87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_0840 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010718  Nther_0840  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  100 
 
 		 1048 aa  2158    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.564215  hitchhiker  0.00099262 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1570  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  23.23 
 
 		 1043 aa  86.7  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4407  ATP-dependent nuclease subunit B-like  25.34 
 
 		 1045 aa  81.3  0.00000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.546962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1499  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  27.44 
 
 		 1049 aa  77.4  0.000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3983  hypothetical protein  21 
 
 		 1100 aa  76.6  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.588967  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4020  hypothetical protein  27.93 
 
 		 1079 aa  73.2  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3877  hypothetical protein  28.37 
 
 		 1151 aa  71.6  0.00000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1804  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  27.56 
 
 		 986 aa  67.4  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2040  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  24.65 
 
 		 1146 aa  65.9  0.000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0024  ATP-dependent nuclease, subunit B  29.15 
 
 		 1158 aa  64.3  0.00000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.199779  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0024  ATP-dependent nuclease subunit B  28.74 
 
 		 1158 aa  63.5  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1996  hypothetical protein  25.42 
 
 		 884 aa  63.9  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.573803  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1525  putative helicase/exonuclease  27.55 
 
 		 997 aa  63.2  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.873687  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2361  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  21.38 
 
 		 1113 aa  63.2  0.00000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0177  putative helicase/exonuclease  27.67 
 
 		 997 aa  61.6  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.169187  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2513  ATP-dependent nuclease subunit B-like  29.79 
 
 		 1029 aa  60.1  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.260712  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1321  methyltransferase type 11  22.19 
 
 		 915 aa  59.7  0.0000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0781  hypothetical protein  26.69 
 
 		 886 aa  59.3  0.0000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.384751  normal  0.165581 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0818  double-strand break repair protein AddB  30.81 
 
 		 1052 aa  58.9  0.0000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0550  ATP-dependent nuclease subunit B-like  25.71 
 
 		 1140 aa  58.9  0.0000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2986  hypothetical protein  28.46 
 
 		 884 aa  58.9  0.0000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.262988 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0085  UvrD/REP helicase  24.14 
 
 		 1016 aa  58.2  0.0000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.60174  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0479  ATP-dependent nuclease subunit B-like  25.23 
 
 		 908 aa  58.2  0.0000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.236866  hitchhiker  0.000840779 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0036  hypothetical protein  24.44 
 
 		 886 aa  57.4  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2115  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  25 
 
 		 957 aa  56.6  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22140  RecB family exonuclease  27.62 
 
 		 333 aa  56.2  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.180752  normal  0.721654 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3437  double-strand break repair helicase AddB  26.18 
 
 		 988 aa  56.2  0.000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1438  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  28.33 
 
 		 1029 aa  56.2  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.140223  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1775  ATP-dependent nuclease subunit B  25.64 
 
 		 1149 aa  56.2  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2952  exonuclease-like protein  26.7 
 
 		 1000 aa  55.8  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.034558  normal  0.0831314 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2222  RecB family exonuclease-like protein  26.48 
 
 		 297 aa  55.8  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.839667  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1287  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  21.15 
 
 		 994 aa  55.1  0.000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2132  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V subunit B  25.76 
 
 		 976 aa  55.1  0.000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.687537 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0202  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  27.94 
 
 		 1149 aa  54.3  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3424  ATP-dependent nuclease subunit B  28.63 
 
 		 1171 aa  54.3  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2374  hypothetical protein  23.63 
 
 		 968 aa  53.5  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1709  hypothetical protein  24.58 
 
 		 896 aa  53.9  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000066453  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0308  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  28.38 
 
 		 1161 aa  53.9  0.00002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3104  hypothetical protein  25.93 
 
 		 884 aa  53.1  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.238928  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0522  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  27.17 
 
 		 1121 aa  52.8  0.00004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4953  double-strand break repair protein AddB  28.95 
 
 		 1045 aa  52.8  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.28213  normal  0.220152 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2077  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  27.96 
 
 		 1169 aa  52  0.00005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2795  putative helicase/exonuclease  27.93 
 
 		 980 aa  50.8  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0765  hypothetical protein  22.88 
 
 		 1100 aa  51.2  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.166845 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1156  hypothetical protein  25.66 
 
 		 865 aa  50.8  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2845  hypothetical protein  27.32 
 
 		 977 aa  51.2  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.786725 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0049  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  24.52 
 
 		 1260 aa  50.8  0.0001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2680  double-strand break repair protein AddB  26.55 
 
 		 991 aa  50.8  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2019  double-strand break repair protein AddB  28.65 
 
 		 1052 aa  51.2  0.0001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2102  hypothetical protein  28.65 
 
 		 1052 aa  50.8  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2897  hypothetical protein  25.73 
 
 		 846 aa  50.4  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1280  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  22.73 
 
 		 958 aa  50.4  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2174  double-strand break repair protein AddB  25.94 
 
 		 1076 aa  50.1  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.229976  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4903  double-strand break repair protein AddB  28.12 
 
 		 1047 aa  50.1  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.402113  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2978  RecB family exonuclease-like protein  26.48 
 
 		 323 aa  50.4  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000129924  hitchhiker  0.00505029 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1142  ATP-dependent nuclease subunit B  25.65 
 
 		 1124 aa  49.7  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1165  hypothetical protein  26.94 
 
 		 984 aa  49.7  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.5757 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4439  double-strand break repair protein AddB  28.12 
 
 		 1047 aa  49.3  0.0004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.522195  normal  0.331635 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1180  RecB family exonuclease  26.79 
 
 		 266 aa  49.3  0.0004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.371869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1243  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  26.75 
 
 		 968 aa  48.9  0.0005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0167838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1392  hypothetical protein  21.54 
 
 		 803 aa  48.1  0.0008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2676  hypothetical protein  23.99 
 
 		 320 aa  48.1  0.0008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.647188  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5824  UvrD/REP helicase  30 
 
 		 1052 aa  48.1  0.0009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.101502 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2636  hypothetical protein  25.46 
 
 		 299 aa  47.8  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0820  hypothetical protein  22.58 
 
 		 914 aa  47.8  0.001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.839231  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3580  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  26.2 
 
 		 1042 aa  47.4  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.412943  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00780  hypothetical protein  24.35 
 
 		 990 aa  47  0.002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1478  hypothetical protein  23.98 
 
 		 273 aa  47.4  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0682127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3243  double-strand break repair protein AddB  26.11 
 
 		 1059 aa  47  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1587  hypothetical protein  25.35 
 
 		 997 aa  47  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0481  ATP-dependent deoxyribonuclease subunit B  25.59 
 
 		 1151 aa  46.6  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5094  double-strand break repair protein AddB  26.32 
 
 		 1054 aa  45.8  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.145083 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3960  double-strand break repair protein AddB  26.02 
 
 		 1064 aa  45.4  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3149  RecB family exonuclease  24.54 
 
 		 277 aa  45.8  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.424506  normal  0.878116 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3199  RecB family exonuclease  24.54 
 
 		 277 aa  45.8  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.487401  normal  0.220799 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3137  RecB family exonuclease  24.54 
 
 		 277 aa  45.8  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.67707  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4287  double-strand break repair protein AddB  27.04 
 
 		 1064 aa  45.4  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.235496  normal  0.271483 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1125  hypothetical protein  25.21 
 
 		 947 aa  45.4  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.290097 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1244  ATP-dependent nuclease, subunit B  29.53 
 
 		 1171 aa  44.7  0.009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1219  ATP-dependent nuclease, subunit B  29.53 
 
 		 1171 aa  44.7  0.009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1844  RecB family exonuclease-like protein  24.33 
 
 		 286 aa  44.7  0.009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1060  ATP-dependent nuclease subunit B  29.53 
 
 		 1171 aa  44.7  0.009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1040  ATP-dependent nuclease, subunit B  29.53 
 
 		 1171 aa  44.7  0.009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1038  ATP-dependent nuclease, subunit B  29.53 
 
 		 1171 aa  44.7  0.009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1141  ATP-dependent nuclease subunit B  29.53 
 
 		 1171 aa  44.7  0.009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.990093  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1485  ATP-dependent nuclease subunit B  29.44 
 
 		 1172 aa  44.7  0.01  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1296  ATP-dependent nuclease, subunit B  29.53 
 
 		 1171 aa  44.7  0.01  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>