35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_1697 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013422  Hneap_1697  signaling modulator of AmpD, AmpE  100 
 
 		 337 aa  665    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0638  signaling modulator of AmpD, AmpE  27.56 
 
 		 296 aa  83.6  0.000000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3348  regulatory protein AmpE  24.34 
 
 		 270 aa  65.1  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3699  signaling modulator of AmpD, AmpE  31.65 
 
 		 295 aa  60.1  0.00000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.32125  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02953  transmembrane protein  29.21 
 
 		 296 aa  58.2  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0877  signaling modulator of AmpD, AmpE  24.71 
 
 		 281 aa  57.4  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0027178  normal  0.0245194 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3419  regulatory protein AmpE  22.51 
 
 		 283 aa  55.5  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.535716  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3858  regulatory protein AmpE  24.82 
 
 		 283 aa  55.1  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000015429 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03227  regulatory protein AmpE  24.79 
 
 		 289 aa  52.4  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0544057  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4810  regulatory protein AmpE  20.71 
 
 		 311 aa  51.6  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0780  regulatory protein AmpE  25.89 
 
 		 284 aa  50.4  0.00004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.29134 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0422  regulatory protein AmpE  23.53 
 
 		 283 aa  50.4  0.00005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4056  regulatory protein AmpE  24.64 
 
 		 283 aa  49.7  0.00006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000497634  normal  0.464654 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3936  regulatory protein AmpE  23.55 
 
 		 283 aa  50.1  0.00006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.501947  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1463  hypothetical protein  26.4 
 
 		 250 aa  49.7  0.00008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1889  hypothetical protein  26.34 
 
 		 334 aa  49.3  0.00009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00289969  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0417  regulatory protein AmpE  22.61 
 
 		 282 aa  48.9  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1520  hypothetical protein  26.4 
 
 		 250 aa  48.9  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3915  regulatory protein AmpE  24.81 
 
 		 283 aa  47.8  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.370917  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0426  regulatory protein AmpE  23.53 
 
 		 283 aa  47.8  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3601  regulatory protein AmpE  23.16 
 
 		 283 aa  46.6  0.0006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.088498  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0424  regulatory protein AmpE  23.28 
 
 		 283 aa  46.2  0.0008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0508582  normal  0.052266 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3779  regulatory protein AmpE  22.4 
 
 		 283 aa  46.2  0.0008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0317  regulatory protein AmpE  24.05 
 
 		 284 aa  45.4  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.810004 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0631  regulatory protein AmpE  24.68 
 
 		 284 aa  45.8  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1003  cobalamin biosynthesis protein  29.14 
 
 		 311 aa  45.1  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1109  putative cobalamin biosynthesis transmembrane protein  25.21 
 
 		 329 aa  45.1  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.805383 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1011  CobD/CbiB family protein  23.08 
 
 		 312 aa  43.9  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.322198  normal  0.895923 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3757  regulatory protein AmpE  26.09 
 
 		 284 aa  43.9  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.118765  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3495  regulatory protein AmpE  24.25 
 
 		 284 aa  43.5  0.005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1038  regulatory protein AmpE  24.25 
 
 		 284 aa  43.5  0.005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.363864 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3367  regulatory protein AmpE  24.25 
 
 		 284 aa  43.5  0.005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.470719  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2432  adenosylcobinamide-phosphate synthase  29.41 
 
 		 304 aa  43.1  0.007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0111605  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0161  regulatory protein AmpE  24 
 
 		 284 aa  42.7  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.667372  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1666  CobD/CbiB family protein  25.81 
 
 		 346 aa  42.7  0.01  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.805294  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>