76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_4179 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_4179  ATP-dependent nuclease subunit B  100 
 
 
951 aa  1949    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0186449 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0454  hypothetical protein  26.98 
 
 
969 aa  300  6e-80  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0460  hypothetical protein  26.98 
 
 
969 aa  300  6e-80  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0517  hypothetical protein  25.74 
 
 
960 aa  290  6e-77  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0137071 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03200  hypothetical protein  26.66 
 
 
911 aa  277  6e-73  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.358674  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0696  hypothetical protein  26.74 
 
 
919 aa  276  1.0000000000000001e-72  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2374  hypothetical protein  27 
 
 
968 aa  250  8e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1837  hypothetical protein  26.07 
 
 
909 aa  238  5.0000000000000005e-61  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.57891  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0978  hypothetical protein  24.12 
 
 
1000 aa  159  3e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.263512  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1658  hypothetical protein  31.87 
 
 
1039 aa  151  4e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.450453  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1165  hypothetical protein  22.18 
 
 
984 aa  142  3.9999999999999997e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.5757 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1587  hypothetical protein  20.92 
 
 
997 aa  137  9e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0765  hypothetical protein  26.71 
 
 
1100 aa  129  3e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.166845 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0088  hypothetical protein  23.71 
 
 
781 aa  87.4  0.000000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.217564  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0381  hypothetical protein  25.38 
 
 
794 aa  84.7  0.000000000000007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0210586  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1911  hypothetical protein  25.07 
 
 
780 aa  81.6  0.00000000000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1475  hypothetical protein  25.08 
 
 
788 aa  79  0.0000000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0853402  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1655  hypothetical protein  24.15 
 
 
788 aa  78.2  0.0000000000007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1829  hypothetical protein  25.39 
 
 
788 aa  77.4  0.000000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.423033  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0385  hypothetical protein  25.78 
 
 
786 aa  73.9  0.00000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.412498  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0735  hypothetical protein  25.53 
 
 
781 aa  72.8  0.00000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1392  hypothetical protein  22.22 
 
 
803 aa  70.9  0.0000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1189  hypothetical protein  22.04 
 
 
962 aa  65.9  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0909  hypothetical protein  24.28 
 
 
783 aa  65.5  0.000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4953  double-strand break repair protein AddB  24.1 
 
 
1045 aa  64.7  0.000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.28213  normal  0.220152 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2223  hypothetical protein  24.32 
 
 
858 aa  63.9  0.00000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5094  double-strand break repair protein AddB  23.56 
 
 
1054 aa  64.3  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.145083 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1306  hypothetical protein  21.51 
 
 
994 aa  63.9  0.00000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.791013  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0987  hypothetical protein  25.52 
 
 
911 aa  64.3  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000754464  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1698  hypothetical protein  24.24 
 
 
922 aa  63.2  0.00000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4903  double-strand break repair protein AddB  22.9 
 
 
1047 aa  63.9  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.402113  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2195  hypothetical protein  24.32 
 
 
858 aa  62.8  0.00000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1977  putative DNA repair protein  23.5 
 
 
913 aa  61.6  0.00000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.286475 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4439  double-strand break repair protein AddB  22.43 
 
 
1047 aa  60.8  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.522195  normal  0.331635 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1608  double-strand break repair protein AddB  22.8 
 
 
1037 aa  59.7  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.62778  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0158  helicase  23.66 
 
 
991 aa  59.7  0.0000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.233932  normal  0.795485 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1125  hypothetical protein  21.05 
 
 
947 aa  58.2  0.0000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.290097 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2004  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  21.22 
 
 
935 aa  58.2  0.0000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1562  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  22.98 
 
 
957 aa  57.4  0.000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0640  inactivated superfamily I helicase-like protein  21.37 
 
 
991 aa  57.4  0.000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1709  hypothetical protein  22.64 
 
 
896 aa  57  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000066453  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0057  hypothetical protein  22.33 
 
 
1049 aa  57  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3437  double-strand break repair helicase AddB  23.28 
 
 
988 aa  57  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1499  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  23.7 
 
 
1049 aa  57  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0645  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  21.04 
 
 
989 aa  56.2  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3299  double-strand break repair protein AddB  22.36 
 
 
1015 aa  55.5  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1033  hypothetical protein  21.36 
 
 
951 aa  54.3  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.187389  normal  0.358259 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0491  double-strand break repair protein AddB  21.95 
 
 
1040 aa  53.9  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00465819 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2680  double-strand break repair protein AddB  22.09 
 
 
991 aa  53.5  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0873  exonuclease RexB  28.12 
 
 
1077 aa  52.8  0.00003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.458095  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0818  double-strand break repair protein AddB  23.77 
 
 
1052 aa  52.4  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0085  hypothetical protein  22.52 
 
 
1016 aa  50.8  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.604328 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3877  hypothetical protein  26.2 
 
 
1151 aa  50.1  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4020  hypothetical protein  25.26 
 
 
1079 aa  50.4  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2115  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  22.32 
 
 
957 aa  48.9  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1066  UvrD/REP helicase  22.22 
 
 
1048 aa  48.5  0.0006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0078  double-strand break repair protein AddB  21.23 
 
 
1049 aa  48.5  0.0006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.160312  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1280  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  20.06 
 
 
958 aa  48.5  0.0006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1682  ATP-dependent exonuclease, subunit B  26.63 
 
 
1106 aa  48.1  0.0007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1804  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  23 
 
 
986 aa  48.1  0.0007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3243  double-strand break repair protein AddB  25.23 
 
 
1059 aa  48.5  0.0007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3983  hypothetical protein  24.21 
 
 
1100 aa  48.1  0.0007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.588967  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1287  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  22.66 
 
 
994 aa  48.1  0.0008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_39374  predicted protein  26.96 
 
 
366 aa  47.8  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1998  helicase  21.25 
 
 
993 aa  47.8  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.138335  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0055  double-strand break repair protein AddB  23.17 
 
 
1062 aa  46.6  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1321  methyltransferase type 11  21.25 
 
 
915 aa  47  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12151  hypothetical protein  28 
 
 
278 aa  46.2  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0467  hypothetical protein  21.69 
 
 
912 aa  46.2  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3064  RecB family exonuclease  27.68 
 
 
291 aa  45.8  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.130933 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0386  hypothetical protein  21.28 
 
 
1042 aa  45.4  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1816  hypothetical protein  25.41 
 
 
280 aa  45.4  0.005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4476  RecB family exonuclease-like protein  29.71 
 
 
267 aa  45.1  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.842186  normal  0.295371 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0085  UvrD/REP helicase  27.32 
 
 
1016 aa  45.1  0.007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.60174  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1478  hypothetical protein  24.29 
 
 
273 aa  44.7  0.008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0682127  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1374  hypothetical protein  36.76 
 
 
862 aa  44.3  0.01  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000886385  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>