87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_1804 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_1804  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  100 
 
 		 986 aa  1883    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1287  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  22.03 
 
 		 994 aa  111  6e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1142  ATP-dependent nuclease subunit B  23.42 
 
 		 1124 aa  111  8.000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1296  ATP-dependent nuclease, subunit B  23.15 
 
 		 1171 aa  107  1e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1244  ATP-dependent nuclease, subunit B  23.11 
 
 		 1171 aa  104  9e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1499  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  29.06 
 
 		 1049 aa  103  1e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1040  ATP-dependent nuclease, subunit B  22.81 
 
 		 1171 aa  102  3e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0024  ATP-dependent nuclease subunit B  18.79 
 
 		 1158 aa  102  3e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1038  ATP-dependent nuclease, subunit B  23.05 
 
 		 1171 aa  102  3e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1141  ATP-dependent nuclease subunit B  23.06 
 
 		 1171 aa  102  4e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.990093  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1060  ATP-dependent nuclease subunit B  23.06 
 
 		 1171 aa  102  4e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1219  ATP-dependent nuclease, subunit B  23.06 
 
 		 1171 aa  101  6e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0024  ATP-dependent nuclease, subunit B  19.41 
 
 		 1158 aa  99.8  3e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.199779  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0670  ATP-dependent nuclease subunit B  22.19 
 
 		 1171 aa  95.9  3e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0985  ATP-dependent nuclease subunit AddB  20.37 
 
 		 1157 aa  94.7  7e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0966  ATP-dependent nuclease subunit AddB  20.37 
 
 		 1157 aa  94.7  7e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1485  ATP-dependent nuclease subunit B  24.65 
 
 		 1172 aa  89.7  2e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2040  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  23.61 
 
 		 1146 aa  85.9  0.000000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2361  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  24.36 
 
 		 1113 aa  80.1  0.0000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0554  exonuclease RexB  20.02 
 
 		 1159 aa  77  0.000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1775  ATP-dependent nuclease subunit B  21.41 
 
 		 1149 aa  76.6  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1415  UvrD-like DNA helicase, C terminal  24.86 
 
 		 1155 aa  71.6  0.00000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1192  ATP-dependent nuclease, subunit B  24.68 
 
 		 1171 aa  71.2  0.00000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.102099  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4149  ATP-dependent nuclease, subunit B  23.72 
 
 		 1171 aa  69.3  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1040  ATP-dependent nuclease subunit AddB  24.11 
 
 		 1171 aa  68.9  0.0000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.20152  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0840  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  27.56 
 
 		 1048 aa  68.6  0.0000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.564215  hitchhiker  0.00099262 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1321  methyltransferase type 11  23.67 
 
 		 915 aa  68.6  0.0000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0859  ATP-dependent nuclease subunit AddB  24.44 
 
 		 1170 aa  68.2  0.0000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1421  UvrD/REP helicase  26.68 
 
 		 1051 aa  67.8  0.0000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1856  ATP-dependent nuclease subunit B  23.8 
 
 		 1186 aa  67.8  0.0000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.274018 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1403  UvrD/REP helicase  26.68 
 
 		 1051 aa  67.8  0.0000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1277  UvrD-like DNA helicase, C terminal  29.19 
 
 		 1165 aa  63.9  0.00000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1457  UvrD/REP helicase  26.42 
 
 		 1051 aa  64.3  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0431152  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3424  ATP-dependent nuclease subunit B  20.55 
 
 		 1171 aa  64.3  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2513  ATP-dependent nuclease subunit B-like  31.58 
 
 		 1029 aa  63.5  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.260712  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7808  UvrD/REP helicase  26.7 
 
 		 1134 aa  63.5  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0522  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  24.35 
 
 		 1121 aa  62.8  0.00000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1438  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  31.58 
 
 		 1029 aa  61.6  0.00000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.140223  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0055  double-strand break repair protein AddB  25.84 
 
 		 1062 aa  60.8  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1437  UvrD/REP helicase  20.89 
 
 		 769 aa  60.1  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.618729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5824  UvrD/REP helicase  32.42 
 
 		 1052 aa  58.9  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.101502 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0696  hypothetical protein  24.68 
 
 		 919 aa  58.5  0.0000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0550  ATP-dependent nuclease subunit B-like  25.37 
 
 		 1140 aa  58.5  0.0000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0085  UvrD/REP helicase  18.2 
 
 		 1016 aa  58.2  0.0000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.60174  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4407  ATP-dependent nuclease subunit B-like  32.78 
 
 		 1045 aa  56.2  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.546962  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1658  hypothetical protein  23.03 
 
 		 1039 aa  55.5  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.450453  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4179  ATP-dependent nuclease subunit B  23.21 
 
 		 951 aa  54.7  0.000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0186449 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0481  ATP-dependent deoxyribonuclease subunit B  27.55 
 
 		 1151 aa  54.3  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1243  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  24.76 
 
 		 968 aa  53.5  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0167838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08480  RecB family exonuclease  24.33 
 
 		 889 aa  52.4  0.00004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.198348 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2132  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V subunit B  27.19 
 
 		 976 aa  52  0.00006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.687537 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0241  UvrD/REP helicase  21.33 
 
 		 706 aa  52  0.00006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00780  hypothetical protein  27.66 
 
 		 990 aa  51.6  0.00008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0523  putative ATP-dependent DNA helicase  24.54 
 
 		 1044 aa  51.2  0.00008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0825  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.42 
 
 		 694 aa  51.6  0.00008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0871  hypothetical protein  25.47 
 
 		 1042 aa  51.2  0.00009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.124792 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0375  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.33 
 
 		 763 aa  50.8  0.0001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13930  RecB family exonuclease  31.46 
 
 		 313 aa  50.8  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.199879  normal  0.841258 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06800  DNA/RNA helicase, superfamily I  25.37 
 
 		 1066 aa  50.4  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.860602  normal  0.467007 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0925  UvrD/REP helicase  36.36 
 
 		 1135 aa  50.8  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.963076 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0158  helicase  29.8 
 
 		 991 aa  50.4  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.233932  normal  0.795485 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0097  ATP-dependent DNA helicase Rep  29.26 
 
 		 797 aa  49.3  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2833  ATP-dependent nuclease subunit B  24.35 
 
 		 1218 aa  49.3  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2845  hypothetical protein  26.82 
 
 		 977 aa  48.9  0.0004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.786725 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1125  hypothetical protein  26.32 
 
 		 947 aa  48.5  0.0006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.290097 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1776  UvrD/REP helicase  28.25 
 
 		 1095 aa  48.5  0.0006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.337618 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2641  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  24.52 
 
 		 1190 aa  48.5  0.0006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.144342 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8377  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  24.94 
 
 		 1051 aa  48.5  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0104  UvrD/REP helicase  28.69 
 
 		 797 aa  48.1  0.0009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0202  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  19.79 
 
 		 1149 aa  47.8  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1709  hypothetical protein  24.09 
 
 		 896 aa  47.8  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000066453  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1937  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  25.23 
 
 		 1187 aa  47.4  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1189  hypothetical protein  26.82 
 
 		 962 aa  47.8  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2479  UvrD/REP helicase  25.63 
 
 		 1115 aa  46.6  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000159355 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4666  UvrD/REP helicase  34.26 
 
 		 1038 aa  47.4  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0501158  normal  0.218907 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1719  UvrD/REP helicase  26.43 
 
 		 646 aa  47.4  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.571128  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0115  UvrD/REP helicase  28.69 
 
 		 797 aa  46.2  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1033  hypothetical protein  26.46 
 
 		 951 aa  46.2  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.187389  normal  0.358259 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2795  putative helicase/exonuclease  27.91 
 
 		 980 aa  46.2  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0963  helicase II - UvrD/PcrA  22.13 
 
 		 638 aa  45.8  0.004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0209  UvrD/REP helicase  25.96 
 
 		 786 aa  45.8  0.004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000644419  normal  0.953058 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1508  UvrD/REP helicase  27.44 
 
 		 1060 aa  45.4  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0896  UvrD/REP helicase  24.28 
 
 		 1066 aa  45.1  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.380602  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1698  hypothetical protein  23.71 
 
 		 922 aa  45.1  0.006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0546  ATP-dependent DNA helicase UvrD  24.27 
 
 		 713 aa  45.4  0.006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16340  DNA/RNA helicase, superfamily I  23.63 
 
 		 772 aa  45.1  0.007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0144318 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3437  double-strand break repair helicase AddB  26 
 
 		 988 aa  45.1  0.007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>