115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_2978 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_2978  RecB family exonuclease-like protein  100 
 
 		 323 aa  642    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000129924  hitchhiker  0.00505029 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22140  RecB family exonuclease  56.34 
 
 		 333 aa  316  3e-85  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.180752  normal  0.721654 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3137  RecB family exonuclease  51.09 
 
 		 277 aa  283  3.0000000000000004e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.67707  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3199  RecB family exonuclease  51.09 
 
 		 277 aa  283  3.0000000000000004e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.487401  normal  0.220799 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3149  RecB family exonuclease  51.09 
 
 		 277 aa  283  3.0000000000000004e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.424506  normal  0.878116 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2636  hypothetical protein  54.62 
 
 		 299 aa  283  4.0000000000000003e-75  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2222  RecB family exonuclease-like protein  55.68 
 
 		 297 aa  282  5.000000000000001e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.839667  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3064  RecB family exonuclease  51.8 
 
 		 291 aa  282  6.000000000000001e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.130933 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3463  RecB family exonuclease  50.72 
 
 		 304 aa  281  1e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4476  RecB family exonuclease-like protein  52.12 
 
 		 267 aa  281  1e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.842186  normal  0.295371 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1180  RecB family exonuclease  52.47 
 
 		 266 aa  280  2e-74  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.371869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2414  RecB family exonuclease-like protein  53.05 
 
 		 351 aa  279  6e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1816  hypothetical protein  50.38 
 
 		 280 aa  278  8e-74  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1844  RecB family exonuclease-like protein  52.4 
 
 		 286 aa  278  1e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2304  RecB family exonuclease-like protein  52.14 
 
 		 311 aa  276  4e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00598996  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5903  RecB family exonuclease-like protein  53.49 
 
 		 295 aa  274  1.0000000000000001e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.016661  normal  0.144641 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12151  hypothetical protein  51.91 
 
 		 278 aa  273  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2676  hypothetical protein  50.7 
 
 		 320 aa  271  1e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.647188  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1478  hypothetical protein  51.15 
 
 		 273 aa  266  2.9999999999999995e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0682127  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2456  RecB family exonuclease-like protein  50.98 
 
 		 295 aa  261  2e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2353  hypothetical protein  50.71 
 
 		 303 aa  258  7e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.978382  normal  0.150681 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1482  RecB family exonuclease-like protein  50.18 
 
 		 302 aa  258  8e-68  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2236  hypothetical protein  50.79 
 
 		 322 aa  258  1e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.636003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2634  RecB family exonuclease  50 
 
 		 303 aa  255  7e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.311495 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4886  hypothetical protein  51.35 
 
 		 334 aa  255  9e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.335853 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1855  putative RecB family exonuclease  49.24 
 
 		 294 aa  254  2.0000000000000002e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20930  RecB family exonuclease  49.01 
 
 		 297 aa  253  2.0000000000000002e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.466535  normal  0.903432 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2007  RecB family exonuclease-like protein  47.51 
 
 		 284 aa  241  1e-62  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.151824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13930  RecB family exonuclease  45.17 
 
 		 313 aa  241  1e-62  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.199879  normal  0.841258 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1198  RecB family exonuclease-like protein  40.32 
 
 		 298 aa  207  3e-52  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0768064  normal  0.151704 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0757  hypothetical protein  36.76 
 
 		 259 aa  151  1e-35  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0625  UvrD/REP helicase  26.91 
 
 		 1019 aa  94  3e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.243128  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4397  hypothetical protein  26.32 
 
 		 615 aa  85.1  0.000000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.272271 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0904  hypothetical protein  30.53 
 
 		 276 aa  81.3  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.107924 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1068  hypothetical protein  24.44 
 
 		 411 aa  80.5  0.00000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2998  hypothetical protein  26.53 
 
 		 306 aa  79.3  0.00000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8396  hypothetical protein  27.37 
 
 		 293 aa  78.6  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.75052 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1197  hypothetical protein  29.1 
 
 		 312 aa  77  0.0000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0561644  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0965  hypothetical protein  29.76 
 
 		 387 aa  76.3  0.0000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0821  hypothetical protein  29.43 
 
 		 279 aa  76.3  0.0000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00000666708  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06610  RecB family exonuclease  28.36 
 
 		 286 aa  75.5  0.000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_39374  predicted protein  28.19 
 
 		 366 aa  72.4  0.000000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0593  exonuclease-like protein  26.36 
 
 		 379 aa  71.2  0.00000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0865179  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_558  hypothetical protein  26.34 
 
 		 379 aa  69.3  0.00000000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0683  hypothetical protein  29.82 
 
 		 302 aa  68.6  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.923342  normal  0.810121 
 
 
-
 
NC_002936  DET0620  hypothetical protein  26.32 
 
 		 379 aa  67.4  0.0000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.638225  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1131  UvrD/REP helicase  32.7 
 
 		 1094 aa  67  0.0000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0737  hypothetical protein  28.47 
 
 		 302 aa  65.5  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.907261  normal  0.486862 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2712  hypothetical protein  27.69 
 
 		 543 aa  63.5  0.000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000442298  hitchhiker  0.0000400817 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1024  hypothetical protein  27.78 
 
 		 387 aa  62.8  0.000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.115422  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15090  DNA/RNA helicase, superfamily I  33.16 
 
 		 1176 aa  62  0.00000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0636  hypothetical protein  28.57 
 
 		 387 aa  61.2  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0777  hypothetical protein  29.23 
 
 		 387 aa  61.2  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0715  hypothetical protein  27.78 
 
 		 387 aa  60.8  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.348942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0825  hypothetical protein  27.89 
 
 		 387 aa  60.8  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0799374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0903  hypothetical protein  27.78 
 
 		 387 aa  60.8  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1403  UvrD/REP helicase  28.73 
 
 		 1051 aa  60.1  0.00000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1421  UvrD/REP helicase  28.73 
 
 		 1051 aa  60.1  0.00000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1457  UvrD/REP helicase  28.73 
 
 		 1051 aa  59.7  0.00000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0431152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0085  UvrD/REP helicase  22.83 
 
 		 1016 aa  59.7  0.00000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.60174  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4258  hypothetical protein  27.14 
 
 		 287 aa  59.7  0.00000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.500216  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0308  exonuclease-like protein  23.55 
 
 		 244 aa  59.3  0.00000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00000290112  hitchhiker  0.00000170332 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4666  UvrD/REP helicase  26.07 
 
 		 1038 aa  57  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0501158  normal  0.218907 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0909  hypothetical protein  26.69 
 
 		 783 aa  57.4  0.0000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13225  ATP-dependent DNA helicase  25.64 
 
 		 1055 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3814  hypothetical protein  30.72 
 
 		 284 aa  55.1  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.18541  normal  0.492417 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0711  UvrD/REP helicase  26.22 
 
 		 1059 aa  54.7  0.000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4244  UvrD/REP helicase  26.2 
 
 		 1062 aa  53.9  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.664691  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00780  hypothetical protein  30.51 
 
 		 990 aa  52.8  0.000009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1392  hypothetical protein  24.15 
 
 		 803 aa  52.4  0.00001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1801  UvrD/REP helicase  25.48 
 
 		 1038 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.078646 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1525  putative helicase/exonuclease  30.14 
 
 		 997 aa  50.4  0.00004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.873687  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0177  putative helicase/exonuclease  28.51 
 
 		 997 aa  50.4  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.169187  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0840  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  26.48 
 
 		 1048 aa  50.4  0.00004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.564215  hitchhiker  0.00099262 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0088  hypothetical protein  24.6 
 
 		 781 aa  50.1  0.00006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.217564  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2040  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  29.24 
 
 		 1146 aa  48.5  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0818  double-strand break repair protein AddB  29.82 
 
 		 1052 aa  48.9  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5824  UvrD/REP helicase  29.21 
 
 		 1052 aa  48.5  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.101502 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1280  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  29.3 
 
 		 958 aa  48.9  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1156  hypothetical protein  26.11 
 
 		 865 aa  47.8  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4408  UvrD/REP helicase  29.09 
 
 		 1123 aa  48.1  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.471337  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0851  UvrD/REP helicase  31.28 
 
 		 1349 aa  48.1  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2102  hypothetical protein  31.13 
 
 		 1052 aa  47.4  0.0003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0988  UvrD/REP helicase  31.55 
 
 		 1146 aa  47.4  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.181635  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0453  hypothetical protein  23.19 
 
 		 276 aa  47.4  0.0003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0515112  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2019  double-strand break repair protein AddB  31.13 
 
 		 1052 aa  47.4  0.0003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1443  superfamily I DNA/RNA helicase  27.82 
 
 		 920 aa  47.4  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  unclonable  0.000000114812  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3799  UvrD/REP helicase  28.8 
 
 		 1130 aa  47  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0121759  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3822  UvrD/REP helicase  27.27 
 
 		 1060 aa  47  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0180671  hitchhiker  0.00809927 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5053  hypothetical protein  26.04 
 
 		 267 aa  47.4  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.609849 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0896  UvrD/REP helicase  25 
 
 		 1066 aa  47  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.380602  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1977  putative DNA repair protein  28.95 
 
 		 913 aa  46.6  0.0005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.286475 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3501  UvrD/REP helicase  26.74 
 
 		 1129 aa  47  0.0005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.235136  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1066  UvrD/REP helicase  26.79 
 
 		 1048 aa  46.6  0.0006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1998  helicase  32.94 
 
 		 993 aa  46.2  0.0008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.138335  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7808  UvrD/REP helicase  23.7 
 
 		 1134 aa  46.2  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2601  hypothetical protein  26.52 
 
 		 263 aa  46.2  0.0009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.718705  normal  0.128689 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0952  hypothetical protein  22.52 
 
 		 263 aa  45.4  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1682  ATP-dependent exonuclease, subunit B  27.04 
 
 		 1106 aa  45.4  0.001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0735  hypothetical protein  27.43 
 
 		 781 aa  45.4  0.001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>