67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJJ81176_1475 on replicon NC_008787
Organism: Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008787  CJJ81176_1475  hypothetical protein  100 
 
 
788 aa  1560    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0853402  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1655  hypothetical protein  99.49 
 
 
788 aa  1552    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1829  hypothetical protein  99.11 
 
 
788 aa  1546    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.423033  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0381  hypothetical protein  46.08 
 
 
794 aa  607  9.999999999999999e-173  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0210586  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0385  hypothetical protein  40.05 
 
 
786 aa  493  9.999999999999999e-139  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.412498  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0909  hypothetical protein  40.1 
 
 
783 aa  486  1e-136  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0735  hypothetical protein  40.3 
 
 
781 aa  474  1e-132  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1392  hypothetical protein  37.59 
 
 
803 aa  448  1.0000000000000001e-124  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1911  hypothetical protein  33.72 
 
 
780 aa  350  7e-95  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0088  hypothetical protein  30.87 
 
 
781 aa  308  2.0000000000000002e-82  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.217564  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4903  double-strand break repair protein AddB  25.48 
 
 
1047 aa  88.2  5e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.402113  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4439  double-strand break repair protein AddB  25 
 
 
1047 aa  87.8  8e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.522195  normal  0.331635 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1165  hypothetical protein  24.69 
 
 
984 aa  86.7  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.5757 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4953  double-strand break repair protein AddB  24.93 
 
 
1045 aa  85.9  0.000000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.28213  normal  0.220152 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3437  double-strand break repair helicase AddB  25.22 
 
 
988 aa  79.7  0.0000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4179  ATP-dependent nuclease subunit B  25.08 
 
 
951 aa  79  0.0000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0186449 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1608  double-strand break repair protein AddB  21.55 
 
 
1037 aa  77  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.62778  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5094  double-strand break repair protein AddB  23.26 
 
 
1054 aa  76.3  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.145083 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03200  hypothetical protein  25.08 
 
 
911 aa  72.8  0.00000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.358674  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3243  double-strand break repair protein AddB  25.08 
 
 
1059 aa  70.5  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1356  double-strand break repair protein AddB  24.69 
 
 
1047 aa  69.7  0.0000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1658  hypothetical protein  21.88 
 
 
1039 aa  68.6  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.450453  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0765  hypothetical protein  22.56 
 
 
1100 aa  67.8  0.0000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.166845 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1587  hypothetical protein  22.4 
 
 
997 aa  66.2  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1189  hypothetical protein  21.22 
 
 
962 aa  65.9  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0978  hypothetical protein  21.32 
 
 
1000 aa  65.9  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.263512  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0491  double-strand break repair protein AddB  22.32 
 
 
1040 aa  64.7  0.000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00465819 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1125  hypothetical protein  19.77 
 
 
947 aa  63.9  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.290097 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3580  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  22 
 
 
1042 aa  63.5  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.412943  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2845  hypothetical protein  24.31 
 
 
977 aa  60.8  0.00000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.786725 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0628  hypothetical protein  26.07 
 
 
1048 aa  60.8  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.397412  normal  0.357504 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3299  double-strand break repair protein AddB  23.76 
 
 
1015 aa  59.3  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1280  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  22.97 
 
 
958 aa  58.5  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0696  hypothetical protein  24.41 
 
 
919 aa  58.2  0.0000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1998  helicase  20.68 
 
 
993 aa  56.6  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.138335  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3149  RecB family exonuclease  26.97 
 
 
277 aa  56.6  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.424506  normal  0.878116 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2132  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V subunit B  20.27 
 
 
976 aa  56.2  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.687537 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3199  RecB family exonuclease  26.97 
 
 
277 aa  56.6  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.487401  normal  0.220799 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3137  RecB family exonuclease  26.97 
 
 
277 aa  56.6  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.67707  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2680  double-strand break repair protein AddB  21.73 
 
 
991 aa  55.8  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0818  double-strand break repair protein AddB  24.19 
 
 
1052 aa  54.7  0.000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4476  RecB family exonuclease-like protein  27.57 
 
 
267 aa  54.7  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.842186  normal  0.295371 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0203  hypothetical protein  24.76 
 
 
1049 aa  54.3  0.000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.587798  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1033  hypothetical protein  21.26 
 
 
951 aa  53.5  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.187389  normal  0.358259 
 
 
-
 
NC_004310  BR2102  hypothetical protein  23.05 
 
 
1052 aa  52  0.00004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2374  hypothetical protein  24.6 
 
 
968 aa  51.6  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0137  double-strand break repair protein AddB  26.72 
 
 
1001 aa  51.2  0.00007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2019  double-strand break repair protein AddB  23.05 
 
 
1052 aa  50.1  0.0001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1837  hypothetical protein  25.72 
 
 
909 aa  49.7  0.0002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.57891  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2304  RecB family exonuclease-like protein  23.91 
 
 
311 aa  49.7  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00598996  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1482  RecB family exonuclease-like protein  25.12 
 
 
302 aa  49.7  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3064  RecB family exonuclease  24.32 
 
 
291 aa  49.3  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.130933 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2223  hypothetical protein  22.62 
 
 
858 aa  48.9  0.0003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2195  hypothetical protein  22.11 
 
 
858 aa  49.3  0.0003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0460  hypothetical protein  22.32 
 
 
969 aa  49.3  0.0003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0454  hypothetical protein  22.32 
 
 
969 aa  49.3  0.0003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3463  RecB family exonuclease  24.37 
 
 
304 aa  48.1  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0055  double-strand break repair protein AddB  24.12 
 
 
1062 aa  48.1  0.0006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0620  hypothetical protein  32.8 
 
 
379 aa  47.8  0.0008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.638225  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0593  exonuclease-like protein  32.8 
 
 
379 aa  47.4  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0865179  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0517  hypothetical protein  20.81 
 
 
960 aa  47.4  0.001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0137071 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1816  hypothetical protein  22.77 
 
 
280 aa  46.6  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12151  hypothetical protein  26.52 
 
 
278 aa  46.6  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1198  RecB family exonuclease-like protein  24.18 
 
 
298 aa  45.8  0.003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0768064  normal  0.151704 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0034  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  20.46 
 
 
836 aa  45.8  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0563603 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2456  RecB family exonuclease-like protein  24.86 
 
 
295 aa  45.1  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1682  ATP-dependent exonuclease, subunit B  26.74 
 
 
1106 aa  45.1  0.006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>