57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1658 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_2374  hypothetical protein  43.5 
 
 		 968 aa  803    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1658  hypothetical protein  100 
 
 		 1039 aa  2133    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.450453  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03200  hypothetical protein  28.35 
 
 		 911 aa  367  1e-100  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.358674  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0696  hypothetical protein  26.67 
 
 		 919 aa  346  1e-93  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1837  hypothetical protein  27.44 
 
 		 909 aa  320  7.999999999999999e-86  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.57891  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0517  hypothetical protein  29.48 
 
 		 960 aa  160  1e-37  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0137071 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0460  hypothetical protein  27.05 
 
 		 969 aa  155  5.9999999999999996e-36  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0454  hypothetical protein  27.05 
 
 		 969 aa  155  5.9999999999999996e-36  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4179  ATP-dependent nuclease subunit B  28.83 
 
 		 951 aa  153  2e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0186449 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0765  hypothetical protein  25.6 
 
 		 1100 aa  151  6e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.166845 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1165  hypothetical protein  29.18 
 
 		 984 aa  117  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.5757 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1587  hypothetical protein  27.67 
 
 		 997 aa  110  1e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0978  hypothetical protein  23.77 
 
 		 1000 aa  93.2  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.263512  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0088  hypothetical protein  22.98 
 
 		 781 aa  84.7  0.000000000000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.217564  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1911  hypothetical protein  22.2 
 
 		 780 aa  78.2  0.0000000000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1655  hypothetical protein  21.41 
 
 		 788 aa  70.9  0.0000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1562  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  25.36 
 
 		 957 aa  69.7  0.0000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1392  hypothetical protein  21.9 
 
 		 803 aa  69.7  0.0000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1475  hypothetical protein  21.41 
 
 		 788 aa  68.9  0.0000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0853402  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0381  hypothetical protein  21.76 
 
 		 794 aa  68.2  0.0000000008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0210586  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1189  hypothetical protein  21.45 
 
 		 962 aa  67  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1829  hypothetical protein  21.88 
 
 		 788 aa  66.6  0.000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.423033  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0385  hypothetical protein  21.52 
 
 		 786 aa  65.9  0.000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.412498  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3299  double-strand break repair protein AddB  24.23 
 
 		 1015 aa  64.3  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0735  hypothetical protein  21.58 
 
 		 781 aa  62.4  0.00000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0909  hypothetical protein  24.21 
 
 		 783 aa  61.2  0.0000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0057  hypothetical protein  23.05 
 
 		 1049 aa  60.1  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1287  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  22.3 
 
 		 994 aa  58.2  0.0000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0089  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  23.39 
 
 		 1048 aa  55.8  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.476876 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0203  hypothetical protein  23.45 
 
 		 1049 aa  54.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.587798  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1998  helicase  21.97 
 
 		 993 aa  52.4  0.00004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.138335  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1454  hypothetical protein  20.67 
 
 		 959 aa  52.4  0.00005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2680  double-strand break repair protein AddB  22.18 
 
 		 991 aa  51.6  0.00008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1804  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  22.7 
 
 		 986 aa  51.2  0.00009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1570  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  28.88 
 
 		 1043 aa  50.8  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2132  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V subunit B  19.53 
 
 		 976 aa  51.2  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.687537 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3583  hypothetical protein  19.93 
 
 		 853 aa  50.4  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0256387  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0628  hypothetical protein  23.23 
 
 		 1048 aa  49.7  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.397412  normal  0.357504 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1156  hypothetical protein  25.12 
 
 		 865 aa  48.9  0.0005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0049  hypothetical protein  21.84 
 
 		 1053 aa  48.9  0.0005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.258638  normal  0.374652 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0386  hypothetical protein  21.25 
 
 		 1042 aa  48.1  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2223  hypothetical protein  21.39 
 
 		 858 aa  47.4  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1284  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  24.87 
 
 		 915 aa  47.8  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.155997 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0640  inactivated superfamily I helicase-like protein  21.38 
 
 		 991 aa  46.6  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0896  UvrD/REP helicase  23.93 
 
 		 1066 aa  47  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.380602  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4903  double-strand break repair protein AddB  22.61 
 
 		 1047 aa  46.2  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.402113  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2195  hypothetical protein  20.85 
 
 		 858 aa  45.8  0.004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4886  hypothetical protein  26.63 
 
 		 334 aa  45.4  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.335853 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0034  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  20.59 
 
 		 836 aa  45.4  0.006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0563603 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1478  hypothetical protein  29.38 
 
 		 273 aa  45.4  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0682127  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3266  DNA-dependent ATPase I and helicase II  25 
 
 		 1041 aa  45.1  0.007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.951374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1306  hypothetical protein  21.11 
 
 		 994 aa  45.1  0.007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.791013  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2194  exonuclease-like protein  23.66 
 
 		 855 aa  45.1  0.007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.759403  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0078  double-strand break repair protein AddB  21.82 
 
 		 1049 aa  45.1  0.008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.160312  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1709  hypothetical protein  23.3 
 
 		 896 aa  44.7  0.009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000066453  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0818  double-strand break repair protein AddB  22.99 
 
 		 1052 aa  44.7  0.009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4287  double-strand break repair protein AddB  22.15 
 
 		 1064 aa  44.7  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.235496  normal  0.271483 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>