72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_0909 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009802  CCC13826_0735  hypothetical protein  61.33 
 
 		 781 aa  936    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0909  hypothetical protein  100 
 
 		 783 aa  1580    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0385  hypothetical protein  41.09 
 
 		 786 aa  578  1.0000000000000001e-163  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.412498  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1392  hypothetical protein  40.17 
 
 		 803 aa  536  1e-151  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1829  hypothetical protein  40.48 
 
 		 788 aa  519  1e-146  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.423033  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1655  hypothetical protein  39.97 
 
 		 788 aa  512  1e-143  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1475  hypothetical protein  40.1 
 
 		 788 aa  511  1e-143  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0853402  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0381  hypothetical protein  40.18 
 
 		 794 aa  507  9.999999999999999e-143  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0210586  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1911  hypothetical protein  35.38 
 
 		 780 aa  380  1e-104  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0088  hypothetical protein  32.72 
 
 		 781 aa  381  1e-104  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.217564  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1587  hypothetical protein  25.39 
 
 		 997 aa  86.7  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1165  hypothetical protein  27.58 
 
 		 984 aa  84  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.5757 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3266  DNA-dependent ATPase I and helicase II  27.27 
 
 		 1041 aa  80.9  0.0000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.951374  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03200  hypothetical protein  23.33 
 
 		 911 aa  79  0.0000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.358674  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0765  hypothetical protein  22.74 
 
 		 1100 aa  78.2  0.0000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.166845 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4179  ATP-dependent nuclease subunit B  25.6 
 
 		 951 aa  75.9  0.000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0186449 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0696  hypothetical protein  24.52 
 
 		 919 aa  74.7  0.000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1658  hypothetical protein  23.24 
 
 		 1039 aa  69.3  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.450453  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0517  hypothetical protein  23.01 
 
 		 960 aa  66.6  0.000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0137071 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0625  UvrD/REP helicase  25.59 
 
 		 1019 aa  62.8  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.243128  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0467  hypothetical protein  26.29 
 
 		 912 aa  61.6  0.00000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0972  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  24.26 
 
 		 916 aa  61.2  0.00000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00798755 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2601  hypothetical protein  26.75 
 
 		 263 aa  59.7  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.718705  normal  0.128689 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2007  RecB family exonuclease-like protein  25.67 
 
 		 284 aa  59.3  0.0000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.151824  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1280  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  22.3 
 
 		 958 aa  59.3  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2978  RecB family exonuclease-like protein  26.69 
 
 		 323 aa  58.5  0.0000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000129924  hitchhiker  0.00505029 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1837  hypothetical protein  24.03 
 
 		 909 aa  58.5  0.0000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.57891  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0896  UvrD/REP helicase  26.92 
 
 		 1066 aa  58.2  0.0000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.380602  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3463  RecB family exonuclease  24.22 
 
 		 304 aa  57.8  0.0000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0978  hypothetical protein  25 
 
 		 1000 aa  55.5  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.263512  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0460  hypothetical protein  20.83 
 
 		 969 aa  55.1  0.000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0454  hypothetical protein  20.83 
 
 		 969 aa  55.1  0.000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5903  RecB family exonuclease-like protein  26.38 
 
 		 295 aa  54.7  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.016661  normal  0.144641 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3437  double-strand break repair helicase AddB  22.58 
 
 		 988 aa  53.9  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2456  RecB family exonuclease-like protein  26.35 
 
 		 295 aa  53.5  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1180  RecB family exonuclease  26.32 
 
 		 266 aa  53.1  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.371869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5824  UvrD/REP helicase  27.31 
 
 		 1052 aa  52  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.101502 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1752  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  23.65 
 
 		 940 aa  52.4  0.00004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.894533 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1855  putative RecB family exonuclease  23.16 
 
 		 294 aa  51.6  0.00005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1977  putative DNA repair protein  28.28 
 
 		 913 aa  51.2  0.00007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.286475 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1478  hypothetical protein  25.97 
 
 		 273 aa  50.4  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0682127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3064  RecB family exonuclease  23.19 
 
 		 291 aa  50.8  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.130933 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1482  RecB family exonuclease-like protein  24.43 
 
 		 302 aa  50.4  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1066  UvrD/REP helicase  22.88 
 
 		 1048 aa  50.1  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0085  UvrD/REP helicase  24.31 
 
 		 1016 aa  49.7  0.0002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.60174  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22140  RecB family exonuclease  24.42 
 
 		 333 aa  50.1  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.180752  normal  0.721654 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0308  exonuclease-like protein  29.25 
 
 		 244 aa  49.3  0.0003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00000290112  hitchhiker  0.00000170332 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2636  hypothetical protein  24.12 
 
 		 299 aa  49.3  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3583  hypothetical protein  23.95 
 
 		 853 aa  48.9  0.0004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0256387  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2414  RecB family exonuclease-like protein  31.2 
 
 		 351 aa  48.5  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1499  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  23.84 
 
 		 1049 aa  48.5  0.0004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_558  hypothetical protein  28.92 
 
 		 379 aa  48.1  0.0005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1998  helicase  23.67 
 
 		 993 aa  48.1  0.0006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.138335  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2676  hypothetical protein  27.78 
 
 		 320 aa  47.8  0.0007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.647188  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2115  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  21.27 
 
 		 957 aa  47.8  0.0007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2222  RecB family exonuclease-like protein  31.11 
 
 		 297 aa  47.4  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.839667  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1816  hypothetical protein  23.72 
 
 		 280 aa  47.4  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3149  RecB family exonuclease  24.9 
 
 		 277 aa  46.2  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.424506  normal  0.878116 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3199  RecB family exonuclease  24.9 
 
 		 277 aa  46.2  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.487401  normal  0.220799 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04130  hypothetical protein  21.48 
 
 		 864 aa  46.6  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3137  RecB family exonuclease  24.9 
 
 		 277 aa  46.2  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.67707  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12151  hypothetical protein  24.41 
 
 		 278 aa  46.2  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0757  hypothetical protein  24.7 
 
 		 259 aa  45.8  0.003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0055  double-strand break repair protein AddB  22.41 
 
 		 1062 aa  45.8  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4476  RecB family exonuclease-like protein  27.78 
 
 		 267 aa  45.8  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.842186  normal  0.295371 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2374  hypothetical protein  24.47 
 
 		 968 aa  45.4  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2634  RecB family exonuclease  24.29 
 
 		 303 aa  45.4  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.311495 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1356  double-strand break repair protein AddB  22.49 
 
 		 1047 aa  45.1  0.005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0620  hypothetical protein  25.96 
 
 		 379 aa  44.7  0.006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.638225  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1844  RecB family exonuclease-like protein  25 
 
 		 286 aa  44.7  0.006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0593  exonuclease-like protein  27.94 
 
 		 379 aa  44.7  0.006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0865179  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2640  hypothetical protein  26.27 
 
 		 883 aa  44.3  0.009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0600209  normal  0.0102086 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>