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_1889  hypothetical protein  100 
 
 		 334 aa  655    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00289969  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3350  cobalamin biosynthesis protein CbiB  77.58 
 
 		 328 aa  490  1e-137  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.171722 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2698  cobalamin biosynthesis protein CbiB  77.27 
 
 		 328 aa  476  1e-133  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0320  cobalamin biosynthesis protein CbiB  75.79 
 
 		 338 aa  464  1e-129  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.167497  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5340  cobalamin biosynthesis protein CbiB  68.34 
 
 		 336 aa  416  9.999999999999999e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1478  cobalamin biosynthesis protein CbiB  66.26 
 
 		 333 aa  410  1e-113  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1695  hypothetical protein  62.84 
 
 		 342 aa  397  1e-109  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.93045  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1407  hypothetical protein  59.43 
 
 		 328 aa  378  1e-103  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.909593  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1466  hypothetical protein  59.16 
 
 		 339 aa  357  9.999999999999999e-98  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0686  putative cobalamin biosynthesis transmembrane protein  53.77 
 
 		 329 aa  307  2.0000000000000002e-82  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.910501 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1109  putative cobalamin biosynthesis transmembrane protein  55.35 
 
 		 329 aa  299  4e-80  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.805383 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1011  CobD/CbiB family protein  46.48 
 
 		 312 aa  259  4e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.322198  normal  0.895923 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2972  CobD/CbiB family protein  46.18 
 
 		 312 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.402163  normal  0.15784 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1666  CobD/CbiB family protein  46.83 
 
 		 346 aa  245  6.999999999999999e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.805294  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0396  CobD/CbiB family protein  46.22 
 
 		 312 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0206694  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2962  CobD/CbiB family protein  46.22 
 
 		 329 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0774  CobD/CbiB family protein  43.95 
 
 		 312 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.219768 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2539  CobD/CbiB family protein  46.22 
 
 		 312 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.207097  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0912  CobD/CbiB family protein  46.22 
 
 		 312 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2852  CobD/CbiB family protein  46.22 
 
 		 312 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2912  CobD/CbiB family protein  46.22 
 
 		 329 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0235  CobD/CbiB family protein  46.22 
 
 		 312 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2578  CobD/CbiB family protein  41.84 
 
 		 326 aa  243  3.9999999999999997e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.884231 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1033  CobD/CbiB family protein  43.35 
 
 		 312 aa  241  2e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0595  CobD/CbiB family protein  43.35 
 
 		 312 aa  241  2e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.142416  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1074  CobD/CbiB family protein  43.35 
 
 		 312 aa  241  2e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2229  CobD/CbiB family protein  43.35 
 
 		 312 aa  239  4e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.29279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4188  CobD/CbiB family protein  42.72 
 
 		 312 aa  238  9e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.450468  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0954  CobD/CbiB family protein  42.72 
 
 		 312 aa  238  1e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.164316  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0950  CobD/CbiB family protein  42.72 
 
 		 312 aa  238  1e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0903  CobD/CbiB family protein  42.25 
 
 		 331 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0938  CobD/CbiB family protein  42.64 
 
 		 324 aa  224  1e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0164662 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0809  CobD/CbiB family protein  42.34 
 
 		 313 aa  223  3e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.37142  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0880  CobD/CbiB family protein  42.34 
 
 		 313 aa  223  3e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.910898 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0522  cobalamin biosynthesis protein CbiB  38.17 
 
 		 319 aa  196  6e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1279  cobalamin biosynthesis protein CbiB  38.17 
 
 		 319 aa  194  2e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00447148  normal  0.925435 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1044  CobD/CbiB family protein  35.76 
 
 		 305 aa  171  2e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.211721 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3023  CobD/CbiB family protein  37.26 
 
 		 307 aa  165  9e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.473012  normal  0.958188 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1994  CobD/CbiB family protein  35.26 
 
 		 303 aa  161  2e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2660  CobD/CbiB family protein  34.29 
 
 		 307 aa  144  2e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.95909  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2432  adenosylcobinamide-phosphate synthase  33.03 
 
 		 304 aa  130  3e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0111605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2205  cobalamin biosynthesis protein  32.51 
 
 		 313 aa  102  8e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0351195  normal  0.625062 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3494  cobalamin biosynthesis protein  30.82 
 
 		 311 aa  97.4  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2716  cobalamin biosynthesis protein  34.08 
 
 		 310 aa  97.1  4e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.530545 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1003  cobalamin biosynthesis protein  29.15 
 
 		 311 aa  95.1  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3731  cobalamin biosynthesis protein  33.74 
 
 		 321 aa  95.1  2e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0140  cobalamin biosynthesis protein  27.27 
 
 		 304 aa  90.9  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1837  cobalamin biosynthesis protein  33.51 
 
 		 312 aa  91.7  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.41199  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2453  cobalamin biosynthesis protein  33.51 
 
 		 312 aa  91.7  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.393352  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2448  cobalamin biosynthesis protein  33.51 
 
 		 312 aa  91.7  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1644  cobalamin biosynthesis protein  30.04 
 
 		 302 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.29794  normal  0.0167016 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1711  cobalamin biosynthesis protein CobD  30 
 
 		 302 aa  87.8  3e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3678  cobalamin biosynthesis protein  29.19 
 
 		 302 aa  86.7  6e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.035544 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2200  cobalamin biosynthesis protein  34.32 
 
 		 326 aa  86.3  7e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0660969 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2089  cobD; cobalamin biosynthetic protein  28.25 
 
 		 301 aa  86.3  8e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.284243  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2496  cobalamin biosynthesis protein  33.33 
 
 		 312 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.315833  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2392  cobalamin biosynthesis protein  30.23 
 
 		 331 aa  84.7  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0151839 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0102  cobalamin biosynthesis protein  29.92 
 
 		 317 aa  84.3  0.000000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2364  cobalamin biosynthesis protein  33.51 
 
 		 314 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5779  cobalamin biosynthesis protein  34.25 
 
 		 314 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.642032 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1274  cobalamin biosynthesis protein  29.93 
 
 		 302 aa  84  0.000000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.272014  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1675  cobalamin biosynthesis protein  30.21 
 
 		 307 aa  82.8  0.000000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.653042  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1234  cobalamin biosynthesis protein  30.8 
 
 		 302 aa  82.8  0.000000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.778235  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2658  cobalamin biosynthesis protein  32.92 
 
 		 326 aa  82  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.869405 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33100  cobalamin biosynthesis protein  29.91 
 
 		 302 aa  81.3  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00042631  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1458  cobalamin biosynthesis protein CobD  30.23 
 
 		 300 aa  81.6  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.862014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4044  cobalamin biosynthesis protein  30.21 
 
 		 302 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0846  cobalamin biosynthesis protein  32.4 
 
 		 314 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0842  cobalamin biosynthesis protein  32.98 
 
 		 314 aa  76.6  0.0000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.98695  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2818  adenosylcobinamide-phosphate synthase  31.43 
 
 		 311 aa  75.9  0.0000000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00349182  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0695  cobalamin biosynthesis protein  33.52 
 
 		 310 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.114905  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1198  cobalamin biosynthesis protein  33.52 
 
 		 314 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2318  cobalamin biosynthesis protein  33.52 
 
 		 310 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0401808  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2969  cobalamin biosynthesis protein  33.52 
 
 		 310 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1037  cobalamin biosynthesis protein  33.52 
 
 		 314 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1043  cobalamin biosynthesis protein  33.52 
 
 		 314 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.110651  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1630  cobalamin biosynthesis protein  33.52 
 
 		 310 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.187303  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47730  cobalamin biosynthesis protein  31.11 
 
 		 312 aa  73.6  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.452767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3677  cobalamin biosynthesis protein CobD  27.73 
 
 		 330 aa  73.6  0.000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.544295 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4115  cobalamin biosynthesis protein  30.68 
 
 		 312 aa  73.6  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1753  cobalamin biosynthesis protein  28.88 
 
 		 302 aa  73.2  0.000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2287  cobalamin biosynthesis protein  32.33 
 
 		 313 aa  67.4  0.0000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.731902  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0271  cobalamin biosynthesis protein  29.57 
 
 		 319 aa  66.2  0.0000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2780  cobalamin biosynthesis protein  32.38 
 
 		 326 aa  65.9  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0845124  normal  0.636847 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0663  cobalamin biosynthesis protein  30.2 
 
 		 326 aa  63.5  0.000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3150  adenosylcobinamide-phosphate synthase  27.12 
 
 		 351 aa  61.6  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000125584  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0638  signaling modulator of AmpD, AmpE  32.3 
 
 		 296 aa  60.5  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1424  adenosylcobinamide-phosphate synthase  25.91 
 
 		 306 aa  60.1  0.00000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0517  cobalamin biosynthesis protein CbiB  27.68 
 
 		 298 aa  56.6  0.0000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3858  regulatory protein AmpE  26.51 
 
 		 283 aa  55.5  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000015429 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0417  regulatory protein AmpE  25.91 
 
 		 282 aa  55.1  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0555  cobalamin biosynthesis protein CobD  25.47 
 
 		 311 aa  53.9  0.000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3419  regulatory protein AmpE  24.44 
 
 		 283 aa  53.5  0.000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.535716  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0483  cobalamin biosynthesis protein  31.25 
 
 		 314 aa  53.1  0.000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0317  regulatory protein AmpE  24.62 
 
 		 284 aa  52.4  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.810004 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3699  signaling modulator of AmpD, AmpE  29.44 
 
 		 295 aa  51.2  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.32125  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1823  cobalamin biosynthesis protein CbiB  21.4 
 
 		 325 aa  51.6  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  1.8692500000000003e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12130  Inner membrane protein  29.93 
 
 		 280 aa  50.8  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.567702  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3433  regulatory protein AmpE  24.29 
 
 		 283 aa  50.4  0.00004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.483045  normal  0.595075 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1514  cobalamin biosynthesis protein  30 
 
 		 325 aa  49.7  0.00006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>