64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1156 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_1156  hypothetical protein  100 
 
 		 865 aa  1730    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1249  hypothetical protein  25.14 
 
 		 742 aa  134  6.999999999999999e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.533851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0987  hypothetical protein  23.28 
 
 		 911 aa  67  0.000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000754464  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0522  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  23.6 
 
 		 1121 aa  64.7  0.000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1284  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  28.42 
 
 		 915 aa  64.3  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.155997 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2223  hypothetical protein  21.16 
 
 		 858 aa  61.6  0.00000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1287  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  19.86 
 
 		 994 aa  61.6  0.00000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2195  hypothetical protein  21.04 
 
 		 858 aa  60.8  0.0000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2115  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  26.89 
 
 		 957 aa  60.1  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2897  hypothetical protein  27.82 
 
 		 846 aa  59.7  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2194  exonuclease-like protein  26.64 
 
 		 855 aa  58.2  0.0000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.759403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1392  hypothetical protein  21.3 
 
 		 803 aa  58.2  0.0000007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2324  exonuclease-like protein  27.88 
 
 		 864 aa  57  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.884454  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2132  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V subunit B  25.86 
 
 		 976 aa  56.6  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.687537 
 
 
-
 
NC_002936  DET0620  hypothetical protein  26.72 
 
 		 379 aa  56.2  0.000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.638225  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1033  hypothetical protein  26.72 
 
 		 951 aa  56.2  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.187389  normal  0.358259 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2513  ATP-dependent nuclease subunit B-like  25.71 
 
 		 1029 aa  55.5  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.260712  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2356  exonuclease-like protein  25.72 
 
 		 856 aa  55.5  0.000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0085  UvrD/REP helicase  24.54 
 
 		 1016 aa  54.3  0.000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.60174  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1502  exonuclease-like protein  25.72 
 
 		 856 aa  54.3  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2640  hypothetical protein  25.81 
 
 		 883 aa  54.3  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0600209  normal  0.0102086 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2222  RecB family exonuclease-like protein  27.38 
 
 		 297 aa  53.5  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.839667  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0593  exonuclease-like protein  25.19 
 
 		 379 aa  52.4  0.00003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0865179  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1189  hypothetical protein  27.86 
 
 		 962 aa  52.8  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0088  hypothetical protein  22.99 
 
 		 781 aa  52.8  0.00003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.217564  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_558  hypothetical protein  26.72 
 
 		 379 aa  52.4  0.00004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2264  exonuclease-like  25.28 
 
 		 856 aa  52  0.00005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0385  hypothetical protein  25 
 
 		 786 aa  51.6  0.00006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.412498  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0481  ATP-dependent deoxyribonuclease subunit B  24.57 
 
 		 1151 aa  51.6  0.00007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2952  exonuclease-like protein  27.3 
 
 		 1000 aa  51.6  0.00007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.034558  normal  0.0831314 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0972  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  29.14 
 
 		 916 aa  50.8  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00798755 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1525  putative helicase/exonuclease  28.69 
 
 		 997 aa  50.8  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.873687  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0840  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  25.66 
 
 		 1048 aa  50.8  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.564215  hitchhiker  0.00099262 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0645  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  27.42 
 
 		 989 aa  50.1  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1125  hypothetical protein  25.1 
 
 		 947 aa  50.1  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.290097 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1578  hypothetical protein  25.48 
 
 		 753 aa  49.7  0.0002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4407  ATP-dependent nuclease subunit B-like  28.96 
 
 		 1045 aa  50.1  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.546962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0177  putative helicase/exonuclease  28.69 
 
 		 997 aa  50.1  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.169187  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1977  putative DNA repair protein  27.96 
 
 		 913 aa  49.7  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.286475 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1911  hypothetical protein  24.52 
 
 		 780 aa  48.9  0.0004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1658  hypothetical protein  25.12 
 
 		 1039 aa  48.9  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.450453  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0818  double-strand break repair protein AddB  34.16 
 
 		 1052 aa  48.5  0.0005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1482  RecB family exonuclease-like protein  27.47 
 
 		 302 aa  48.5  0.0006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1570  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  24.85 
 
 		 1043 aa  48.1  0.0007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0978  hypothetical protein  24.93 
 
 		 1000 aa  48.1  0.0007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.263512  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1454  hypothetical protein  30.49 
 
 		 959 aa  48.1  0.0008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2978  RecB family exonuclease-like protein  26.55 
 
 		 323 aa  48.1  0.0008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000129924  hitchhiker  0.00505029 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0034  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  24.63 
 
 		 836 aa  47.4  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0563603 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5824  UvrD/REP helicase  27.21 
 
 		 1052 aa  47.4  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.101502 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0454  hypothetical protein  22.14 
 
 		 969 aa  47  0.001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0460  hypothetical protein  22.14 
 
 		 969 aa  47  0.001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5903  RecB family exonuclease-like protein  26.84 
 
 		 295 aa  46.6  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.016661  normal  0.144641 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4244  UvrD/REP helicase  29.27 
 
 		 1062 aa  46.2  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.664691  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0647  hypothetical protein  33.33 
 
 		 940 aa  47  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.34885  normal  0.818335 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1243  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  29.52 
 
 		 968 aa  45.8  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0167838  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1068  hypothetical protein  24.78 
 
 		 411 aa  45.4  0.004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00780  hypothetical protein  28.33 
 
 		 990 aa  45.4  0.005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1998  helicase  25.93 
 
 		 993 aa  44.7  0.008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.138335  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1587  hypothetical protein  24.86 
 
 		 997 aa  44.7  0.008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1837  hypothetical protein  29.08 
 
 		 909 aa  44.3  0.009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.57891  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0965  hypothetical protein  27.66 
 
 		 387 aa  44.7  0.009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1682  ATP-dependent exonuclease, subunit B  27.91 
 
 		 1106 aa  44.3  0.009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1709  hypothetical protein  23.45 
 
 		 896 aa  44.3  0.009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000066453  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0696  hypothetical protein  23.67 
 
 		 919 aa  44.3  0.01  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>