79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_1911 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_1911  hypothetical protein  100 
 
 		 780 aa  1610    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0088  hypothetical protein  37.06 
 
 		 781 aa  508  9.999999999999999e-143  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.217564  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0735  hypothetical protein  33.04 
 
 		 781 aa  368  1e-100  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1392  hypothetical protein  32.56 
 
 		 803 aa  365  2e-99  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0385  hypothetical protein  31.81 
 
 		 786 aa  362  2e-98  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.412498  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0381  hypothetical protein  31.7 
 
 		 794 aa  358  1.9999999999999998e-97  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0210586  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0909  hypothetical protein  35.38 
 
 		 783 aa  358  1.9999999999999998e-97  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1829  hypothetical protein  33.85 
 
 		 788 aa  353  8e-96  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.423033  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1655  hypothetical protein  33.72 
 
 		 788 aa  350  7e-95  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1475  hypothetical protein  33.72 
 
 		 788 aa  350  7e-95  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0853402  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2374  hypothetical protein  23.73 
 
 		 968 aa  95.5  4e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1165  hypothetical protein  25.31 
 
 		 984 aa  94.4  8e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.5757 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0460  hypothetical protein  23.21 
 
 		 969 aa  84.7  0.000000000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0454  hypothetical protein  23.21 
 
 		 969 aa  84.7  0.000000000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0696  hypothetical protein  22.87 
 
 		 919 aa  82  0.00000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4179  ATP-dependent nuclease subunit B  25.07 
 
 		 951 aa  81.6  0.00000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0186449 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0765  hypothetical protein  25.23 
 
 		 1100 aa  81.3  0.00000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.166845 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1587  hypothetical protein  26.27 
 
 		 997 aa  79.7  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0972  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  24.7 
 
 		 916 aa  77.4  0.0000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00798755 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1837  hypothetical protein  25.22 
 
 		 909 aa  75.9  0.000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.57891  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0978  hypothetical protein  23.61 
 
 		 1000 aa  75.1  0.000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.263512  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2952  exonuclease-like protein  26.11 
 
 		 1000 aa  73.9  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.034558  normal  0.0831314 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1658  hypothetical protein  22.2 
 
 		 1039 aa  72.4  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.450453  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1189  hypothetical protein  25.12 
 
 		 962 aa  70.5  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03200  hypothetical protein  22.04 
 
 		 911 aa  68.2  0.0000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.358674  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2845  hypothetical protein  24.06 
 
 		 977 aa  68.2  0.0000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.786725 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0177  putative helicase/exonuclease  26.02 
 
 		 997 aa  65.9  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.169187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2680  double-strand break repair protein AddB  23.46 
 
 		 991 aa  65.5  0.000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0517  hypothetical protein  22.7 
 
 		 960 aa  65.1  0.000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0137071 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2132  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V subunit B  23.01 
 
 		 976 aa  65.1  0.000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.687537 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2195  hypothetical protein  22.1 
 
 		 858 aa  64.7  0.000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3877  hypothetical protein  26.79 
 
 		 1151 aa  64.7  0.000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1525  putative helicase/exonuclease  25.45 
 
 		 997 aa  64.3  0.000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.873687  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2223  hypothetical protein  22.1 
 
 		 858 aa  63.9  0.00000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3437  double-strand break repair helicase AddB  24.16 
 
 		 988 aa  61.2  0.00000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4020  hypothetical protein  26.07 
 
 		 1079 aa  60.8  0.00000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1125  hypothetical protein  24.01 
 
 		 947 aa  60.5  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.290097 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3583  hypothetical protein  22.43 
 
 		 853 aa  58.9  0.0000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0256387  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3983  hypothetical protein  25 
 
 		 1100 aa  57.4  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.588967  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0034  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  25 
 
 		 836 aa  56.6  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0563603 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2115  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  22.28 
 
 		 957 aa  56.2  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2601  hypothetical protein  26.57 
 
 		 263 aa  55.5  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.718705  normal  0.128689 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0137  double-strand break repair protein AddB  24.94 
 
 		 1001 aa  55.8  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1280  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  23.63 
 
 		 958 aa  54.3  0.000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2998  hypothetical protein  24.86 
 
 		 306 aa  54.3  0.000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1033  hypothetical protein  23.06 
 
 		 951 aa  53.9  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.187389  normal  0.358259 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0952  hypothetical protein  20.85 
 
 		 263 aa  53.5  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1508  UvrD/REP helicase  21.62 
 
 		 1060 aa  53.1  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2414  RecB family exonuclease-like protein  23.66 
 
 		 351 aa  52.8  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1562  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  21.88 
 
 		 957 aa  52  0.00004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20930  RecB family exonuclease  24.42 
 
 		 297 aa  52  0.00004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.466535  normal  0.903432 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1197  hypothetical protein  26.25 
 
 		 312 aa  51.2  0.00007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0561644  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1816  hypothetical protein  26.42 
 
 		 280 aa  51.2  0.00007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0524  hypothetical protein  29.17 
 
 		 779 aa  50.8  0.0001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8396  hypothetical protein  23.72 
 
 		 293 aa  49.7  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.75052 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4886  hypothetical protein  26.34 
 
 		 334 aa  49.7  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.335853 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1998  helicase  22.92 
 
 		 993 aa  49.3  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.138335  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1752  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  27.93 
 
 		 940 aa  49.3  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.894533 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0203  hypothetical protein  24.35 
 
 		 1049 aa  49.3  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.587798  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2636  hypothetical protein  24.25 
 
 		 299 aa  49.3  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1478  hypothetical protein  28.26 
 
 		 273 aa  48.9  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0682127  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1977  putative DNA repair protein  23.23 
 
 		 913 aa  48.9  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.286475 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1156  hypothetical protein  24.52 
 
 		 865 aa  48.9  0.0004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0158  helicase  30.3 
 
 		 991 aa  48.5  0.0005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.233932  normal  0.795485 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2634  RecB family exonuclease  23.27 
 
 		 303 aa  48.1  0.0007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.311495 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1482  RecB family exonuclease-like protein  25 
 
 		 302 aa  47  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0645  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  22.81 
 
 		 989 aa  47.4  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5053  hypothetical protein  25.13 
 
 		 267 aa  47.4  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.609849 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0386  hypothetical protein  23.85 
 
 		 1042 aa  47.8  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0625  UvrD/REP helicase  25.54 
 
 		 1019 aa  47  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.243128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3463  RecB family exonuclease  26.82 
 
 		 304 aa  47  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06610  RecB family exonuclease  23.2 
 
 		 286 aa  47  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4258  hypothetical protein  21.57 
 
 		 287 aa  46.2  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.500216  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3266  DNA-dependent ATPase I and helicase II  24.08 
 
 		 1041 aa  45.1  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.951374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1066  UvrD/REP helicase  22.02 
 
 		 1048 aa  45.1  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1698  hypothetical protein  24.18 
 
 		 922 aa  44.7  0.007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0024  ATP-dependent nuclease subunit B  28.35 
 
 		 1158 aa  44.7  0.007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0024  ATP-dependent nuclease, subunit B  27.95 
 
 		 1158 aa  44.7  0.007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.199779  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3064  RecB family exonuclease  28.49 
 
 		 291 aa  44.3  0.009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.130933 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>