52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_0385 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008599  CFF8240_0385  hypothetical protein  100 
 
 		 786 aa  1573    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.412498  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0909  hypothetical protein  41.09 
 
 		 783 aa  556  1e-157  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0735  hypothetical protein  41.09 
 
 		 781 aa  533  1e-150  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1392  hypothetical protein  40.88 
 
 		 803 aa  506  9.999999999999999e-143  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1655  hypothetical protein  40.18 
 
 		 788 aa  496  1e-139  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1829  hypothetical protein  40.05 
 
 		 788 aa  495  9.999999999999999e-139  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.423033  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1475  hypothetical protein  40.05 
 
 		 788 aa  493  9.999999999999999e-139  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0853402  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0381  hypothetical protein  37.97 
 
 		 794 aa  467  9.999999999999999e-131  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0210586  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1911  hypothetical protein  31.81 
 
 		 780 aa  362  2e-98  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0088  hypothetical protein  31.97 
 
 		 781 aa  355  1e-96  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.217564  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1165  hypothetical protein  20.31 
 
 		 984 aa  77.8  0.0000000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.5757 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2374  hypothetical protein  23.08 
 
 		 968 aa  76.3  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4179  ATP-dependent nuclease subunit B  25.78 
 
 		 951 aa  73.9  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0186449 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0696  hypothetical protein  22.36 
 
 		 919 aa  73.2  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0978  hypothetical protein  24.84 
 
 		 1000 aa  72  0.00000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.263512  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0517  hypothetical protein  21.53 
 
 		 960 aa  67.8  0.0000000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0137071 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3437  double-strand break repair helicase AddB  20.6 
 
 		 988 aa  67  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1658  hypothetical protein  21.52 
 
 		 1039 aa  65.9  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.450453  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1587  hypothetical protein  22.86 
 
 		 997 aa  63.5  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03200  hypothetical protein  19.55 
 
 		 911 aa  62.8  0.00000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.358674  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0460  hypothetical protein  22.17 
 
 		 969 aa  62.8  0.00000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0454  hypothetical protein  22.17 
 
 		 969 aa  62.8  0.00000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0765  hypothetical protein  21.17 
 
 		 1100 aa  62  0.00000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.166845 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0625  UvrD/REP helicase  23.89 
 
 		 1019 aa  56.2  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.243128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3266  DNA-dependent ATPase I and helicase II  26.38 
 
 		 1041 aa  55.8  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.951374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0137  double-strand break repair protein AddB  21.19 
 
 		 1001 aa  55.5  0.000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1837  hypothetical protein  20.83 
 
 		 909 aa  55.1  0.000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.57891  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1698  hypothetical protein  19.72 
 
 		 922 aa  54.7  0.000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4258  hypothetical protein  24.24 
 
 		 287 aa  54.7  0.000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.500216  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0593  exonuclease-like protein  26.79 
 
 		 379 aa  53.9  0.00001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0865179  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0467  hypothetical protein  23.97 
 
 		 912 aa  53.1  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_558  hypothetical protein  29.73 
 
 		 379 aa  53.1  0.00002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2680  double-strand break repair protein AddB  19 
 
 		 991 aa  53.1  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1998  helicase  21.64 
 
 		 993 aa  52.8  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.138335  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2897  hypothetical protein  27.67 
 
 		 846 aa  52.8  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0034  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  23.36 
 
 		 836 aa  52  0.00004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0563603 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1156  hypothetical protein  25 
 
 		 865 aa  51.6  0.00005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0620  hypothetical protein  29.55 
 
 		 379 aa  51.2  0.00007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.638225  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1198  RecB family exonuclease-like protein  22.22 
 
 		 298 aa  51.2  0.00008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0768064  normal  0.151704 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2115  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  17.35 
 
 		 957 aa  50.4  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3064  RecB family exonuclease  25.84 
 
 		 291 aa  50.4  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.130933 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4476  RecB family exonuclease-like protein  26.26 
 
 		 267 aa  50.4  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.842186  normal  0.295371 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2264  exonuclease-like  30 
 
 		 856 aa  49.7  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0055  double-strand break repair protein AddB  24.26 
 
 		 1062 aa  49.7  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1525  putative helicase/exonuclease  24.07 
 
 		 997 aa  49.7  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.873687  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0177  putative helicase/exonuclease  22.99 
 
 		 997 aa  49.3  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.169187  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2132  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V subunit B  19.09 
 
 		 976 aa  48.5  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.687537 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0453  hypothetical protein  23.6 
 
 		 276 aa  47.4  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0515112  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0308  exonuclease-like protein  29.75 
 
 		 244 aa  46.2  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00000290112  hitchhiker  0.00000170332 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2324  exonuclease-like protein  23.61 
 
 		 864 aa  45.4  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.884454  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3299  double-strand break repair protein AddB  21.05 
 
 		 1015 aa  44.3  0.009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0965  hypothetical protein  24.34 
 
 		 387 aa  43.9  0.01  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>