109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1478 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_1478  hypothetical protein  100 
 
 		 273 aa  547  1e-155  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0682127  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1816  hypothetical protein  67.7 
 
 		 280 aa  362  3e-99  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2414  RecB family exonuclease-like protein  54.17 
 
 		 351 aa  306  2.0000000000000002e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5903  RecB family exonuclease-like protein  55.26 
 
 		 295 aa  304  1.0000000000000001e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.016661  normal  0.144641 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1844  RecB family exonuclease-like protein  58.91 
 
 		 286 aa  303  2.0000000000000002e-81  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20930  RecB family exonuclease  55.26 
 
 		 297 aa  293  2e-78  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.466535  normal  0.903432 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2304  RecB family exonuclease-like protein  54.05 
 
 		 311 aa  281  8.000000000000001e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00598996  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1482  RecB family exonuclease-like protein  56.03 
 
 		 302 aa  278  1e-73  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2636  hypothetical protein  54.02 
 
 		 299 aa  274  1.0000000000000001e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2634  RecB family exonuclease  52.43 
 
 		 303 aa  271  6e-72  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.311495 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4886  hypothetical protein  54.62 
 
 		 334 aa  270  1e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.335853 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1180  RecB family exonuclease  53.64 
 
 		 266 aa  270  2e-71  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.371869  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2007  RecB family exonuclease-like protein  53.7 
 
 		 284 aa  270  2e-71  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.151824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22140  RecB family exonuclease  53.26 
 
 		 333 aa  270  2.9999999999999997e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.180752  normal  0.721654 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1855  putative RecB family exonuclease  52.38 
 
 		 294 aa  269  4e-71  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2222  RecB family exonuclease-like protein  52.76 
 
 		 297 aa  261  8e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.839667  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13930  RecB family exonuclease  48.47 
 
 		 313 aa  261  1e-68  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.199879  normal  0.841258 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2676  hypothetical protein  53.99 
 
 		 320 aa  259  4e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.647188  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2978  RecB family exonuclease-like protein  50.79 
 
 		 323 aa  258  9e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000129924  hitchhiker  0.00505029 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3463  RecB family exonuclease  52.87 
 
 		 304 aa  254  8e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4476  RecB family exonuclease-like protein  49.43 
 
 		 267 aa  254  1.0000000000000001e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.842186  normal  0.295371 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3064  RecB family exonuclease  51.72 
 
 		 291 aa  254  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.130933 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3137  RecB family exonuclease  53.08 
 
 		 277 aa  251  9.000000000000001e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.67707  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3199  RecB family exonuclease  53.08 
 
 		 277 aa  251  9.000000000000001e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.487401  normal  0.220799 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3149  RecB family exonuclease  53.08 
 
 		 277 aa  251  9.000000000000001e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.424506  normal  0.878116 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2236  hypothetical protein  51.16 
 
 		 322 aa  250  2e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.636003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12151  hypothetical protein  53.82 
 
 		 278 aa  250  2e-65  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2353  hypothetical protein  50.74 
 
 		 303 aa  244  9.999999999999999e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.978382  normal  0.150681 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2456  RecB family exonuclease-like protein  49 
 
 		 295 aa  233  3e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1198  RecB family exonuclease-like protein  48.3 
 
 		 298 aa  226  4e-58  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0768064  normal  0.151704 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0757  hypothetical protein  35.77 
 
 		 259 aa  139  3e-32  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0821  hypothetical protein  29.96 
 
 		 279 aa  81.6  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00000666708  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_39374  predicted protein  29.78 
 
 		 366 aa  80.9  0.00000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0625  UvrD/REP helicase  25.9 
 
 		 1019 aa  80.5  0.00000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.243128  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2998  hypothetical protein  31.1 
 
 		 306 aa  75.1  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1280  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  31.12 
 
 		 958 aa  72.8  0.000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8396  hypothetical protein  26.52 
 
 		 293 aa  72.8  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.75052 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1197  hypothetical protein  28.27 
 
 		 312 aa  71.2  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0561644  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0904  hypothetical protein  29.55 
 
 		 276 aa  70.5  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.107924 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1068  hypothetical protein  23.39 
 
 		 411 aa  68.9  0.00000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0085  UvrD/REP helicase  27.04 
 
 		 1016 aa  68.9  0.00000000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.60174  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06610  RecB family exonuclease  26.01 
 
 		 286 aa  68.6  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0593  exonuclease-like protein  25.55 
 
 		 379 aa  67.4  0.0000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0865179  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4397  hypothetical protein  24.32 
 
 		 615 aa  66.2  0.0000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.272271 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5824  UvrD/REP helicase  28 
 
 		 1052 aa  65.1  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.101502 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0965  hypothetical protein  27.34 
 
 		 387 aa  63.9  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_558  hypothetical protein  25.19 
 
 		 379 aa  63.9  0.000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0308  exonuclease-like protein  22.8 
 
 		 244 aa  59.3  0.00000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00000290112  hitchhiker  0.00000170332 
 
 
-
 
NC_002936  DET0620  hypothetical protein  24.9 
 
 		 379 aa  58.5  0.0000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.638225  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13225  ATP-dependent DNA helicase  32 
 
 		 1055 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1403  UvrD/REP helicase  32.03 
 
 		 1051 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1421  UvrD/REP helicase  32.03 
 
 		 1051 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4666  UvrD/REP helicase  31.78 
 
 		 1038 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0501158  normal  0.218907 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2601  hypothetical protein  24.53 
 
 		 263 aa  57  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.718705  normal  0.128689 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2712  hypothetical protein  26.34 
 
 		 543 aa  57  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000442298  hitchhiker  0.0000400817 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1801  UvrD/REP helicase  27.03 
 
 		 1038 aa  56.6  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.078646 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1457  UvrD/REP helicase  31.25 
 
 		 1051 aa  56.2  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0431152  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0952  hypothetical protein  23.36 
 
 		 263 aa  56.2  0.0000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0683  hypothetical protein  27.47 
 
 		 302 aa  55.1  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.923342  normal  0.810121 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4258  hypothetical protein  27.62 
 
 		 287 aa  55.5  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.500216  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0896  UvrD/REP helicase  27.92 
 
 		 1066 aa  55.1  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.380602  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3814  hypothetical protein  30.37 
 
 		 284 aa  53.5  0.000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.18541  normal  0.492417 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4244  UvrD/REP helicase  21.74 
 
 		 1062 aa  53.1  0.000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.664691  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0737  hypothetical protein  26.22 
 
 		 302 aa  52.8  0.000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.907261  normal  0.486862 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0735  hypothetical protein  22.96 
 
 		 781 aa  52.4  0.000008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0636  hypothetical protein  26.17 
 
 		 387 aa  52  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1284  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  31.28 
 
 		 915 aa  50.8  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.155997 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0909  hypothetical protein  32.8 
 
 		 783 aa  50.1  0.00004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1392  hypothetical protein  19.78 
 
 		 803 aa  49.7  0.00005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0777  hypothetical protein  26.09 
 
 		 387 aa  49.7  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0282  hypothetical protein  22.64 
 
 		 279 aa  49.3  0.00006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1829  hypothetical protein  26.06 
 
 		 788 aa  48.9  0.00008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.423033  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1911  hypothetical protein  28.26 
 
 		 780 aa  48.9  0.00009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4065  hypothetical protein  28.24 
 
 		 986 aa  48.1  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.633062  normal  0.255669 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3437  double-strand break repair helicase AddB  30.69 
 
 		 988 aa  48.1  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00780  hypothetical protein  28.24 
 
 		 990 aa  48.1  0.0001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1682  ATP-dependent exonuclease, subunit B  24.84 
 
 		 1106 aa  48.1  0.0002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0840  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  23.98 
 
 		 1048 aa  47.4  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.564215  hitchhiker  0.00099262 
 
 
-
 
NC_002950  PG0517  hypothetical protein  27.81 
 
 		 960 aa  47  0.0004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0137071 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1525  putative helicase/exonuclease  28.66 
 
 		 997 aa  46.2  0.0006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.873687  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0453  hypothetical protein  24.84 
 
 		 276 aa  45.8  0.0007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0515112  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1066  UvrD/REP helicase  22.61 
 
 		 1048 aa  45.8  0.0007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15100  DNA/RNA helicase, superfamily I  31.61 
 
 		 1145 aa  45.8  0.0007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0177  putative helicase/exonuclease  28.66 
 
 		 997 aa  45.4  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.169187  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1658  hypothetical protein  29.38 
 
 		 1039 aa  45.4  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.450453  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1998  helicase  29.25 
 
 		 993 aa  44.7  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.138335  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1131  UvrD/REP helicase  27.86 
 
 		 1094 aa  44.3  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0781  hypothetical protein  34.23 
 
 		 886 aa  44.3  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.384751  normal  0.165581 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4179  ATP-dependent nuclease subunit B  24.29 
 
 		 951 aa  44.7  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0186449 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0715  hypothetical protein  26.85 
 
 		 387 aa  44.7  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.348942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0825  hypothetical protein  26.95 
 
 		 387 aa  44.7  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0799374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0903  hypothetical protein  26.85 
 
 		 387 aa  44.7  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1024  hypothetical protein  26.46 
 
 		 387 aa  44.3  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.115422  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1655  hypothetical protein  24.07 
 
 		 788 aa  43.9  0.003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0523  putative ATP-dependent DNA helicase  26.05 
 
 		 1044 aa  43.9  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1475  hypothetical protein  24.65 
 
 		 788 aa  43.9  0.003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0853402  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4407  ATP-dependent nuclease subunit B-like  37.5 
 
 		 1045 aa  43.9  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.546962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0925  UvrD/REP helicase  33.33 
 
 		 1135 aa  43.9  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.963076 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1977  putative DNA repair protein  29.09 
 
 		 913 aa  43.5  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.286475 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1243  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  29.51 
 
 		 968 aa  43.1  0.004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0167838  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>