More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2058 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_2058  DNA ligase, NAD-dependent  100 
 
 		 708 aa  1390    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0004  DNA ligase, NAD-dependent  44.71 
 
 		 675 aa  538  1e-151  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2927  DNA ligase, NAD-dependent  39.58 
 
 		 683 aa  441  9.999999999999999e-123  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000591487  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3660  DNA ligase, NAD-dependent  37.8 
 
 		 681 aa  426  1e-118  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0589668  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2728  NAD-dependent DNA ligase C4-type  38.61 
 
 		 671 aa  426  1e-118  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2346  DNA ligase, NAD-dependent  36.68 
 
 		 670 aa  428  1e-118  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1511  DNA ligase, NAD-dependent  33.23 
 
 		 662 aa  424  1e-117  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0217425  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0890  DNA ligase, NAD-dependent  37.76 
 
 		 670 aa  421  1e-116  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0182  DNA ligase, NAD-dependent  34.69 
 
 		 681 aa  422  1e-116  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0647  DNA ligase, NAD-dependent  37.3 
 
 		 707 aa  416  9.999999999999999e-116  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.407599  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1094  DNA ligase, NAD-dependent  36.73 
 
 		 672 aa  417  9.999999999999999e-116  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.878392  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0894  DNA ligase, NAD-dependent  34.75 
 
 		 700 aa  414  1e-114  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1522  NAD-dependent DNA ligase  34.68 
 
 		 673 aa  412  1e-114  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2948  DNA ligase, NAD-dependent  36.73 
 
 		 668 aa  412  1e-114  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1117  DNA ligase, NAD-dependent  38.86 
 
 		 673 aa  414  1e-114  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.62969  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0538  DNA ligase, NAD-dependent  34.86 
 
 		 662 aa  413  1e-114  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1617  DNA ligase, NAD-dependent  37.88 
 
 		 672 aa  415  1e-114  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.755766  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0271  NAD-dependent DNA ligase LigA  35.61 
 
 		 670 aa  409  1e-113  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2213  DNA ligase, NAD-dependent  36.02 
 
 		 671 aa  411  1e-113  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000618814  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1336  DNA ligase, NAD-dependent  36.32 
 
 		 668 aa  409  1e-113  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0655  DNA ligase, NAD-dependent  34.53 
 
 		 670 aa  411  1e-113  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0462  DNA ligase, NAD-dependent  34.45 
 
 		 663 aa  412  1e-113  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1432  NAD-dependent DNA ligase LigA  37.2 
 
 		 670 aa  409  1.0000000000000001e-112  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000269504  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2744  NAD-dependent DNA ligase LigA  37.05 
 
 		 670 aa  409  1.0000000000000001e-112  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000148607  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2024  DNA ligase (NAD(+))  37.65 
 
 		 675 aa  406  1.0000000000000001e-112  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00334946  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1321  NAD-dependent DNA ligase LigA  37.2 
 
 		 670 aa  409  1.0000000000000001e-112  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000153003  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1313  DNA ligase  34.07 
 
 		 670 aa  406  1.0000000000000001e-112  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.269353 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1305  DNA ligase, NAD-dependent  37.37 
 
 		 672 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.617786  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1428  DNA ligase, NAD-dependent  37.1 
 
 		 694 aa  408  1.0000000000000001e-112  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0176599  normal  0.198216 
 
 
-
 
NC_002950  PG1253  DNA ligase, NAD-dependent  37.59 
 
 		 669 aa  405  1e-111  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1734  NAD-dependent DNA ligase  38.36 
 
 		 683 aa  404  1e-111  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.39998  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1618  DNA ligase, NAD-dependent  34.46 
 
 		 673 aa  405  1e-111  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000164842  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1222  DNA ligase, NAD-dependent  36.84 
 
 		 712 aa  403  1e-111  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004153  DNA ligase  35.91 
 
 		 690 aa  403  1e-111  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0490058  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02311  NAD-dependent DNA ligase LigA  37.05 
 
 		 671 aa  401  9.999999999999999e-111  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000571235  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1250  DNA ligase, NAD-dependent  36.9 
 
 		 671 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000262994  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2546  NAD-dependent DNA ligase LigA  37.05 
 
 		 671 aa  401  9.999999999999999e-111  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  6.01558e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1886  NAD-dependent DNA ligase  38.11 
 
 		 711 aa  400  9.999999999999999e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0136067  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1045  DNA ligase, NAD-dependent  36.69 
 
 		 680 aa  399  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2698  NAD-dependent DNA ligase LigA  36.9 
 
 		 671 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000106098  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2883  DNA ligase, NAD-dependent  35.02 
 
 		 678 aa  402  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.745192 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02272  hypothetical protein  37.05 
 
 		 671 aa  401  9.999999999999999e-111  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000450383  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1267  NAD-dependent DNA ligase LigA  36.9 
 
 		 671 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000309607  decreased coverage  0.0000372126 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0801  NAD-dependent DNA ligase LigA  36.87 
 
 		 682 aa  400  9.999999999999999e-111  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0327  DNA ligase, NAD-dependent  38.35 
 
 		 685 aa  400  9.999999999999999e-111  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3444  NAD-dependent DNA ligase LigA  36.38 
 
 		 673 aa  396  1e-109  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000441921  hitchhiker  0.000209829 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3642  NAD-dependent DNA ligase LigA  36.9 
 
 		 671 aa  399  1e-109  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000402344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2566  NAD-dependent DNA ligase LigA  36.75 
 
 		 671 aa  399  1e-109  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000140501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4515  DNA ligase, NAD-dependent  37.85 
 
 		 726 aa  399  1e-109  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0877  DNA ligase, NAD-dependent  37.1 
 
 		 718 aa  397  1e-109  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00627604  hitchhiker  0.0000000262982 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01312  NAD-dependent DNA ligase LigA  36.14 
 
 		 670 aa  399  1e-109  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1526  DNA ligase, NAD-dependent  36.82 
 
 		 797 aa  397  1e-109  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0626416  normal  0.309916 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2438  DNA ligase, NAD-dependent  37.23 
 
 		 673 aa  394  1e-108  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0451  DNA ligase, NAD-dependent  37.85 
 
 		 808 aa  392  1e-108  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.950618 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1035  DNA ligase, NAD-dependent  34.53 
 
 		 663 aa  394  1e-108  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2571  NAD-dependent DNA ligase LigA  37.01 
 
 		 671 aa  393  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000161057  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1816  DNA ligase, NAD-dependent  37.85 
 
 		 707 aa  393  1e-108  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.633094  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0592  DNA ligase, NAD-dependent  32.07 
 
 		 669 aa  395  1e-108  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0313  NAD-dependent DNA ligase LigA  35.58 
 
 		 676 aa  393  1e-108  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0763  DNA ligase, NAD-dependent  35.19 
 
 		 677 aa  394  1e-108  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000192603  normal  0.836157 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0683  DNA ligase, NAD-dependent  35.46 
 
 		 684 aa  393  1e-108  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.992096  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1239  DNA ligase, NAD-dependent  34.3 
 
 		 672 aa  395  1e-108  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00267622  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1343  DNA ligase, NAD-dependent  35.4 
 
 		 683 aa  394  1e-108  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.584756  normal  0.20338 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1926  hypothetical protein  34.03 
 
 		 671 aa  395  1e-108  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3950  DNA ligase, NAD-dependent  35.58 
 
 		 684 aa  394  1e-108  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2190  DNA ligase, NAD-dependent  39.2 
 
 		 693 aa  390  1e-107  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0728062  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2792  NAD-dependent DNA ligase LigA  37.03 
 
 		 671 aa  392  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.755122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0277  NAD-dependent DNA ligase LigA  37.36 
 
 		 679 aa  392  1e-107  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0939  DNA ligase (NAD+)  38.29 
 
 		 698 aa  392  1e-107  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.331194  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2686  NAD-dependent DNA ligase LigA  36.88 
 
 		 671 aa  390  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.595672  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2620  NAD-dependent DNA ligase LigA  37.03 
 
 		 671 aa  391  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.936148  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3403  NAD-dependent DNA ligase LigA  36.55 
 
 		 681 aa  390  1e-107  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3318  DNA ligase, NAD-dependent  33.68 
 
 		 670 aa  392  1e-107  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.563923 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0681  DNA ligase, NAD-dependent  38.4 
 
 		 673 aa  389  1e-107  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.295891  normal  0.841285 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2662  NAD-dependent DNA ligase LigA  36.73 
 
 		 671 aa  392  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0516763  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0847  DNA ligase, NAD-dependent  34.43 
 
 		 688 aa  386  1e-106  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2939  NAD-dependent DNA ligase LigA  36.3 
 
 		 671 aa  387  1e-106  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000192646  normal  0.0623801 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1672  DNA ligase, NAD-dependent  36.69 
 
 		 740 aa  386  1e-106  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.672303  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3562  NAD-dependent DNA ligase LigA  36.59 
 
 		 681 aa  389  1e-106  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0163  DNA ligase, NAD-dependent  36.4 
 
 		 685 aa  386  1e-106  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0316123  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1167  DNA ligase, NAD-dependent  36.84 
 
 		 678 aa  386  1e-106  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.140803  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2022  DNA ligase, NAD-dependent  35.46 
 
 		 691 aa  387  1e-106  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1676  NAD-dependent DNA ligase  35.29 
 
 		 688 aa  386  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.194979  normal  0.0666248 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1455  DNA ligase, NAD-dependent  35.55 
 
 		 671 aa  387  1e-106  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2461  DNA ligase, NAD-dependent  35.29 
 
 		 688 aa  389  1e-106  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0455112  hitchhiker  0.000280706 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0824  DNA ligase, NAD-dependent  34.43 
 
 		 688 aa  386  1e-106  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3418  DNA ligase, NAD-dependent  35.74 
 
 		 674 aa  387  1e-106  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1881  DNA ligase (NAD+)  35.09 
 
 		 674 aa  385  1e-105  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.605724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2592  DNA ligase, NAD-dependent  36.59 
 
 		 706 aa  385  1e-105  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.457213 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0369  DNA ligase (NAD(+))  34.6 
 
 		 661 aa  385  1e-105  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2057  DNA ligase, NAD-dependent  35.72 
 
 		 691 aa  383  1e-105  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.258192  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1926  DNA ligase, NAD-dependent  35.72 
 
 		 691 aa  385  1e-105  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.55791  normal  0.279266 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1715  DNA ligase, NAD-dependent  35.44 
 
 		 682 aa  383  1e-105  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000203227  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0287  NAD-dependent DNA ligase LigA  33.43 
 
 		 669 aa  384  1e-105  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2442  DNA ligase, NAD-dependent  35.55 
 
 		 691 aa  381  1e-104  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.414068  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2364  DNA ligase, NAD-dependent  35.05 
 
 		 685 aa  382  1e-104  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0084265  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2062  DNA ligase, NAD-dependent  35.55 
 
 		 691 aa  381  1e-104  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.631088  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2013  DNA ligase, NAD-dependent  37.44 
 
 		 666 aa  380  1e-104  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2201  DNA ligase, NAD-dependent  36.34 
 
 		 690 aa  380  1e-104  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.378461  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1403  DNA ligase, NAD-dependent  36.65 
 
 		 693 aa  382  1e-104  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.655941  normal  0.448551 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>