82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_0818 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_4287  double-strand break repair protein AddB  44.62 
 
 		 1064 aa  800    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.235496  normal  0.271483 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2019  double-strand break repair protein AddB  86.85 
 
 		 1052 aa  1756    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3243  double-strand break repair protein AddB  44.48 
 
 		 1059 aa  829    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0818  double-strand break repair protein AddB  100 
 
 		 1052 aa  2089    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1356  double-strand break repair protein AddB  49.95 
 
 		 1047 aa  978    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3580  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  56.84 
 
 		 1042 aa  1048    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.412943  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3960  double-strand break repair protein AddB  44.62 
 
 		 1064 aa  803    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0055  double-strand break repair protein AddB  43.42 
 
 		 1062 aa  781    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2102  hypothetical protein  86.95 
 
 		 1052 aa  1758    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4903  double-strand break repair protein AddB  40 
 
 		 1047 aa  592  1e-168  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.402113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0137  double-strand break repair protein AddB  39.79 
 
 		 1001 aa  594  1e-168  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4439  double-strand break repair protein AddB  40.6 
 
 		 1047 aa  588  1e-166  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.522195  normal  0.331635 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0078  double-strand break repair protein AddB  39.18 
 
 		 1049 aa  585  1.0000000000000001e-165  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.160312  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4953  double-strand break repair protein AddB  39.94 
 
 		 1045 aa  584  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.28213  normal  0.220152 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0089  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  38.94 
 
 		 1048 aa  582  1e-164  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.476876 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0057  hypothetical protein  38.66 
 
 		 1049 aa  580  1e-164  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3299  double-strand break repair protein AddB  40.71 
 
 		 1015 aa  567  1e-160  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0049  hypothetical protein  38.6 
 
 		 1053 aa  563  1.0000000000000001e-159  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.258638  normal  0.374652 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1608  double-strand break repair protein AddB  40.57 
 
 		 1037 aa  562  1e-158  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.62778  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0628  hypothetical protein  39.42 
 
 		 1048 aa  554  1e-156  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.397412  normal  0.357504 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0386  hypothetical protein  39.18 
 
 		 1042 aa  551  1e-155  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0203  hypothetical protein  38.22 
 
 		 1049 aa  547  1e-154  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.587798  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1413  double-strand break repair protein AddB  38.56 
 
 		 1043 aa  547  1e-154  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0491  double-strand break repair protein AddB  38.89 
 
 		 1040 aa  543  1e-153  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00465819 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3435  hypothetical protein  38.1 
 
 		 1018 aa  518  1.0000000000000001e-145  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2174  double-strand break repair protein AddB  34.89 
 
 		 1076 aa  492  1e-137  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.229976  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4852  double-strand break repair protein AddB  36.82 
 
 		 999 aa  491  1e-137  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.173842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2845  hypothetical protein  32.79 
 
 		 977 aa  412  1e-113  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.786725 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0085  hypothetical protein  34.05 
 
 		 1016 aa  397  1e-109  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.604328 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2952  exonuclease-like protein  33.64 
 
 		 1000 aa  395  1e-108  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.034558  normal  0.0831314 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2680  double-strand break repair protein AddB  35.85 
 
 		 991 aa  396  1e-108  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0177  putative helicase/exonuclease  33.68 
 
 		 997 aa  394  1e-108  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.169187  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1525  putative helicase/exonuclease  33.43 
 
 		 997 aa  392  1e-107  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.873687  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1296  double-strand break repair protein AddB  34.66 
 
 		 1014 aa  386  1e-105  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.862539  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4065  hypothetical protein  32.25 
 
 		 986 aa  366  1e-99  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.633062  normal  0.255669 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3437  double-strand break repair helicase AddB  31.72 
 
 		 988 aa  363  9e-99  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2795  putative helicase/exonuclease  32.29 
 
 		 980 aa  343  1e-92  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0158  helicase  32.87 
 
 		 991 aa  342  2e-92  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.233932  normal  0.795485 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1998  helicase  30.22 
 
 		 993 aa  328  4.0000000000000003e-88  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.138335  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5094  double-strand break repair protein AddB  44.55 
 
 		 1054 aa  321  3.9999999999999996e-86  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.145083 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1454  hypothetical protein  33.11 
 
 		 959 aa  305  2.0000000000000002e-81  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0263  hypothetical protein  21.73 
 
 		 911 aa  180  1e-43  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.453707  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0820  hypothetical protein  21.3 
 
 		 914 aa  177  9.999999999999999e-43  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.839231  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1189  hypothetical protein  27.33 
 
 		 962 aa  109  3e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1125  hypothetical protein  25.39 
 
 		 947 aa  107  1e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.290097 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1033  hypothetical protein  24.14 
 
 		 951 aa  93.6  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.187389  normal  0.358259 
 
 
-
 
NC_002978  WD0912  hypothetical protein  24.78 
 
 		 890 aa  89.7  3e-16  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.216262  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2115  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  28.12 
 
 		 957 aa  84.7  0.000000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2132  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V subunit B  26.65 
 
 		 976 aa  83.6  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.687537 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0524  hypothetical protein  24.24 
 
 		 779 aa  76.6  0.000000000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1280  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  25.51 
 
 		 958 aa  75.1  0.000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0034  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  25.41 
 
 		 836 aa  68.9  0.0000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0563603 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2171  hypothetical protein  41.76 
 
 		 142 aa  67  0.000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.198101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0640  inactivated superfamily I helicase-like protein  23.95 
 
 		 991 aa  67  0.000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0088  hypothetical protein  24.23 
 
 		 781 aa  63.2  0.00000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.217564  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1306  hypothetical protein  24.94 
 
 		 994 aa  62.8  0.00000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.791013  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2324  exonuclease-like protein  30.74 
 
 		 864 aa  61.2  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.884454  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2897  hypothetical protein  31.68 
 
 		 846 aa  61.2  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0735  hypothetical protein  21.69 
 
 		 781 aa  58.5  0.0000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1284  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  31.53 
 
 		 915 aa  58.5  0.0000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.155997 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0840  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  30.81 
 
 		 1048 aa  58.5  0.0000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.564215  hitchhiker  0.00099262 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1562  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  25.06 
 
 		 957 aa  57  0.000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0696  hypothetical protein  20.5 
 
 		 919 aa  56.2  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03200  hypothetical protein  18.37 
 
 		 911 aa  54.3  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.358674  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1475  hypothetical protein  23.98 
 
 		 788 aa  53.9  0.00001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0853402  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4179  ATP-dependent nuclease subunit B  23.77 
 
 		 951 aa  52.8  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0186449 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0711  UvrD/REP helicase  27.54 
 
 		 1059 aa  52.4  0.00005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1165  hypothetical protein  24.62 
 
 		 984 aa  51.6  0.00007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.5757 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0479  ATP-dependent nuclease subunit B-like  24.4 
 
 		 908 aa  50.4  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.236866  hitchhiker  0.000840779 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00780  hypothetical protein  28.42 
 
 		 990 aa  49.7  0.0003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2978  RecB family exonuclease-like protein  29.82 
 
 		 323 aa  49.3  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000129924  hitchhiker  0.00505029 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1156  hypothetical protein  34.16 
 
 		 865 aa  48.9  0.0006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0722  hypothetical protein  25.39 
 
 		 930 aa  48.5  0.0007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.851206  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1977  putative DNA repair protein  25.77 
 
 		 913 aa  48.1  0.0009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.286475 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1709  hypothetical protein  26.4 
 
 		 896 aa  47.4  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000066453  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1816  hypothetical protein  28.89 
 
 		 280 aa  46.2  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2414  RecB family exonuclease-like protein  29.08 
 
 		 351 aa  46.2  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1752  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  24.06 
 
 		 940 aa  45.8  0.004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.894533 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1499  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  30.41 
 
 		 1049 aa  45.8  0.004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0645  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  24.54 
 
 		 989 aa  44.7  0.009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2974  UvrD/REP helicase  30.61 
 
 		 1074 aa  44.7  0.009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1682  ATP-dependent exonuclease, subunit B  28.42 
 
 		 1106 aa  44.7  0.01  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>