69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_3757 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_3757  regulatory protein AmpE  100 
 
 		 284 aa  566  1e-160  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.118765  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3571  regulatory protein AmpE  95.07 
 
 		 284 aa  520  1e-147  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0631  regulatory protein AmpE  76.76 
 
 		 284 aa  418  1e-116  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0780  regulatory protein AmpE  71.83 
 
 		 284 aa  406  1.0000000000000001e-112  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.29134 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0670  regulatory protein AmpE  76.76 
 
 		 284 aa  404  1e-111  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3367  regulatory protein AmpE  69.37 
 
 		 284 aa  384  1e-106  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.470719  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3495  regulatory protein AmpE  69.37 
 
 		 284 aa  384  1e-106  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1038  regulatory protein AmpE  69.37 
 
 		 284 aa  384  1e-106  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.363864 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0655  regulatory protein AmpE  61.62 
 
 		 284 aa  360  2e-98  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0117  regulatory protein AmpE  65.14 
 
 		 284 aa  357  9.999999999999999e-98  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0149146  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0167  regulatory protein AmpE  63.03 
 
 		 284 aa  357  9.999999999999999e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.762774  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0159  regulatory protein AmpE  62.68 
 
 		 284 aa  356  2.9999999999999997e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0164  regulatory protein AmpE  62.68 
 
 		 284 aa  356  2.9999999999999997e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.320883  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0160  regulatory protein AmpE  62.68 
 
 		 284 aa  356  2.9999999999999997e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0114  regulatory protein AmpE  64.79 
 
 		 284 aa  355  5e-97  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.363052 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0115  regulatory protein AmpE  64.79 
 
 		 284 aa  355  5.999999999999999e-97  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000121424  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0113  regulatory protein AmpE  64.79 
 
 		 284 aa  355  5.999999999999999e-97  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000149419  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3491  signaling modulator of AmpD, AmpE  64.79 
 
 		 284 aa  355  5.999999999999999e-97  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00110  predicted inner membrane protein  64.79 
 
 		 284 aa  355  5.999999999999999e-97  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0643086  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3548  regulatory protein AmpE  64.79 
 
 		 284 aa  355  5.999999999999999e-97  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0782358  hitchhiker  0.00499322 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00109  hypothetical protein  64.79 
 
 		 284 aa  355  5.999999999999999e-97  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.147668  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0161  regulatory protein AmpE  62.68 
 
 		 284 aa  354  1e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.667372  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0104  regulatory protein AmpE  64.44 
 
 		 284 aa  352  4e-96  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.325186  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0417  regulatory protein AmpE  32.18 
 
 		 282 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0317  regulatory protein AmpE  30.85 
 
 		 284 aa  120  3e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.810004 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0373  regulatory protein AmpE  30.95 
 
 		 286 aa  113  3e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.490103  hitchhiker  0.0000919241 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0426  regulatory protein AmpE  31.4 
 
 		 283 aa  113  3e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3601  regulatory protein AmpE  31.06 
 
 		 283 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.088498  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0424  regulatory protein AmpE  30.38 
 
 		 283 aa  109  5e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0508582  normal  0.052266 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0422  regulatory protein AmpE  29.86 
 
 		 283 aa  106  4e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3419  regulatory protein AmpE  29.9 
 
 		 283 aa  106  5e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.535716  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3858  regulatory protein AmpE  32.41 
 
 		 283 aa  105  7e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000015429 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3936  regulatory protein AmpE  31.14 
 
 		 283 aa  103  2e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.501947  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4056  regulatory protein AmpE  31.49 
 
 		 283 aa  103  3e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000497634  normal  0.464654 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3915  regulatory protein AmpE  31.49 
 
 		 283 aa  102  6e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.370917  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3779  regulatory protein AmpE  28.96 
 
 		 283 aa  102  6e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3433  regulatory protein AmpE  30.27 
 
 		 283 aa  101  1e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.483045  normal  0.595075 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0429  regulatory protein AmpE  30.57 
 
 		 283 aa  99.4  7e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000942425 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3348  regulatory protein AmpE  28.12 
 
 		 270 aa  97.4  2e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4810  regulatory protein AmpE  27.84 
 
 		 311 aa  94.7  2e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03227  regulatory protein AmpE  30.23 
 
 		 289 aa  90.1  4e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0544057  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3385  regulatory protein AmpE  25 
 
 		 327 aa  72  0.00000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12130  Inner membrane protein  32.89 
 
 		 280 aa  62.8  0.000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.567702  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0638  signaling modulator of AmpD, AmpE  27.31 
 
 		 296 aa  61.2  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3699  signaling modulator of AmpD, AmpE  28.43 
 
 		 295 aa  54.3  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.32125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0788  AmpE  27.81 
 
 		 277 aa  52  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.689986  normal  0.152356 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0818  ampE protein  28.03 
 
 		 278 aa  50.1  0.00004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.927721  normal  0.187912 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33100  cobalamin biosynthesis protein  33.12 
 
 		 302 aa  48.1  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00042631  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1044  CobD/CbiB family protein  29.5 
 
 		 305 aa  47  0.0004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.211721 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0951  ampE protein  26.75 
 
 		 278 aa  47  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2392  cobalamin biosynthesis protein  29.14 
 
 		 331 aa  46.6  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0151839 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1458  cobalamin biosynthesis protein CobD  27.21 
 
 		 300 aa  45.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.862014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0824  signaling modulator of AmpD, AmpE  24.67 
 
 		 276 aa  45.1  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1463  hypothetical protein  24.77 
 
 		 250 aa  45.1  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1520  hypothetical protein  22.34 
 
 		 250 aa  45.1  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58660  hypothetical protein  28 
 
 		 278 aa  45.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0813  signaling modulator of AmpD, AmpE  24.67 
 
 		 276 aa  44.3  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.17689 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1109  putative cobalamin biosynthesis transmembrane protein  26.82 
 
 		 329 aa  43.9  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.805383 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0522  cobalamin biosynthesis protein CbiB  36 
 
 		 319 aa  43.5  0.004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0781  signaling modulator of AmpD, AmpE  27.45 
 
 		 277 aa  43.1  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0790  signaling modulator of AmpD, AmpE  24.67 
 
 		 276 aa  43.1  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2852  CobD/CbiB family protein  24.43 
 
 		 312 aa  42.7  0.007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0912  CobD/CbiB family protein  24.43 
 
 		 312 aa  42.7  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2539  CobD/CbiB family protein  24.43 
 
 		 312 aa  42.7  0.007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.207097  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0235  CobD/CbiB family protein  24.43 
 
 		 312 aa  42.7  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0396  CobD/CbiB family protein  24.43 
 
 		 312 aa  42.7  0.007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0206694  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2912  CobD/CbiB family protein  24.43 
 
 		 329 aa  42.4  0.009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2962  CobD/CbiB family protein  24.43 
 
 		 329 aa  42.4  0.009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0903  CobD/CbiB family protein  27.39 
 
 		 331 aa  42.4  0.01  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>