67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_1454 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_1454  hypothetical protein  100 
 
 		 959 aa  1835    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1296  double-strand break repair protein AddB  43.47 
 
 		 1014 aa  559  1e-158  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.862539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0137  double-strand break repair protein AddB  38.06 
 
 		 1001 aa  463  1e-129  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3435  hypothetical protein  38.08 
 
 		 1018 aa  436  1e-120  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2680  double-strand break repair protein AddB  37 
 
 		 991 aa  415  1e-114  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1998  helicase  35.19 
 
 		 993 aa  397  1e-109  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.138335  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0818  double-strand break repair protein AddB  34.74 
 
 		 1052 aa  389  1e-106  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0057  hypothetical protein  35.24 
 
 		 1049 aa  383  1e-105  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0386  hypothetical protein  35.23 
 
 		 1042 aa  384  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3580  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  36.1 
 
 		 1042 aa  382  1e-104  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.412943  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4852  double-strand break repair protein AddB  35.93 
 
 		 999 aa  370  1e-101  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.173842  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2102  hypothetical protein  34.6 
 
 		 1052 aa  367  1e-100  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0049  hypothetical protein  35 
 
 		 1053 aa  368  1e-100  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.258638  normal  0.374652 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2019  double-strand break repair protein AddB  34.6 
 
 		 1052 aa  367  1e-100  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0078  double-strand break repair protein AddB  34.95 
 
 		 1049 aa  363  9e-99  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.160312  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0628  hypothetical protein  35.99 
 
 		 1048 aa  361  3e-98  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.397412  normal  0.357504 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0089  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  34.87 
 
 		 1048 aa  358  2.9999999999999997e-97  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.476876 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0203  hypothetical protein  34.75 
 
 		 1049 aa  354  4e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.587798  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1413  double-strand break repair protein AddB  34.4 
 
 		 1043 aa  348  3e-94  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0491  double-strand break repair protein AddB  35.7 
 
 		 1040 aa  347  6e-94  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00465819 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3299  double-strand break repair protein AddB  37.47 
 
 		 1015 aa  343  1e-92  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0158  helicase  36.22 
 
 		 991 aa  341  4e-92  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.233932  normal  0.795485 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1356  double-strand break repair protein AddB  30.56 
 
 		 1047 aa  340  5.9999999999999996e-92  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1608  double-strand break repair protein AddB  34.52 
 
 		 1037 aa  334  4e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.62778  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0085  hypothetical protein  35.05 
 
 		 1016 aa  333  1e-89  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.604328 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4439  double-strand break repair protein AddB  34.25 
 
 		 1047 aa  328  3e-88  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.522195  normal  0.331635 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4903  double-strand break repair protein AddB  34.25 
 
 		 1047 aa  327  5e-88  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.402113  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5094  double-strand break repair protein AddB  34.26 
 
 		 1054 aa  325  2e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.145083 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3243  double-strand break repair protein AddB  33.23 
 
 		 1059 aa  317  8e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4953  double-strand break repair protein AddB  33.21 
 
 		 1045 aa  313  1e-83  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.28213  normal  0.220152 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4287  double-strand break repair protein AddB  33.19 
 
 		 1064 aa  311  2.9999999999999997e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.235496  normal  0.271483 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3960  double-strand break repair protein AddB  32.72 
 
 		 1064 aa  308  4.0000000000000004e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2174  double-strand break repair protein AddB  31.05 
 
 		 1076 aa  306  2.0000000000000002e-81  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.229976  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0055  double-strand break repair protein AddB  31.86 
 
 		 1062 aa  295  2e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2845  hypothetical protein  32.99 
 
 		 977 aa  290  9e-77  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.786725 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2952  exonuclease-like protein  34.21 
 
 		 1000 aa  279  2e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.034558  normal  0.0831314 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0177  putative helicase/exonuclease  34.48 
 
 		 997 aa  271  2.9999999999999997e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.169187  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1525  putative helicase/exonuclease  34.37 
 
 		 997 aa  269  2e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.873687  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4065  hypothetical protein  32.49 
 
 		 986 aa  265  2e-69  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.633062  normal  0.255669 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3437  double-strand break repair helicase AddB  32.33 
 
 		 988 aa  261  3e-68  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2795  putative helicase/exonuclease  32.59 
 
 		 980 aa  218  2.9999999999999998e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0912  hypothetical protein  21.65 
 
 		 890 aa  141  4.999999999999999e-32  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.216262  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0820  hypothetical protein  20.74 
 
 		 914 aa  117  1.0000000000000001e-24  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.839231  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1280  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  28.65 
 
 		 958 aa  96.7  2e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1125  hypothetical protein  28.72 
 
 		 947 aa  94.7  8e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.290097 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1189  hypothetical protein  28.53 
 
 		 962 aa  89  3e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1033  hypothetical protein  27.95 
 
 		 951 aa  80.5  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.187389  normal  0.358259 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2115  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  26.35 
 
 		 957 aa  77.4  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0263  hypothetical protein  20.99 
 
 		 911 aa  73.6  0.00000000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.453707  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2132  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V subunit B  25.23 
 
 		 976 aa  70.5  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.687537 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0088  hypothetical protein  22.44 
 
 		 781 aa  64.7  0.000000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.217564  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0645  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  27.88 
 
 		 989 aa  62.8  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0524  hypothetical protein  25.52 
 
 		 779 aa  62  0.00000005  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1306  hypothetical protein  25.16 
 
 		 994 aa  60.8  0.0000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.791013  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0640  inactivated superfamily I helicase-like protein  24.94 
 
 		 991 aa  58.9  0.0000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1658  hypothetical protein  20.39 
 
 		 1039 aa  55.5  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.450453  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03200  hypothetical protein  18.55 
 
 		 911 aa  55.1  0.000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.358674  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0722  hypothetical protein  27.17 
 
 		 930 aa  53.1  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.851206  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2264  exonuclease-like  26.27 
 
 		 856 aa  52.8  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2324  exonuclease-like protein  27.26 
 
 		 864 aa  52  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.884454  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0987  hypothetical protein  25.55 
 
 		 911 aa  51.6  0.00007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000754464  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1321  methyltransferase type 11  27.75 
 
 		 915 aa  49.7  0.0003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2897  hypothetical protein  26.62 
 
 		 846 aa  49.3  0.0004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1156  hypothetical protein  30.77 
 
 		 865 aa  48.1  0.0008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1911  hypothetical protein  21.33 
 
 		 780 aa  47.8  0.001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0479  ATP-dependent nuclease subunit B-like  25.33 
 
 		 908 aa  46.2  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.236866  hitchhiker  0.000840779 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1709  hypothetical protein  24.85 
 
 		 896 aa  44.3  0.01  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000066453  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>