87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_1287 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010644  Emin_1287  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  100 
 
 		 994 aa  2033    Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0202  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  22.2 
 
 		 1149 aa  100  1e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1775  ATP-dependent nuclease subunit B  22.25 
 
 		 1149 aa  90.5  2e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1142  ATP-dependent nuclease subunit B  21.25 
 
 		 1124 aa  86.7  0.000000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1804  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  23.46 
 
 		 986 aa  87  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0024  ATP-dependent nuclease subunit B  21.84 
 
 		 1158 aa  80.9  0.0000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1415  UvrD-like DNA helicase, C terminal  20.43 
 
 		 1155 aa  79.3  0.0000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0024  ATP-dependent nuclease, subunit B  21.6 
 
 		 1158 aa  79  0.0000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.199779  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2040  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  20.66 
 
 		 1146 aa  79  0.0000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0034  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  27.68 
 
 		 836 aa  78.2  0.0000000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0563603 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0481  ATP-dependent deoxyribonuclease subunit B  22.57 
 
 		 1151 aa  73.2  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1560  ATP-dependent nuclease subunit B  22 
 
 		 1033 aa  72.8  0.00000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0240476  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1040  ATP-dependent nuclease subunit AddB  24.01 
 
 		 1171 aa  71.6  0.00000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.20152  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0670  ATP-dependent nuclease subunit B  23.85 
 
 		 1171 aa  71.6  0.00000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1219  ATP-dependent nuclease, subunit B  25.31 
 
 		 1171 aa  70.1  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1356  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  23.81 
 
 		 935 aa  69.7  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.188722  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1296  ATP-dependent nuclease, subunit B  25.49 
 
 		 1171 aa  68.6  0.0000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1244  ATP-dependent nuclease, subunit B  24.56 
 
 		 1171 aa  68.6  0.0000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1277  UvrD-like DNA helicase, C terminal  21.78 
 
 		 1165 aa  67.8  0.0000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1141  ATP-dependent nuclease subunit B  24.56 
 
 		 1171 aa  68.2  0.0000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.990093  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1060  ATP-dependent nuclease subunit B  24.56 
 
 		 1171 aa  68.2  0.0000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4407  ATP-dependent nuclease subunit B-like  21.86 
 
 		 1045 aa  67.4  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.546962  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1321  methyltransferase type 11  22.1 
 
 		 915 aa  67.8  0.000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1038  ATP-dependent nuclease, subunit B  24.06 
 
 		 1171 aa  67.4  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1192  ATP-dependent nuclease, subunit B  25.97 
 
 		 1171 aa  66.6  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.102099  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4149  ATP-dependent nuclease, subunit B  25.73 
 
 		 1171 aa  67  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1040  ATP-dependent nuclease, subunit B  23.81 
 
 		 1171 aa  66.6  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1562  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  24.17 
 
 		 957 aa  66.6  0.000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0522  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  21.75 
 
 		 1121 aa  67  0.000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1856  ATP-dependent nuclease subunit B  20.56 
 
 		 1186 aa  65.5  0.000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.274018 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3983  hypothetical protein  21.6 
 
 		 1100 aa  65.1  0.000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.588967  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3877  hypothetical protein  20.9 
 
 		 1151 aa  65.1  0.000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5413  hypothetical protein  21.7 
 
 		 886 aa  64.7  0.000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.871624  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1156  hypothetical protein  21.1 
 
 		 865 aa  63.2  0.00000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1485  ATP-dependent nuclease subunit B  22.94 
 
 		 1172 aa  62.8  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1499  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  23.44 
 
 		 1049 aa  61.6  0.00000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4020  hypothetical protein  21.18 
 
 		 1079 aa  60.8  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0859  ATP-dependent nuclease subunit AddB  23.76 
 
 		 1170 aa  60.5  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1658  hypothetical protein  24.53 
 
 		 1039 aa  60.1  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.450453  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1032  ATP-dependent nuclease, subunit B  22.16 
 
 		 1158 aa  59.7  0.0000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.30431  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0049  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  20.58 
 
 		 1260 aa  58.9  0.0000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2194  exonuclease-like protein  24.39 
 
 		 855 aa  58.5  0.0000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.759403  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2513  ATP-dependent nuclease subunit B-like  22.77 
 
 		 1029 aa  58.2  0.0000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.260712  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0003  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  21.53 
 
 		 1099 aa  58.2  0.0000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0517  hypothetical protein  22.76 
 
 		 960 aa  57  0.000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0137071 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1996  hypothetical protein  23.43 
 
 		 884 aa  56.6  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.573803  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0840  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  21.15 
 
 		 1048 aa  55.5  0.000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.564215  hitchhiker  0.00099262 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0088  hypothetical protein  24.63 
 
 		 781 aa  54.3  0.00001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.217564  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2115  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  24.57 
 
 		 957 aa  54.3  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2361  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  21.07 
 
 		 1113 aa  53.5  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3424  ATP-dependent nuclease subunit B  21.13 
 
 		 1171 aa  52.4  0.00004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3583  hypothetical protein  21.69 
 
 		 853 aa  52  0.00006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0256387  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2833  ATP-dependent nuclease subunit B  19.78 
 
 		 1218 aa  52  0.00006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1438  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  22.48 
 
 		 1029 aa  51.6  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.140223  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2264  exonuclease-like  23.74 
 
 		 856 aa  51.2  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0454  hypothetical protein  23.62 
 
 		 969 aa  51.2  0.0001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0460  hypothetical protein  23.62 
 
 		 969 aa  51.2  0.0001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4179  ATP-dependent nuclease subunit B  22.9 
 
 		 951 aa  49.7  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0186449 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2324  exonuclease-like protein  24.83 
 
 		 864 aa  49.3  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.884454  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0554  exonuclease RexB  21.07 
 
 		 1159 aa  49.3  0.0004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1837  hypothetical protein  23.95 
 
 		 909 aa  48.9  0.0005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.57891  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1611  UvrD/REP helicase  25.62 
 
 		 729 aa  48.5  0.0005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.780541  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0625  UvrD/REP helicase  20.7 
 
 		 1019 aa  48.9  0.0005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.243128  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03200  hypothetical protein  25.54 
 
 		 911 aa  48.1  0.0007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.358674  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3266  DNA-dependent ATPase I and helicase II  23.12 
 
 		 1041 aa  48.1  0.0007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.951374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1784  Exodeoxyribonuclease V  33.01 
 
 		 1274 aa  48.1  0.0008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.911102 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2986  hypothetical protein  20.99 
 
 		 884 aa  48.1  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.262988 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0345  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  26.09 
 
 		 1074 aa  47.4  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0550  ATP-dependent nuclease subunit B-like  22.8 
 
 		 1140 aa  47.4  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2132  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V subunit B  22.84 
 
 		 976 aa  47  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.687537 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0055  double-strand break repair protein AddB  22.49 
 
 		 1062 aa  46.2  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1900  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  33 
 
 		 1163 aa  46.2  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0325  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  27.09 
 
 		 1071 aa  46.2  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00559956 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1533  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  27.01 
 
 		 1054 aa  46.6  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1243  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  25.29 
 
 		 968 aa  46.2  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0167838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0996  exodeoxyribonuclease V, RecC subunit  24.44 
 
 		 1075 aa  45.8  0.004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.958514 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2245  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  30 
 
 		 1234 aa  45.4  0.005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.965648 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3960  double-strand break repair protein AddB  26.23 
 
 		 1064 aa  45.4  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1502  exonuclease-like protein  23.91 
 
 		 856 aa  45.1  0.006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4287  double-strand break repair protein AddB  26.78 
 
 		 1064 aa  45.1  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.235496  normal  0.271483 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0481  UvrD/REP helicase  25.16 
 
 		 736 aa  45.1  0.007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.272547  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2077  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  21.21 
 
 		 1169 aa  44.7  0.008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0043  DNA-dependent helicase II  28 
 
 		 723 aa  44.7  0.009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.779926  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1756  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  34.11 
 
 		 1166 aa  44.7  0.01  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4322  exodeoxyribonuclease V, RecC subunit  25 
 
 		 1112 aa  44.3  0.01  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0873  exonuclease RexB  21.98 
 
 		 1077 aa  44.7  0.01  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.458095  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1775  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  30.83 
 
 		 1236 aa  44.3  0.01  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>