46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_4810 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_4810  regulatory protein AmpE  100 
 
 		 311 aa  645    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3348  regulatory protein AmpE  34.71 
 
 		 270 aa  193  4e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03227  regulatory protein AmpE  31.49 
 
 		 289 aa  142  7e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0544057  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0373  regulatory protein AmpE  27.91 
 
 		 286 aa  123  4e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.490103  hitchhiker  0.0000919241 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0417  regulatory protein AmpE  26.75 
 
 		 282 aa  112  6e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0317  regulatory protein AmpE  29.14 
 
 		 284 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.810004 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0422  regulatory protein AmpE  27.61 
 
 		 283 aa  109  5e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3858  regulatory protein AmpE  27.38 
 
 		 283 aa  105  8e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000015429 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3433  regulatory protein AmpE  27.91 
 
 		 283 aa  103  4e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.483045  normal  0.595075 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0429  regulatory protein AmpE  28.66 
 
 		 283 aa  103  4e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000942425 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3419  regulatory protein AmpE  25.85 
 
 		 283 aa  102  9e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.535716  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3779  regulatory protein AmpE  27.55 
 
 		 283 aa  100  3e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0426  regulatory protein AmpE  27.03 
 
 		 283 aa  97.8  2e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3601  regulatory protein AmpE  26.22 
 
 		 283 aa  97.4  3e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.088498  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0631  regulatory protein AmpE  26.16 
 
 		 284 aa  96.3  6e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4056  regulatory protein AmpE  26.77 
 
 		 283 aa  96.3  7e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000497634  normal  0.464654 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0424  regulatory protein AmpE  26.28 
 
 		 283 aa  95.9  8e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0508582  normal  0.052266 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3936  regulatory protein AmpE  26.77 
 
 		 283 aa  95.9  8e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.501947  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3367  regulatory protein AmpE  25.77 
 
 		 284 aa  94.7  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.470719  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1038  regulatory protein AmpE  25.77 
 
 		 284 aa  94.7  2e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.363864 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3495  regulatory protein AmpE  25.77 
 
 		 284 aa  94.7  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3915  regulatory protein AmpE  26.77 
 
 		 283 aa  94  3e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.370917  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3385  regulatory protein AmpE  27.59 
 
 		 327 aa  92.4  8e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0780  regulatory protein AmpE  25.86 
 
 		 284 aa  90.5  3e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.29134 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0670  regulatory protein AmpE  27.52 
 
 		 284 aa  85.5  0.000000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3757  regulatory protein AmpE  27.97 
 
 		 284 aa  84.7  0.000000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.118765  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3571  regulatory protein AmpE  25.9 
 
 		 284 aa  80.1  0.00000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0167  regulatory protein AmpE  27.8 
 
 		 284 aa  79  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.762774  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0655  regulatory protein AmpE  26.57 
 
 		 284 aa  79  0.0000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0160  regulatory protein AmpE  27.39 
 
 		 284 aa  77.8  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0161  regulatory protein AmpE  27.39 
 
 		 284 aa  77.8  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.667372  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0164  regulatory protein AmpE  27.39 
 
 		 284 aa  77.8  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.320883  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0159  regulatory protein AmpE  27.39 
 
 		 284 aa  77.8  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0114  regulatory protein AmpE  26.54 
 
 		 284 aa  76.3  0.0000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.363052 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0117  regulatory protein AmpE  26.54 
 
 		 284 aa  75.9  0.0000000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0149146  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00109  hypothetical protein  26.54 
 
 		 284 aa  75.5  0.000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.147668  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3491  signaling modulator of AmpD, AmpE  26.54 
 
 		 284 aa  75.5  0.000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3548  regulatory protein AmpE  26.54 
 
 		 284 aa  75.5  0.000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0782358  hitchhiker  0.00499322 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0113  regulatory protein AmpE  26.54 
 
 		 284 aa  75.5  0.000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000149419  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0115  regulatory protein AmpE  26.54 
 
 		 284 aa  75.5  0.000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000121424  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00110  predicted inner membrane protein  26.54 
 
 		 284 aa  75.5  0.000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0643086  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0104  regulatory protein AmpE  26.54 
 
 		 284 aa  74.7  0.000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.325186  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0638  signaling modulator of AmpD, AmpE  22.43 
 
 		 296 aa  57.8  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1697  signaling modulator of AmpD, AmpE  21.97 
 
 		 337 aa  47.8  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1478  cobalamin biosynthesis protein CbiB  23.73 
 
 		 333 aa  47  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1695  hypothetical protein  22.1 
 
 		 342 aa  45.1  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.93045  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>